RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560957.1

AKAP13-223, Transcript of A-kinase anchoring protein 13, human

TSL 3

Gene AKAP13, Length 751 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
AKAP13-223	ENST00000560957	MRGPRX2	Q96LB1	330 aa		7.64	□□□□□ -1.19
AKAP13-223	ENST00000560957	REPIN1	Q9BWE0	567 aa	Known RBP	7.64	□□□□□ -1.19
AKAP13-223	ENST00000560957	NPAS3	Q8IXF0	933 aa		7.63	□□□□□ -1.19
AKAP13-223	ENST00000560957	ZSCAN1	Q8NBB4	408 aa		7.63	□□□□□ -1.19
AKAP13-223	ENST00000560957	RDH13	Q8NBN7	331 aa		7.63	□□□□□ -1.19
AKAP13-223	ENST00000560957	HPS1	Q92902	700 aa		7.63	□□□□□ -1.19
AKAP13-223	ENST00000560957	DAXX	Q9UER7	740 aa	Predicted RBP	7.63	□□□□□ -1.19
AKAP13-223	ENST00000560957	NXF1	Q9UBU9	619 aa	Known RBP	7.62	□□□□□ -1.19
AKAP13-223	ENST00000560957	GMPR	P36959	345 aa		7.61	□□□□□ -1.19
AKAP13-223	ENST00000560957	GCGR	P47871	477 aa		7.61	□□□□□ -1.19
AKAP13-223	ENST00000560957	MMP16	P51512	607 aa		7.61	□□□□□ -1.19
AKAP13-223	ENST00000560957	HIC1	Q14526	733 aa		7.61	□□□□□ -1.19
AKAP13-223	ENST00000560957	PAXIP1	Q6ZW49	1069 aa	Predicted RBP	7.61	□□□□□ -1.19
AKAP13-223	ENST00000560957	KCNV2	Q8TDN2	545 aa		7.6	□□□□□ -1.19
AKAP13-223	ENST00000560957	CFAP44	Q96MT7	982 aa		7.6	□□□□□ -1.19
AKAP13-223	ENST00000560957	RNF19B	Q6ZMZ0	732 aa		7.59	□□□□□ -1.19
AKAP13-223	ENST00000560957	IRF7	Q92985	503 aa		7.59	□□□□□ -1.19
AKAP13-223	ENST00000560957	DDX11L8	A8MPP1	907 aa		7.58	□□□□□ -1.2
AKAP13-223	ENST00000560957	FECH	P22830	423 aa		7.58	□□□□□ -1.2
AKAP13-223	ENST00000560957	SULF1	Q8IWU6	871 aa		7.58	□□□□□ -1.2
AKAP13-223	ENST00000560957	WNT7B	P56706	349 aa		7.56	□□□□□ -1.2
AKAP13-223	ENST00000560957		Q3C1V9	767 aa		7.56	□□□□□ -1.2
AKAP13-223	ENST00000560957	GRIPAP1	Q4V328	841 aa		7.56	□□□□□ -1.2
AKAP13-223	ENST00000560957		H3BM21	787 aa		7.55	□□□□□ -1.2
AKAP13-223	ENST00000560957	DXO	O77932	396 aa	Known RBP	7.55	□□□□□ -1.2
AKAP13-223	ENST00000560957	RC3H1	Q5TC82	1133 aa	Known RBP	7.55	□□□□□ -1.2
AKAP13-223	ENST00000560957	SKOR1	P84550	965 aa		7.54	□□□□□ -1.2
AKAP13-223	ENST00000560957	SUZ12	Q15022	739 aa	Known RBP	7.53	□□□□□ -1.2
AKAP13-223	ENST00000560957	GNPAT	O15228	680 aa		7.52	□□□□□ -1.21
AKAP13-223	ENST00000560957	TRIM46	Q7Z4K8	759 aa		7.52	□□□□□ -1.21
AKAP13-223	ENST00000560957	ERBB4	Q15303	1308 aa		7.52	□□□□□ -1.21
AKAP13-223	ENST00000560957	USB1	Q9BQ65	265 aa	Known RBP	7.51	□□□□□ -1.21
