RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000574099.1

CCDC40-211, Transcript of coiled-coil domain containing 40, humanhuman

TSL 4

Gene CCDC40, Length 537 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC40-211ENST00000574099 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP26.62■■□□□ 1.85
CCDC40-211ENST00000574099 MYOM2P54296 1465 aa26.61■■□□□ 1.85
CCDC40-211ENST00000574099 NAIPQ13075 1403 aa26.6■■□□□ 1.85
CCDC40-211ENST00000574099 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa26.59■■□□□ 1.85
CCDC40-211ENST00000574099 EP400Q96L91 3159 aa26.58■■□□□ 1.85
CCDC40-211ENST00000574099 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP26.58■■□□□ 1.85
CCDC40-211ENST00000574099 ESCO1Q5FWF5 840 aa26.58■■□□□ 1.85
CCDC40-211ENST00000574099 PXDNQ92626 1479 aa26.57■■□□□ 1.84
CCDC40-211ENST00000574099 NPHP3Q7Z494 1330 aa26.57■■□□□ 1.84
CCDC40-211ENST00000574099 BCL9LQ86UU0 1499 aa26.55■■□□□ 1.84
CCDC40-211ENST00000574099 ZRANB1Q9UGI0 708 aa26.55■■□□□ 1.84
CCDC40-211ENST00000574099 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa26.53■■□□□ 1.84
CCDC40-211ENST00000574099 NUTM2FA1L443 756 aa26.52■■□□□ 1.84
CCDC40-211ENST00000574099 FOXO3O43524 673 aa26.52■■□□□ 1.84
CCDC40-211ENST00000574099 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP26.5■■□□□ 1.83
CCDC40-211ENST00000574099 FOXD1Q16676 465 aa26.49■■□□□ 1.83
CCDC40-211ENST00000574099 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP26.49■■□□□ 1.83
CCDC40-211ENST00000574099 TNKS1BP1Q9C0C2 1729 aaKnown RBP26.48■■□□□ 1.83
CCDC40-211ENST00000574099 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP26.48■■□□□ 1.83
CCDC40-211ENST00000574099 STK26Q9P289 416 aa26.48■■□□□ 1.83
CCDC40-211ENST00000574099 GLI3P10071 1580 aa26.46■■□□□ 1.83
CCDC40-211ENST00000574099 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa26.45■■□□□ 1.83
CCDC40-211ENST00000574099 WAPLQ7Z5K2 1190 aa26.45■■□□□ 1.82
CCDC40-211ENST00000574099 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP26.45■■□□□ 1.82
CCDC40-211ENST00000574099 CCDC125Q86Z20 511 aa26.44■■□□□ 1.82
CCDC40-211ENST00000574099 KNDC1Q76NI1 1749 aa26.43■■□□□ 1.82
CCDC40-211ENST00000574099 FMN2Q9NZ56 1722 aa26.43■■□□□ 1.82
CCDC40-211ENST00000574099 RALGAPBQ86X10 1494 aa26.42■■□□□ 1.82
CCDC40-211ENST00000574099 BRWD3Q6RI45 1802 aa26.42■■□□□ 1.82
CCDC40-211ENST00000574099 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa26.42■■□□□ 1.82
CCDC40-211ENST00000574099 IFT172Q9UG01 1749 aa26.42■■□□□ 1.82
CCDC40-211ENST00000574099 KIF1AQ12756 1690 aa26.41■■□□□ 1.82
CCDC40-211ENST00000574099 TECPR2O15040 1411 aa26.41■■□□□ 1.82
CCDC40-211ENST00000574099 USP32Q8NFA0 1604 aa26.41■■□□□ 1.82
CCDC40-211ENST00000574099 SLIT2O94813 1529 aa26.4■■□□□ 1.82
CCDC40-211ENST00000574099 RGL3Q3MIN7 710 aa26.39■■□□□ 1.82
CCDC40-211ENST00000574099 UNC5CLQ8IV45 518 aa26.39■■□□□ 1.82
CCDC40-211ENST00000574099 TMEM132EQ6IEE7 984 aa26.38■■□□□ 1.81
CCDC40-211ENST00000574099 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa26.38■■□□□ 1.81
CCDC40-211ENST00000574099 CCDC144AA2RUR9 1427 aa26.37■■□□□ 1.81
CCDC40-211ENST00000574099 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP26.37■■□□□ 1.81
CCDC40-211ENST00000574099 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP26.36■■□□□ 1.81
CCDC40-211ENST00000574099 PLEKHG5O94827 1062 aa26.36■■□□□ 1.81
CCDC40-211ENST00000574099 DEFB132Q7Z7B7 95 aa26.34■■□□□ 1.81
CCDC40-211ENST00000574099 PLCH1Q4KWH8 1693 aa26.34■■□□□ 1.81
CCDC40-211ENST00000574099 ABCC11Q96J66 1382 aa26.33■■□□□ 1.81
CCDC40-211ENST00000574099 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa26.33■■□□□ 1.81
CCDC40-211ENST00000574099 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP26.33■■□□□ 1.81
