RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000578698.1

PTPRM-209, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRM, Length 486 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-209ENST00000578698 WIPF1O43516 503 aa6.81□□□□□ -1.32
PTPRM-209ENST00000578698 HIC1Q14526 733 aa6.81□□□□□ -1.32
PTPRM-209ENST00000578698 ATP13A2Q9NQ11 1180 aa6.81□□□□□ -1.32
PTPRM-209ENST00000578698 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP6.81□□□□□ -1.32
PTPRM-209ENST00000578698 FECHP22830 423 aa6.8□□□□□ -1.32
PTPRM-209ENST00000578698 DHX30Q7L2E3 1194 aaKnown RBP eCLIP6.8□□□□□ -1.32
PTPRM-209ENST00000578698 NLRP7Q8WX94 980 aa6.8□□□□□ -1.32
PTPRM-209ENST00000578698 SNRPBP14678 240 aaKnown RBP6.79□□□□□ -1.32
PTPRM-209ENST00000578698 SNIP1Q8TAD8 396 aaKnown RBP6.79□□□□□ -1.32
PTPRM-209ENST00000578698 ARXQ96QS3 562 aa6.79□□□□□ -1.32
PTPRM-209ENST00000578698 WNT7AO00755 349 aa6.78□□□□□ -1.32
PTPRM-209ENST00000578698 TERTO14746 1132 aaKnown RBP6.78□□□□□ -1.32
PTPRM-209ENST00000578698 SMPD1P17405 629 aa6.78□□□□□ -1.32
PTPRM-209ENST00000578698 RNF19BQ6ZMZ0 732 aa6.78□□□□□ -1.32
PTPRM-209ENST00000578698 SULF1Q8IWU6 871 aa6.78□□□□□ -1.32
PTPRM-209ENST00000578698 SENP2Q9HC62 589 aa6.78□□□□□ -1.32
PTPRM-209ENST00000578698 J3QL48 77 aa6.77□□□□□ -1.33
PTPRM-209ENST00000578698 GNPATO15228 680 aa6.77□□□□□ -1.33
PTPRM-209ENST00000578698 GCGRP47871 477 aa6.77□□□□□ -1.33
PTPRM-209ENST00000578698 TRIM32Q13049 653 aa6.77□□□□□ -1.33
PTPRM-209ENST00000578698 MSS51Q4VC12 460 aa6.77□□□□□ -1.33
PTPRM-209ENST00000578698 BRICD5Q6PL45 260 aa6.77□□□□□ -1.33
PTPRM-209ENST00000578698 MRGPRX2Q96LB1 330 aa6.77□□□□□ -1.33
PTPRM-209ENST00000578698 TRIM47Q96LD4 638 aa6.77□□□□□ -1.33
PTPRM-209ENST00000578698 GRIPAP1Q4V328 841 aa6.76□□□□□ -1.33
PTPRM-209ENST00000578698 RBM26Q5T8P6 1007 aaKnown RBP6.76□□□□□ -1.33
PTPRM-209ENST00000578698 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP6.76□□□□□ -1.33
PTPRM-209ENST00000578698 TMEM132AQ24JP5 1023 aa6.75□□□□□ -1.33
PTPRM-209ENST00000578698 LCE2CQ5TA81 110 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPRM-209ENST00000578698 HPS1Q92902 700 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPRM-209ENST00000578698 KIFC2Q96AC6 838 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPRM-209ENST00000578698 REPIN1Q9BWE0 567 aaKnown RBP6.74□□□□□ -1.33
PTPRM-209ENST00000578698 TESPA1A2RU30 521 aaPredicted RBP6.73□□□□□ -1.33
PTPRM-209ENST00000578698 CCDC24Q8N4L8 307 aa6.73□□□□□ -1.33
PTPRM-209ENST00000578698 FAM181BA6NEQ2 426 aa6.72□□□□□ -1.33
PTPRM-209ENST00000578698 Q3C1V9 767 aa6.72□□□□□ -1.33
PTPRM-209ENST00000578698 SMYD5Q6GMV2 418 aa6.72□□□□□ -1.33
PTPRM-209ENST00000578698 SLC16A10Q8TF71 515 aa6.72□□□□□ -1.33
PTPRM-209ENST00000578698 ZC3H15Q8WU90 426 aaKnown RBP6.72□□□□□ -1.33
PTPRM-209ENST00000578698 MMP16P51512 607 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRM-209ENST00000578698 PHOX2BQ99453 314 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRM-209ENST00000578698 ALDH1A1P00352 501 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRM-209ENST00000578698 RC3H1Q5TC82 1133 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
PTPRM-209ENST00000578698 C14orf37Q86TY3 774 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRM-209ENST00000578698 USB1Q9BQ65 265 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
PTPRM-209ENST00000578698 GPR37O15354 613 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRM-209ENST00000578698 DXOO77932 396 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
PTPRM-209ENST00000578698 BRPF1P55201 1214 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
PTPRM-209ENST00000578698 ERICH6Q7L0X2 663 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRM-209ENST00000578698 BMP1P13497 986 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRM-209ENST00000578698 SKOR1P84550 965 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRM-209ENST00000578698 NXF1Q9UBU9 619 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
