RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000561868.1

SPNS1-205, Transcript of sphingolipid transporter 1 (putative), humanhuman

TSL 5

Gene SPNS1, Length 441 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPNS1-205ENST00000561868 RGS12O14924 1447 aa23.13■■□□□ 1.29
SPNS1-205ENST00000561868 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP23.12■■□□□ 1.29
SPNS1-205ENST00000561868 ORAI2Q96SN7 254 aa23.12■■□□□ 1.29
SPNS1-205ENST00000561868 NPHP3Q7Z494 1330 aa23.11■■□□□ 1.29
SPNS1-205ENST00000561868 ADAMTS2O95450 1211 aa23.1■■□□□ 1.29
SPNS1-205ENST00000561868 TRPC5Q9UL62 973 aaPredicted RBP23.09■■□□□ 1.29
SPNS1-205ENST00000561868 CCDC144AA2RUR9 1427 aa23.08■■□□□ 1.29
SPNS1-205ENST00000561868 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP23.08■■□□□ 1.29
SPNS1-205ENST00000561868 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa23.08■■□□□ 1.29
SPNS1-205ENST00000561868 USP21Q9UK80 565 aa23.07■■□□□ 1.28
SPNS1-205ENST00000561868 TECPR2O15040 1411 aa23.07■■□□□ 1.28
SPNS1-205ENST00000561868 ATAD2Q6PL18 1390 aa23.06■■□□□ 1.28
SPNS1-205ENST00000561868 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP23.06■■□□□ 1.28
SPNS1-205ENST00000561868 KNDC1Q76NI1 1749 aa23.05■■□□□ 1.28
SPNS1-205ENST00000561868 IFT172Q9UG01 1749 aa23.05■■□□□ 1.28
SPNS1-205ENST00000561868 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP23.05■■□□□ 1.28
SPNS1-205ENST00000561868 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP23.04■■□□□ 1.28
SPNS1-205ENST00000561868 ESCO1Q5FWF5 840 aa23.04■■□□□ 1.28
SPNS1-205ENST00000561868 MYOM2P54296 1465 aa23.03■■□□□ 1.28
SPNS1-205ENST00000561868 PXDNQ92626 1479 aa23.02■■□□□ 1.28
SPNS1-205ENST00000561868 ATRNO75882 1429 aa23.01■■□□□ 1.27
SPNS1-205ENST00000561868 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa23.01■■□□□ 1.27
SPNS1-205ENST00000561868 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa23.01■■□□□ 1.27
SPNS1-205ENST00000561868 ABCC11Q96J66 1382 aa23.01■■□□□ 1.27
SPNS1-205ENST00000561868 KIF1AQ12756 1690 aa23■■□□□ 1.27
SPNS1-205ENST00000561868 FOXO3O43524 673 aa22.97■■□□□ 1.27
SPNS1-205ENST00000561868 RGL3Q3MIN7 710 aa22.97■■□□□ 1.27
SPNS1-205ENST00000561868 PIK3C2GO75747 1445 aa22.97■■□□□ 1.27
SPNS1-205ENST00000561868 FMN2Q9NZ56 1722 aa22.96■■□□□ 1.27
SPNS1-205ENST00000561868 STK26Q9P289 416 aa22.96■■□□□ 1.27
SPNS1-205ENST00000561868 TNKS1BP1Q9C0C2 1729 aaKnown RBP22.96■■□□□ 1.27
SPNS1-205ENST00000561868 SIRT1Q96EB6 747 aa22.95■■□□□ 1.26
SPNS1-205ENST00000561868 CCDC125Q86Z20 511 aa22.94■■□□□ 1.26
SPNS1-205ENST00000561868 WAPLQ7Z5K2 1190 aa22.93■■□□□ 1.26
SPNS1-205ENST00000561868 BCL9LQ86UU0 1499 aa22.92■■□□□ 1.26
SPNS1-205ENST00000561868 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP22.92■■□□□ 1.26
SPNS1-205ENST00000561868 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa22.89■■□□□ 1.26
SPNS1-205ENST00000561868 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP22.89■■□□□ 1.25
SPNS1-205ENST00000561868 TMEM132EQ6IEE7 984 aa22.89■■□□□ 1.25
SPNS1-205ENST00000561868 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP22.89■■□□□ 1.25
SPNS1-205ENST00000561868 NUTM2FA1L443 756 aa22.88■■□□□ 1.25
SPNS1-205ENST00000561868 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP22.88■■□□□ 1.25
SPNS1-205ENST00000561868 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa22.88■■□□□ 1.25
SPNS1-205ENST00000561868 PSME1Q06323 249 aa22.87■■□□□ 1.25
SPNS1-205ENST00000561868 UNC5CLQ8IV45 518 aa22.86■■□□□ 1.25
SPNS1-205ENST00000561868 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP22.86■■□□□ 1.25
SPNS1-205ENST00000561868 USP32Q8NFA0 1604 aa22.86■■□□□ 1.25
SPNS1-205ENST00000561868 NRXN1Q9ULB1 1477 aa22.85■■□□□ 1.25
