RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000533650.5

TATDN3-216, Transcript of TatD DNase domain containing 3, humanhuman

TSL 3

Gene TATDN3, Length 417 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TATDN3-216ENST00000533650 ATAD2Q6PL18 1390 aa23.39■■□□□ 1.33
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TATDN3-216ENST00000533650 EP400Q96L91 3159 aa23.36■■□□□ 1.33
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TATDN3-216ENST00000533650 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP23.33■■□□□ 1.33
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TATDN3-216ENST00000533650 WAPLQ7Z5K2 1190 aa23.3■■□□□ 1.32
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TATDN3-216ENST00000533650 ABCC11Q96J66 1382 aa23.27■■□□□ 1.31
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TATDN3-216ENST00000533650 ZRANB1Q9UGI0 708 aa23.26■■□□□ 1.31
TATDN3-216ENST00000533650 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa23.26■■□□□ 1.31
TATDN3-216ENST00000533650 TMEM132EQ6IEE7 984 aa23.24■■□□□ 1.31
TATDN3-216ENST00000533650 CCDC144AA2RUR9 1427 aa23.24■■□□□ 1.31
TATDN3-216ENST00000533650 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa23.24■■□□□ 1.31
TATDN3-216ENST00000533650 UNC5CLQ8IV45 518 aa23.22■■□□□ 1.31
TATDN3-216ENST00000533650 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa23.22■■□□□ 1.31
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TATDN3-216ENST00000533650 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa23.21■■□□□ 1.31
TATDN3-216ENST00000533650 MPHOSPH9Q99550 1183 aa23.2■■□□□ 1.3
TATDN3-216ENST00000533650 KRT28Q7Z3Y7 464 aa23.19■■□□□ 1.3
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TATDN3-216ENST00000533650 PIK3C2GO75747 1445 aa23.16■■□□□ 1.3
TATDN3-216ENST00000533650 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP23.16■■□□□ 1.3
TATDN3-216ENST00000533650 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP23.15■■□□□ 1.3
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TATDN3-216ENST00000533650 PSME1Q06323 249 aa23.14■■□□□ 1.29
TATDN3-216ENST00000533650 PHF8Q9UPP1 1060 aa23.13■■□□□ 1.29
TATDN3-216ENST00000533650 KNDC1Q76NI1 1749 aa23.12■■□□□ 1.29
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TATDN3-216ENST00000533650 IFT172Q9UG01 1749 aa23.11■■□□□ 1.29
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TATDN3-216ENST00000533650 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP23.1■■□□□ 1.29
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TATDN3-216ENST00000533650 GLI3P10071 1580 aa23.1■■□□□ 1.29
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TATDN3-216ENST00000533650 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP23.03■■□□□ 1.28
TATDN3-216ENST00000533650 ARHGEF10O15013 1369 aa23.02■■□□□ 1.28
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TATDN3-216ENST00000533650 LMOD2Q6P5Q4 547 aa23.02■■□□□ 1.28
TATDN3-216ENST00000533650 PLEKHG5O94827 1062 aa23.01■■□□□ 1.27
TATDN3-216ENST00000533650 KRT27Q7Z3Y8 459 aa23.01■■□□□ 1.27
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TATDN3-216ENST00000533650 BTG4Q9NY30 223 aa22.93■■□□□ 1.26
TATDN3-216ENST00000533650 PLCH1Q4KWH8 1693 aa22.93■■□□□ 1.26
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TATDN3-216ENST00000533650 BAG6P46379 1132 aa22.9■■□□□ 1.26
TATDN3-216ENST00000533650 MYT1Q01538 1121 aa22.9■■□□□ 1.26
TATDN3-216ENST00000533650 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP22.9■■□□□ 1.26
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TATDN3-216ENST00000533650 ADGRB2O60241 1585 aa22.88■■□□□ 1.25
TATDN3-216ENST00000533650 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP22.88■■□□□ 1.25
TATDN3-216ENST00000533650 PRR36Q9H6K5 1346 aa22.87■■□□□ 1.25
TATDN3-216ENST00000533650 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP22.86■■□□□ 1.25
TATDN3-216ENST00000533650 SPATA31A5Q5VU36 1347 aa22.85■■□□□ 1.25
TATDN3-216ENST00000533650 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa22.85■■□□□ 1.25
TATDN3-216ENST00000533650 STAC3Q96MF2 364 aa22.85■■□□□ 1.25
TATDN3-216ENST00000533650 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP22.85■■□□□ 1.25
TATDN3-216ENST00000533650 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP22.84■■□□□ 1.25
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