RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560587.1

ZNF280D-215, Transcript of zinc finger protein 280D, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene ZNF280D, Length 1,441 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF280D-215ENST00000560587 SIRT1Q96EB6 747 aa36.03■■■■□ 3.36
ZNF280D-215ENST00000560587 DLC1Q96QB1 1528 aa36.02■■■■□ 3.36
ZNF280D-215ENST00000560587 JCADQ9P266 1359 aa36.02■■■■□ 3.36
ZNF280D-215ENST00000560587 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP35.95■■■■□ 3.35
ZNF280D-215ENST00000560587 PRAM1Q96QH2 718 aa35.94■■■■□ 3.34
ZNF280D-215ENST00000560587 FMN2Q9NZ56 1722 aa35.94■■■■□ 3.34
ZNF280D-215ENST00000560587 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa35.94■■■■□ 3.34
ZNF280D-215ENST00000560587 SHPRHQ149N8 1683 aa35.93■■■■□ 3.34
ZNF280D-215ENST00000560587 ORAI2Q96SN7 254 aa35.91■■■■□ 3.34
ZNF280D-215ENST00000560587 SIN3AQ96ST3 1273 aa35.9■■■■□ 3.34
ZNF280D-215ENST00000560587 POGKQ9P215 609 aa35.9■■■■□ 3.34
ZNF280D-215ENST00000560587 TRAK1Q9UPV9 953 aa35.9■■■■□ 3.34
ZNF280D-215ENST00000560587 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP35.88■■■■□ 3.33
ZNF280D-215ENST00000560587 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP35.86■■■■□ 3.33
ZNF280D-215ENST00000560587 ADGRB2O60241 1585 aa35.85■■■■□ 3.33
ZNF280D-215ENST00000560587 NEUROD1Q13562 356 aa35.85■■■■□ 3.33
ZNF280D-215ENST00000560587 ESCO1Q5FWF5 840 aa35.85■■■■□ 3.33
ZNF280D-215ENST00000560587 ILDR2Q71H61 639 aa35.85■■■■□ 3.33
ZNF280D-215ENST00000560587 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa35.85■■■■□ 3.33
ZNF280D-215ENST00000560587 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP35.85■■■■□ 3.33
ZNF280D-215ENST00000560587 NUTM2FA1L443 756 aa35.83■■■■□ 3.33
ZNF280D-215ENST00000560587 L3MBTL2Q969R5 705 aa35.83■■■■□ 3.33
ZNF280D-215ENST00000560587 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP35.83■■■■□ 3.33
ZNF280D-215ENST00000560587 KIF1AQ12756 1690 aa35.79■■■■□ 3.32
ZNF280D-215ENST00000560587 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP35.77■■■■□ 3.32
ZNF280D-215ENST00000560587 NPHP3Q7Z494 1330 aa35.77■■■■□ 3.32
ZNF280D-215ENST00000560587 LRP6O75581 1613 aa35.77■■■■□ 3.32
ZNF280D-215ENST00000560587 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP35.73■■■■□ 3.31
ZNF280D-215ENST00000560587 PNPLA6Q8IY17 1366 aa35.73■■■■□ 3.31
ZNF280D-215ENST00000560587 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP35.73■■■■□ 3.31
ZNF280D-215ENST00000560587 NBPF1Q3BBV0 1214 aa35.72■■■■□ 3.31
ZNF280D-215ENST00000560587 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP35.72■■■■□ 3.31
ZNF280D-215ENST00000560587 ANKARQ7Z5J8 1434 aa35.71■■■■□ 3.31
ZNF280D-215ENST00000560587 PXDNQ92626 1479 aa35.71■■■■□ 3.31
ZNF280D-215ENST00000560587 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP35.7■■■■□ 3.31
ZNF280D-215ENST00000560587 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa35.7■■■■□ 3.31
ZNF280D-215ENST00000560587 FOXO3O43524 673 aa35.69■■■■□ 3.3
ZNF280D-215ENST00000560587 USP32Q8NFA0 1604 aa35.69■■■■□ 3.3
ZNF280D-215ENST00000560587 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP35.68■■■■□ 3.3
ZNF280D-215ENST00000560587 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP35.66■■■■□ 3.3
ZNF280D-215ENST00000560587 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP35.66■■■■□ 3.3
ZNF280D-215ENST00000560587 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP35.66■■■■□ 3.3
ZNF280D-215ENST00000560587 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP35.66■■■■□ 3.3
ZNF280D-215ENST00000560587 TULP4Q9NRJ4 1543 aa35.66■■■■□ 3.3
ZNF280D-215ENST00000560587 PHF8Q9UPP1 1060 aa35.65■■■■□ 3.3
ZNF280D-215ENST00000560587 TONSLQ96HA7 1378 aa35.63■■■■□ 3.29
ZNF280D-215ENST00000560587 WASLO00401 505 aaPredicted RBP35.63■■■■□ 3.29
ZNF280D-215ENST00000560587 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP35.63■■■■□ 3.29
