RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000555855.5

FOXN3-211, Transcript of forkhead box N3, humanhuman

TSL 5

Gene FOXN3, Length 851 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXN3-211ENST00000555855 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP29.11■■■□□ 2.25
FOXN3-211ENST00000555855 RGL3Q3MIN7 710 aa29.08■■■□□ 2.25
FOXN3-211ENST00000555855 STK26Q9P289 416 aa29.08■■■□□ 2.25
FOXN3-211ENST00000555855 FOXD1Q16676 465 aa29.07■■■□□ 2.24
FOXN3-211ENST00000555855 PPLO60437 1756 aa29.06■■■□□ 2.24
FOXN3-211ENST00000555855 ATAD2Q6PL18 1390 aa29.06■■■□□ 2.24
FOXN3-211ENST00000555855 FOXO3O43524 673 aa29.06■■■□□ 2.24
FOXN3-211ENST00000555855 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa29.05■■■□□ 2.24
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FOXN3-211ENST00000555855 NUTM2FA1L443 756 aa29.02■■■□□ 2.24
FOXN3-211ENST00000555855 CCDC144AA2RUR9 1427 aa29.02■■■□□ 2.24
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FOXN3-211ENST00000555855 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa28.99■■■□□ 2.23
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FOXN3-211ENST00000555855 TMEM132EQ6IEE7 984 aa28.98■■■□□ 2.23
FOXN3-211ENST00000555855 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa28.97■■■□□ 2.23
FOXN3-211ENST00000555855 MPHOSPH9Q99550 1183 aa28.97■■■□□ 2.23
FOXN3-211ENST00000555855 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP28.97■■■□□ 2.23
FOXN3-211ENST00000555855 ABCC11Q96J66 1382 aa28.96■■■□□ 2.23
FOXN3-211ENST00000555855 MYOM2P54296 1465 aa28.95■■■□□ 2.22
FOXN3-211ENST00000555855 PXDNQ92626 1479 aa28.94■■■□□ 2.22
FOXN3-211ENST00000555855 CCDC125Q86Z20 511 aa28.93■■■□□ 2.22
FOXN3-211ENST00000555855 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP28.93■■■□□ 2.22
FOXN3-211ENST00000555855 TECPR2O15040 1411 aa28.92■■■□□ 2.22
FOXN3-211ENST00000555855 ZRANB1Q9UGI0 708 aa28.91■■■□□ 2.22
FOXN3-211ENST00000555855 BCL9LQ86UU0 1499 aa28.91■■■□□ 2.22
FOXN3-211ENST00000555855 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa28.9■■■□□ 2.22
FOXN3-211ENST00000555855 KRT28Q7Z3Y7 464 aa28.89■■■□□ 2.22
FOXN3-211ENST00000555855 SIRT1Q96EB6 747 aa28.89■■■□□ 2.22
FOXN3-211ENST00000555855 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa28.88■■■□□ 2.21
FOXN3-211ENST00000555855 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa28.88■■■□□ 2.21
FOXN3-211ENST00000555855 UNC5CLQ8IV45 518 aa28.87■■■□□ 2.21
FOXN3-211ENST00000555855 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP28.86■■■□□ 2.21
FOXN3-211ENST00000555855 PSME1Q06323 249 aa28.86■■■□□ 2.21
FOXN3-211ENST00000555855 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP28.85■■■□□ 2.21
FOXN3-211ENST00000555855 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP28.85■■■□□ 2.21
FOXN3-211ENST00000555855 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP28.84■■■□□ 2.21
FOXN3-211ENST00000555855 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP28.84■■■□□ 2.21
FOXN3-211ENST00000555855 PIK3C2GO75747 1445 aa28.83■■■□□ 2.21
FOXN3-211ENST00000555855 PHF8Q9UPP1 1060 aa28.82■■■□□ 2.2
FOXN3-211ENST00000555855 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP28.81■■■□□ 2.2
FOXN3-211ENST00000555855 KNDC1Q76NI1 1749 aa28.8■■■□□ 2.2
FOXN3-211ENST00000555855 IFT172Q9UG01 1749 aa28.8■■■□□ 2.2
FOXN3-211ENST00000555855 CFAP70Q5T0N1 1121 aa28.78■■■□□ 2.2
FOXN3-211ENST00000555855 FMN2Q9NZ56 1722 aa28.77■■■□□ 2.2
FOXN3-211ENST00000555855 KIF1AQ12756 1690 aa28.77■■■□□ 2.2
FOXN3-211ENST00000555855 LMOD2Q6P5Q4 547 aa28.77■■■□□ 2.2
