RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000563367.1

NME3-203, Transcript of NME/NM23 nucleoside diphosphate kinase 3, humanhuman

TSL 3

Gene NME3, Length 891 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME3-203ENST00000563367 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa41.06■■■■■ 4.16
NME3-203ENST00000563367 NHSL1Q5SYE7 1610 aa41.01■■■■■ 4.16
NME3-203ENST00000563367 DLC1Q96QB1 1528 aa41.01■■■■■ 4.16
NME3-203ENST00000563367 NEUROD1Q13562 356 aa40.99■■■■■ 4.15
NME3-203ENST00000563367 PRAM1Q96QH2 718 aa40.97■■■■■ 4.15
NME3-203ENST00000563367 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa40.97■■■■■ 4.15
NME3-203ENST00000563367 TRAK1Q9UPV9 953 aa40.97■■■■■ 4.15
NME3-203ENST00000563367 L3MBTL2Q969R5 705 aa40.96■■■■■ 4.15
NME3-203ENST00000563367 ORAI2Q96SN7 254 aa40.95■■■■■ 4.15
NME3-203ENST00000563367 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP40.94■■■■■ 4.14
NME3-203ENST00000563367 FMN2Q9NZ56 1722 aa40.93■■■■■ 4.14
NME3-203ENST00000563367 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP40.93■■■■■ 4.14
NME3-203ENST00000563367 JCADQ9P266 1359 aa40.92■■■■■ 4.14
NME3-203ENST00000563367 POGKQ9P215 609 aa40.9■■■■■ 4.14
NME3-203ENST00000563367 NUTM2FA1L443 756 aa40.88■■■■■ 4.13
NME3-203ENST00000563367 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP40.87■■■■■ 4.13
NME3-203ENST00000563367 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP40.86■■■■■ 4.13
NME3-203ENST00000563367 SHPRHQ149N8 1683 aa40.85■■■■■ 4.13
NME3-203ENST00000563367 NBPF1Q3BBV0 1214 aa40.85■■■■■ 4.13
NME3-203ENST00000563367 ESCO1Q5FWF5 840 aa40.83■■■■■ 4.13
NME3-203ENST00000563367 ILDR2Q71H61 639 aa40.82■■■■■ 4.13
NME3-203ENST00000563367 ADGRB2O60241 1585 aa40.79■■■■■ 4.12
NME3-203ENST00000563367 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP40.76■■■■■ 4.12
NME3-203ENST00000563367 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP40.76■■■■■ 4.12
NME3-203ENST00000563367 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP40.75■■■■■ 4.11
NME3-203ENST00000563367 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP40.75■■■■■ 4.11
NME3-203ENST00000563367 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP40.73■■■■■ 4.11
NME3-203ENST00000563367 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa40.73■■■■■ 4.11
NME3-203ENST00000563367 USP32Q8NFA0 1604 aa40.71■■■■■ 4.11
NME3-203ENST00000563367 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa40.71■■■■■ 4.11
NME3-203ENST00000563367 PCGF6Q9BYE7 350 aa40.71■■■■■ 4.11
NME3-203ENST00000563367 LRP6O75581 1613 aa40.71■■■■■ 4.11
NME3-203ENST00000563367 FOXO3O43524 673 aa40.69■■■■■ 4.1
NME3-203ENST00000563367 KIF1AQ12756 1690 aa40.69■■■■■ 4.1
NME3-203ENST00000563367 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP40.67■■■■■ 4.1
NME3-203ENST00000563367 NPHP3Q7Z494 1330 aa40.67■■■■■ 4.1
NME3-203ENST00000563367 PNPLA6Q8IY17 1366 aa40.66■■■■■ 4.1
NME3-203ENST00000563367 PXDNQ92626 1479 aa40.65■■■■■ 4.1
NME3-203ENST00000563367 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP40.63■■■■■ 4.09
NME3-203ENST00000563367 ANKARQ7Z5J8 1434 aa40.62■■■■■ 4.09
NME3-203ENST00000563367 WASLO00401 505 aaPredicted RBP40.62■■■■■ 4.09
NME3-203ENST00000563367 NBPF8Q3BBV2 869 aa40.62■■■■■ 4.09
NME3-203ENST00000563367 PHF8Q9UPP1 1060 aa40.61■■■■■ 4.09
NME3-203ENST00000563367 TONSLQ96HA7 1378 aa40.61■■■■■ 4.09
NME3-203ENST00000563367 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP40.6■■■■■ 4.09
NME3-203ENST00000563367 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP40.6■■■■■ 4.09
NME3-203ENST00000563367 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP40.6■■■■■ 4.09
NME3-203ENST00000563367 TULP4Q9NRJ4 1543 aa40.58■■■■■ 4.09
NME3-203ENST00000563367 PRR36Q9H6K5 1346 aa40.58■■■■■ 4.09
