RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000527103.1

PITPNM1-208, Transcript of phosphatidylinositol transfer protein membrane associated 1, human

TSL 4

Gene PITPNM1, Length 308 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PITPNM1-208	ENST00000527103	BRINP3	Q76B58	766 aa		32.08	■■■□□ 2.73
PITPNM1-208	ENST00000527103	NBPF1	Q3BBV0	1214 aa		32.07	■■■□□ 2.72
PITPNM1-208	ENST00000527103	SAFB2	Q14151	953 aa	Known RBP eCLIP	32.06	■■■□□ 2.72
PITPNM1-208	ENST00000527103	DLC1	Q96QB1	1528 aa		32.03	■■■□□ 2.72
PITPNM1-208	ENST00000527103	C1orf167	Q5SNV9	1468 aa		32.02	■■■□□ 2.72
PITPNM1-208	ENST00000527103	TONSL	Q96HA7	1378 aa		32	■■■□□ 2.71
PITPNM1-208	ENST00000527103	ORAI2	Q96SN7	254 aa		31.99	■■■□□ 2.71
PITPNM1-208	ENST00000527103	KIAA1210	Q9ULL0	1709 aa		31.97	■■■□□ 2.71
PITPNM1-208	ENST00000527103	NUTM2F	A1L443	756 aa		31.97	■■■□□ 2.71
PITPNM1-208	ENST00000527103	CDC42BPG	Q6DT37	1551 aa		31.96	■■■□□ 2.71
PITPNM1-208	ENST00000527103	NBPF8	Q3BBV2	869 aa		31.95	■■■□□ 2.71
PITPNM1-208	ENST00000527103	ESCO1	Q5FWF5	840 aa		31.94	■■■□□ 2.7
PITPNM1-208	ENST00000527103	HIRIP3	Q9BW71	556 aa	Predicted RBP	31.92	■■■□□ 2.7
PITPNM1-208	ENST00000527103	MINK1	Q8N4C8	1332 aa	Predicted RBP	31.92	■■■□□ 2.7
PITPNM1-208	ENST00000527103	DDX17	Q92841	729 aa	Known RBP	31.91	■■■□□ 2.7
PITPNM1-208	ENST00000527103	PHLPP1	O60346	1717 aa		31.91	■■■□□ 2.7
PITPNM1-208	ENST00000527103	AHDC1	Q5TGY3	1603 aa	Predicted RBP	31.89	■■■□□ 2.7
PITPNM1-208	ENST00000527103	ILDR2	Q71H61	639 aa		31.88	■■■□□ 2.69
PITPNM1-208	ENST00000527103	CLSPN	Q9HAW4	1339 aa		31.88	■■■□□ 2.69
PITPNM1-208	ENST00000527103	ROCK2	O75116	1388 aa	Known RBP	31.85	■■■□□ 2.69
PITPNM1-208	ENST00000527103	JCAD	Q9P266	1359 aa		31.85	■■■□□ 2.69
PITPNM1-208	ENST00000527103	WASL	O00401	505 aa	Predicted RBP	31.84	■■■□□ 2.69
PITPNM1-208	ENST00000527103	CCER1	Q8TC90	406 aa	Predicted RBP	31.84	■■■□□ 2.69
PITPNM1-208	ENST00000527103	COL16A1	Q07092	1604 aa	Predicted RBP	31.84	■■■□□ 2.69
PITPNM1-208	ENST00000527103	MED1	Q15648	1581 aa	Predicted RBP	31.83	■■■□□ 2.69
PITPNM1-208	ENST00000527103	LRRC59	Q96AG4	307 aa	Known RBP	31.82	■■■□□ 2.68
PITPNM1-208	ENST00000527103	ARHGEF28	Q8N1W1	1705 aa	Known RBP	31.82	■■■□□ 2.68
PITPNM1-208	ENST00000527103	TRPM1	Q7Z4N2	1603 aa		31.82	■■■□□ 2.68
PITPNM1-208	ENST00000527103	FMN2	Q9NZ56	1722 aa		31.81	■■■□□ 2.68
PITPNM1-208	ENST00000527103	FOXO3	O43524	673 aa		31.81	■■■□□ 2.68
PITPNM1-208	ENST00000527103	CENPJ	Q9HC77	1338 aa	Predicted RBP	31.79	■■■□□ 2.68
