RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000517179.1

RNU6-111P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 111, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-111P, Length 105 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-111P-201ENST00000517179 FECHP22830 423 aa6.7□□□□□ -1.34
RNU6-111P-201ENST00000517179 TRIM32Q13049 653 aa6.7□□□□□ -1.34
RNU6-111P-201ENST00000517179 HIC1Q14526 733 aa6.7□□□□□ -1.34
RNU6-111P-201ENST00000517179 SUZ12Q15022 739 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
RNU6-111P-201ENST00000517179 MSS51Q4VC12 460 aa6.7□□□□□ -1.34
RNU6-111P-201ENST00000517179 BRICD5Q6PL45 260 aa6.7□□□□□ -1.34
RNU6-111P-201ENST00000517179 MRGPRX2Q96LB1 330 aa6.7□□□□□ -1.34
RNU6-111P-201ENST00000517179 J3QL48 77 aa6.69□□□□□ -1.34
RNU6-111P-201ENST00000517179 KCNV2Q8TDN2 545 aa6.69□□□□□ -1.34
RNU6-111P-201ENST00000517179 REPIN1Q9BWE0 567 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
RNU6-111P-201ENST00000517179 GCGRP47871 477 aa6.68□□□□□ -1.34
RNU6-111P-201ENST00000517179 GRIPAP1Q4V328 841 aa6.68□□□□□ -1.34
RNU6-111P-201ENST00000517179 SULF1Q8IWU6 871 aa6.68□□□□□ -1.34
RNU6-111P-201ENST00000517179 HPS1Q92902 700 aa6.67□□□□□ -1.34
RNU6-111P-201ENST00000517179 Q3C1V9 767 aa6.66□□□□□ -1.34
RNU6-111P-201ENST00000517179 NXF1Q9UBU9 619 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
RNU6-111P-201ENST00000517179 RNF19BQ6ZMZ0 732 aa6.65□□□□□ -1.34
RNU6-111P-201ENST00000517179 ZSCAN1Q8NBB4 408 aa6.65□□□□□ -1.34
RNU6-111P-201ENST00000517179 MMP16P51512 607 aa6.64□□□□□ -1.35
RNU6-111P-201ENST00000517179 IRF7Q92985 503 aa6.64□□□□□ -1.35
RNU6-111P-201ENST00000517179 GMPRP36959 345 aa6.63□□□□□ -1.35
RNU6-111P-201ENST00000517179 NPAS3Q8IXF0 933 aa6.63□□□□□ -1.35
RNU6-111P-201ENST00000517179 SEMA3EO15041 775 aa6.62□□□□□ -1.35
RNU6-111P-201ENST00000517179 GNPATO15228 680 aa6.62□□□□□ -1.35
RNU6-111P-201ENST00000517179 RC3H1Q5TC82 1133 aaKnown RBP6.62□□□□□ -1.35
RNU6-111P-201ENST00000517179 ALDH1A1P00352 501 aa6.61□□□□□ -1.35
RNU6-111P-201ENST00000517179 WNT7BP56706 349 aa6.61□□□□□ -1.35
RNU6-111P-201ENST00000517179 P3H3Q8IVL6 736 aa6.61□□□□□ -1.35
RNU6-111P-201ENST00000517179 NLRP7Q8WX94 980 aa6.61□□□□□ -1.35
RNU6-111P-201ENST00000517179 DXOO77932 396 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
RNU6-111P-201ENST00000517179 CCDC24Q8N4L8 307 aa6.6□□□□□ -1.35
RNU6-111P-201ENST00000517179 USB1Q9BQ65 265 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
RNU6-111P-201ENST00000517179 LORP23490 312 aaPredicted RBP6.58□□□□□ -1.36
RNU6-111P-201ENST00000517179 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa6.58□□□□□ -1.36
RNU6-111P-201ENST00000517179 H3BM21 787 aa6.57□□□□□ -1.36
RNU6-111P-201ENST00000517179 SKOR1P84550 965 aa6.57□□□□□ -1.36
RNU6-111P-201ENST00000517179 RBM26Q5T8P6 1007 aaKnown RBP6.57□□□□□ -1.36
RNU6-111P-201ENST00000517179 SMYD5Q6GMV2 418 aa6.57□□□□□ -1.36
RNU6-111P-201ENST00000517179 CAPN5O15484 640 aaPredicted RBP6.56□□□□□ -1.36
RNU6-111P-201ENST00000517179 BMP1P13497 986 aa6.56□□□□□ -1.36
RNU6-111P-201ENST00000517179 VEGFBP49765 207 aa6.56□□□□□ -1.36
RNU6-111P-201ENST00000517179 PHOX2BQ99453 314 aa6.56□□□□□ -1.36
RNU6-111P-201ENST00000517179 WASF2Q9Y6W5 498 aa6.56□□□□□ -1.36
RNU6-111P-201ENST00000517179 TRIM46Q7Z4K8 759 aa6.55□□□□□ -1.36
RNU6-111P-201ENST00000517179 KDM4AO75164 1064 aa6.54□□□□□ -1.36
RNU6-111P-201ENST00000517179 EHBP1Q8NDI1 1231 aa6.54□□□□□ -1.36
RNU6-111P-201ENST00000517179 ERBB4Q15303 1308 aa6.53□□□□□ -1.36
RNU6-111P-201ENST00000517179 SIAH2O43255 324 aa6.53□□□□□ -1.36
