RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000576589.1

NOMO3-217, Transcript of NODAL modulator 3, human

TSL 5

Gene NOMO3, Length 683 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NOMO3-217	ENST00000576589	MST1R	Q04912	1400 aa		40.75	■■■■■ 4.11
NOMO3-217	ENST00000576589	PLEKHH1	Q9ULM0	1364 aa		40.74	■■■■■ 4.11
NOMO3-217	ENST00000576589	L3MBTL2	Q969R5	705 aa		40.74	■■■■■ 4.11
NOMO3-217	ENST00000576589	KNDC1	Q76NI1	1749 aa		40.71	■■■■■ 4.11
NOMO3-217	ENST00000576589	ADGRB1	O14514	1584 aa		40.71	■■■■■ 4.11
NOMO3-217	ENST00000576589	BRINP3	Q76B58	766 aa		40.71	■■■■■ 4.11
NOMO3-217	ENST00000576589	PCGF6	Q9BYE7	350 aa		40.71	■■■■■ 4.11
NOMO3-217	ENST00000576589	SPATA31A6	Q5VVP1	1343 aa		40.69	■■■■■ 4.11
NOMO3-217	ENST00000576589	AHDC1	Q5TGY3	1603 aa	Predicted RBP	40.68	■■■■■ 4.1
NOMO3-217	ENST00000576589	TRAK1	Q9UPV9	953 aa		40.67	■■■■■ 4.1
NOMO3-217	ENST00000576589	PRAM1	Q96QH2	718 aa		40.66	■■■■■ 4.1
NOMO3-217	ENST00000576589	POGK	Q9P215	609 aa		40.63	■■■■■ 4.09
NOMO3-217	ENST00000576589	C1orf167	Q5SNV9	1468 aa		40.63	■■■■■ 4.09
NOMO3-217	ENST00000576589	LRP6	O75581	1613 aa		40.62	■■■■■ 4.09
NOMO3-217	ENST00000576589	SAFB2	Q14151	953 aa	Known RBP eCLIP	40.61	■■■■■ 4.09
NOMO3-217	ENST00000576589	MEX3C	Q5U5Q3	659 aa	Known RBP	40.61	■■■■■ 4.09
NOMO3-217	ENST00000576589	DLC1	Q96QB1	1528 aa		40.61	■■■■■ 4.09
NOMO3-217	ENST00000576589	CDC42BPG	Q6DT37	1551 aa		40.57	■■■■■ 4.09
NOMO3-217	ENST00000576589	NBPF1	Q3BBV0	1214 aa		40.55	■■■■■ 4.08
NOMO3-217	ENST00000576589	SHPRH	Q149N8	1683 aa		40.54	■■■■■ 4.08
NOMO3-217	ENST00000576589	ORAI2	Q96SN7	254 aa		40.54	■■■■■ 4.08
NOMO3-217	ENST00000576589	NUTM2F	A1L443	756 aa		40.52	■■■■■ 4.08
NOMO3-217	ENST00000576589	ZNF772	Q68DY9	489 aa	Predicted RBP	40.51	■■■■■ 4.08
NOMO3-217	ENST00000576589	ESCO1	Q5FWF5	840 aa		40.48	■■■■■ 4.07
NOMO3-217	ENST00000576589	DDX17	Q92841	729 aa	Known RBP	40.48	■■■■■ 4.07
NOMO3-217	ENST00000576589	KIAA1210	Q9ULL0	1709 aa		40.47	■■■■■ 4.07
NOMO3-217	ENST00000576589	NUTM2B	A6NNL0	878 aa	Predicted RBP	40.47	■■■■■ 4.07
NOMO3-217	ENST00000576589	NUTM2E	B1AL46	878 aa	Predicted RBP	40.47	■■■■■ 4.07
NOMO3-217	ENST00000576589	NUTM2A	Q8IVF1	878 aa	Predicted RBP	40.47	■■■■■ 4.07
NOMO3-217	ENST00000576589	TONSL	Q96HA7	1378 aa		40.47	■■■■■ 4.07
NOMO3-217	ENST00000576589	LRRC59	Q96AG4	307 aa	Known RBP	40.43	■■■■■ 4.06
NOMO3-217	ENST00000576589	MINK1	Q8N4C8	1332 aa	Predicted RBP	40.42	■■■■■ 4.06