NME3-203ENST00000563367 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP40.54■■■■■ 4.08
NME3-203ENST00000563367 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP40.53■■■■■ 4.08
NME3-203ENST00000563367 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP40.53■■■■■ 4.08
NME3-203ENST00000563367 QRICH2Q9H0J4 1663 aa40.52■■■■■ 4.08
NME3-203ENST00000563367 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa40.51■■■■■ 4.08
NME3-203ENST00000563367 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP40.51■■■■■ 4.08
NME3-203ENST00000563367 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP40.5■■■■■ 4.07
NME3-203ENST00000563367 KRT28Q7Z3Y7 464 aa40.5■■■■■ 4.07
NME3-203ENST00000563367 CDK19Q9BWU1 502 aa40.49■■■■■ 4.07
NME3-203ENST00000563367 ATP7BP35670 1465 aa40.46■■■■■ 4.07
NME3-203ENST00000563367 ITSN1Q15811 1721 aa40.46■■■■■ 4.07
NME3-203ENST00000563367 POTEAQ6S8J7 498 aa40.45■■■■■ 4.07
NME3-203ENST00000563367 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP40.44■■■■■ 4.06
NME3-203ENST00000563367 GPRASP1Q5JY77 1395 aa40.44■■■■■ 4.06
NME3-203ENST00000563367 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa40.43■■■■■ 4.06
NME3-203ENST00000563367 PSME1Q06323 249 aa40.41■■■■■ 4.06
NME3-203ENST00000563367 RALGAPBQ86X10 1494 aa40.39■■■■■ 4.06
NME3-203ENST00000563367 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa40.39■■■■■ 4.06
NME3-203ENST00000563367 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP40.37■■■■■ 4.05
NME3-203ENST00000563367 ADAMTS2O95450 1211 aa40.37■■■■■ 4.05
NME3-203ENST00000563367 SBNO1A3KN83 1393 aa40.35■■■■■ 4.05
NME3-203ENST00000563367 TNS3Q68CZ2 1445 aa40.35■■■■■ 4.05
NME3-203ENST00000563367 C8orf37Q96NL8 207 aa40.33■■■■■ 4.05
NME3-203ENST00000563367 CARD11Q9BXL7 1154 aa40.32■■■■■ 4.05
NME3-203ENST00000563367 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP40.31■■■■■ 4.04
NME3-203ENST00000563367 SOCS7O14512 581 aa40.31■■■■■ 4.04
NME3-203ENST00000563367 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP40.31■■■■■ 4.04
NME3-203ENST00000563367 AFF2P51816 1311 aa40.31■■■■■ 4.04
NME3-203ENST00000563367 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP40.3■■■■■ 4.04
NME3-203ENST00000563367 CABP2Q9NPB3 220 aa40.3■■■■■ 4.04
NME3-203ENST00000563367 CCDC61Q9Y6R9 512 aa40.3■■■■■ 4.04
NME3-203ENST00000563367 CLSPNQ9HAW4 1339 aa40.3■■■■■ 4.04
NME3-203ENST00000563367 ZNF772Q68DY9 489 aaPredicted RBP40.29■■■■■ 4.04
NME3-203ENST00000563367 ALS2Q96Q42 1657 aa40.27■■■■■ 4.04
NME3-203ENST00000563367 LMOD2Q6P5Q4 547 aa40.24■■■■■ 4.03
NME3-203ENST00000563367 NGLY1Q96IV0 654 aa40.24■■■■■ 4.03
NME3-203ENST00000563367 PLEKHG3A1L390 1219 aa40.23■■■■■ 4.03
NME3-203ENST00000563367 ARHGEF10O15013 1369 aa40.23■■■■■ 4.03
NME3-203ENST00000563367 ABCA3Q99758 1704 aa40.22■■■■■ 4.03
NME3-203ENST00000563367 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP40.22■■■■■ 4.03
NME3-203ENST00000563367 ACEP12821 1306 aa40.21■■■■■ 4.03
NME3-203ENST00000563367 EVC2Q86UK5 1308 aa40.21■■■■■ 4.03
NME3-203ENST00000563367 CABLES1Q8TDN4 633 aa40.21■■■■■ 4.03
NME3-203ENST00000563367 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa40.2■■■■■ 4.03
NME3-203ENST00000563367 PLEKHG5O94827 1062 aa40.19■■■■■ 4.02
NME3-203ENST00000563367 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP40.15■■■■■ 4.02
NME3-203ENST00000563367 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP40.15■■■■■ 4.02
NME3-203ENST00000563367 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa40.14■■■■■ 4.02
NME3-203ENST00000563367 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP40.14■■■■■ 4.02
NME3-203ENST00000563367 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa40.13■■■■■ 4.01
NME3-203ENST00000563367 CABP1Q9NZU7 370 aa40.11■■■■■ 4.01
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 69.3 ms