AKAP13-223	ENST00000560957	ALDH1A1	P00352	501 aa		7.5	□□□□□ -1.21
AKAP13-223	ENST00000560957	BMP1	P13497	986 aa		7.49	□□□□□ -1.21
AKAP13-223	ENST00000560957	VEGFB	P49765	207 aa		7.49	□□□□□ -1.21
AKAP13-223	ENST00000560957	NLRP7	Q8WX94	980 aa		7.49	□□□□□ -1.21
AKAP13-223	ENST00000560957	SEMA3E	O15041	775 aa		7.48	□□□□□ -1.21
AKAP13-223	ENST00000560957	CAPN5	O15484	640 aa	Predicted RBP	7.48	□□□□□ -1.21
AKAP13-223	ENST00000560957	SIAH2	O43255	324 aa		7.48	□□□□□ -1.21
AKAP13-223	ENST00000560957	PHOX2B	Q99453	314 aa		7.48	□□□□□ -1.21
AKAP13-223	ENST00000560957	GPR37	O15354	613 aa		7.47	□□□□□ -1.21
AKAP13-223	ENST00000560957	CCDC24	Q8N4L8	307 aa		7.47	□□□□□ -1.21
AKAP13-223	ENST00000560957	VSIG8	P0DPA2	414 aa		7.46	□□□□□ -1.22
AKAP13-223	ENST00000560957	P3H3	Q8IVL6	736 aa		7.46	□□□□□ -1.22
AKAP13-223	ENST00000560957	KCNMA1	Q12791	1236 aa		7.45	□□□□□ -1.22
AKAP13-223	ENST00000560957	CD46	P15529	392 aa		7.44	□□□□□ -1.22
AKAP13-223	ENST00000560957	EHBP1	Q8NDI1	1231 aa		7.44	□□□□□ -1.22
AKAP13-223	ENST00000560957	WASF2	Q9Y6W5	498 aa		7.44	□□□□□ -1.22
AKAP13-223	ENST00000560957	RBM26	Q5T8P6	1007 aa	Known RBP	7.43	□□□□□ -1.22
AKAP13-223	ENST00000560957	ZFP42	Q96MM3	310 aa		7.43	□□□□□ -1.22
AKAP13-223	ENST00000560957	KDM4A	O75164	1064 aa		7.42	□□□□□ -1.22
AKAP13-223	ENST00000560957	GSK3A	P49840	483 aa		7.42	□□□□□ -1.22
AKAP13-223	ENST00000560957	USP46	P62068	366 aa		7.42	□□□□□ -1.22
AKAP13-223	ENST00000560957	TESPA1	A2RU30	521 aa	Predicted RBP	7.41	□□□□□ -1.22
AKAP13-223	ENST00000560957	JUND	P17535	347 aa		7.41	□□□□□ -1.22
AKAP13-223	ENST00000560957	TSHZ2	Q9NRE2	1034 aa		7.41	□□□□□ -1.22
AKAP13-223	ENST00000560957	RTN4	Q9NQC3	1192 aa	Known RBP	7.4	□□□□□ -1.22
AKAP13-223	ENST00000560957	AMER1	Q5JTC6	1135 aa	Predicted RBP	7.39	□□□□□ -1.23
AKAP13-223	ENST00000560957	SMYD5	Q6GMV2	418 aa		7.39	□□□□□ -1.23
AKAP13-223	ENST00000560957	KCTD17	Q8N5Z5	321 aa		7.39	□□□□□ -1.23
AKAP13-223	ENST00000560957	HLA-C	Q95604	372 aa		7.38	□□□□□ -1.23
AKAP13-223	ENST00000560957	NUDT12	Q9BQG2	462 aa		7.38	□□□□□ -1.23
AKAP13-223	ENST00000560957	HOXA2	O43364	376 aa		7.37	□□□□□ -1.23
AKAP13-223	ENST00000560957	PTCRA	Q6ISU1	281 aa	Predicted RBP	7.37	□□□□□ -1.23
AKAP13-223	ENST00000560957	MRPL14	Q6P1L8	145 aa	Known RBP	7.37	□□□□□ -1.23
AKAP13-223	ENST00000560957	SH3BP2	P78314	561 aa		7.36	□□□□□ -1.23