NOMO3-217	ENST00000576589	HIRIP3	Q9BW71	556 aa	Predicted RBP	40.42	■■■■■ 4.06
NOMO3-217	ENST00000576589	NHSL1	Q5SYE7	1610 aa		40.39	■■■■■ 4.06
NOMO3-217	ENST00000576589	NBPF8	Q3BBV2	869 aa		40.37	■■■■■ 4.05
NOMO3-217	ENST00000576589	FMN2	Q9NZ56	1722 aa		40.36	■■■■■ 4.05
NOMO3-217	ENST00000576589	ARHGEF28	Q8N1W1	1705 aa	Known RBP	40.33	■■■■■ 4.05
NOMO3-217	ENST00000576589	ADGRB2	O60241	1585 aa		40.32	■■■■■ 4.05
NOMO3-217	ENST00000576589	WASL	O00401	505 aa	Predicted RBP	40.32	■■■■■ 4.05
NOMO3-217	ENST00000576589	SOS2	Q07890	1332 aa	Predicted RBP	40.32	■■■■■ 4.04
NOMO3-217	ENST00000576589	NPHP3	Q7Z494	1330 aa		40.32	■■■■■ 4.04
NOMO3-217	ENST00000576589	ROCK2	O75116	1388 aa	Known RBP	40.32	■■■■■ 4.04
NOMO3-217	ENST00000576589	FOXO3	O43524	673 aa		40.31	■■■■■ 4.04
NOMO3-217	ENST00000576589	RXRB	P28702	533 aa		40.31	■■■■■ 4.04
NOMO3-217	ENST00000576589	AFF2	P51816	1311 aa		40.29	■■■■■ 4.04
NOMO3-217	ENST00000576589	PNPLA6	Q8IY17	1366 aa		40.29	■■■■■ 4.04
NOMO3-217	ENST00000576589	TRPM1	Q7Z4N2	1603 aa		40.28	■■■■■ 4.04
NOMO3-217	ENST00000576589	PHF8	Q9UPP1	1060 aa		40.26	■■■■■ 4.04
NOMO3-217	ENST00000576589	ANKAR	Q7Z5J8	1434 aa		40.25	■■■■■ 4.03
NOMO3-217	ENST00000576589	EIF3A	Q14152	1382 aa	Known RBP	40.25	■■■■■ 4.03
NOMO3-217	ENST00000576589	CLSPN	Q9HAW4	1339 aa		40.24	■■■■■ 4.03
NOMO3-217	ENST00000576589	CENPJ	Q9HC77	1338 aa	Predicted RBP	40.24	■■■■■ 4.03
NOMO3-217	ENST00000576589	XPC	Q01831	940 aa	Predicted RBP	40.23	■■■■■ 4.03
NOMO3-217	ENST00000576589	C8orf37	Q96NL8	207 aa		40.22	■■■■■ 4.03
NOMO3-217	ENST00000576589	PRR36	Q9H6K5	1346 aa		40.2	■■■■■ 4.03
NOMO3-217	ENST00000576589	UPF1	Q92900	1129 aa	Known RBP eCLIP	40.2	■■■■■ 4.03
NOMO3-217	ENST00000576589	CDK19	Q9BWU1	502 aa		40.18	■■■■■ 4.02
NOMO3-217	ENST00000576589	TULP4	Q9NRJ4	1543 aa		40.17	■■■■■ 4.02
NOMO3-217	ENST00000576589	PMFBP1	Q8TBY8	1022 aa		40.17	■■■■■ 4.02
NOMO3-217	ENST00000576589	GPRASP1	Q5JY77	1395 aa		40.17	■■■■■ 4.02
NOMO3-217	ENST00000576589	PXDN	Q92626	1479 aa		40.17	■■■■■ 4.02
NOMO3-217	ENST00000576589	CDK12	Q9NYV4	1490 aa	Predicted RBP	40.16	■■■■■ 4.02
NOMO3-217	ENST00000576589	KIF1A	Q12756	1690 aa		40.15	■■■■■ 4.02
NOMO3-217	ENST00000576589	CCER1	Q8TC90	406 aa	Predicted RBP	40.15	■■■■■ 4.02
NOMO3-217	ENST00000576589	USP32	Q8NFA0	1604 aa		40.14	■■■■■ 4.02
NOMO3-217	ENST00000576589	KRT28	Q7Z3Y7	464 aa		40.14	■■■■■ 4.02
