RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000554669.5

LINC01578-203, Transcript of long intergenic non-protein coding RNA 1578, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene LINC01578, Length 578 nt, Biotype lincRNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01578-203ENST00000554669 SIN3AQ96ST3 1273 aa41.73■■■■■ 4.27
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LINC01578-203ENST00000554669 DLC1Q96QB1 1528 aa41.68■■■■■ 4.26
LINC01578-203ENST00000554669 NHSL1Q5SYE7 1610 aa41.67■■■■■ 4.26
LINC01578-203ENST00000554669 JCADQ9P266 1359 aa41.65■■■■■ 4.26
LINC01578-203ENST00000554669 PRAM1Q96QH2 718 aa41.65■■■■■ 4.26
LINC01578-203ENST00000554669 TRAK1Q9UPV9 953 aa41.62■■■■■ 4.25
LINC01578-203ENST00000554669 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP41.6■■■■■ 4.25
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LINC01578-203ENST00000554669 ADGRB2O60241 1585 aa41.46■■■■■ 4.23
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LINC01578-203ENST00000554669 USP32Q8NFA0 1604 aa41.36■■■■■ 4.21
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LINC01578-203ENST00000554669 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP41.3■■■■■ 4.2
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LINC01578-203ENST00000554669 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa41.29■■■■■ 4.2
LINC01578-203ENST00000554669 PRR36Q9H6K5 1346 aa41.29■■■■■ 4.2
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LINC01578-203ENST00000554669 PLEKHG5O94827 1062 aa40.85■■■■■ 4.13
LINC01578-203ENST00000554669 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa40.84■■■■■ 4.13
LINC01578-203ENST00000554669 ABCA3Q99758 1704 aa40.83■■■■■ 4.13
LINC01578-203ENST00000554669 EVC2Q86UK5 1308 aa40.83■■■■■ 4.13
LINC01578-203ENST00000554669 QTRT2Q9H974 415 aaKnown RBP40.81■■■■■ 4.12
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LINC01578-203ENST00000554669 BCL9LQ86UU0 1499 aa40.78■■■■■ 4.12
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