RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000523270.1

CNOT8-223, Transcript of CCR4-NOT transcription complex subunit 8, human

TSL 4

Gene CNOT8, Length 575 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CNOT8-223	ENST00000523270	DLC1	Q96QB1	1528 aa		29.83	■■■□□ 2.37
CNOT8-223	ENST00000523270	STAC3	Q96MF2	364 aa		29.82	■■■□□ 2.36
CNOT8-223	ENST00000523270	FMN2	Q9NZ56	1722 aa		29.79	■■■□□ 2.36
CNOT8-223	ENST00000523270	SIRT1	Q96EB6	747 aa		29.79	■■■□□ 2.36
CNOT8-223	ENST00000523270	KIAA1210	Q9ULL0	1709 aa		29.79	■■■□□ 2.36
CNOT8-223	ENST00000523270	DDX17	Q92841	729 aa	Known RBP	29.78	■■■□□ 2.36
CNOT8-223	ENST00000523270	PRAM1	Q96QH2	718 aa		29.77	■■■□□ 2.36
CNOT8-223	ENST00000523270	ORAI2	Q96SN7	254 aa		29.77	■■■□□ 2.36
CNOT8-223	ENST00000523270	ARHGEF28	Q8N1W1	1705 aa	Known RBP	29.76	■■■□□ 2.36
CNOT8-223	ENST00000523270	NEUROD1	Q13562	356 aa		29.76	■■■□□ 2.35
CNOT8-223	ENST00000523270	SAFB2	Q14151	953 aa	Known RBP eCLIP	29.76	■■■□□ 2.35
CNOT8-223	ENST00000523270	TRAK1	Q9UPV9	953 aa		29.76	■■■□□ 2.35
CNOT8-223	ENST00000523270	L3MBTL2	Q969R5	705 aa		29.75	■■■□□ 2.35
CNOT8-223	ENST00000523270	JCAD	Q9P266	1359 aa		29.74	■■■□□ 2.35
CNOT8-223	ENST00000523270	SHPRH	Q149N8	1683 aa		29.72	■■■□□ 2.35
CNOT8-223	ENST00000523270	NUTM2F	A1L443	756 aa		29.72	■■■□□ 2.35
CNOT8-223	ENST00000523270	ILDR2	Q71H61	639 aa		29.72	■■■□□ 2.35
CNOT8-223	ENST00000523270	RGPD8	O14715	1765 aa	Predicted RBP	29.72	■■■□□ 2.35
CNOT8-223	ENST00000523270	ADGRB2	O60241	1585 aa		29.69	■■■□□ 2.34
CNOT8-223	ENST00000523270	NBPF1	Q3BBV0	1214 aa		29.69	■■■□□ 2.34
CNOT8-223	ENST00000523270	POGK	Q9P215	609 aa		29.68	■■■□□ 2.34
CNOT8-223	ENST00000523270	LRP6	O75581	1613 aa		29.66	■■■□□ 2.34
CNOT8-223	ENST00000523270	USP32	Q8NFA0	1604 aa		29.65	■■■□□ 2.34
CNOT8-223	ENST00000523270	TRPM1	Q7Z4N2	1603 aa		29.64	■■■□□ 2.34
CNOT8-223	ENST00000523270	ESCO1	Q5FWF5	840 aa		29.64	■■■□□ 2.34
CNOT8-223	ENST00000523270	HIRIP3	Q9BW71	556 aa	Predicted RBP	29.63	■■■□□ 2.33
CNOT8-223	ENST00000523270	MINK1	Q8N4C8	1332 aa	Predicted RBP	29.63	■■■□□ 2.33
CNOT8-223	ENST00000523270	PHF23	Q9BUL5	403 aa	Predicted RBP	29.6	■■■□□ 2.33
CNOT8-223	ENST00000523270	SOS2	Q07890	1332 aa	Predicted RBP	29.6	■■■□□ 2.33
CNOT8-223	ENST00000523270	KIF1A	Q12756	1690 aa		29.6	■■■□□ 2.33
CNOT8-223	ENST00000523270	PXDN	Q92626	1479 aa		29.59	■■■□□ 2.33
CNOT8-223	ENST00000523270	PNPLA6	Q8IY17	1366 aa		29.58	■■■□□ 2.33