NOMO3-217	ENST00000576589	CARD11	Q9BXL7	1154 aa		40.14	■■■■■ 4.02
NOMO3-217	ENST00000576589	QTRT2	Q9H974	415 aa	Known RBP	40.14	■■■■■ 4.02
NOMO3-217	ENST00000576589	NUDT16	Q96DE0	195 aa	Known RBP	40.13	■■■■■ 4.01
NOMO3-217	ENST00000576589	ADAMTS2	O95450	1211 aa		40.12	■■■■■ 4.01
NOMO3-217	ENST00000576589	RALGAPB	Q86X10	1494 aa		40.12	■■■■■ 4.01
NOMO3-217	ENST00000576589	RGPD8	O14715	1765 aa	Predicted RBP	40.1	■■■■■ 4.01
NOMO3-217	ENST00000576589	NGLY1	Q96IV0	654 aa		40.1	■■■■■ 4.01
NOMO3-217	ENST00000576589	PSME1	Q06323	249 aa		40.09	■■■■■ 4.01
NOMO3-217	ENST00000576589	RBM6	P78332	1123 aa	Known RBP	40.07	■■■■■ 4.01
NOMO3-217	ENST00000576589	TIMELESS	Q9UNS1	1208 aa		40.06	■■■■■ 4
NOMO3-217	ENST00000576589	ATP7B	P35670	1465 aa		40.06	■■■■■ 4
NOMO3-217	ENST00000576589	SRPK2	P78362	688 aa	Known RBP	40.05	■■■■■ 4
NOMO3-217	ENST00000576589	SPATA31A3	Q5VYP0	1347 aa		40.03	■■■■■ 4
NOMO3-217	ENST00000576589	NGDN	Q8NEJ9	315 aa	Known RBP	40.03	■■■■■ 4
NOMO3-217	ENST00000576589	CCDC61	Q9Y6R9	512 aa		40.02	■■■■■ 4
NOMO3-217	ENST00000576589	CABP2	Q9NPB3	220 aa		40.01	■■■■■ 4
NOMO3-217	ENST00000576589	QRICH2	Q9H0J4	1663 aa		40.01	■■■■■ 4
NOMO3-217	ENST00000576589	RGS12	O14924	1447 aa		39.98	■■■■□ 3.99
NOMO3-217	ENST00000576589	SBNO1	A3KN83	1393 aa		39.97	■■■■□ 3.99
NOMO3-217	ENST00000576589	EVC2	Q86UK5	1308 aa		39.97	■■■■□ 3.99
NOMO3-217	ENST00000576589	USP21	Q9UK80	565 aa		39.96	■■■■□ 3.99
NOMO3-217	ENST00000576589	TNS3	Q68CZ2	1445 aa		39.95	■■■■□ 3.99
NOMO3-217	ENST00000576589	LMOD2	Q6P5Q4	547 aa		39.93	■■■■□ 3.98
NOMO3-217	ENST00000576589	PLEKHG3	A1L390	1219 aa		39.92	■■■■□ 3.98
NOMO3-217	ENST00000576589	FNBP4	Q8N3X1	1017 aa	Predicted RBP	39.92	■■■■□ 3.98
NOMO3-217	ENST00000576589	COL22A1	Q8NFW1	1626 aa	Predicted RBP	39.91	■■■■□ 3.98
NOMO3-217	ENST00000576589	TRPC5	Q9UL62	973 aa	Predicted RBP	39.89	■■■■□ 3.98
NOMO3-217	ENST00000576589	ACE	P12821	1306 aa		39.89	■■■■□ 3.98
NOMO3-217	ENST00000576589	ITSN1	Q15811	1721 aa		39.88	■■■■□ 3.98
NOMO3-217	ENST00000576589	ARHGEF10	O15013	1369 aa		39.86	■■■■□ 3.97
NOMO3-217	ENST00000576589	SBNO2	Q9Y2G9	1366 aa		39.86	■■■■□ 3.97
NOMO3-217	ENST00000576589	PPIP5K1	Q6PFW1	1433 aa		39.86	■■■■□ 3.97
NOMO3-217	ENST00000576589	POLR3A	O14802	1390 aa	Predicted RBP	39.85	■■■■□ 3.97
NOMO3-217	ENST00000576589	PAK3	O75914	559 aa	Predicted RBP	39.84	■■■■□ 3.97

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