RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557779.1

TMEM229B-208, Transcript of transmembrane protein 229B, humanhuman

TSL 2

Gene TMEM229B, Length 701 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM229B-208ENST00000557779 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP35.6■■■■□ 3.29
TMEM229B-208ENST00000557779 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP35.59■■■■□ 3.29
TMEM229B-208ENST00000557779 WAPLQ7Z5K2 1190 aa35.58■■■■□ 3.29
TMEM229B-208ENST00000557779 ORAI2Q96SN7 254 aa35.58■■■■□ 3.29
TMEM229B-208ENST00000557779 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa35.56■■■■□ 3.28
TMEM229B-208ENST00000557779 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP35.56■■■■□ 3.28
TMEM229B-208ENST00000557779 CFAP70Q5T0N1 1121 aa35.54■■■■□ 3.28
TMEM229B-208ENST00000557779 PNPLA6Q8IY17 1366 aa35.53■■■■□ 3.28
TMEM229B-208ENST00000557779 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP35.51■■■■□ 3.28
TMEM229B-208ENST00000557779 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP35.51■■■■□ 3.28
TMEM229B-208ENST00000557779 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP35.51■■■■□ 3.28
TMEM229B-208ENST00000557779 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP35.5■■■■□ 3.27
TMEM229B-208ENST00000557779 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP35.5■■■■□ 3.27
TMEM229B-208ENST00000557779 SIRT1Q96EB6 747 aa35.49■■■■□ 3.27
TMEM229B-208ENST00000557779 ESCO1Q5FWF5 840 aa35.45■■■■□ 3.27
TMEM229B-208ENST00000557779 ZNF772Q68DY9 489 aaPredicted RBP35.44■■■■□ 3.26
TMEM229B-208ENST00000557779 ADGRB1O14514 1584 aa35.42■■■■□ 3.26
TMEM229B-208ENST00000557779 FMN2Q9NZ56 1722 aa35.42■■■■□ 3.26
TMEM229B-208ENST00000557779 DCAF11Q8TEB1 546 aa35.41■■■■□ 3.26
TMEM229B-208ENST00000557779 DLC1Q96QB1 1528 aa35.41■■■■□ 3.26
TMEM229B-208ENST00000557779 NPHP3Q7Z494 1330 aa35.4■■■■□ 3.26
TMEM229B-208ENST00000557779 NUTM2FA1L443 756 aa35.39■■■■□ 3.26
TMEM229B-208ENST00000557779 PXDNQ92626 1479 aa35.38■■■■□ 3.25
TMEM229B-208ENST00000557779 STAC3Q96MF2 364 aa35.38■■■■□ 3.25
TMEM229B-208ENST00000557779 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa35.38■■■■□ 3.25
TMEM229B-208ENST00000557779 PRAM1Q96QH2 718 aa35.36■■■■□ 3.25
TMEM229B-208ENST00000557779 AFF2P51816 1311 aa35.34■■■■□ 3.25
TMEM229B-208ENST00000557779 FOXO3O43524 673 aa35.34■■■■□ 3.25
TMEM229B-208ENST00000557779 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP35.32■■■■□ 3.25
TMEM229B-208ENST00000557779 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP35.31■■■■□ 3.24
TMEM229B-208ENST00000557779 C8orf37Q96NL8 207 aa35.31■■■■□ 3.24
TMEM229B-208ENST00000557779 KIF1AQ12756 1690 aa35.3■■■■□ 3.24
TMEM229B-208ENST00000557779 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP35.29■■■■□ 3.24
TMEM229B-208ENST00000557779 POGKQ9P215 609 aa35.29■■■■□ 3.24
TMEM229B-208ENST00000557779 ADGRB2O60241 1585 aa35.27■■■■□ 3.24
TMEM229B-208ENST00000557779 TRAK1Q9UPV9 953 aa35.27■■■■□ 3.24
TMEM229B-208ENST00000557779 ADAMTS2O95450 1211 aa35.26■■■■□ 3.24
TMEM229B-208ENST00000557779 RXRBP28702 533 aa35.22■■■■□ 3.23
TMEM229B-208ENST00000557779 NGLY1Q96IV0 654 aa35.2■■■■□ 3.23
TMEM229B-208ENST00000557779 PHF8Q9UPP1 1060 aa35.2■■■■□ 3.23
TMEM229B-208ENST00000557779 ANKARQ7Z5J8 1434 aa35.2■■■■□ 3.23
TMEM229B-208ENST00000557779 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP35.19■■■■□ 3.22
TMEM229B-208ENST00000557779 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP35.19■■■■□ 3.22
TMEM229B-208ENST00000557779 USP32Q8NFA0 1604 aa35.17■■■■□ 3.22
TMEM229B-208ENST00000557779 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa35.16■■■■□ 3.22
TMEM229B-208ENST00000557779 KRT28Q7Z3Y7 464 aa35.15■■■■□ 3.22
TMEM229B-208ENST00000557779 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP35.15■■■■□ 3.22
TMEM229B-208ENST00000557779 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP35.14■■■■□ 3.22
