RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000531385.1

PTPRU-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type U, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRU, Length 737 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRU-211ENST00000531385 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP27.22■■□□□ 1.95
PTPRU-211ENST00000531385 NHSL1Q5SYE7 1610 aa27.22■■□□□ 1.95
PTPRU-211ENST00000531385 NEUROD1Q13562 356 aa27.2■■□□□ 1.94
PTPRU-211ENST00000531385 PRAM1Q96QH2 718 aa27.2■■□□□ 1.94
PTPRU-211ENST00000531385 NUTM2FA1L443 756 aa27.19■■□□□ 1.94
PTPRU-211ENST00000531385 ORAI2Q96SN7 254 aa27.19■■□□□ 1.94
PTPRU-211ENST00000531385 TRAK1Q9UPV9 953 aa27.19■■□□□ 1.94
PTPRU-211ENST00000531385 DLC1Q96QB1 1528 aa27.18■■□□□ 1.94
PTPRU-211ENST00000531385 STAC3Q96MF2 364 aa27.18■■□□□ 1.94
PTPRU-211ENST00000531385 ILDR2Q71H61 639 aa27.16■■□□□ 1.94
PTPRU-211ENST00000531385 JCADQ9P266 1359 aa27.16■■□□□ 1.94
PTPRU-211ENST00000531385 FMN2Q9NZ56 1722 aa27.16■■□□□ 1.94
PTPRU-211ENST00000531385 L3MBTL2Q969R5 705 aa27.15■■□□□ 1.94
PTPRU-211ENST00000531385 SIRT1Q96EB6 747 aa27.14■■□□□ 1.94
PTPRU-211ENST00000531385 POGKQ9P215 609 aa27.13■■□□□ 1.93
PTPRU-211ENST00000531385 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP27.13■■□□□ 1.93
PTPRU-211ENST00000531385 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa27.12■■□□□ 1.93
PTPRU-211ENST00000531385 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP27.11■■□□□ 1.93
PTPRU-211ENST00000531385 SHPRHQ149N8 1683 aa27.11■■□□□ 1.93
PTPRU-211ENST00000531385 NBPF1Q3BBV0 1214 aa27.1■■□□□ 1.93
PTPRU-211ENST00000531385 ESCO1Q5FWF5 840 aa27.09■■□□□ 1.93
PTPRU-211ENST00000531385 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP27.09■■□□□ 1.93
PTPRU-211ENST00000531385 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP27.08■■□□□ 1.93
PTPRU-211ENST00000531385 LRP6O75581 1613 aa27.08■■□□□ 1.93
PTPRU-211ENST00000531385 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP27.07■■□□□ 1.92
PTPRU-211ENST00000531385 ADGRB2O60241 1585 aa27.06■■□□□ 1.92
PTPRU-211ENST00000531385 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP27.03■■□□□ 1.92
PTPRU-211ENST00000531385 USP32Q8NFA0 1604 aa27.02■■□□□ 1.92
PTPRU-211ENST00000531385 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa27.01■■□□□ 1.92
PTPRU-211ENST00000531385 PNPLA6Q8IY17 1366 aa27■■□□□ 1.91
PTPRU-211ENST00000531385 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP27■■□□□ 1.91
PTPRU-211ENST00000531385 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP27■■□□□ 1.91
PTPRU-211ENST00000531385 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP27■■□□□ 1.91
PTPRU-211ENST00000531385 FOXO3O43524 673 aa27■■□□□ 1.91
PTPRU-211ENST00000531385 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP27■■□□□ 1.91
PTPRU-211ENST00000531385 PCGF6Q9BYE7 350 aa27■■□□□ 1.91
PTPRU-211ENST00000531385 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP27■■□□□ 1.91
PTPRU-211ENST00000531385 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa26.99■■□□□ 1.91
PTPRU-211ENST00000531385 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP26.99■■□□□ 1.91
PTPRU-211ENST00000531385 PXDNQ92626 1479 aa26.99■■□□□ 1.91
PTPRU-211ENST00000531385 KIF1AQ12756 1690 aa26.98■■□□□ 1.91
PTPRU-211ENST00000531385 NPHP3Q7Z494 1330 aa26.97■■□□□ 1.91
PTPRU-211ENST00000531385 NBPF8Q3BBV2 869 aa26.95■■□□□ 1.9
PTPRU-211ENST00000531385 PRR36Q9H6K5 1346 aa26.94■■□□□ 1.9
PTPRU-211ENST00000531385 PHF8Q9UPP1 1060 aa26.94■■□□□ 1.9
PTPRU-211ENST00000531385 TONSLQ96HA7 1378 aa26.94■■□□□ 1.9
PTPRU-211ENST00000531385 ANKARQ7Z5J8 1434 aa26.93■■□□□ 1.9
PTPRU-211ENST00000531385 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP26.93■■□□□ 1.9
PTPRU-211ENST00000531385 TULP4Q9NRJ4 1543 aa26.93■■□□□ 1.9
