RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000529285.5

RPS3-213, Transcript of ribosomal protein S3, human

TSL 5

Gene RPS3, Length 550 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RPS3-213	ENST00000529285	ADGRL3	Q9HAR2	1447 aa		29.07	■■■□□ 2.24
RPS3-213	ENST00000529285	ARHGEF28	Q8N1W1	1705 aa	Known RBP	29.06	■■■□□ 2.24
RPS3-213	ENST00000529285	CADPS2	Q86UW7	1296 aa		29.05	■■■□□ 2.24
RPS3-213	ENST00000529285	CENPJ	Q9HC77	1338 aa	Predicted RBP	29.04	■■■□□ 2.24
RPS3-213	ENST00000529285	SIPA1L2	Q9P2F8	1722 aa	Predicted RBP	29.04	■■■□□ 2.24
RPS3-213	ENST00000529285	MINK1	Q8N4C8	1332 aa	Predicted RBP	29.03	■■■□□ 2.24
RPS3-213	ENST00000529285	EIF3A	Q14152	1382 aa	Known RBP	29.02	■■■□□ 2.24
RPS3-213	ENST00000529285	NALCN	Q8IZF0	1738 aa		29.02	■■■□□ 2.24
RPS3-213	ENST00000529285	HIRIP3	Q9BW71	556 aa	Predicted RBP	29.01	■■■□□ 2.23
RPS3-213	ENST00000529285	SLAIN2	Q9P270	581 aa		29	■■■□□ 2.23
RPS3-213	ENST00000529285	DCC	P43146	1447 aa		28.99	■■■□□ 2.23
RPS3-213	ENST00000529285	PIP4K2B	P78356	416 aa		28.97	■■■□□ 2.23
RPS3-213	ENST00000529285	FBXO41	Q8TF61	875 aa		28.94	■■■□□ 2.22
RPS3-213	ENST00000529285	SCAF1	Q9H7N4	1312 aa	Known RBP	28.94	■■■□□ 2.22
RPS3-213	ENST00000529285	USP47	Q96K76	1375 aa		28.93	■■■□□ 2.22
RPS3-213	ENST00000529285	ST20-MTHFS	A0A0A6YYL1	179 aa		28.93	■■■□□ 2.22
RPS3-213	ENST00000529285	WASL	O00401	505 aa	Predicted RBP	28.93	■■■□□ 2.22
RPS3-213	ENST00000529285	NUTM2F	A1L443	756 aa		28.91	■■■□□ 2.22
RPS3-213	ENST00000529285	CDC42BPG	Q6DT37	1551 aa		28.91	■■■□□ 2.22
RPS3-213	ENST00000529285	QRICH2	Q9H0J4	1663 aa		28.9	■■■□□ 2.22
RPS3-213	ENST00000529285	ZEB1	P37275	1124 aa	Predicted RBP	28.9	■■■□□ 2.22
RPS3-213	ENST00000529285	CDK19	Q9BWU1	502 aa		28.9	■■■□□ 2.22
RPS3-213	ENST00000529285	MST1R	Q04912	1400 aa		28.89	■■■□□ 2.22
RPS3-213	ENST00000529285	ADGRB2	O60241	1585 aa		28.88	■■■□□ 2.21
RPS3-213	ENST00000529285	EIF4G2	P78344	907 aa	Known RBP eCLIP	28.87	■■■□□ 2.21
RPS3-213	ENST00000529285	EVC2	Q86UK5	1308 aa		28.85	■■■□□ 2.21
RPS3-213	ENST00000529285	C1orf167	Q5SNV9	1468 aa		28.85	■■■□□ 2.21
RPS3-213	ENST00000529285	FMN2	Q9NZ56	1722 aa		28.83	■■■□□ 2.21
RPS3-213	ENST00000529285	SLC24A1	O60721	1099 aa		28.83	■■■□□ 2.21
RPS3-213	ENST00000529285	SRPK2	P78362	688 aa	Known RBP	28.83	■■■□□ 2.21
RPS3-213	ENST00000529285	ESCO1	Q5FWF5	840 aa		28.83	■■■□□ 2.21