AKAP13-223	ENST00000560957	SCARF1	Q14162	830 aa		7.36	□□□□□ -1.23
AKAP13-223	ENST00000560957	MPND	Q8N594	471 aa		7.36	□□□□□ -1.23
AKAP13-223	ENST00000560957	TMEM151A	Q8N4L1	468 aa		7.35	□□□□□ -1.23
AKAP13-223	ENST00000560957	RETREG3	Q86VR2	466 aa		7.34	□□□□□ -1.23
AKAP13-223	ENST00000560957	PLEKHG3	A1L390	1219 aa		7.33	□□□□□ -1.24
AKAP13-223	ENST00000560957	NNT	Q13423	1086 aa		7.33	□□□□□ -1.24
AKAP13-223	ENST00000560957	PURB	Q96QR8	312 aa	Known RBP	7.33	□□□□□ -1.24
AKAP13-223	ENST00000560957	TLL2	Q9Y6L7	1015 aa		7.33	□□□□□ -1.24
AKAP13-223	ENST00000560957	RNF225	M0QZC1	329 aa	Predicted RBP	7.32	□□□□□ -1.24
AKAP13-223	ENST00000560957	GDF11	O95390	407 aa		7.32	□□□□□ -1.24
AKAP13-223	ENST00000560957	ADH1C	P00326	375 aa		7.32	□□□□□ -1.24
AKAP13-223	ENST00000560957	CCNYL3	P0C7X3	344 aa		7.32	□□□□□ -1.24
AKAP13-223	ENST00000560957	TIMP2	P16035	220 aa		7.32	□□□□□ -1.24
AKAP13-223	ENST00000560957	RASSF7	Q02833	373 aa		7.32	□□□□□ -1.24
AKAP13-223	ENST00000560957	SOBP	A7XYQ1	873 aa		7.31	□□□□□ -1.24
AKAP13-223	ENST00000560957	GUCA2A	Q02747	115 aa		7.31	□□□□□ -1.24
AKAP13-223	ENST00000560957	SYMPK	Q92797	1274 aa	Known RBP	7.31	□□□□□ -1.24
AKAP13-223	ENST00000560957	VARS	P26640	1264 aa	Known RBP	7.3	□□□□□ -1.24
AKAP13-223	ENST00000560957	KLF16	Q9BXK1	252 aa	Predicted RBP	7.3	□□□□□ -1.24
AKAP13-223	ENST00000560957	MS4A1	P11836	297 aa		7.29	□□□□□ -1.24
AKAP13-223	ENST00000560957	WDR4	P57081	412 aa	Known RBP	7.29	□□□□□ -1.24
AKAP13-223	ENST00000560957	UNC93B1	Q9H1C4	597 aa		7.29	□□□□□ -1.24
AKAP13-223	ENST00000560957	PPFIA3	O75145	1194 aa		7.28	□□□□□ -1.24
AKAP13-223	ENST00000560957	PTPRN	Q16849	979 aa		7.28	□□□□□ -1.24
AKAP13-223	ENST00000560957	GPIHBP1	Q8IV16	184 aa		7.28	□□□□□ -1.24
AKAP13-223	ENST00000560957	MAN1A2	O60476	641 aa		7.27	□□□□□ -1.25
AKAP13-223	ENST00000560957	MAP2K5	Q13163	448 aa		7.27	□□□□□ -1.25
AKAP13-223	ENST00000560957	ZNF511	Q8NB15	262 aa		7.27	□□□□□ -1.25
AKAP13-223	ENST00000560957	BAP1	Q92560	729 aa		7.27	□□□□□ -1.25
AKAP13-223	ENST00000560957	EVA1B	Q9NVM1	165 aa		7.27	□□□□□ -1.25
AKAP13-223	ENST00000560957	MDM2	Q00987	491 aa	Predicted RBP	7.26	□□□□□ -1.25
AKAP13-223	ENST00000560957	LINC01559	Q495D7	138 aa		7.26	□□□□□ -1.25
AKAP13-223	ENST00000560957	ADAMTS8	Q9UP79	889 aa		7.26	□□□□□ -1.25
AKAP13-223	ENST00000560957	IGHA1	P01876	353 aa		7.24	□□□□□ -1.25

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