RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516635.1

RNU6-344P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 344, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-344P, Length 111 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-344P-201ENST00000516635 FDX1P10109 184 aa4.85□□□□□ -1.63
RNU6-344P-201ENST00000516635 CLK2P49760 499 aaKnown RBP4.85□□□□□ -1.63
RNU6-344P-201ENST00000516635 USP46P62068 366 aa4.85□□□□□ -1.63
RNU6-344P-201ENST00000516635 SH3D19Q5HYK7 790 aa4.85□□□□□ -1.63
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RNU6-344P-201ENST00000516635 SKIV2LQ15477 1246 aaKnown RBP4.84□□□□□ -1.63
RNU6-344P-201ENST00000516635 ZNF787Q6DD87 383 aa4.84□□□□□ -1.63
RNU6-344P-201ENST00000516635 THAP11Q96EK4 314 aa4.84□□□□□ -1.63
RNU6-344P-201ENST00000516635 IL21Q9HBE4 155 aa4.84□□□□□ -1.63
RNU6-344P-201ENST00000516635 PRDM9Q9NQV7 894 aa4.84□□□□□ -1.63
RNU6-344P-201ENST00000516635 STK17AQ9UEE5 414 aa4.84□□□□□ -1.63
RNU6-344P-201ENST00000516635 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP4.84□□□□□ -1.63
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RNU6-344P-201ENST00000516635 NR1I2O75469 434 aa4.83□□□□□ -1.64
RNU6-344P-201ENST00000516635 ITGBL1O95965 494 aaPredicted RBP4.83□□□□□ -1.64
RNU6-344P-201ENST00000516635 HRCP23327 699 aa4.83□□□□□ -1.64
RNU6-344P-201ENST00000516635 GRIPAP1Q4V328 841 aa4.83□□□□□ -1.64
RNU6-344P-201ENST00000516635 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP4.83□□□□□ -1.64
RNU6-344P-201ENST00000516635 BRICD5Q6PL45 260 aa4.83□□□□□ -1.64
RNU6-344P-201ENST00000516635 FAM160A2Q8N612 972 aaPredicted RBP4.83□□□□□ -1.64
RNU6-344P-201ENST00000516635 RSPH6AQ9H0K4 717 aa4.83□□□□□ -1.64
RNU6-344P-201ENST00000516635 KCNC4Q03721 635 aa4.82□□□□□ -1.64
RNU6-344P-201ENST00000516635 DIXDC1Q155Q3 683 aa4.82□□□□□ -1.64
RNU6-344P-201ENST00000516635 SPSB2Q99619 263 aa4.82□□□□□ -1.64
RNU6-344P-201ENST00000516635 GNL3Q9BVP2 549 aaKnown RBP eCLIP4.82□□□□□ -1.64
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RNU6-344P-201ENST00000516635 PPEF1O14829 653 aaPredicted RBP4.81□□□□□ -1.64
RNU6-344P-201ENST00000516635 LILRB3O75022 631 aa4.81□□□□□ -1.64
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RNU6-344P-201ENST00000516635 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP4.8□□□□□ -1.64
RNU6-344P-201ENST00000516635 FMNL1O95466 1100 aaPredicted RBP4.8□□□□□ -1.64
RNU6-344P-201ENST00000516635 S1PR4O95977 384 aa4.8□□□□□ -1.64
RNU6-344P-201ENST00000516635 ADH1BP00325 375 aa4.8□□□□□ -1.64
RNU6-344P-201ENST00000516635 GJA5P36382 358 aa4.8□□□□□ -1.64
RNU6-344P-201ENST00000516635 MTMR2Q13614 643 aa4.8□□□□□ -1.64
RNU6-344P-201ENST00000516635 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP4.8□□□□□ -1.64
RNU6-344P-201ENST00000516635 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP4.8□□□□□ -1.64
RNU6-344P-201ENST00000516635 USB1Q9BQ65 265 aaKnown RBP4.8□□□□□ -1.64
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RNU6-344P-201ENST00000516635 Q3C1V9 767 aa4.79□□□□□ -1.64
RNU6-344P-201ENST00000516635 PRR7Q8TB68 274 aa4.79□□□□□ -1.64
RNU6-344P-201ENST00000516635 TSC1Q92574 1164 aa4.79□□□□□ -1.64
RNU6-344P-201ENST00000516635 ZBTB3Q9H5J0 574 aa4.79□□□□□ -1.64
RNU6-344P-201ENST00000516635 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP4.78□□□□□ -1.64
RNU6-344P-201ENST00000516635 RFC5P40937 340 aa4.78□□□□□ -1.64
RNU6-344P-201ENST00000516635 TUSC1Q2TAM9 212 aa4.78□□□□□ -1.64
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RNU6-344P-201ENST00000516635 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP4.78□□□□□ -1.64
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RNU6-344P-201ENST00000516635 PLA2G2CQ5R387 149 aa4.77□□□□□ -1.65
RNU6-344P-201ENST00000516635 PPP2R2DQ66LE6 453 aa4.77□□□□□ -1.65
RNU6-344P-201ENST00000516635 LCE2BO14633 110 aa4.76□□□□□ -1.65
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RNU6-344P-201ENST00000516635 LRRN4Q8WUT4 740 aa4.76□□□□□ -1.65
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RNU6-344P-201ENST00000516635 LIAT1Q6ZQX7 453 aa4.71□□□□□ -1.66
RNU6-344P-201ENST00000516635 ANKLE1Q8NAG6 615 aa4.71□□□□□ -1.66
RNU6-344P-201ENST00000516635 MTMR14Q8NCE2 650 aa4.71□□□□□ -1.66
RNU6-344P-201ENST00000516635 GGCXP38435 758 aa4.7□□□□□ -1.66
RNU6-344P-201ENST00000516635 TMEM259Q4ZIN3 620 aa4.7□□□□□ -1.66
RNU6-344P-201ENST00000516635 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP4.7□□□□□ -1.66
RNU6-344P-201ENST00000516635 TRIM34Q9BYJ4 488 aa4.7□□□□□ -1.66
RNU6-344P-201ENST00000516635 EVA1BQ9NVM1 165 aa4.7□□□□□ -1.66
RNU6-344P-201ENST00000516635 KCNH2Q12809 1159 aa4.69□□□□□ -1.66
RNU6-344P-201ENST00000516635 MCM6Q14566 821 aa4.69□□□□□ -1.66
RNU6-344P-201ENST00000516635 LINC01559Q495D7 138 aa4.69□□□□□ -1.66
RNU6-344P-201ENST00000516635 UNC93B1Q9H1C4 597 aa4.69□□□□□ -1.66
RNU6-344P-201ENST00000516635 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa4.69□□□□□ -1.66
RNU6-344P-201ENST00000516635 GFRA3O60609 400 aa4.68□□□□□ -1.66
RNU6-344P-201ENST00000516635 BAP1Q92560 729 aa4.68□□□□□ -1.66
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