RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000517351.5

TCEA1-202, Transcript of transcription elongation factor A1, humanhuman

TSL 4

Gene TCEA1, Length 539 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCEA1-202ENST00000517351 SIN3AQ96ST3 1273 aa37.11■■■■□ 3.53
TCEA1-202ENST00000517351 JCADQ9P266 1359 aa37.1■■■■□ 3.53
TCEA1-202ENST00000517351 DLC1Q96QB1 1528 aa37.09■■■■□ 3.53
TCEA1-202ENST00000517351 PRAM1Q96QH2 718 aa37.08■■■■□ 3.53
TCEA1-202ENST00000517351 NHSL1Q5SYE7 1610 aa37.07■■■■□ 3.52
TCEA1-202ENST00000517351 ORAI2Q96SN7 254 aa37.06■■■■□ 3.52
TCEA1-202ENST00000517351 TRAK1Q9UPV9 953 aa37.06■■■■□ 3.52
TCEA1-202ENST00000517351 NEUROD1Q13562 356 aa37.04■■■■□ 3.52
TCEA1-202ENST00000517351 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP37.04■■■■□ 3.52
TCEA1-202ENST00000517351 POGKQ9P215 609 aa37.04■■■■□ 3.52
TCEA1-202ENST00000517351 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP37.03■■■■□ 3.52
TCEA1-202ENST00000517351 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP37.02■■■■□ 3.52
TCEA1-202ENST00000517351 L3MBTL2Q969R5 705 aa37.01■■■■□ 3.52
TCEA1-202ENST00000517351 NUTM2FA1L443 756 aa37■■■■□ 3.51
TCEA1-202ENST00000517351 ILDR2Q71H61 639 aa36.99■■■■□ 3.51
TCEA1-202ENST00000517351 ESCO1Q5FWF5 840 aa36.98■■■■□ 3.51
TCEA1-202ENST00000517351 FMN2Q9NZ56 1722 aa36.98■■■■□ 3.51
TCEA1-202ENST00000517351 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa36.98■■■■□ 3.51
TCEA1-202ENST00000517351 SHPRHQ149N8 1683 aa36.95■■■■□ 3.51
TCEA1-202ENST00000517351 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP36.94■■■■□ 3.5
TCEA1-202ENST00000517351 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa36.92■■■■□ 3.5
TCEA1-202ENST00000517351 NBPF1Q3BBV0 1214 aa36.89■■■■□ 3.5
TCEA1-202ENST00000517351 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP36.89■■■■□ 3.5
TCEA1-202ENST00000517351 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP36.88■■■■□ 3.49
TCEA1-202ENST00000517351 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP36.87■■■■□ 3.49
TCEA1-202ENST00000517351 ADGRB2O60241 1585 aa36.87■■■■□ 3.49
TCEA1-202ENST00000517351 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP36.86■■■■□ 3.49
TCEA1-202ENST00000517351 NPHP3Q7Z494 1330 aa36.85■■■■□ 3.49
TCEA1-202ENST00000517351 FOXO3O43524 673 aa36.83■■■■□ 3.49
TCEA1-202ENST00000517351 LRP6O75581 1613 aa36.83■■■■□ 3.49
TCEA1-202ENST00000517351 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP36.81■■■■□ 3.48
TCEA1-202ENST00000517351 PNPLA6Q8IY17 1366 aa36.81■■■■□ 3.48
TCEA1-202ENST00000517351 KIF1AQ12756 1690 aa36.8■■■■□ 3.48
TCEA1-202ENST00000517351 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP36.8■■■■□ 3.48
TCEA1-202ENST00000517351 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP36.79■■■■□ 3.48
TCEA1-202ENST00000517351 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP36.79■■■■□ 3.48
TCEA1-202ENST00000517351 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP36.79■■■■□ 3.48
TCEA1-202ENST00000517351 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP36.78■■■■□ 3.48
TCEA1-202ENST00000517351 ANKARQ7Z5J8 1434 aa36.77■■■■□ 3.48
TCEA1-202ENST00000517351 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP36.77■■■■□ 3.48
TCEA1-202ENST00000517351 PXDNQ92626 1479 aa36.76■■■■□ 3.48
TCEA1-202ENST00000517351 WASLO00401 505 aaPredicted RBP36.76■■■■□ 3.48
TCEA1-202ENST00000517351 PHF8Q9UPP1 1060 aa36.76■■■■□ 3.48
TCEA1-202ENST00000517351 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa36.75■■■■□ 3.47
TCEA1-202ENST00000517351 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP36.75■■■■□ 3.47
TCEA1-202ENST00000517351 TONSLQ96HA7 1378 aa36.75■■■■□ 3.47
TCEA1-202ENST00000517351 USP32Q8NFA0 1604 aa36.74■■■■□ 3.47
TCEA1-202ENST00000517351 PCGF6Q9BYE7 350 aa36.72■■■■□ 3.47
