RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000566180.5

RNPS1-218, Transcript of RNA binding protein with serine rich domain 1, humanhuman

TSL 5

Gene RNPS1, Length 814 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNPS1-218ENST00000566180 ADGRB1O14514 1584 aa31■■■□□ 2.55
RNPS1-218ENST00000566180 ORAI2Q96SN7 254 aa30.99■■■□□ 2.55
RNPS1-218ENST00000566180 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa30.98■■■□□ 2.55
RNPS1-218ENST00000566180 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP30.97■■■□□ 2.55
RNPS1-218ENST00000566180 PRAM1Q96QH2 718 aa30.96■■■□□ 2.55
RNPS1-218ENST00000566180 DLC1Q96QB1 1528 aa30.94■■■□□ 2.54
RNPS1-218ENST00000566180 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP30.94■■■□□ 2.54
RNPS1-218ENST00000566180 TRAK1Q9UPV9 953 aa30.94■■■□□ 2.54
RNPS1-218ENST00000566180 SIN3AQ96ST3 1273 aa30.93■■■□□ 2.54
RNPS1-218ENST00000566180 POGKQ9P215 609 aa30.92■■■□□ 2.54
RNPS1-218ENST00000566180 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP30.91■■■□□ 2.54
RNPS1-218ENST00000566180 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa30.91■■■□□ 2.54
RNPS1-218ENST00000566180 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP30.9■■■□□ 2.54
RNPS1-218ENST00000566180 ESCO1Q5FWF5 840 aa30.9■■■□□ 2.54
RNPS1-218ENST00000566180 NHSL1Q5SYE7 1610 aa30.88■■■□□ 2.53
RNPS1-218ENST00000566180 NUTM2FA1L443 756 aa30.88■■■□□ 2.53
RNPS1-218ENST00000566180 L3MBTL2Q969R5 705 aa30.88■■■□□ 2.53
RNPS1-218ENST00000566180 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP30.86■■■□□ 2.53
RNPS1-218ENST00000566180 NEUROD1Q13562 356 aa30.85■■■□□ 2.53
RNPS1-218ENST00000566180 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP30.85■■■□□ 2.53
RNPS1-218ENST00000566180 NPHP3Q7Z494 1330 aa30.81■■■□□ 2.52
RNPS1-218ENST00000566180 NBPF1Q3BBV0 1214 aa30.8■■■□□ 2.52
RNPS1-218ENST00000566180 SHPRHQ149N8 1683 aa30.8■■■□□ 2.52
RNPS1-218ENST00000566180 FOXO3O43524 673 aa30.79■■■□□ 2.52
RNPS1-218ENST00000566180 LRP6O75581 1613 aa30.79■■■□□ 2.52
RNPS1-218ENST00000566180 PNPLA6Q8IY17 1366 aa30.79■■■□□ 2.52
RNPS1-218ENST00000566180 FMN2Q9NZ56 1722 aa30.77■■■□□ 2.52
RNPS1-218ENST00000566180 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP30.76■■■□□ 2.52
RNPS1-218ENST00000566180 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP30.76■■■□□ 2.51
RNPS1-218ENST00000566180 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP30.75■■■□□ 2.51
RNPS1-218ENST00000566180 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP30.75■■■□□ 2.51
RNPS1-218ENST00000566180 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP30.75■■■□□ 2.51
RNPS1-218ENST00000566180 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa30.74■■■□□ 2.51
RNPS1-218ENST00000566180 SOCS7O14512 581 aa30.73■■■□□ 2.51
RNPS1-218ENST00000566180 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP30.73■■■□□ 2.51
RNPS1-218ENST00000566180 ADGRB2O60241 1585 aa30.73■■■□□ 2.51
RNPS1-218ENST00000566180 PHF8Q9UPP1 1060 aa30.72■■■□□ 2.51
RNPS1-218ENST00000566180 ANKARQ7Z5J8 1434 aa30.72■■■□□ 2.51
RNPS1-218ENST00000566180 PXDNQ92626 1479 aa30.71■■■□□ 2.51
RNPS1-218ENST00000566180 WASLO00401 505 aaPredicted RBP30.71■■■□□ 2.51
RNPS1-218ENST00000566180 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP30.71■■■□□ 2.51
RNPS1-218ENST00000566180 POTEAQ6S8J7 498 aa30.69■■■□□ 2.5
RNPS1-218ENST00000566180 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP30.68■■■□□ 2.5
RNPS1-218ENST00000566180 KRT28Q7Z3Y7 464 aa30.65■■■□□ 2.5
RNPS1-218ENST00000566180 PRR36Q9H6K5 1346 aa30.65■■■□□ 2.5
RNPS1-218ENST00000566180 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP30.64■■■□□ 2.5
RNPS1-218ENST00000566180 KIF1AQ12756 1690 aa30.64■■■□□ 2.5
RNPS1-218ENST00000566180 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa30.62■■■□□ 2.49
