RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550655.5

CS-219, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 2

Gene CS, Length 589 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-219ENST00000550655 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa25.88■■□□□ 1.73
CS-219ENST00000550655 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa25.88■■□□□ 1.73
CS-219ENST00000550655 STAC3Q96MF2 364 aa25.87■■□□□ 1.73
CS-219ENST00000550655 JCADQ9P266 1359 aa25.85■■□□□ 1.73
CS-219ENST00000550655 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP25.84■■□□□ 1.73
CS-219ENST00000550655 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP25.84■■□□□ 1.73
CS-219ENST00000550655 SIRT1Q96EB6 747 aa25.84■■□□□ 1.73
CS-219ENST00000550655 ILDR2Q71H61 639 aa25.83■■□□□ 1.73
CS-219ENST00000550655 ADGRB2O60241 1585 aa25.82■■□□□ 1.72
CS-219ENST00000550655 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP25.79■■□□□ 1.72
CS-219ENST00000550655 LRP6O75581 1613 aa25.77■■□□□ 1.72
CS-219ENST00000550655 ORAI2Q96SN7 254 aa25.77■■□□□ 1.72
CS-219ENST00000550655 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP25.76■■□□□ 1.71
CS-219ENST00000550655 PRAM1Q96QH2 718 aa25.76■■□□□ 1.71
CS-219ENST00000550655 KIF1AQ12756 1690 aa25.75■■□□□ 1.71
CS-219ENST00000550655 USP32Q8NFA0 1604 aa25.74■■□□□ 1.71
CS-219ENST00000550655 SIN3AQ96ST3 1273 aa25.74■■□□□ 1.71
CS-219ENST00000550655 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP25.73■■□□□ 1.71
CS-219ENST00000550655 TRAK1Q9UPV9 953 aa25.72■■□□□ 1.71
CS-219ENST00000550655 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa25.71■■□□□ 1.71
CS-219ENST00000550655 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa25.71■■□□□ 1.71
CS-219ENST00000550655 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP25.7■■□□□ 1.7
CS-219ENST00000550655 PXDNQ92626 1479 aa25.7■■□□□ 1.7
CS-219ENST00000550655 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP25.69■■□□□ 1.7
CS-219ENST00000550655 NUTM2FA1L443 756 aa25.69■■□□□ 1.7
CS-219ENST00000550655 L3MBTL2Q969R5 705 aa25.69■■□□□ 1.7
CS-219ENST00000550655 PNPLA6Q8IY17 1366 aa25.69■■□□□ 1.7
CS-219ENST00000550655 ESCO1Q5FWF5 840 aa25.68■■□□□ 1.7
CS-219ENST00000550655 POGKQ9P215 609 aa25.68■■□□□ 1.7
CS-219ENST00000550655 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP25.68■■□□□ 1.7
CS-219ENST00000550655 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP25.67■■□□□ 1.7
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CS-219ENST00000550655 NEUROD1Q13562 356 aa25.64■■□□□ 1.7
CS-219ENST00000550655 NPHP3Q7Z494 1330 aa25.63■■□□□ 1.69
CS-219ENST00000550655 TULP4Q9NRJ4 1543 aa25.63■■□□□ 1.69
CS-219ENST00000550655 NBPF1Q3BBV0 1214 aa25.63■■□□□ 1.69
CS-219ENST00000550655 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP25.61■■□□□ 1.69
CS-219ENST00000550655 ITSN1Q15811 1721 aa25.6■■□□□ 1.69
CS-219ENST00000550655 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP25.6■■□□□ 1.69
CS-219ENST00000550655 QRICH2Q9H0J4 1663 aa25.59■■□□□ 1.69
CS-219ENST00000550655 FOXO3O43524 673 aa25.59■■□□□ 1.69
CS-219ENST00000550655 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa25.57■■□□□ 1.68
CS-219ENST00000550655 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP25.56■■□□□ 1.68
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CS-219ENST00000550655 ATP7BP35670 1465 aa25.55■■□□□ 1.68
