RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000535976.1

CLIP1-AS1-201, CLIP1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene CLIP1-AS1, Length 1,745 nt, Biotype lincRNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 BHMG1C9JSJ3 638 aaPredicted RBP8.34□□□□□ -1.07
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 ARHGEF1Q92888 912 aaKnown RBP8.34□□□□□ -1.07
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP8.34□□□□□ -1.07
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP8.34□□□□□ -1.07
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa8.34□□□□□ -1.07
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 PREX2Q70Z35 1606 aa8.33□□□□□ -1.08
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP8.33□□□□□ -1.08
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP8.33□□□□□ -1.08
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 SPDYE16A6NNV3 312 aaPredicted RBP8.33□□□□□ -1.08
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 ABCC10Q5T3U5 1492 aa8.32□□□□□ -1.08
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 ARHGAP5Q13017 1502 aa8.32□□□□□ -1.08
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 MAPKBP1O60336 1514 aa8.32□□□□□ -1.08
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 TTC37Q6PGP7 1564 aa8.32□□□□□ -1.08
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa8.32□□□□□ -1.08
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP8.31□□□□□ -1.08
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 ABCA9Q8IUA7 1624 aa8.31□□□□□ -1.08
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 NRG2O14511 850 aaPredicted RBP8.31□□□□□ -1.08
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 ZNF454Q8N9F8 522 aa8.31□□□□□ -1.08
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 NBPF3Q9H094 633 aa8.31□□□□□ -1.08
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 RSPH4AQ5TD94 716 aa8.3□□□□□ -1.08
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 ZNF775Q96BV0 537 aaPredicted RBP8.3□□□□□ -1.08
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa8.3□□□□□ -1.08
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa8.3□□□□□ -1.08
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 CFAP74Q9C0B2 1584 aa8.3□□□□□ -1.08
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 PLCH2O75038 1416 aa8.29□□□□□ -1.08
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 TSPY4P0CV99 314 aa8.29□□□□□ -1.08
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 TSPY10P0CW01 314 aa8.29□□□□□ -1.08
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 FOSBP53539 338 aa8.29□□□□□ -1.08
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 ARAP3Q8WWN8 1544 aa8.29□□□□□ -1.08
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 NBR1Q14596 966 aa8.29□□□□□ -1.08
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP8.28□□□□□ -1.08
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 CD109Q6YHK3 1445 aa8.28□□□□□ -1.08
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 KCNC4Q03721 635 aa8.28□□□□□ -1.08
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 HOMEZQ8IX15 550 aa8.28□□□□□ -1.08
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 TSPOAP1O95153 1857 aa8.28□□□□□ -1.08
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 ADGBQ8N7X0 1667 aa8.28□□□□□ -1.08
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 PHF14O94880 888 aa8.27□□□□□ -1.09
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 FAM69CQ0P6D2 419 aa8.27□□□□□ -1.09
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 NYAP1Q6ZVC0 841 aa8.27□□□□□ -1.09
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 DDX12PQ92771 950 aa8.27□□□□□ -1.09
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 BCL2L12Q9HB09 334 aa8.27□□□□□ -1.09
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 CROCC2H7BZ55 1655 aa8.26□□□□□ -1.09
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP8.26□□□□□ -1.09
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP8.26□□□□□ -1.09
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 CHIC2Q9UKJ5 165 aa8.26□□□□□ -1.09
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 PCDHGA10Q9Y5H3 936 aa8.26□□□□□ -1.09
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 GLI2P10070 1586 aa8.26□□□□□ -1.09
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 ARHGEF5Q12774 1597 aa8.26□□□□□ -1.09
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa8.26□□□□□ -1.09
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP8.26□□□□□ -1.09
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 ZDHHC16Q969W1 377 aa8.26□□□□□ -1.09
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 FANCAO15360 1455 aa8.25□□□□□ -1.09
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 DAPK1P53355 1430 aa8.25□□□□□ -1.09
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 ANKK1Q8NFD2 765 aa8.25□□□□□ -1.09
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 SETD5Q9C0A6 1442 aa8.25□□□□□ -1.09
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 KIF13AQ9H1H9 1805 aa8.24□□□□□ -1.09
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 PTPREP23469 700 aa8.24□□□□□ -1.09
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 TYW1BQ6NUM6 668 aa8.24□□□□□ -1.09
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 FBXW7Q969H0 707 aa8.24□□□□□ -1.09
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 EPAS1Q99814 870 aa8.24□□□□□ -1.09
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 ZBED2Q9BTP6 218 aa8.24□□□□□ -1.09
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa8.24□□□□□ -1.09
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa8.24□□□□□ -1.09
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 DIP2BQ9P265 1576 aa8.24□□□□□ -1.09
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 CCDC141Q6ZP82 1450 aa8.24□□□□□ -1.09
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 GRXCR2A6NFK2 248 aa8.23□□□□□ -1.09
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP8.23□□□□□ -1.09
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa8.23□□□□□ -1.09
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 SYCP2Q9BX26 1530 aa8.23□□□□□ -1.09
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 ABCC5O15440 1437 aa8.23□□□□□ -1.09
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 AKNAQ7Z591 1439 aa8.23□□□□□ -1.09
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 HRCP23327 699 aa8.23□□□□□ -1.09
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 C14orf37Q86TY3 774 aa8.23□□□□□ -1.09
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 ADAM33Q9BZ11 813 aa8.23□□□□□ -1.09
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa8.23□□□□□ -1.09
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 GCC2Q8IWJ2 1684 aa8.23□□□□□ -1.09
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 ADGRL1O94910 1474 aa8.22□□□□□ -1.09
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 TEX14Q8IWB6 1497 aa8.22□□□□□ -1.09
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 SHANK2Q9UPX8 1470 aa8.22□□□□□ -1.09
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 ABCC1P33527 1531 aa8.22□□□□□ -1.09
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 ROCK1Q13464 1354 aa8.22□□□□□ -1.09
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 NEO1Q92859 1461 aa8.22□□□□□ -1.09
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 C9orf84Q5VXU9 1444 aa8.21□□□□□ -1.09
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 SEMA3EO15041 775 aa8.21□□□□□ -1.09
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 SCAPERQ9BY12 1400 aa8.21□□□□□ -1.1
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 MLLT3P42568 568 aaPredicted RBP8.2□□□□□ -1.1
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 MAST1Q9Y2H9 1570 aa8.2□□□□□ -1.1
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP8.2□□□□□ -1.1
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 HFM1A2PYH4 1435 aa8.2□□□□□ -1.1
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 MBD5Q9P267 1494 aa8.2□□□□□ -1.1
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa8.2□□□□□ -1.1
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP8.2□□□□□ -1.1
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP8.2□□□□□ -1.1
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 PTPRKQ15262 1439 aa8.19□□□□□ -1.1
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 ADGRL2O95490 1459 aa8.19□□□□□ -1.1
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 TRIM52Q96A61 297 aa8.19□□□□□ -1.1
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP8.19□□□□□ -1.1
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa8.18□□□□□ -1.1
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 MAP3K7O43318 606 aa8.18□□□□□ -1.1
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 OSBPP22059 807 aa8.18□□□□□ -1.1
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