RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000538616.1

CD27-AS1-208, CD27 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2

Gene CD27-AS1, Length 657 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD27-AS1-208ENST00000538616 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa28.86■■■□□ 2.21
CD27-AS1-208ENST00000538616 BCL9LQ86UU0 1499 aa28.85■■■□□ 2.21
CD27-AS1-208ENST00000538616 VGFO15240 615 aaPredicted RBP28.84■■■□□ 2.21
CD27-AS1-208ENST00000538616 MYOM2P54296 1465 aa28.84■■■□□ 2.21
CD27-AS1-208ENST00000538616 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa28.84■■■□□ 2.21
CD27-AS1-208ENST00000538616 ROBO2Q9HCK4 1378 aa28.83■■■□□ 2.21
CD27-AS1-208ENST00000538616 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP28.81■■■□□ 2.2
CD27-AS1-208ENST00000538616 PRAG1Q86YV5 1406 aa28.8■■■□□ 2.2
CD27-AS1-208ENST00000538616 ESCO1Q5FWF5 840 aa28.79■■■□□ 2.2
CD27-AS1-208ENST00000538616 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP28.76■■■□□ 2.2
CD27-AS1-208ENST00000538616 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP28.76■■■□□ 2.19
CD27-AS1-208ENST00000538616 UNC5CLQ8IV45 518 aa28.75■■■□□ 2.19
CD27-AS1-208ENST00000538616 FOXO3O43524 673 aa28.73■■■□□ 2.19
CD27-AS1-208ENST00000538616 CLTCL1P53675 1640 aa28.72■■■□□ 2.19
CD27-AS1-208ENST00000538616 PXDNQ92626 1479 aa28.72■■■□□ 2.19
CD27-AS1-208ENST00000538616 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa28.71■■■□□ 2.19
CD27-AS1-208ENST00000538616 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP28.71■■■□□ 2.19
CD27-AS1-208ENST00000538616 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP28.7■■■□□ 2.18
CD27-AS1-208ENST00000538616 KIF1BO60333 1816 aa28.69■■■□□ 2.18
CD27-AS1-208ENST00000538616 TNKS1BP1Q9C0C2 1729 aaKnown RBP28.69■■■□□ 2.18
CD27-AS1-208ENST00000538616 RALGAPBQ86X10 1494 aa28.68■■■□□ 2.18
CD27-AS1-208ENST00000538616 DEFB132Q7Z7B7 95 aa28.68■■■□□ 2.18
CD27-AS1-208ENST00000538616 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP28.67■■■□□ 2.18
CD27-AS1-208ENST00000538616 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa28.67■■■□□ 2.18
CD27-AS1-208ENST00000538616 SLIT2O94813 1529 aa28.66■■■□□ 2.18
CD27-AS1-208ENST00000538616 GLI3P10071 1580 aa28.62■■■□□ 2.17
CD27-AS1-208ENST00000538616 LRP5O75197 1615 aa28.62■■■□□ 2.17
CD27-AS1-208ENST00000538616 SEPT12Q8IYM1 358 aa28.62■■■□□ 2.17
CD27-AS1-208ENST00000538616 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa28.6■■■□□ 2.17
CD27-AS1-208ENST00000538616 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP28.58■■■□□ 2.17
CD27-AS1-208ENST00000538616 VPS72Q15906 364 aa28.58■■■□□ 2.17
CD27-AS1-208ENST00000538616 MPHOSPH9Q99550 1183 aa28.57■■■□□ 2.16
CD27-AS1-208ENST00000538616 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP28.56■■■□□ 2.16
CD27-AS1-208ENST00000538616 KRT27Q7Z3Y8 459 aa28.56■■■□□ 2.16
CD27-AS1-208ENST00000538616 CCDC144AA2RUR9 1427 aa28.55■■■□□ 2.16
CD27-AS1-208ENST00000538616 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa28.55■■■□□ 2.16
CD27-AS1-208ENST00000538616 NUTM2FA1L443 756 aa28.55■■■□□ 2.16
CD27-AS1-208ENST00000538616 BAG6P46379 1132 aa28.54■■■□□ 2.16
CD27-AS1-208ENST00000538616 BRWD3Q6RI45 1802 aa28.53■■■□□ 2.16
CD27-AS1-208ENST00000538616 KRT28Q7Z3Y7 464 aa28.52■■■□□ 2.16
CD27-AS1-208ENST00000538616 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP28.52■■■□□ 2.16
CD27-AS1-208ENST00000538616 USP32Q8NFA0 1604 aa28.51■■■□□ 2.15
CD27-AS1-208ENST00000538616 HRCP23327 699 aa28.51■■■□□ 2.15
CD27-AS1-208ENST00000538616 PSME1Q06323 249 aa28.5■■■□□ 2.15
CD27-AS1-208ENST00000538616 WAPLQ7Z5K2 1190 aa28.5■■■□□ 2.15
CD27-AS1-208ENST00000538616 TECPR2O15040 1411 aa28.5■■■□□ 2.15
CD27-AS1-208ENST00000538616 STK26Q9P289 416 aa28.48■■■□□ 2.15
CD27-AS1-208ENST00000538616 PPLO60437 1756 aa28.47■■■□□ 2.15