RPS3-213	ENST00000529285	TESK2	Q96S53	571 aa		28.83	■■■□□ 2.21
RPS3-213	ENST00000529285	ORAI2	Q96SN7	254 aa		28.83	■■■□□ 2.21
RPS3-213	ENST00000529285	SBNO2	Q9Y2G9	1366 aa		28.83	■■■□□ 2.21
RPS3-213	ENST00000529285	HSPA5	P11021	654 aa	Known RBP	28.82	■■■□□ 2.2
RPS3-213	ENST00000529285	BRINP3	Q76B58	766 aa		28.81	■■■□□ 2.2
RPS3-213	ENST00000529285	CABP2	Q9NPB3	220 aa		28.81	■■■□□ 2.2
RPS3-213	ENST00000529285	NUDT16	Q96DE0	195 aa	Known RBP	28.8	■■■□□ 2.2
RPS3-213	ENST00000529285	ANKAR	Q7Z5J8	1434 aa		28.77	■■■□□ 2.2
RPS3-213	ENST00000529285	ROBO1	Q9Y6N7	1651 aa		28.77	■■■□□ 2.2
RPS3-213	ENST00000529285	PRR36	Q9H6K5	1346 aa		28.77	■■■□□ 2.2
RPS3-213	ENST00000529285	TULP4	Q9NRJ4	1543 aa		28.76	■■■□□ 2.19
RPS3-213	ENST00000529285	RGPD8	O14715	1765 aa	Predicted RBP	28.75	■■■□□ 2.19
RPS3-213	ENST00000529285	TMF1	P82094	1093 aa		28.74	■■■□□ 2.19
RPS3-213	ENST00000529285	PHF8	Q9UPP1	1060 aa		28.74	■■■□□ 2.19
RPS3-213	ENST00000529285	CCDC61	Q9Y6R9	512 aa		28.73	■■■□□ 2.19
RPS3-213	ENST00000529285	USP32	Q8NFA0	1604 aa		28.72	■■■□□ 2.19
RPS3-213	ENST00000529285	ILDR1	Q86SU0	546 aa	Predicted RBP	28.72	■■■□□ 2.19
RPS3-213	ENST00000529285	PMFBP1	Q8TBY8	1022 aa		28.71	■■■□□ 2.19
RPS3-213	ENST00000529285	FOXO3	O43524	673 aa		28.69	■■■□□ 2.18
RPS3-213	ENST00000529285	HSPA1L	P34931	641 aa		28.69	■■■□□ 2.18
RPS3-213	ENST00000529285	DDX17	Q92841	729 aa	Known RBP	28.69	■■■□□ 2.18
RPS3-213	ENST00000529285	PUS7	Q96PZ0	661 aa	Known RBP	28.69	■■■□□ 2.18
RPS3-213	ENST00000529285	ATP7B	P35670	1465 aa		28.69	■■■□□ 2.18
RPS3-213	ENST00000529285	DISP3	Q9P2K9	1392 aa		28.67	■■■□□ 2.18
RPS3-213	ENST00000529285	CDCA8	Q53HL2	280 aa		28.66	■■■□□ 2.18
RPS3-213	ENST00000529285	CABP1	Q9NZU7	370 aa		28.66	■■■□□ 2.18
RPS3-213	ENST00000529285	PLEKHG3	A1L390	1219 aa		28.65	■■■□□ 2.18
RPS3-213	ENST00000529285	NGDN	Q8NEJ9	315 aa	Known RBP	28.65	■■■□□ 2.18
RPS3-213	ENST00000529285	ATAD2	Q6PL18	1390 aa		28.64	■■■□□ 2.18
RPS3-213	ENST00000529285	NPHP3	Q7Z494	1330 aa		28.64	■■■□□ 2.17
RPS3-213	ENST00000529285	PPIP5K1	Q6PFW1	1433 aa		28.63	■■■□□ 2.17
RPS3-213	ENST00000529285	PSME1	Q06323	249 aa		28.63	■■■□□ 2.17
RPS3-213	ENST00000529285	ITSN1	Q15811	1721 aa		28.63	■■■□□ 2.17
RPS3-213	ENST00000529285	KIF1A	Q12756	1690 aa		28.62	■■■□□ 2.17
RPS3-213	ENST00000529285	TMC1	Q8TDI8	760 aa		28.61	■■■□□ 2.17
RPS3-213	ENST00000529285	XPC	Q01831	940 aa	Predicted RBP	28.6	■■■□□ 2.17