PTPRM-209ENST00000578698 GMPRP36959 345 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRM-209ENST00000578698 VEGFBP49765 207 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRM-209ENST00000578698 WNT7BP56706 349 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRM-209ENST00000578698 NEUROD2Q15784 382 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRM-209ENST00000578698 HOMEZQ8IX15 550 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRM-209ENST00000578698 ZSCAN1Q8NBB4 408 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRM-209ENST00000578698 IRF7Q92985 503 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRM-209ENST00000578698 SLC24A3Q9HC58 644 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRM-209ENST00000578698 KDM4AO75164 1064 aa6.65□□□□□ -1.34
PTPRM-209ENST00000578698 HLA-CQ95604 372 aa6.65□□□□□ -1.34
PTPRM-209ENST00000578698 WASF2Q9Y6W5 498 aa6.65□□□□□ -1.34
PTPRM-209ENST00000578698 CD46P15529 392 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRM-209ENST00000578698 GPIHBP1Q8IV16 184 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRM-209ENST00000578698 EHBP1Q8NDI1 1231 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRM-209ENST00000578698 CAPN5O15484 640 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
PTPRM-209ENST00000578698 ZMYND10O75800 440 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRM-209ENST00000578698 TRIM46Q7Z4K8 759 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPRM-209ENST00000578698 JUNDP17535 347 aa6.61□□□□□ -1.35
PTPRM-209ENST00000578698 GUCA2AQ02747 115 aa6.61□□□□□ -1.35
PTPRM-209ENST00000578698 HOXA2O43364 376 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRM-209ENST00000578698 USP46P62068 366 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRM-209ENST00000578698 NPAS3Q8IXF0 933 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRM-209ENST00000578698 MDM2Q00987 491 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
PTPRM-209ENST00000578698 SYMPKQ92797 1274 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
PTPRM-209ENST00000578698 NUDT12Q9BQG2 462 aa6.59□□□□□ -1.35
PTPRM-209ENST00000578698 ERBB4Q15303 1308 aa6.58□□□□□ -1.36
PTPRM-209ENST00000578698 H3BM21 787 aa6.58□□□□□ -1.36
PTPRM-209ENST00000578698 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP6.58□□□□□ -1.36
PTPRM-209ENST00000578698 LORP23490 312 aaPredicted RBP6.58□□□□□ -1.36
PTPRM-209ENST00000578698 BARGINQ6ZT62 677 aa6.58□□□□□ -1.36
PTPRM-209ENST00000578698 ZFP42Q96MM3 310 aa6.58□□□□□ -1.36
PTPRM-209ENST00000578698 SIAH2O43255 324 aa6.57□□□□□ -1.36
PTPRM-209ENST00000578698 PTCRAQ6ISU1 281 aaPredicted RBP6.57□□□□□ -1.36
PTPRM-209ENST00000578698 MAP2K5Q13163 448 aa6.56□□□□□ -1.36
PTPRM-209ENST00000578698 RETREG3Q86VR2 466 aa6.56□□□□□ -1.36
PTPRM-209ENST00000578698 KRI1Q8N9T8 703 aaKnown RBP6.56□□□□□ -1.36
PTPRM-209ENST00000578698 TLL2Q9Y6L7 1015 aa6.56□□□□□ -1.36
PTPRM-209ENST00000578698 SH3BP2P78314 561 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRM-209ENST00000578698 LINC01559Q495D7 138 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRM-209ENST00000578698 NUTM1Q86Y26 1132 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRM-209ENST00000578698 AK7Q96M32 723 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRM-209ENST00000578698 LOC100996750A0A140TA64 210 aa6.54□□□□□ -1.36
PTPRM-209ENST00000578698 C6orf229H3BNL8 230 aa6.54□□□□□ -1.36
PTPRM-209ENST00000578698 CCNYL3P0C7X3 344 aa6.54□□□□□ -1.36
PTPRM-209ENST00000578698 MS4A1P11836 297 aa6.54□□□□□ -1.36
PTPRM-209ENST00000578698 KRTAP4-6Q9BYQ5 205 aa6.54□□□□□ -1.36
PTPRM-209ENST00000578698 NNTQ13423 1086 aa6.53□□□□□ -1.36
PTPRM-209ENST00000578698 SCARF1Q14162 830 aa6.53□□□□□ -1.36
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