CNOT8-223	ENST00000523270	RGS17	Q9UGC6	210 aa	Predicted RBP	29.58	■■■□□ 2.33
CNOT8-223	ENST00000523270	SPATA31A6	Q5VVP1	1343 aa		29.56	■■■□□ 2.32
CNOT8-223	ENST00000523270	LRRC59	Q96AG4	307 aa	Known RBP	29.56	■■■□□ 2.32
CNOT8-223	ENST00000523270	PCGF6	Q9BYE7	350 aa		29.56	■■■□□ 2.32
CNOT8-223	ENST00000523270	XPC	Q01831	940 aa	Predicted RBP	29.55	■■■□□ 2.32
CNOT8-223	ENST00000523270	FOXO3	O43524	673 aa		29.54	■■■□□ 2.32
CNOT8-223	ENST00000523270	NBPF8	Q3BBV2	869 aa		29.54	■■■□□ 2.32
CNOT8-223	ENST00000523270	NPHP3	Q7Z494	1330 aa		29.53	■■■□□ 2.32
CNOT8-223	ENST00000523270	TULP4	Q9NRJ4	1543 aa		29.53	■■■□□ 2.32
CNOT8-223	ENST00000523270	ANKAR	Q7Z5J8	1434 aa		29.53	■■■□□ 2.32
CNOT8-223	ENST00000523270	PRR36	Q9H6K5	1346 aa		29.52	■■■□□ 2.32
CNOT8-223	ENST00000523270	NUTM2B	A6NNL0	878 aa	Predicted RBP	29.5	■■■□□ 2.31
CNOT8-223	ENST00000523270	NUTM2E	B1AL46	878 aa	Predicted RBP	29.5	■■■□□ 2.31
CNOT8-223	ENST00000523270	WASL	O00401	505 aa	Predicted RBP	29.5	■■■□□ 2.31
CNOT8-223	ENST00000523270	NUTM2A	Q8IVF1	878 aa	Predicted RBP	29.5	■■■□□ 2.31
CNOT8-223	ENST00000523270	TONSL	Q96HA7	1378 aa		29.5	■■■□□ 2.31
CNOT8-223	ENST00000523270	PHF8	Q9UPP1	1060 aa		29.49	■■■□□ 2.31
CNOT8-223	ENST00000523270	QRICH2	Q9H0J4	1663 aa		29.49	■■■□□ 2.31
CNOT8-223	ENST00000523270	COL22A1	Q8NFW1	1626 aa	Predicted RBP	29.48	■■■□□ 2.31
CNOT8-223	ENST00000523270	ATP7B	P35670	1465 aa		29.46	■■■□□ 2.31
CNOT8-223	ENST00000523270	ROCK2	O75116	1388 aa	Known RBP	29.45	■■■□□ 2.31
CNOT8-223	ENST00000523270	PMFBP1	Q8TBY8	1022 aa		29.44	■■■□□ 2.3
CNOT8-223	ENST00000523270	MEX3C	Q5U5Q3	659 aa	Known RBP	29.43	■■■□□ 2.3
CNOT8-223	ENST00000523270	CENPJ	Q9HC77	1338 aa	Predicted RBP	29.43	■■■□□ 2.3
CNOT8-223	ENST00000523270	ITSN1	Q15811	1721 aa		29.42	■■■□□ 2.3
CNOT8-223	ENST00000523270	EIF3A	Q14152	1382 aa	Known RBP	29.42	■■■□□ 2.3
CNOT8-223	ENST00000523270	TOPAZ1	Q8N9V7	1692 aa		29.42	■■■□□ 2.3
CNOT8-223	ENST00000523270	POTEA	Q6S8J7	498 aa		29.42	■■■□□ 2.3
CNOT8-223	ENST00000523270	GPRASP1	Q5JY77	1395 aa		29.41	■■■□□ 2.3
CNOT8-223	ENST00000523270	KRT28	Q7Z3Y7	464 aa		29.41	■■■□□ 2.3
CNOT8-223	ENST00000523270	CDK19	Q9BWU1	502 aa		29.4	■■■□□ 2.3
CNOT8-223	ENST00000523270	TRPM3	Q9HCF6	1732 aa	Predicted RBP	29.4	■■■□□ 2.3
CNOT8-223	ENST00000523270	RALGAPB	Q86X10	1494 aa		29.39	■■■□□ 2.3
CNOT8-223	ENST00000523270	SPATA31A3	Q5VYP0	1347 aa		29.38	■■■□□ 2.29