ZNF280D-215ENST00000560587 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP35.61■■■■□ 3.29
ZNF280D-215ENST00000560587 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP35.58■■■■□ 3.29
ZNF280D-215ENST00000560587 ITSN1Q15811 1721 aa35.55■■■■□ 3.28
ZNF280D-215ENST00000560587 PRR36Q9H6K5 1346 aa35.55■■■■□ 3.28
ZNF280D-215ENST00000560587 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP35.55■■■■□ 3.28
ZNF280D-215ENST00000560587 QRICH2Q9H0J4 1663 aa35.54■■■■□ 3.28
ZNF280D-215ENST00000560587 ATP7BP35670 1465 aa35.53■■■■□ 3.28
ZNF280D-215ENST00000560587 SOCS7O14512 581 aa35.53■■■■□ 3.28
ZNF280D-215ENST00000560587 KRT28Q7Z3Y7 464 aa35.53■■■■□ 3.28
ZNF280D-215ENST00000560587 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa35.52■■■■□ 3.28
ZNF280D-215ENST00000560587 PCGF6Q9BYE7 350 aa35.51■■■■□ 3.28
ZNF280D-215ENST00000560587 PSME1Q06323 249 aa35.5■■■■□ 3.27
ZNF280D-215ENST00000560587 NBPF8Q3BBV2 869 aa35.5■■■■□ 3.27
ZNF280D-215ENST00000560587 POTEAQ6S8J7 498 aa35.5■■■■□ 3.27
ZNF280D-215ENST00000560587 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa35.5■■■■□ 3.27
ZNF280D-215ENST00000560587 TNS3Q68CZ2 1445 aa35.49■■■■□ 3.27
ZNF280D-215ENST00000560587 ZNF772Q68DY9 489 aaPredicted RBP35.49■■■■□ 3.27
ZNF280D-215ENST00000560587 CDK19Q9BWU1 502 aa35.48■■■■□ 3.27
ZNF280D-215ENST00000560587 GPRASP1Q5JY77 1395 aa35.47■■■■□ 3.27
ZNF280D-215ENST00000560587 SBNO1A3KN83 1393 aa35.46■■■■□ 3.27
ZNF280D-215ENST00000560587 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa35.45■■■■□ 3.27
ZNF280D-215ENST00000560587 ADAMTS2O95450 1211 aa35.45■■■■□ 3.27
ZNF280D-215ENST00000560587 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP35.45■■■■□ 3.27
ZNF280D-215ENST00000560587 C8orf37Q96NL8 207 aa35.45■■■■□ 3.27
ZNF280D-215ENST00000560587 RALGAPBQ86X10 1494 aa35.44■■■■□ 3.26
ZNF280D-215ENST00000560587 AFF2P51816 1311 aa35.43■■■■□ 3.26
ZNF280D-215ENST00000560587 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP35.41■■■■□ 3.26
ZNF280D-215ENST00000560587 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP35.4■■■■□ 3.26
ZNF280D-215ENST00000560587 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP35.39■■■■□ 3.26
ZNF280D-215ENST00000560587 ARHGEF10O15013 1369 aa35.39■■■■□ 3.26
ZNF280D-215ENST00000560587 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP35.38■■■■□ 3.25
ZNF280D-215ENST00000560587 NGLY1Q96IV0 654 aa35.37■■■■□ 3.25
ZNF280D-215ENST00000560587 CCDC61Q9Y6R9 512 aa35.36■■■■□ 3.25
ZNF280D-215ENST00000560587 LMOD2Q6P5Q4 547 aa35.35■■■■□ 3.25
ZNF280D-215ENST00000560587 CARD11Q9BXL7 1154 aa35.35■■■■□ 3.25
ZNF280D-215ENST00000560587 ALS2Q96Q42 1657 aa35.34■■■■□ 3.25
ZNF280D-215ENST00000560587 CLSPNQ9HAW4 1339 aa35.33■■■■□ 3.25
ZNF280D-215ENST00000560587 ABCA3Q99758 1704 aa35.32■■■■□ 3.24
ZNF280D-215ENST00000560587 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP35.31■■■■□ 3.24
ZNF280D-215ENST00000560587 EVC2Q86UK5 1308 aa35.31■■■■□ 3.24
ZNF280D-215ENST00000560587 CABP2Q9NPB3 220 aa35.31■■■■□ 3.24
ZNF280D-215ENST00000560587 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP35.29■■■■□ 3.24
ZNF280D-215ENST00000560587 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa35.29■■■■□ 3.24
ZNF280D-215ENST00000560587 PLEKHG3A1L390 1219 aa35.27■■■■□ 3.24
ZNF280D-215ENST00000560587 ACEP12821 1306 aa35.27■■■■□ 3.24
ZNF280D-215ENST00000560587 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP35.25■■■■□ 3.23
ZNF280D-215ENST00000560587 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP35.25■■■■□ 3.23
ZNF280D-215ENST00000560587 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa35.24■■■■□ 3.23
ZNF280D-215ENST00000560587 RXRBP28702 533 aa35.24■■■■□ 3.23
ZNF280D-215ENST00000560587 CABLES1Q8TDN4 633 aa35.24■■■■□ 3.23
ZNF280D-215ENST00000560587 USP21Q9UK80 565 aa35.24■■■■□ 3.23
ZNF280D-215ENST00000560587 PLEKHG5O94827 1062 aa35.23■■■■□ 3.23
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.5 ms