TMEM229B-208ENST00000557779 QTRT2Q9H974 415 aaKnown RBP35.14■■■■□ 3.22
TMEM229B-208ENST00000557779 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP35.12■■■■□ 3.21
TMEM229B-208ENST00000557779 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP35.11■■■■□ 3.21
TMEM229B-208ENST00000557779 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa35.1■■■■□ 3.21
TMEM229B-208ENST00000557779 TNS3Q68CZ2 1445 aa35.1■■■■□ 3.21
TMEM229B-208ENST00000557779 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP35.1■■■■□ 3.21
TMEM229B-208ENST00000557779 TULP4Q9NRJ4 1543 aa35.1■■■■□ 3.21
TMEM229B-208ENST00000557779 RBM6P78332 1123 aaKnown RBP35.09■■■■□ 3.21
TMEM229B-208ENST00000557779 USP21Q9UK80 565 aa35.09■■■■□ 3.21
TMEM229B-208ENST00000557779 PSME1Q06323 249 aa35.08■■■■□ 3.21
TMEM229B-208ENST00000557779 WASLO00401 505 aaPredicted RBP35.07■■■■□ 3.2
TMEM229B-208ENST00000557779 SBNO1A3KN83 1393 aa35.07■■■■□ 3.2
TMEM229B-208ENST00000557779 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP35.06■■■■□ 3.2
TMEM229B-208ENST00000557779 RGS12O14924 1447 aa35.06■■■■□ 3.2
TMEM229B-208ENST00000557779 PRR36Q9H6K5 1346 aa35.06■■■■□ 3.2
TMEM229B-208ENST00000557779 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa35.05■■■■□ 3.2
TMEM229B-208ENST00000557779 TRPC5Q9UL62 973 aaPredicted RBP35.02■■■■□ 3.2
TMEM229B-208ENST00000557779 ATRNO75882 1429 aa35.01■■■■□ 3.2
TMEM229B-208ENST00000557779 BCL9LQ86UU0 1499 aa35■■■■□ 3.19
TMEM229B-208ENST00000557779 ARHGEF10O15013 1369 aa35■■■■□ 3.19
TMEM229B-208ENST00000557779 NBPF1Q3BBV0 1214 aa34.98■■■■□ 3.19
TMEM229B-208ENST00000557779 ATP7BP35670 1465 aa34.97■■■■□ 3.19
TMEM229B-208ENST00000557779 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP34.96■■■■□ 3.19
TMEM229B-208ENST00000557779 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP34.95■■■■□ 3.19
TMEM229B-208ENST00000557779 L3MBTL2Q969R5 705 aa34.94■■■■□ 3.18
TMEM229B-208ENST00000557779 GPRASP1Q5JY77 1395 aa34.94■■■■□ 3.18
TMEM229B-208ENST00000557779 LMOD2Q6P5Q4 547 aa34.93■■■■□ 3.18
TMEM229B-208ENST00000557779 ABCA3Q99758 1704 aa34.92■■■■□ 3.18
TMEM229B-208ENST00000557779 SLIT2O94813 1529 aa34.92■■■■□ 3.18
TMEM229B-208ENST00000557779 CABLES1Q8TDN4 633 aa34.92■■■■□ 3.18
TMEM229B-208ENST00000557779 SIN3AQ96ST3 1273 aa34.92■■■■□ 3.18
TMEM229B-208ENST00000557779 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP34.91■■■■□ 3.18
TMEM229B-208ENST00000557779 ITSN1Q15811 1721 aa34.9■■■■□ 3.18
TMEM229B-208ENST00000557779 TNKS1BP1Q9C0C2 1729 aaKnown RBP34.9■■■■□ 3.18
TMEM229B-208ENST00000557779 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP34.89■■■■□ 3.18
TMEM229B-208ENST00000557779 ALS2Q96Q42 1657 aa34.89■■■■□ 3.18
TMEM229B-208ENST00000557779 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP34.88■■■■□ 3.17
TMEM229B-208ENST00000557779 CDK19Q9BWU1 502 aa34.88■■■■□ 3.17
TMEM229B-208ENST00000557779 PLEKHG5O94827 1062 aa34.87■■■■□ 3.17
TMEM229B-208ENST00000557779 UNC5CLQ8IV45 518 aa34.85■■■■□ 3.17
TMEM229B-208ENST00000557779 NEUROD1Q13562 356 aa34.84■■■■□ 3.17
TMEM229B-208ENST00000557779 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa34.84■■■■□ 3.17
TMEM229B-208ENST00000557779 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP34.83■■■■□ 3.17
TMEM229B-208ENST00000557779 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP34.82■■■■□ 3.17
TMEM229B-208ENST00000557779 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa34.8■■■■□ 3.16
TMEM229B-208ENST00000557779 PLCH1Q4KWH8 1693 aa34.79■■■■□ 3.16
TMEM229B-208ENST00000557779 RALGAPBQ86X10 1494 aa34.78■■■■□ 3.16
TMEM229B-208ENST00000557779 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP34.78■■■■□ 3.16
TMEM229B-208ENST00000557779 CCDC61Q9Y6R9 512 aa34.78■■■■□ 3.16
TMEM229B-208ENST00000557779 GLI3P10071 1580 aa34.78■■■■□ 3.16
TMEM229B-208ENST00000557779 NWD2Q9ULI1 1742 aa34.77■■■■□ 3.16
TMEM229B-208ENST00000557779 ATAD2Q6PL18 1390 aa34.76■■■■□ 3.16
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 55.3 ms