CD27-AS1-208ENST00000538616 PSDA5PKW4 1024 aaPredicted RBP28.47■■■□□ 2.15
CD27-AS1-208ENST00000538616 ABCC11Q96J66 1382 aa28.47■■■□□ 2.15
CD27-AS1-208ENST00000538616 KIF1AQ12756 1690 aa28.46■■■□□ 2.15
CD27-AS1-208ENST00000538616 TNS3Q68CZ2 1445 aa28.43■■■□□ 2.14
CD27-AS1-208ENST00000538616 A0A0G2JS52 829 aa28.43■■■□□ 2.14
CD27-AS1-208ENST00000538616 MYT1Q01538 1121 aa28.43■■■□□ 2.14
CD27-AS1-208ENST00000538616 NWD2Q9ULI1 1742 aa28.43■■■□□ 2.14
CD27-AS1-208ENST00000538616 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa28.42■■■□□ 2.14
CD27-AS1-208ENST00000538616 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP28.42■■■□□ 2.14
CD27-AS1-208ENST00000538616 CABLES1Q8TDN4 633 aa28.41■■■□□ 2.14
CD27-AS1-208ENST00000538616 ARHGEF10O15013 1369 aa28.4■■■□□ 2.14
CD27-AS1-208ENST00000538616 PHF8Q9UPP1 1060 aa28.4■■■□□ 2.14
CD27-AS1-208ENST00000538616 SBNO1A3KN83 1393 aa28.39■■■□□ 2.14
CD27-AS1-208ENST00000538616 FMN2Q9NZ56 1722 aa28.38■■■□□ 2.13
CD27-AS1-208ENST00000538616 SIRT1Q96EB6 747 aa28.38■■■□□ 2.13
CD27-AS1-208ENST00000538616 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa28.37■■■□□ 2.13
CD27-AS1-208ENST00000538616 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa28.37■■■□□ 2.13
CD27-AS1-208ENST00000538616 FAM83GA6ND36 823 aa28.37■■■□□ 2.13
CD27-AS1-208ENST00000538616 LMOD2Q6P5Q4 547 aa28.37■■■□□ 2.13
CD27-AS1-208ENST00000538616 PLCH1Q4KWH8 1693 aa28.35■■■□□ 2.13
CD27-AS1-208ENST00000538616 RGL3Q3MIN7 710 aa28.35■■■□□ 2.13
CD27-AS1-208ENST00000538616 TMEM132EQ6IEE7 984 aa28.35■■■□□ 2.13
CD27-AS1-208ENST00000538616 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP28.34■■■□□ 2.13
CD27-AS1-208ENST00000538616 FAM98CQ17RN3 349 aaKnown RBP28.34■■■□□ 2.13
CD27-AS1-208ENST00000538616 PLEKHG5O94827 1062 aa28.33■■■□□ 2.13
CD27-AS1-208ENST00000538616 KNDC1Q76NI1 1749 aa28.32■■■□□ 2.12
CD27-AS1-208ENST00000538616 R3HDM1Q15032 1099 aaKnown RBP28.32■■■□□ 2.12
CD27-AS1-208ENST00000538616 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa28.32■■■□□ 2.12
CD27-AS1-208ENST00000538616 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP28.3■■■□□ 2.12
CD27-AS1-208ENST00000538616 NRXN1Q9ULB1 1477 aa28.29■■■□□ 2.12
CD27-AS1-208ENST00000538616 BTG4Q9NY30 223 aa28.29■■■□□ 2.12
CD27-AS1-208ENST00000538616 DISP2A7MBM2 1401 aa28.28■■■□□ 2.12
CD27-AS1-208ENST00000538616 IFT172Q9UG01 1749 aa28.27■■■□□ 2.12
CD27-AS1-208ENST00000538616 RGPD1P0DJD0 1748 aa28.26■■■□□ 2.12
CD27-AS1-208ENST00000538616 PIK3C2GO75747 1445 aa28.26■■■□□ 2.11
CD27-AS1-208ENST00000538616 ABCA3Q99758 1704 aa28.23■■■□□ 2.11
CD27-AS1-208ENST00000538616 SPATA31A5Q5VU36 1347 aa28.22■■■□□ 2.11
CD27-AS1-208ENST00000538616 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa28.22■■■□□ 2.11
CD27-AS1-208ENST00000538616 FAM182BQ5T319 152 aa28.21■■■□□ 2.11
CD27-AS1-208ENST00000538616 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP28.21■■■□□ 2.11
CD27-AS1-208ENST00000538616 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP28.21■■■□□ 2.11
CD27-AS1-208ENST00000538616 EZH2Q15910 746 aaKnown RBP28.2■■■□□ 2.1
CD27-AS1-208ENST00000538616 NRAPQ86VF7 1730 aa28.19■■■□□ 2.1
CD27-AS1-208ENST00000538616 YY1P25490 414 aa28.19■■■□□ 2.1
CD27-AS1-208ENST00000538616 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa28.19■■■□□ 2.1
CD27-AS1-208ENST00000538616 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP28.19■■■□□ 2.1
CD27-AS1-208ENST00000538616 ANKARQ7Z5J8 1434 aa28.18■■■□□ 2.1
CD27-AS1-208ENST00000538616 COL14A1Q05707 1796 aaKnown RBP28.17■■■□□ 2.1
CD27-AS1-208ENST00000538616 GPRASP1Q5JY77 1395 aa28.17■■■□□ 2.1
CD27-AS1-208ENST00000538616 PARD3Q8TEW0 1356 aa28.17■■■□□ 2.1
CD27-AS1-208ENST00000538616 FAM196AQ6ZSG2 479 aa28.17■■■□□ 2.1
CD27-AS1-208ENST00000538616 CAMKK2Q96RR4 588 aa28.17■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.1 ms