RNU6-111P-201ENST00000517179 TESPA1A2RU30 521 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.37
RNU6-111P-201ENST00000517179 GPR37O15354 613 aa6.52□□□□□ -1.37
RNU6-111P-201ENST00000517179 CD46P15529 392 aa6.52□□□□□ -1.37
RNU6-111P-201ENST00000517179 USP46P62068 366 aa6.52□□□□□ -1.37
RNU6-111P-201ENST00000517179 JUNDP17535 347 aa6.5□□□□□ -1.37
RNU6-111P-201ENST00000517179 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
RNU6-111P-201ENST00000517179 ZFP42Q96MM3 310 aa6.5□□□□□ -1.37
RNU6-111P-201ENST00000517179 SCARF1Q14162 830 aa6.48□□□□□ -1.37
RNU6-111P-201ENST00000517179 HLA-CQ95604 372 aa6.48□□□□□ -1.37
RNU6-111P-201ENST00000517179 NUDT12Q9BQG2 462 aa6.48□□□□□ -1.37
RNU6-111P-201ENST00000517179 HOXA2O43364 376 aa6.47□□□□□ -1.37
RNU6-111P-201ENST00000517179 KCNMA1Q12791 1236 aa6.47□□□□□ -1.37
RNU6-111P-201ENST00000517179 PTCRAQ6ISU1 281 aaPredicted RBP6.47□□□□□ -1.37
RNU6-111P-201ENST00000517179 PLEKHG3A1L390 1219 aa6.46□□□□□ -1.38
RNU6-111P-201ENST00000517179 VSIG8P0DPA2 414 aa6.46□□□□□ -1.38
RNU6-111P-201ENST00000517179 SH3BP2P78314 561 aa6.46□□□□□ -1.38
RNU6-111P-201ENST00000517179 MRPL14Q6P1L8 145 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
RNU6-111P-201ENST00000517179 RETREG3Q86VR2 466 aa6.45□□□□□ -1.38
RNU6-111P-201ENST00000517179 GPIHBP1Q8IV16 184 aa6.45□□□□□ -1.38
RNU6-111P-201ENST00000517179 KCTD17Q8N5Z5 321 aa6.45□□□□□ -1.38
RNU6-111P-201ENST00000517179 SYMPKQ92797 1274 aaKnown RBP6.44□□□□□ -1.38
RNU6-111P-201ENST00000517179 PURBQ96QR8 312 aaKnown RBP6.44□□□□□ -1.38
RNU6-111P-201ENST00000517179 CCNYL3P0C7X3 344 aa6.43□□□□□ -1.38
RNU6-111P-201ENST00000517179 GUCA2AQ02747 115 aa6.43□□□□□ -1.38
RNU6-111P-201ENST00000517179 NNTQ13423 1086 aa6.43□□□□□ -1.38
RNU6-111P-201ENST00000517179 MS4A1P11836 297 aa6.42□□□□□ -1.38
RNU6-111P-201ENST00000517179 MDM2Q00987 491 aaPredicted RBP6.42□□□□□ -1.38
RNU6-111P-201ENST00000517179 TMEM151AQ8N4L1 468 aa6.42□□□□□ -1.38
RNU6-111P-201ENST00000517179 MPNDQ8N594 471 aa6.42□□□□□ -1.38
RNU6-111P-201ENST00000517179 TLL2Q9Y6L7 1015 aa6.42□□□□□ -1.38
RNU6-111P-201ENST00000517179 SOBPA7XYQ1 873 aa6.41□□□□□ -1.38
RNU6-111P-201ENST00000517179 ADH1CP00326 375 aa6.41□□□□□ -1.38
RNU6-111P-201ENST00000517179 VARSP26640 1264 aaKnown RBP6.41□□□□□ -1.38
RNU6-111P-201ENST00000517179 WDR4P57081 412 aaKnown RBP6.41□□□□□ -1.38
RNU6-111P-201ENST00000517179 UNC93B1Q9H1C4 597 aa6.41□□□□□ -1.38
RNU6-111P-201ENST00000517179 MAN1A2O60476 641 aa6.4□□□□□ -1.38
RNU6-111P-201ENST00000517179 GDF11O95390 407 aa6.4□□□□□ -1.38
RNU6-111P-201ENST00000517179 TIMP2P16035 220 aa6.4□□□□□ -1.38
RNU6-111P-201ENST00000517179 GSK3AP49840 483 aa6.4□□□□□ -1.38
RNU6-111P-201ENST00000517179 MAP2K5Q13163 448 aa6.4□□□□□ -1.38
RNU6-111P-201ENST00000517179 LINC01559Q495D7 138 aa6.4□□□□□ -1.38
RNU6-111P-201ENST00000517179 NUTM1Q86Y26 1132 aa6.4□□□□□ -1.38
RNU6-111P-201ENST00000517179 BAP1Q92560 729 aa6.4□□□□□ -1.38
RNU6-111P-201ENST00000517179 EVA1BQ9NVM1 165 aa6.4□□□□□ -1.38
RNU6-111P-201ENST00000517179 C6orf229H3BNL8 230 aa6.39□□□□□ -1.39
RNU6-111P-201ENST00000517179 PTPRNQ16849 979 aa6.39□□□□□ -1.39
RNU6-111P-201ENST00000517179 RTN4Q9NQC3 1192 aaKnown RBP6.39□□□□□ -1.39
RNU6-111P-201ENST00000517179 RNF225M0QZC1 329 aaPredicted RBP6.38□□□□□ -1.39
RNU6-111P-201ENST00000517179 IRF6O14896 467 aa6.38□□□□□ -1.39
RNU6-111P-201ENST00000517179 RASSF7Q02833 373 aa6.38□□□□□ -1.39
RNU6-111P-201ENST00000517179 ZNF511Q8NB15 262 aa6.38□□□□□ -1.39
RNU6-111P-201ENST00000517179 PPFIA3O75145 1194 aa6.37□□□□□ -1.39
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16 ms