CCDC40-211ENST00000574099 KRT28Q7Z3Y7 464 aa26.32■■□□□ 1.8
CCDC40-211ENST00000574099 PIK3C2GO75747 1445 aa26.31■■□□□ 1.8
CCDC40-211ENST00000574099 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa26.31■■□□□ 1.8
CCDC40-211ENST00000574099 ABCA3Q99758 1704 aa26.31■■□□□ 1.8
CCDC40-211ENST00000574099 TNS3Q68CZ2 1445 aa26.31■■□□□ 1.8
CCDC40-211ENST00000574099 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP26.31■■□□□ 1.8
CCDC40-211ENST00000574099 CABLES1Q8TDN4 633 aa26.3■■□□□ 1.8
CCDC40-211ENST00000574099 SEPT12Q8IYM1 358 aa26.29■■□□□ 1.8
CCDC40-211ENST00000574099 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP26.28■■□□□ 1.8
CCDC40-211ENST00000574099 NWD2Q9ULI1 1742 aa26.28■■□□□ 1.8
CCDC40-211ENST00000574099 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP26.27■■□□□ 1.8
CCDC40-211ENST00000574099 PHF8Q9UPP1 1060 aa26.25■■□□□ 1.79
CCDC40-211ENST00000574099 VPS72Q15906 364 aa26.24■■□□□ 1.79
CCDC40-211ENST00000574099 LMOD2Q6P5Q4 547 aa26.24■■□□□ 1.79
CCDC40-211ENST00000574099 PSME1Q06323 249 aa26.22■■□□□ 1.79
CCDC40-211ENST00000574099 NRXN1Q9ULB1 1477 aa26.22■■□□□ 1.79
CCDC40-211ENST00000574099 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP26.21■■□□□ 1.79
CCDC40-211ENST00000574099 LRP5O75197 1615 aa26.21■■□□□ 1.79
CCDC40-211ENST00000574099 A0A0G2JS52 829 aa26.2■■□□□ 1.78
CCDC40-211ENST00000574099 MYT1Q01538 1121 aa26.2■■□□□ 1.78
CCDC40-211ENST00000574099 MPHOSPH9Q99550 1183 aa26.2■■□□□ 1.78
CCDC40-211ENST00000574099 KRT27Q7Z3Y8 459 aa26.19■■□□□ 1.78
CCDC40-211ENST00000574099 SBNO1A3KN83 1393 aa26.19■■□□□ 1.78
CCDC40-211ENST00000574099 NRAPQ86VF7 1730 aa26.18■■□□□ 1.78
CCDC40-211ENST00000574099 ARHGEF10O15013 1369 aa26.17■■□□□ 1.78
CCDC40-211ENST00000574099 SIRT1Q96EB6 747 aa26.16■■□□□ 1.78
CCDC40-211ENST00000574099 PSDA5PKW4 1024 aaPredicted RBP26.15■■□□□ 1.78
CCDC40-211ENST00000574099 CFAP70Q5T0N1 1121 aa26.15■■□□□ 1.78
CCDC40-211ENST00000574099 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa26.15■■□□□ 1.78
CCDC40-211ENST00000574099 PRAM1Q96QH2 718 aa26.15■■□□□ 1.78
CCDC40-211ENST00000574099 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP26.15■■□□□ 1.78
CCDC40-211ENST00000574099 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP26.15■■□□□ 1.78
CCDC40-211ENST00000574099 FAM83GA6ND36 823 aa26.14■■□□□ 1.78
CCDC40-211ENST00000574099 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP26.14■■□□□ 1.78
CCDC40-211ENST00000574099 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP26.12■■□□□ 1.77
CCDC40-211ENST00000574099 FAM98CQ17RN3 349 aaKnown RBP26.12■■□□□ 1.77
CCDC40-211ENST00000574099 BAG6P46379 1132 aa26.11■■□□□ 1.77
CCDC40-211ENST00000574099 ANKARQ7Z5J8 1434 aa26.09■■□□□ 1.77
CCDC40-211ENST00000574099 BTG4Q9NY30 223 aa26.09■■□□□ 1.77
CCDC40-211ENST00000574099 ALS2Q96Q42 1657 aa26.09■■□□□ 1.77
CCDC40-211ENST00000574099 ADGRB2O60241 1585 aa26.08■■□□□ 1.77
CCDC40-211ENST00000574099 COL14A1Q05707 1796 aaKnown RBP26.08■■□□□ 1.77
CCDC40-211ENST00000574099 POGKQ9P215 609 aa26.08■■□□□ 1.77
CCDC40-211ENST00000574099 RGPD1P0DJD0 1748 aa26.08■■□□□ 1.76
CCDC40-211ENST00000574099 DLC1Q96QB1 1528 aa26.07■■□□□ 1.76
CCDC40-211ENST00000574099 FAM182BQ5T319 152 aa26.06■■□□□ 1.76
CCDC40-211ENST00000574099 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP26.05■■□□□ 1.76
CCDC40-211ENST00000574099 HRCP23327 699 aa26.04■■□□□ 1.76
CCDC40-211ENST00000574099 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP26.03■■□□□ 1.76
CCDC40-211ENST00000574099 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa26.02■■□□□ 1.76
CCDC40-211ENST00000574099 GPRASP1Q5JY77 1395 aa26.02■■□□□ 1.76
CCDC40-211ENST00000574099 TNS1Q9HBL0 1735 aaKnown RBP26.02■■□□□ 1.76
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