PITPNM1-208	ENST00000527103	NHSL1	Q5SYE7	1610 aa		31.78	■■■□□ 2.68
PITPNM1-208	ENST00000527103	SOS2	Q07890	1332 aa	Predicted RBP	31.78	■■■□□ 2.68
PITPNM1-208	ENST00000527103	NPHP3	Q7Z494	1330 aa		31.77	■■■□□ 2.68
PITPNM1-208	ENST00000527103	ADGRB2	O60241	1585 aa		31.77	■■■□□ 2.68
PITPNM1-208	ENST00000527103	PHF8	Q9UPP1	1060 aa		31.77	■■■□□ 2.68
PITPNM1-208	ENST00000527103	TIMELESS	Q9UNS1	1208 aa		31.76	■■■□□ 2.67
PITPNM1-208	ENST00000527103	CDK19	Q9BWU1	502 aa		31.75	■■■□□ 2.67
PITPNM1-208	ENST00000527103	CARD11	Q9BXL7	1154 aa		31.75	■■■□□ 2.67
PITPNM1-208	ENST00000527103	EIF3A	Q14152	1382 aa	Known RBP	31.74	■■■□□ 2.67
PITPNM1-208	ENST00000527103	GPRASP1	Q5JY77	1395 aa		31.74	■■■□□ 2.67
PITPNM1-208	ENST00000527103	ANKAR	Q7Z5J8	1434 aa		31.74	■■■□□ 2.67
PITPNM1-208	ENST00000527103	XPC	Q01831	940 aa	Predicted RBP	31.73	■■■□□ 2.67
PITPNM1-208	ENST00000527103	PRR36	Q9H6K5	1346 aa		31.73	■■■□□ 2.67
PITPNM1-208	ENST00000527103	PMFBP1	Q8TBY8	1022 aa		31.71	■■■□□ 2.67
PITPNM1-208	ENST00000527103	SPATA31A6	Q5VVP1	1343 aa		31.71	■■■□□ 2.67
PITPNM1-208	ENST00000527103	NUDT16	Q96DE0	195 aa	Known RBP	31.7	■■■□□ 2.67
PITPNM1-208	ENST00000527103	RALGAPB	Q86X10	1494 aa		31.68	■■■□□ 2.66
PITPNM1-208	ENST00000527103	KRT28	Q7Z3Y7	464 aa		31.68	■■■□□ 2.66
PITPNM1-208	ENST00000527103	PHF23	Q9BUL5	403 aa	Predicted RBP	31.68	■■■□□ 2.66
PITPNM1-208	ENST00000527103	RGPD8	O14715	1765 aa	Predicted RBP	31.68	■■■□□ 2.66
PITPNM1-208	ENST00000527103	TULP4	Q9NRJ4	1543 aa		31.67	■■■□□ 2.66
PITPNM1-208	ENST00000527103	SOCS7	O14512	581 aa		31.66	■■■□□ 2.66
PITPNM1-208	ENST00000527103	PSME1	Q06323	249 aa		31.66	■■■□□ 2.66
PITPNM1-208	ENST00000527103	USP32	Q8NFA0	1604 aa		31.66	■■■□□ 2.66
PITPNM1-208	ENST00000527103	NUTM2B	A6NNL0	878 aa	Predicted RBP	31.65	■■■□□ 2.66
PITPNM1-208	ENST00000527103	NUTM2E	B1AL46	878 aa	Predicted RBP	31.65	■■■□□ 2.66
PITPNM1-208	ENST00000527103	NUTM2A	Q8IVF1	878 aa	Predicted RBP	31.65	■■■□□ 2.66
PITPNM1-208	ENST00000527103	PXDN	Q92626	1479 aa		31.65	■■■□□ 2.66
PITPNM1-208	ENST00000527103	PNPLA6	Q8IY17	1366 aa		31.64	■■■□□ 2.66
PITPNM1-208	ENST00000527103	KIF1A	Q12756	1690 aa		31.64	■■■□□ 2.65
PITPNM1-208	ENST00000527103	SRPK2	P78362	688 aa	Known RBP	31.63	■■■□□ 2.65
PITPNM1-208	ENST00000527103	SHPRH	Q149N8	1683 aa		31.63	■■■□□ 2.65
PITPNM1-208	ENST00000527103	CABP2	Q9NPB3	220 aa		31.61	■■■□□ 2.65
PITPNM1-208	ENST00000527103	CCDC61	Q9Y6R9	512 aa		31.61	■■■□□ 2.65
PITPNM1-208	ENST00000527103	NGDN	Q8NEJ9	315 aa	Known RBP	31.6	■■■□□ 2.65