RNPS1-218ENST00000566180 TULP4Q9NRJ4 1543 aa30.62■■■□□ 2.49
RNPS1-218ENST00000566180 PSME1Q06323 249 aa30.61■■■□□ 2.49
RNPS1-218ENST00000566180 ZNF772Q68DY9 489 aaPredicted RBP30.61■■■□□ 2.49
RNPS1-218ENST00000566180 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa30.61■■■□□ 2.49
RNPS1-218ENST00000566180 NBPF8Q3BBV2 869 aa30.6■■■□□ 2.49
RNPS1-218ENST00000566180 USP32Q8NFA0 1604 aa30.6■■■□□ 2.49
RNPS1-218ENST00000566180 TONSLQ96HA7 1378 aa30.59■■■□□ 2.49
RNPS1-218ENST00000566180 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP30.59■■■□□ 2.49
RNPS1-218ENST00000566180 CDK19Q9BWU1 502 aa30.59■■■□□ 2.49
RNPS1-218ENST00000566180 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP30.57■■■□□ 2.48
RNPS1-218ENST00000566180 ADAMTS2O95450 1211 aa30.57■■■□□ 2.48
RNPS1-218ENST00000566180 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP30.57■■■□□ 2.48
RNPS1-218ENST00000566180 C8orf37Q96NL8 207 aa30.56■■■□□ 2.48
RNPS1-218ENST00000566180 AFF2P51816 1311 aa30.55■■■□□ 2.48
RNPS1-218ENST00000566180 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP30.55■■■□□ 2.48
RNPS1-218ENST00000566180 SBNO1A3KN83 1393 aa30.54■■■□□ 2.48
RNPS1-218ENST00000566180 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa30.54■■■□□ 2.48
RNPS1-218ENST00000566180 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP30.53■■■□□ 2.48
RNPS1-218ENST00000566180 ATP7BP35670 1465 aa30.52■■■□□ 2.48
RNPS1-218ENST00000566180 TNS3Q68CZ2 1445 aa30.51■■■□□ 2.47
RNPS1-218ENST00000566180 NGLY1Q96IV0 654 aa30.51■■■□□ 2.47
RNPS1-218ENST00000566180 PCGF6Q9BYE7 350 aa30.51■■■□□ 2.47
RNPS1-218ENST00000566180 GPRASP1Q5JY77 1395 aa30.51■■■□□ 2.47
RNPS1-218ENST00000566180 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP30.5■■■□□ 2.47
RNPS1-218ENST00000566180 CCDC61Q9Y6R9 512 aa30.49■■■□□ 2.47
RNPS1-218ENST00000566180 ARHGEF10O15013 1369 aa30.45■■■□□ 2.47
RNPS1-218ENST00000566180 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP30.45■■■□□ 2.47
RNPS1-218ENST00000566180 LMOD2Q6P5Q4 547 aa30.44■■■□□ 2.46
RNPS1-218ENST00000566180 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP30.44■■■□□ 2.46
RNPS1-218ENST00000566180 PLEKHG3A1L390 1219 aa30.43■■■□□ 2.46
RNPS1-218ENST00000566180 CARD11Q9BXL7 1154 aa30.43■■■□□ 2.46
RNPS1-218ENST00000566180 RXRBP28702 533 aa30.42■■■□□ 2.46
RNPS1-218ENST00000566180 CABP2Q9NPB3 220 aa30.42■■■□□ 2.46
RNPS1-218ENST00000566180 QTRT2Q9H974 415 aaKnown RBP30.41■■■□□ 2.46
RNPS1-218ENST00000566180 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP30.41■■■□□ 2.46
RNPS1-218ENST00000566180 RALGAPBQ86X10 1494 aa30.4■■■□□ 2.46
RNPS1-218ENST00000566180 CABLES1Q8TDN4 633 aa30.4■■■□□ 2.46
RNPS1-218ENST00000566180 USP21Q9UK80 565 aa30.4■■■□□ 2.46
RNPS1-218ENST00000566180 ACEP12821 1306 aa30.39■■■□□ 2.46
RNPS1-218ENST00000566180 EVC2Q86UK5 1308 aa30.38■■■□□ 2.45
RNPS1-218ENST00000566180 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP30.37■■■□□ 2.45
RNPS1-218ENST00000566180 CLSPNQ9HAW4 1339 aa30.37■■■□□ 2.45
RNPS1-218ENST00000566180 QRICH2Q9H0J4 1663 aa30.36■■■□□ 2.45
RNPS1-218ENST00000566180 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP30.36■■■□□ 2.45
RNPS1-218ENST00000566180 ITSN1Q15811 1721 aa30.35■■■□□ 2.45
RNPS1-218ENST00000566180 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP30.35■■■□□ 2.45
RNPS1-218ENST00000566180 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa30.34■■■□□ 2.45
RNPS1-218ENST00000566180 PLEKHG5O94827 1062 aa30.34■■■□□ 2.45
RNPS1-218ENST00000566180 RBM6P78332 1123 aaKnown RBP30.34■■■□□ 2.45
RNPS1-218ENST00000566180 TRPC5Q9UL62 973 aaPredicted RBP30.33■■■□□ 2.45
RNPS1-218ENST00000566180 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa30.33■■■□□ 2.45
RNPS1-218ENST00000566180 BCL9LQ86UU0 1499 aa30.31■■■□□ 2.44
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.5 ms