FOXN3-211ENST00000555855 SLIT2O94813 1529 aa28.76■■■□□ 2.19
FOXN3-211ENST00000555855 PLEKHG5O94827 1062 aa28.75■■■□□ 2.19
FOXN3-211ENST00000555855 RALGAPBQ86X10 1494 aa28.74■■■□□ 2.19
FOXN3-211ENST00000555855 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP28.74■■■□□ 2.19
FOXN3-211ENST00000555855 PRAM1Q96QH2 718 aa28.74■■■□□ 2.19
FOXN3-211ENST00000555855 POGKQ9P215 609 aa28.74■■■□□ 2.19
FOXN3-211ENST00000555855 CABLES1Q8TDN4 633 aa28.73■■■□□ 2.19
FOXN3-211ENST00000555855 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP28.73■■■□□ 2.19
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FOXN3-211ENST00000555855 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP28.72■■■□□ 2.19
FOXN3-211ENST00000555855 TNS3Q68CZ2 1445 aa28.71■■■□□ 2.19
FOXN3-211ENST00000555855 VPS72Q15906 364 aa28.71■■■□□ 2.19
FOXN3-211ENST00000555855 SEPT12Q8IYM1 358 aa28.71■■■□□ 2.19
FOXN3-211ENST00000555855 SBNO1A3KN83 1393 aa28.69■■■□□ 2.18
FOXN3-211ENST00000555855 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP28.68■■■□□ 2.18
FOXN3-211ENST00000555855 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP28.68■■■□□ 2.18
FOXN3-211ENST00000555855 ARHGEF10O15013 1369 aa28.67■■■□□ 2.18
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FOXN3-211ENST00000555855 USP32Q8NFA0 1604 aa28.67■■■□□ 2.18
FOXN3-211ENST00000555855 GLI3P10071 1580 aa28.67■■■□□ 2.18
FOXN3-211ENST00000555855 NRXN1Q9ULB1 1477 aa28.65■■■□□ 2.18
FOXN3-211ENST00000555855 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP28.64■■■□□ 2.18
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FOXN3-211ENST00000555855 KRT27Q7Z3Y8 459 aa28.62■■■□□ 2.17
FOXN3-211ENST00000555855 DEFB132Q7Z7B7 95 aa28.62■■■□□ 2.17
FOXN3-211ENST00000555855 EP400Q96L91 3159 aa28.61■■■□□ 2.17
FOXN3-211ENST00000555855 A0A0G2JS52 829 aa28.6■■■□□ 2.17
FOXN3-211ENST00000555855 MYT1Q01538 1121 aa28.6■■■□□ 2.17
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FOXN3-211ENST00000555855 ANKARQ7Z5J8 1434 aa28.6■■■□□ 2.17
FOXN3-211ENST00000555855 BRWD3Q6RI45 1802 aa28.59■■■□□ 2.17
FOXN3-211ENST00000555855 GPRASP1Q5JY77 1395 aa28.58■■■□□ 2.17
FOXN3-211ENST00000555855 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP28.57■■■□□ 2.16
FOXN3-211ENST00000555855 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa28.57■■■□□ 2.16
FOXN3-211ENST00000555855 DLC1Q96QB1 1528 aa28.57■■■□□ 2.16
FOXN3-211ENST00000555855 NWD2Q9ULI1 1742 aa28.57■■■□□ 2.16
FOXN3-211ENST00000555855 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa28.55■■■□□ 2.16
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FOXN3-211ENST00000555855 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP28.54■■■□□ 2.16
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FOXN3-211ENST00000555855 FAM98CQ17RN3 349 aaKnown RBP28.52■■■□□ 2.16
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FOXN3-211ENST00000555855 DCAF11Q8TEB1 546 aa28.52■■■□□ 2.16
FOXN3-211ENST00000555855 STAC3Q96MF2 364 aa28.52■■■□□ 2.16
FOXN3-211ENST00000555855 WASLO00401 505 aaPredicted RBP28.51■■■□□ 2.15
FOXN3-211ENST00000555855 BAG6P46379 1132 aa28.51■■■□□ 2.15
FOXN3-211ENST00000555855 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP28.5■■■□□ 2.15
FOXN3-211ENST00000555855 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa28.49■■■□□ 2.15
FOXN3-211ENST00000555855 ABCA3Q99758 1704 aa28.46■■■□□ 2.15
FOXN3-211ENST00000555855 PRR36Q9H6K5 1346 aa28.46■■■□□ 2.15
FOXN3-211ENST00000555855 ADGRB2O60241 1585 aa28.46■■■□□ 2.15
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