PITPNM1-208	ENST00000527103	EVC2	Q86UK5	1308 aa		31.58	■■■□□ 2.65
PITPNM1-208	ENST00000527103	MEX3C	Q5U5Q3	659 aa	Known RBP	31.58	■■■□□ 2.65
PITPNM1-208	ENST00000527103	ATP7B	P35670	1465 aa		31.58	■■■□□ 2.65
PITPNM1-208	ENST00000527103	QRICH2	Q9H0J4	1663 aa		31.57	■■■□□ 2.65
PITPNM1-208	ENST00000527103	SPATA31A3	Q5VYP0	1347 aa		31.57	■■■□□ 2.64
PITPNM1-208	ENST00000527103	LRP6	O75581	1613 aa		31.57	■■■□□ 2.64
PITPNM1-208	ENST00000527103	RGS17	Q9UGC6	210 aa	Predicted RBP	31.55	■■■□□ 2.64
PITPNM1-208	ENST00000527103	PLEKHG3	A1L390	1219 aa		31.54	■■■□□ 2.64
PITPNM1-208	ENST00000527103	SBNO1	A3KN83	1393 aa		31.52	■■■□□ 2.64
PITPNM1-208	ENST00000527103	LMOD2	Q6P5Q4	547 aa		31.5	■■■□□ 2.63
PITPNM1-208	ENST00000527103	ACE	P12821	1306 aa		31.49	■■■□□ 2.63
PITPNM1-208	ENST00000527103	SBNO2	Q9Y2G9	1366 aa		31.48	■■■□□ 2.63
PITPNM1-208	ENST00000527103	ST20-MTHFS	A0A0A6YYL1	179 aa		31.48	■■■□□ 2.63
PITPNM1-208	ENST00000527103	ADAMTS2	O95450	1211 aa		31.48	■■■□□ 2.63
PITPNM1-208	ENST00000527103	CABP1	Q9NZU7	370 aa		31.48	■■■□□ 2.63
PITPNM1-208	ENST00000527103	TNS3	Q68CZ2	1445 aa		31.47	■■■□□ 2.63
PITPNM1-208	ENST00000527103	PPIP5K1	Q6PFW1	1433 aa		31.46	■■■□□ 2.63
PITPNM1-208	ENST00000527103	ITSN1	Q15811	1721 aa		31.46	■■■□□ 2.63
PITPNM1-208	ENST00000527103	PAK3	O75914	559 aa	Predicted RBP	31.45	■■■□□ 2.63
PITPNM1-208	ENST00000527103	POLR3A	O14802	1390 aa	Predicted RBP	31.44	■■■□□ 2.62
PITPNM1-208	ENST00000527103	COL22A1	Q8NFW1	1626 aa	Predicted RBP	31.43	■■■□□ 2.62
PITPNM1-208	ENST00000527103	C8orf37	Q96NL8	207 aa		31.42	■■■□□ 2.62
PITPNM1-208	ENST00000527103	ARHGEF10	O15013	1369 aa		31.42	■■■□□ 2.62
PITPNM1-208	ENST00000527103	PLEKHG5	O94827	1062 aa		31.41	■■■□□ 2.62
PITPNM1-208	ENST00000527103	TESK2	Q96S53	571 aa		31.41	■■■□□ 2.62
PITPNM1-208	ENST00000527103	TOPAZ1	Q8N9V7	1692 aa		31.41	■■■□□ 2.62
PITPNM1-208	ENST00000527103	POTEA	Q6S8J7	498 aa		31.4	■■■□□ 2.62
PITPNM1-208	ENST00000527103	CABLES1	Q8TDN4	633 aa		31.4	■■■□□ 2.62
PITPNM1-208	ENST00000527103	NGLY1	Q96IV0	654 aa		31.4	■■■□□ 2.62
PITPNM1-208	ENST00000527103	USP47	Q96K76	1375 aa		31.4	■■■□□ 2.62
PITPNM1-208	ENST00000527103	SLC24A1	O60721	1099 aa		31.39	■■■□□ 2.62
PITPNM1-208	ENST00000527103	ZNF772	Q68DY9	489 aa	Predicted RBP	31.38	■■■□□ 2.61
PITPNM1-208	ENST00000527103	ATAD2	Q6PL18	1390 aa		31.37	■■■□□ 2.61
PITPNM1-208	ENST00000527103	AFF2	P51816	1311 aa		31.36	■■■□□ 2.61

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