PTPRU-211ENST00000531385 WASLO00401 505 aaPredicted RBP26.92■■□□□ 1.9
PTPRU-211ENST00000531385 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa26.91■■□□□ 1.9
PTPRU-211ENST00000531385 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP26.9■■□□□ 1.9
PTPRU-211ENST00000531385 QRICH2Q9H0J4 1663 aa26.89■■□□□ 1.9
PTPRU-211ENST00000531385 POTEAQ6S8J7 498 aa26.88■■□□□ 1.89
PTPRU-211ENST00000531385 ATP7BP35670 1465 aa26.87■■□□□ 1.89
PTPRU-211ENST00000531385 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP26.87■■□□□ 1.89
PTPRU-211ENST00000531385 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP26.86■■□□□ 1.89
PTPRU-211ENST00000531385 KRT28Q7Z3Y7 464 aa26.86■■□□□ 1.89
PTPRU-211ENST00000531385 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP26.86■■□□□ 1.89
PTPRU-211ENST00000531385 ADAMTS2O95450 1211 aa26.84■■□□□ 1.89
PTPRU-211ENST00000531385 CDK19Q9BWU1 502 aa26.84■■□□□ 1.89
PTPRU-211ENST00000531385 ITSN1Q15811 1721 aa26.82■■□□□ 1.88
PTPRU-211ENST00000531385 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa26.82■■□□□ 1.88
PTPRU-211ENST00000531385 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP26.81■■□□□ 1.88
PTPRU-211ENST00000531385 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa26.8■■□□□ 1.88
PTPRU-211ENST00000531385 C8orf37Q96NL8 207 aa26.8■■□□□ 1.88
PTPRU-211ENST00000531385 TNS3Q68CZ2 1445 aa26.8■■□□□ 1.88
PTPRU-211ENST00000531385 RALGAPBQ86X10 1494 aa26.8■■□□□ 1.88
PTPRU-211ENST00000531385 PLEKHG5O94827 1062 aa26.79■■□□□ 1.88
PTPRU-211ENST00000531385 PSME1Q06323 249 aa26.79■■□□□ 1.88
PTPRU-211ENST00000531385 GPRASP1Q5JY77 1395 aa26.79■■□□□ 1.88
PTPRU-211ENST00000531385 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP26.79■■□□□ 1.88
PTPRU-211ENST00000531385 AFF2P51816 1311 aa26.78■■□□□ 1.88
PTPRU-211ENST00000531385 SOCS7O14512 581 aa26.76■■□□□ 1.87
PTPRU-211ENST00000531385 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP26.75■■□□□ 1.87
PTPRU-211ENST00000531385 LMOD2Q6P5Q4 547 aa26.75■■□□□ 1.87
PTPRU-211ENST00000531385 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP26.75■■□□□ 1.87
PTPRU-211ENST00000531385 CABP2Q9NPB3 220 aa26.75■■□□□ 1.87
PTPRU-211ENST00000531385 SBNO1A3KN83 1393 aa26.74■■□□□ 1.87
PTPRU-211ENST00000531385 CARD11Q9BXL7 1154 aa26.74■■□□□ 1.87
PTPRU-211ENST00000531385 CABLES1Q8TDN4 633 aa26.72■■□□□ 1.87
PTPRU-211ENST00000531385 ABCA3Q99758 1704 aa26.72■■□□□ 1.87
PTPRU-211ENST00000531385 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP26.72■■□□□ 1.87
PTPRU-211ENST00000531385 ALS2Q96Q42 1657 aa26.71■■□□□ 1.87
PTPRU-211ENST00000531385 ZNF772Q68DY9 489 aaPredicted RBP26.71■■□□□ 1.87
PTPRU-211ENST00000531385 NGLY1Q96IV0 654 aa26.7■■□□□ 1.86
PTPRU-211ENST00000531385 CCDC61Q9Y6R9 512 aa26.69■■□□□ 1.86
PTPRU-211ENST00000531385 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa26.68■■□□□ 1.86
PTPRU-211ENST00000531385 ACEP12821 1306 aa26.67■■□□□ 1.86
PTPRU-211ENST00000531385 ARHGEF10O15013 1369 aa26.67■■□□□ 1.86
PTPRU-211ENST00000531385 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP26.66■■□□□ 1.86
PTPRU-211ENST00000531385 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP26.65■■□□□ 1.86
PTPRU-211ENST00000531385 EVC2Q86UK5 1308 aa26.65■■□□□ 1.86
PTPRU-211ENST00000531385 PLEKHG3A1L390 1219 aa26.63■■□□□ 1.85
PTPRU-211ENST00000531385 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP26.63■■□□□ 1.85
PTPRU-211ENST00000531385 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP26.63■■□□□ 1.85
PTPRU-211ENST00000531385 CLSPNQ9HAW4 1339 aa26.62■■□□□ 1.85
PTPRU-211ENST00000531385 USP21Q9UK80 565 aa26.61■■□□□ 1.85
PTPRU-211ENST00000531385 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa26.6■■□□□ 1.85
PTPRU-211ENST00000531385 CABP1Q9NZU7 370 aa26.6■■□□□ 1.85
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