CS-219ENST00000550655 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP25.55■■□□□ 1.68
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CS-219ENST00000550655 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP25.55■■□□□ 1.68
CS-219ENST00000550655 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP25.55■■□□□ 1.68
CS-219ENST00000550655 PHF8Q9UPP1 1060 aa25.55■■□□□ 1.68
CS-219ENST00000550655 PRR36Q9H6K5 1346 aa25.55■■□□□ 1.68
CS-219ENST00000550655 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP25.54■■□□□ 1.68
CS-219ENST00000550655 WASLO00401 505 aaPredicted RBP25.54■■□□□ 1.68
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CS-219ENST00000550655 ABCA3Q99758 1704 aa25.51■■□□□ 1.68
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CS-219ENST00000550655 TNS3Q68CZ2 1445 aa25.48■■□□□ 1.67
CS-219ENST00000550655 TONSLQ96HA7 1378 aa25.48■■□□□ 1.67
CS-219ENST00000550655 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa25.48■■□□□ 1.67
CS-219ENST00000550655 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP25.47■■□□□ 1.67
CS-219ENST00000550655 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP25.47■■□□□ 1.67
CS-219ENST00000550655 KRT28Q7Z3Y7 464 aa25.47■■□□□ 1.67
CS-219ENST00000550655 GPRASP1Q5JY77 1395 aa25.46■■□□□ 1.67
CS-219ENST00000550655 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa25.46■■□□□ 1.67
CS-219ENST00000550655 RALGAPBQ86X10 1494 aa25.46■■□□□ 1.67
CS-219ENST00000550655 SBNO1A3KN83 1393 aa25.44■■□□□ 1.66
CS-219ENST00000550655 AFF2P51816 1311 aa25.43■■□□□ 1.66
CS-219ENST00000550655 CDK19Q9BWU1 502 aa25.43■■□□□ 1.66
CS-219ENST00000550655 ZNF772Q68DY9 489 aaPredicted RBP25.42■■□□□ 1.66
CS-219ENST00000550655 C8orf37Q96NL8 207 aa25.42■■□□□ 1.66
CS-219ENST00000550655 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa25.42■■□□□ 1.66
CS-219ENST00000550655 ADAMTS2O95450 1211 aa25.41■■□□□ 1.66
CS-219ENST00000550655 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP25.41■■□□□ 1.66
CS-219ENST00000550655 PSME1Q06323 249 aa25.4■■□□□ 1.66
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CS-219ENST00000550655 PCGF6Q9BYE7 350 aa25.37■■□□□ 1.65
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CS-219ENST00000550655 TNKS1BP1Q9C0C2 1729 aaKnown RBP25.36■■□□□ 1.65
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CS-219ENST00000550655 PLCH1Q4KWH8 1693 aa25.33■■□□□ 1.65
CS-219ENST00000550655 NGLY1Q96IV0 654 aa25.33■■□□□ 1.65
CS-219ENST00000550655 CCDC61Q9Y6R9 512 aa25.33■■□□□ 1.65
CS-219ENST00000550655 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa25.31■■□□□ 1.64
CS-219ENST00000550655 PHRF1Q9P1Y6 1649 aaKnown RBP25.31■■□□□ 1.64
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CS-219ENST00000550655 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP25.31■■□□□ 1.64
CS-219ENST00000550655 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP25.3■■□□□ 1.64
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CS-219ENST00000550655 CABP2Q9NPB3 220 aa25.3■■□□□ 1.64
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CS-219ENST00000550655 CABLES1Q8TDN4 633 aa25.29■■□□□ 1.64
CS-219ENST00000550655 CARD11Q9BXL7 1154 aa25.29■■□□□ 1.64
CS-219ENST00000550655 BCL9LQ86UU0 1499 aa25.28■■□□□ 1.64
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