RPS3-213	ENST00000529285	KRT28	Q7Z3Y7	464 aa		28.6	■■■□□ 2.17
RPS3-213	ENST00000529285	AHDC1	Q5TGY3	1603 aa	Predicted RBP	28.6	■■■□□ 2.17
RPS3-213	ENST00000529285	ACE	P12821	1306 aa		28.6	■■■□□ 2.17
RPS3-213	ENST00000529285	PHLPP1	O60346	1717 aa		28.6	■■■□□ 2.17
RPS3-213	ENST00000529285	NHSL1	Q5SYE7	1610 aa		28.59	■■■□□ 2.17
RPS3-213	ENST00000529285	TOPAZ1	Q8N9V7	1692 aa		28.59	■■■□□ 2.17
RPS3-213	ENST00000529285	SOS2	Q07890	1332 aa	Predicted RBP	28.58	■■■□□ 2.17
RPS3-213	ENST00000529285	SLC12A5	Q9H2X9	1139 aa		28.57	■■■□□ 2.16
RPS3-213	ENST00000529285	C11orf95	C9JLR9	678 aa	Predicted RBP	28.56	■■■□□ 2.16
RPS3-213	ENST00000529285	LRRC59	Q96AG4	307 aa	Known RBP	28.56	■■■□□ 2.16
RPS3-213	ENST00000529285	POLR3GL	Q9BT43	218 aa		28.56	■■■□□ 2.16
RPS3-213	ENST00000529285	POLR3A	O14802	1390 aa	Predicted RBP	28.55	■■■□□ 2.16
RPS3-213	ENST00000529285	ZNF692	Q9BU19	519 aa	Predicted RBP	28.52	■■■□□ 2.16
RPS3-213	ENST00000529285	PXDN	Q92626	1479 aa		28.52	■■■□□ 2.16
RPS3-213	ENST00000529285	COL16A1	Q07092	1604 aa	Predicted RBP	28.51	■■■□□ 2.15
RPS3-213	ENST00000529285	NINL	Q9Y2I6	1382 aa		28.5	■■■□□ 2.15
RPS3-213	ENST00000529285	TERF2IP	Q9NYB0	399 aa		28.49	■■■□□ 2.15
RPS3-213	ENST00000529285	PAK3	O75914	559 aa	Predicted RBP	28.48	■■■□□ 2.15
RPS3-213	ENST00000529285	HDGFL2	Q7Z4V5	671 aa	Predicted RBP	28.48	■■■□□ 2.15
RPS3-213	ENST00000529285	SBNO1	A3KN83	1393 aa		28.46	■■■□□ 2.15
RPS3-213	ENST00000529285	KIF7	Q2M1P5	1343 aa		28.45	■■■□□ 2.15
RPS3-213	ENST00000529285	SPATA31A3	Q5VYP0	1347 aa		28.45	■■■□□ 2.15
RPS3-213	ENST00000529285	CPSF1	Q10570	1443 aa	Known RBP	28.45	■■■□□ 2.15
RPS3-213	ENST00000529285	LMOD2	Q6P5Q4	547 aa		28.45	■■■□□ 2.14
RPS3-213	ENST00000529285	JCAD	Q9P266	1359 aa		28.45	■■■□□ 2.14
RPS3-213	ENST00000529285	KTN1	Q86UP2	1357 aa	Known RBP	28.44	■■■□□ 2.14
RPS3-213	ENST00000529285	CD163L1	Q9NR16	1453 aa		28.42	■■■□□ 2.14
RPS3-213	ENST00000529285	USP6	P35125	1406 aa		28.42	■■■□□ 2.14
RPS3-213	ENST00000529285	BRD4	O60885	1362 aa	Predicted RBP	28.41	■■■□□ 2.14
RPS3-213	ENST00000529285	TNS3	Q68CZ2	1445 aa		28.4	■■■□□ 2.14
RPS3-213	ENST00000529285	AKAP12	Q02952	1782 aa		28.39	■■■□□ 2.14
RPS3-213	ENST00000529285		A0A1W2PP64	1363 aa		28.39	■■■□□ 2.14
RPS3-213	ENST00000529285	TRPM3	Q9HCF6	1732 aa	Predicted RBP	28.39	■■■□□ 2.14

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