CNOT8-223	ENST00000523270	NUDT16	Q96DE0	195 aa	Known RBP	29.37	■■■□□ 2.29
CNOT8-223	ENST00000523270	TNS3	Q68CZ2	1445 aa		29.36	■■■□□ 2.29
CNOT8-223	ENST00000523270	ADAMTS2	O95450	1211 aa		29.33	■■■□□ 2.29
CNOT8-223	ENST00000523270	MARF1	Q9Y4F3	1742 aa	Known RBP	29.33	■■■□□ 2.29
CNOT8-223	ENST00000523270	SBNO1	A3KN83	1393 aa		29.32	■■■□□ 2.28
CNOT8-223	ENST00000523270	ABCA3	Q99758	1704 aa		29.31	■■■□□ 2.28
CNOT8-223	ENST00000523270	ALS2	Q96Q42	1657 aa		29.31	■■■□□ 2.28
CNOT8-223	ENST00000523270	AFF2	P51816	1311 aa		29.31	■■■□□ 2.28
CNOT8-223	ENST00000523270	PSME1	Q06323	249 aa		29.31	■■■□□ 2.28
CNOT8-223	ENST00000523270	C8orf37	Q96NL8	207 aa		29.31	■■■□□ 2.28
CNOT8-223	ENST00000523270	SOCS7	O14512	581 aa		29.28	■■■□□ 2.28
CNOT8-223	ENST00000523270	CARD11	Q9BXL7	1154 aa		29.28	■■■□□ 2.28
CNOT8-223	ENST00000523270	CABP2	Q9NPB3	220 aa		29.28	■■■□□ 2.28
CNOT8-223	ENST00000523270	SRPK2	P78362	688 aa	Known RBP	29.26	■■■□□ 2.27
CNOT8-223	ENST00000523270	NGDN	Q8NEJ9	315 aa	Known RBP	29.26	■■■□□ 2.27
CNOT8-223	ENST00000523270	ZNF772	Q68DY9	489 aa	Predicted RBP	29.24	■■■□□ 2.27
CNOT8-223	ENST00000523270	CCDC61	Q9Y6R9	512 aa		29.24	■■■□□ 2.27
CNOT8-223	ENST00000523270	PLEKHG5	O94827	1062 aa		29.23	■■■□□ 2.27
CNOT8-223	ENST00000523270	LMOD2	Q6P5Q4	547 aa		29.23	■■■□□ 2.27
CNOT8-223	ENST00000523270	CABLES1	Q8TDN4	633 aa		29.23	■■■□□ 2.27
CNOT8-223	ENST00000523270	POLR3A	O14802	1390 aa	Predicted RBP	29.23	■■■□□ 2.27
CNOT8-223	ENST00000523270	CLSPN	Q9HAW4	1339 aa		29.22	■■■□□ 2.27
CNOT8-223	ENST00000523270	PPIP5K1	Q6PFW1	1433 aa		29.22	■■■□□ 2.27
CNOT8-223	ENST00000523270	ACE	P12821	1306 aa		29.21	■■■□□ 2.27
CNOT8-223	ENST00000523270	CRYBG1	Q9Y4K1	1723 aa		29.21	■■■□□ 2.27
CNOT8-223	ENST00000523270	PLEKHG3	A1L390	1219 aa		29.21	■■■□□ 2.27
CNOT8-223	ENST00000523270	NGLY1	Q96IV0	654 aa		29.21	■■■□□ 2.27
CNOT8-223	ENST00000523270	ARHGEF10	O15013	1369 aa		29.21	■■■□□ 2.27
CNOT8-223	ENST00000523270	EVC2	Q86UK5	1308 aa		29.19	■■■□□ 2.26
CNOT8-223	ENST00000523270	SBNO2	Q9Y2G9	1366 aa		29.16	■■■□□ 2.26
CNOT8-223	ENST00000523270	PAK3	O75914	559 aa	Predicted RBP	29.15	■■■□□ 2.26
CNOT8-223	ENST00000523270	FNBP4	Q8N3X1	1017 aa	Predicted RBP	29.14	■■■□□ 2.26
CNOT8-223	ENST00000523270	CCER1	Q8TC90	406 aa	Predicted RBP	29.13	■■■□□ 2.25
CNOT8-223	ENST00000523270	CABP1	Q9NZU7	370 aa		29.13	■■■□□ 2.25

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