RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000527027.1

PTPRU-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type U, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRU, Length 619 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRU-210ENST00000527027 TRPC5Q9UL62 973 aaPredicted RBP24.18■■□□□ 1.46
PTPRU-210ENST00000527027 NPHP3Q7Z494 1330 aa24.17■■□□□ 1.46
PTPRU-210ENST00000527027 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa24.16■■□□□ 1.46
PTPRU-210ENST00000527027 RGL3Q3MIN7 710 aa24.14■■□□□ 1.45
PTPRU-210ENST00000527027 FOXO3O43524 673 aa24.13■■□□□ 1.45
PTPRU-210ENST00000527027 STK26Q9P289 416 aa24.13■■□□□ 1.45
PTPRU-210ENST00000527027 PPLO60437 1756 aa24.13■■□□□ 1.45
PTPRU-210ENST00000527027 WAPLQ7Z5K2 1190 aa24.12■■□□□ 1.45
PTPRU-210ENST00000527027 ATAD2Q6PL18 1390 aa24.11■■□□□ 1.45
PTPRU-210ENST00000527027 CCDC144AA2RUR9 1427 aa24.1■■□□□ 1.45
PTPRU-210ENST00000527027 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa24.09■■□□□ 1.45
PTPRU-210ENST00000527027 MYOM2P54296 1465 aa24.09■■□□□ 1.45
PTPRU-210ENST00000527027 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa24.09■■□□□ 1.45
PTPRU-210ENST00000527027 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP24.09■■□□□ 1.45
PTPRU-210ENST00000527027 ATRNO75882 1429 aa24.09■■□□□ 1.45
PTPRU-210ENST00000527027 PXDNQ92626 1479 aa24.08■■□□□ 1.45
PTPRU-210ENST00000527027 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP24.08■■□□□ 1.45
PTPRU-210ENST00000527027 ABCC11Q96J66 1382 aa24.08■■□□□ 1.45
PTPRU-210ENST00000527027 NUTM2FA1L443 756 aa24.08■■□□□ 1.45
PTPRU-210ENST00000527027 TMEM132EQ6IEE7 984 aa24.08■■□□□ 1.45
PTPRU-210ENST00000527027 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP24.08■■□□□ 1.45
PTPRU-210ENST00000527027 TECPR2O15040 1411 aa24.08■■□□□ 1.44
PTPRU-210ENST00000527027 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa24.08■■□□□ 1.44
PTPRU-210ENST00000527027 MPHOSPH9Q99550 1183 aa24.07■■□□□ 1.44
PTPRU-210ENST00000527027 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa24.07■■□□□ 1.44
PTPRU-210ENST00000527027 BCL9LQ86UU0 1499 aa24.04■■□□□ 1.44
PTPRU-210ENST00000527027 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa24.03■■□□□ 1.44
PTPRU-210ENST00000527027 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP24.02■■□□□ 1.44
PTPRU-210ENST00000527027 SIRT1Q96EB6 747 aa24.01■■□□□ 1.43
PTPRU-210ENST00000527027 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa24■■□□□ 1.43
PTPRU-210ENST00000527027 PIK3C2GO75747 1445 aa24■■□□□ 1.43
PTPRU-210ENST00000527027 CCDC125Q86Z20 511 aa23.99■■□□□ 1.43
PTPRU-210ENST00000527027 KRT28Q7Z3Y7 464 aa23.98■■□□□ 1.43
PTPRU-210ENST00000527027 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP23.98■■□□□ 1.43
PTPRU-210ENST00000527027 EP400Q96L91 3159 aa23.98■■□□□ 1.43
PTPRU-210ENST00000527027 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP23.97■■□□□ 1.43
PTPRU-210ENST00000527027 UNC5CLQ8IV45 518 aa23.96■■□□□ 1.43
PTPRU-210ENST00000527027 ZRANB1Q9UGI0 708 aa23.95■■□□□ 1.42
PTPRU-210ENST00000527027 IFT172Q9UG01 1749 aa23.93■■□□□ 1.42
PTPRU-210ENST00000527027 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP23.93■■□□□ 1.42
PTPRU-210ENST00000527027 PSME1Q06323 249 aa23.93■■□□□ 1.42
PTPRU-210ENST00000527027 PHF8Q9UPP1 1060 aa23.93■■□□□ 1.42
PTPRU-210ENST00000527027 CFAP70Q5T0N1 1121 aa23.92■■□□□ 1.42
PTPRU-210ENST00000527027 KNDC1Q76NI1 1749 aa23.92■■□□□ 1.42
PTPRU-210ENST00000527027 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP23.91■■□□□ 1.42
PTPRU-210ENST00000527027 SLIT2O94813 1529 aa23.91■■□□□ 1.42
PTPRU-210ENST00000527027 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP23.9■■□□□ 1.42
PTPRU-210ENST00000527027 FMN2Q9NZ56 1722 aa23.9■■□□□ 1.42