SPNS1-205ENST00000561868 KRT28Q7Z3Y7 464 aa22.85■■□□□ 1.25
SPNS1-205ENST00000561868 ZRANB1Q9UGI0 708 aa22.85■■□□□ 1.25
SPNS1-205ENST00000561868 SLIT2O94813 1529 aa22.85■■□□□ 1.25
SPNS1-205ENST00000561868 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP22.84■■□□□ 1.25
SPNS1-205ENST00000561868 TNS3Q68CZ2 1445 aa22.83■■□□□ 1.25
SPNS1-205ENST00000561868 PHF8Q9UPP1 1060 aa22.83■■□□□ 1.25
SPNS1-205ENST00000561868 NWD2Q9ULI1 1742 aa22.82■■□□□ 1.24
SPNS1-205ENST00000561868 SBNO1A3KN83 1393 aa22.81■■□□□ 1.24
SPNS1-205ENST00000561868 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP22.81■■□□□ 1.24
SPNS1-205ENST00000561868 EP400Q96L91 3159 aa22.81■■□□□ 1.24
SPNS1-205ENST00000561868 DLC1Q96QB1 1528 aa22.81■■□□□ 1.24
SPNS1-205ENST00000561868 RALGAPBQ86X10 1494 aa22.8■■□□□ 1.24
SPNS1-205ENST00000561868 ARHGEF10O15013 1369 aa22.8■■□□□ 1.24
SPNS1-205ENST00000561868 STAC3Q96MF2 364 aa22.8■■□□□ 1.24
SPNS1-205ENST00000561868 GLI3P10071 1580 aa22.8■■□□□ 1.24
SPNS1-205ENST00000561868 ANKARQ7Z5J8 1434 aa22.79■■□□□ 1.24
SPNS1-205ENST00000561868 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP22.76■■□□□ 1.23
SPNS1-205ENST00000561868 CFAP70Q5T0N1 1121 aa22.76■■□□□ 1.23
SPNS1-205ENST00000561868 PLCH1Q4KWH8 1693 aa22.76■■□□□ 1.23
SPNS1-205ENST00000561868 ADGRB2O60241 1585 aa22.76■■□□□ 1.23
SPNS1-205ENST00000561868 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP22.76■■□□□ 1.23
SPNS1-205ENST00000561868 ABCA3Q99758 1704 aa22.75■■□□□ 1.23
SPNS1-205ENST00000561868 PRAM1Q96QH2 718 aa22.75■■□□□ 1.23
SPNS1-205ENST00000561868 POGKQ9P215 609 aa22.75■■□□□ 1.23
SPNS1-205ENST00000561868 BRWD3Q6RI45 1802 aa22.74■■□□□ 1.23
SPNS1-205ENST00000561868 VPS72Q15906 364 aa22.74■■□□□ 1.23
SPNS1-205ENST00000561868 DCAF11Q8TEB1 546 aa22.73■■□□□ 1.23
SPNS1-205ENST00000561868 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP22.72■■□□□ 1.23
SPNS1-205ENST00000561868 LMOD2Q6P5Q4 547 aa22.7■■□□□ 1.22
SPNS1-205ENST00000561868 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP22.69■■□□□ 1.22
SPNS1-205ENST00000561868 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP22.69■■□□□ 1.22
SPNS1-205ENST00000561868 SEPT12Q8IYM1 358 aa22.69■■□□□ 1.22
SPNS1-205ENST00000561868 ADGRB1O14514 1584 aa22.68■■□□□ 1.22
SPNS1-205ENST00000561868 GPRASP1Q5JY77 1395 aa22.68■■□□□ 1.22
SPNS1-205ENST00000561868 SIN3AQ96ST3 1273 aa22.68■■□□□ 1.22
SPNS1-205ENST00000561868 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa22.68■■□□□ 1.22
SPNS1-205ENST00000561868 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP22.68■■□□□ 1.22
SPNS1-205ENST00000561868 CABLES1Q8TDN4 633 aa22.67■■□□□ 1.22
SPNS1-205ENST00000561868 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP22.67■■□□□ 1.22
SPNS1-205ENST00000561868 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa22.66■■□□□ 1.22
SPNS1-205ENST00000561868 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa22.65■■□□□ 1.22
SPNS1-205ENST00000561868 TULP4Q9NRJ4 1543 aa22.65■■□□□ 1.22
SPNS1-205ENST00000561868 ALS2Q96Q42 1657 aa22.65■■□□□ 1.22
SPNS1-205ENST00000561868 COL14A1Q05707 1796 aaKnown RBP22.64■■□□□ 1.22
SPNS1-205ENST00000561868 KRT27Q7Z3Y8 459 aa22.64■■□□□ 1.21
SPNS1-205ENST00000561868 NRAPQ86VF7 1730 aa22.63■■□□□ 1.21
SPNS1-205ENST00000561868 PCGF6Q9BYE7 350 aa22.63■■□□□ 1.21
SPNS1-205ENST00000561868 TRAK1Q9UPV9 953 aa22.63■■□□□ 1.21
SPNS1-205ENST00000561868 FAM83GA6ND36 823 aa22.62■■□□□ 1.21
SPNS1-205ENST00000561868 ITSN1Q15811 1721 aa22.62■■□□□ 1.21
SPNS1-205ENST00000561868 L3MBTL2Q969R5 705 aa22.61■■□□□ 1.21
SPNS1-205ENST00000561868 WASLO00401 505 aaPredicted RBP22.6■■□□□ 1.21
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