TCEA1-202ENST00000517351 TULP4Q9NRJ4 1543 aa36.71■■■■□ 3.47
TCEA1-202ENST00000517351 PRR36Q9H6K5 1346 aa36.68■■■■□ 3.46
TCEA1-202ENST00000517351 NBPF8Q3BBV2 869 aa36.68■■■■□ 3.46
TCEA1-202ENST00000517351 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP36.67■■■■□ 3.46
TCEA1-202ENST00000517351 KRT28Q7Z3Y7 464 aa36.67■■■■□ 3.46
TCEA1-202ENST00000517351 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa36.67■■■■□ 3.46
TCEA1-202ENST00000517351 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP36.65■■■■□ 3.46
TCEA1-202ENST00000517351 POTEAQ6S8J7 498 aa36.63■■■■□ 3.45
TCEA1-202ENST00000517351 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP36.63■■■■□ 3.45
TCEA1-202ENST00000517351 CDK19Q9BWU1 502 aa36.62■■■■□ 3.45
TCEA1-202ENST00000517351 PSME1Q06323 249 aa36.61■■■■□ 3.45
TCEA1-202ENST00000517351 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa36.6■■■■□ 3.45
TCEA1-202ENST00000517351 SOCS7O14512 581 aa36.59■■■■□ 3.45
TCEA1-202ENST00000517351 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP36.59■■■■□ 3.45
TCEA1-202ENST00000517351 ATP7BP35670 1465 aa36.58■■■■□ 3.45
TCEA1-202ENST00000517351 QRICH2Q9H0J4 1663 aa36.58■■■■□ 3.45
TCEA1-202ENST00000517351 ADAMTS2O95450 1211 aa36.57■■■■□ 3.44
TCEA1-202ENST00000517351 ZNF772Q68DY9 489 aaPredicted RBP36.56■■■■□ 3.44
TCEA1-202ENST00000517351 GPRASP1Q5JY77 1395 aa36.55■■■■□ 3.44
TCEA1-202ENST00000517351 ITSN1Q15811 1721 aa36.55■■■■□ 3.44
TCEA1-202ENST00000517351 C8orf37Q96NL8 207 aa36.55■■■■□ 3.44
TCEA1-202ENST00000517351 TNS3Q68CZ2 1445 aa36.54■■■■□ 3.44
TCEA1-202ENST00000517351 SBNO1A3KN83 1393 aa36.53■■■■□ 3.44
TCEA1-202ENST00000517351 AFF2P51816 1311 aa36.53■■■■□ 3.44
TCEA1-202ENST00000517351 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP36.52■■■■□ 3.44
TCEA1-202ENST00000517351 RALGAPBQ86X10 1494 aa36.5■■■■□ 3.43
TCEA1-202ENST00000517351 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP36.49■■■■□ 3.43
TCEA1-202ENST00000517351 CARD11Q9BXL7 1154 aa36.49■■■■□ 3.43
TCEA1-202ENST00000517351 NGLY1Q96IV0 654 aa36.48■■■■□ 3.43
TCEA1-202ENST00000517351 CCDC61Q9Y6R9 512 aa36.48■■■■□ 3.43
TCEA1-202ENST00000517351 LMOD2Q6P5Q4 547 aa36.47■■■■□ 3.43
TCEA1-202ENST00000517351 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa36.46■■■■□ 3.43
TCEA1-202ENST00000517351 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP36.45■■■■□ 3.43
TCEA1-202ENST00000517351 ARHGEF10O15013 1369 aa36.45■■■■□ 3.43
TCEA1-202ENST00000517351 CABP2Q9NPB3 220 aa36.45■■■■□ 3.43
TCEA1-202ENST00000517351 CLSPNQ9HAW4 1339 aa36.44■■■■□ 3.42
TCEA1-202ENST00000517351 EVC2Q86UK5 1308 aa36.41■■■■□ 3.42
TCEA1-202ENST00000517351 PLEKHG3A1L390 1219 aa36.4■■■■□ 3.42
TCEA1-202ENST00000517351 PLEKHG5O94827 1062 aa36.39■■■■□ 3.42
TCEA1-202ENST00000517351 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP36.39■■■■□ 3.42
TCEA1-202ENST00000517351 ACEP12821 1306 aa36.38■■■■□ 3.41
TCEA1-202ENST00000517351 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP36.38■■■■□ 3.41
TCEA1-202ENST00000517351 CABLES1Q8TDN4 633 aa36.38■■■■□ 3.41
TCEA1-202ENST00000517351 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP36.38■■■■□ 3.41
TCEA1-202ENST00000517351 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa36.37■■■■□ 3.41
TCEA1-202ENST00000517351 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP36.37■■■■□ 3.41
TCEA1-202ENST00000517351 ALS2Q96Q42 1657 aa36.37■■■■□ 3.41
TCEA1-202ENST00000517351 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP36.35■■■■□ 3.41
TCEA1-202ENST00000517351 USP21Q9UK80 565 aa36.34■■■■□ 3.41
TCEA1-202ENST00000517351 RXRBP28702 533 aa36.33■■■■□ 3.41
TCEA1-202ENST00000517351 QTRT2Q9H974 415 aaKnown RBP36.33■■■■□ 3.41
TCEA1-202ENST00000517351 ABCA3Q99758 1704 aa36.31■■■■□ 3.4
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