PTPRU-210ENST00000527027 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP23.89■■□□□ 1.41
PTPRU-210ENST00000527027 RALGAPBQ86X10 1494 aa23.88■■□□□ 1.41
PTPRU-210ENST00000527027 PRAM1Q96QH2 718 aa23.88■■□□□ 1.41
PTPRU-210ENST00000527027 KIF1AQ12756 1690 aa23.88■■□□□ 1.41
PTPRU-210ENST00000527027 CABLES1Q8TDN4 633 aa23.87■■□□□ 1.41
PTPRU-210ENST00000527027 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP23.86■■□□□ 1.41
PTPRU-210ENST00000527027 NRXN1Q9ULB1 1477 aa23.86■■□□□ 1.41
PTPRU-210ENST00000527027 TNS3Q68CZ2 1445 aa23.85■■□□□ 1.41
PTPRU-210ENST00000527027 TNKS1BP1Q9C0C2 1729 aaKnown RBP23.84■■□□□ 1.41
PTPRU-210ENST00000527027 SBNO1A3KN83 1393 aa23.84■■□□□ 1.41
PTPRU-210ENST00000527027 VPS72Q15906 364 aa23.84■■□□□ 1.41
PTPRU-210ENST00000527027 LMOD2Q6P5Q4 547 aa23.84■■□□□ 1.41
PTPRU-210ENST00000527027 POGKQ9P215 609 aa23.84■■□□□ 1.41
PTPRU-210ENST00000527027 GLI3P10071 1580 aa23.83■■□□□ 1.41
PTPRU-210ENST00000527027 PLEKHG5O94827 1062 aa23.83■■□□□ 1.41
PTPRU-210ENST00000527027 SEPT12Q8IYM1 358 aa23.83■■□□□ 1.41
PTPRU-210ENST00000527027 USP32Q8NFA0 1604 aa23.81■■□□□ 1.4
PTPRU-210ENST00000527027 ARHGEF10O15013 1369 aa23.81■■□□□ 1.4
PTPRU-210ENST00000527027 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP23.81■■□□□ 1.4
PTPRU-210ENST00000527027 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa23.81■■□□□ 1.4
PTPRU-210ENST00000527027 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP23.81■■□□□ 1.4
PTPRU-210ENST00000527027 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP23.79■■□□□ 1.4
PTPRU-210ENST00000527027 FAM83GA6ND36 823 aa23.78■■□□□ 1.4
PTPRU-210ENST00000527027 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP23.77■■□□□ 1.4
PTPRU-210ENST00000527027 ANKARQ7Z5J8 1434 aa23.76■■□□□ 1.39
PTPRU-210ENST00000527027 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP23.76■■□□□ 1.39
PTPRU-210ENST00000527027 DLC1Q96QB1 1528 aa23.76■■□□□ 1.39
PTPRU-210ENST00000527027 DEFB132Q7Z7B7 95 aa23.76■■□□□ 1.39
PTPRU-210ENST00000527027 KRT27Q7Z3Y8 459 aa23.75■■□□□ 1.39
PTPRU-210ENST00000527027 TRAK1Q9UPV9 953 aa23.75■■□□□ 1.39
PTPRU-210ENST00000527027 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP23.73■■□□□ 1.39
PTPRU-210ENST00000527027 GPRASP1Q5JY77 1395 aa23.71■■□□□ 1.39
PTPRU-210ENST00000527027 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa23.71■■□□□ 1.39
PTPRU-210ENST00000527027 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa23.71■■□□□ 1.39
PTPRU-210ENST00000527027 NWD2Q9ULI1 1742 aa23.7■■□□□ 1.39
PTPRU-210ENST00000527027 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP23.7■■□□□ 1.38
PTPRU-210ENST00000527027 BTG4Q9NY30 223 aa23.7■■□□□ 1.38
PTPRU-210ENST00000527027 ADGRB1O14514 1584 aa23.69■■□□□ 1.38
PTPRU-210ENST00000527027 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP23.69■■□□□ 1.38
PTPRU-210ENST00000527027 BRWD3Q6RI45 1802 aa23.69■■□□□ 1.38
PTPRU-210ENST00000527027 WASLO00401 505 aaPredicted RBP23.69■■□□□ 1.38
PTPRU-210ENST00000527027 DCAF11Q8TEB1 546 aa23.69■■□□□ 1.38
PTPRU-210ENST00000527027 PRR36Q9H6K5 1346 aa23.68■■□□□ 1.38
PTPRU-210ENST00000527027 A0A0G2JS52 829 aa23.68■■□□□ 1.38
PTPRU-210ENST00000527027 MYT1Q01538 1121 aa23.68■■□□□ 1.38
PTPRU-210ENST00000527027 STAC3Q96MF2 364 aa23.68■■□□□ 1.38
PTPRU-210ENST00000527027 PLCH1Q4KWH8 1693 aa23.67■■□□□ 1.38
PTPRU-210ENST00000527027 ADGRB2O60241 1585 aa23.67■■□□□ 1.38
PTPRU-210ENST00000527027 FAM98CQ17RN3 349 aaKnown RBP23.67■■□□□ 1.38
PTPRU-210ENST00000527027 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP23.65■■□□□ 1.38
PTPRU-210ENST00000527027 ABCA3Q99758 1704 aa23.64■■□□□ 1.38
PTPRU-210ENST00000527027 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP23.63■■□□□ 1.37
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