RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000514813.6

RRN3P1-201, Transcript of RRN3 homolog, RNA polymerase I transcription factor pseudogene 1, humanhuman

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Gene RRN3P1, Length 3,645 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRN3P1-201ENST00000514813 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP9.16□□□□□ -0.94
RRN3P1-201ENST00000514813 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa9.15□□□□□ -0.94
RRN3P1-201ENST00000514813 PREX1Q8TCU6 1659 aa9.15□□□□□ -0.94
RRN3P1-201ENST00000514813 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP9.15□□□□□ -0.94
RRN3P1-201ENST00000514813 PTPRTO14522 1441 aa9.15□□□□□ -0.95
RRN3P1-201ENST00000514813 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP9.14□□□□□ -0.95
RRN3P1-201ENST00000514813 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa9.14□□□□□ -0.95
RRN3P1-201ENST00000514813 CABP2Q9NPB3 220 aa9.14□□□□□ -0.95
RRN3P1-201ENST00000514813 PIK3C2BO00750 1634 aa9.13□□□□□ -0.95
RRN3P1-201ENST00000514813 MYO3AQ8NEV4 1616 aa9.13□□□□□ -0.95
RRN3P1-201ENST00000514813 MROH1Q8NDA8 1641 aa9.13□□□□□ -0.95
RRN3P1-201ENST00000514813 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP9.13□□□□□ -0.95
RRN3P1-201ENST00000514813 PLA2R1Q13018 1463 aa9.13□□□□□ -0.95
RRN3P1-201ENST00000514813 NGLY1Q96IV0 654 aa9.12□□□□□ -0.95
RRN3P1-201ENST00000514813 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa9.12□□□□□ -0.95
RRN3P1-201ENST00000514813 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP9.12□□□□□ -0.95
RRN3P1-201ENST00000514813 C8orf37Q96NL8 207 aa9.12□□□□□ -0.95
RRN3P1-201ENST00000514813 SAMD1Q6SPF0 538 aaPredicted RBP9.11□□□□□ -0.95
RRN3P1-201ENST00000514813 CABLES1Q8TDN4 633 aa9.11□□□□□ -0.95
RRN3P1-201ENST00000514813 TET3O43151 1660 aa9.11□□□□□ -0.95
RRN3P1-201ENST00000514813 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP9.11□□□□□ -0.95
RRN3P1-201ENST00000514813 USP35Q9P2H5 1018 aa9.11□□□□□ -0.95
RRN3P1-201ENST00000514813 SYNMO15061 1565 aa9.1□□□□□ -0.95
RRN3P1-201ENST00000514813 DCAF8L1A6NGE4 600 aa9.1□□□□□ -0.95
RRN3P1-201ENST00000514813 CDK19Q9BWU1 502 aa9.1□□□□□ -0.95
RRN3P1-201ENST00000514813 NBPF8Q3BBV2 869 aa9.1□□□□□ -0.95
RRN3P1-201ENST00000514813 ARID3AQ99856 593 aa9.1□□□□□ -0.95
RRN3P1-201ENST00000514813 PHF8Q9UPP1 1060 aa9.1□□□□□ -0.95
RRN3P1-201ENST00000514813 E9PCH4 1651 aa9.09□□□□□ -0.95
RRN3P1-201ENST00000514813 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP9.09□□□□□ -0.95
RRN3P1-201ENST00000514813 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa9.09□□□□□ -0.95
RRN3P1-201ENST00000514813 LMTK2Q8IWU2 1503 aa9.09□□□□□ -0.95
RRN3P1-201ENST00000514813 ADGRB3O60242 1522 aa9.09□□□□□ -0.95
RRN3P1-201ENST00000514813 ROBO2Q9HCK4 1378 aa9.09□□□□□ -0.95
RRN3P1-201ENST00000514813 MSH5O43196 834 aa9.09□□□□□ -0.96
RRN3P1-201ENST00000514813 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa9.08□□□□□ -0.96
RRN3P1-201ENST00000514813 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP9.08□□□□□ -0.96
RRN3P1-201ENST00000514813 BRPF1P55201 1214 aaPredicted RBP9.08□□□□□ -0.96
RRN3P1-201ENST00000514813 BRINP3Q76B58 766 aa9.08□□□□□ -0.96
RRN3P1-201ENST00000514813 KRT28Q7Z3Y7 464 aa9.08□□□□□ -0.96
RRN3P1-201ENST00000514813 MROH2AA6NES4 1674 aa9.08□□□□□ -0.96
RRN3P1-201ENST00000514813 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP9.07□□□□□ -0.96
RRN3P1-201ENST00000514813 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP9.07□□□□□ -0.96
RRN3P1-201ENST00000514813 IQGAP3Q86VI3 1631 aa9.07□□□□□ -0.96
RRN3P1-201ENST00000514813 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP9.07□□□□□ -0.96
RRN3P1-201ENST00000514813 ZC3H6P61129 1189 aaKnown RBP9.07□□□□□ -0.96
RRN3P1-201ENST00000514813 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP9.07□□□□□ -0.96
RRN3P1-201ENST00000514813 UNC13BO14795 1591 aa9.07□□□□□ -0.96
RRN3P1-201ENST00000514813 CABP1Q9NZU7 370 aa9.07□□□□□ -0.96
RRN3P1-201ENST00000514813 ABTB2Q8N961 1025 aa9.06□□□□□ -0.96
RRN3P1-201ENST00000514813 CIZ1Q9ULV3 898 aaPredicted RBP9.06□□□□□ -0.96
RRN3P1-201ENST00000514813 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa9.06□□□□□ -0.96
RRN3P1-201ENST00000514813 STRN4Q9NRL3 753 aa9.06□□□□□ -0.96
RRN3P1-201ENST00000514813 ZFYVE9O95405 1425 aa9.05□□□□□ -0.96
RRN3P1-201ENST00000514813 WASLO00401 505 aaPredicted RBP9.05□□□□□ -0.96
RRN3P1-201ENST00000514813 GPRASP1Q5JY77 1395 aa9.05□□□□□ -0.96
RRN3P1-201ENST00000514813 CLTCL1P53675 1640 aa9.05□□□□□ -0.96
RRN3P1-201ENST00000514813 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP9.05□□□□□ -0.96
RRN3P1-201ENST00000514813 GCC2Q8IWJ2 1684 aa9.05□□□□□ -0.96
RRN3P1-201ENST00000514813 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa9.05□□□□□ -0.96
RRN3P1-201ENST00000514813 EVA1CP58658 441 aa9.05□□□□□ -0.96
RRN3P1-201ENST00000514813 NLRP6P59044 892 aa9.05□□□□□ -0.96
RRN3P1-201ENST00000514813 NPHP3Q7Z494 1330 aa9.04□□□□□ -0.96
RRN3P1-201ENST00000514813 EVC2Q86UK5 1308 aa9.04□□□□□ -0.96
RRN3P1-201ENST00000514813 VWDEQ8N2E2 1590 aa9.04□□□□□ -0.96
RRN3P1-201ENST00000514813 STAC3Q96MF2 364 aa9.04□□□□□ -0.96
RRN3P1-201ENST00000514813 U3KPZ7 1027 aaPredicted RBP9.04□□□□□ -0.96
RRN3P1-201ENST00000514813 TRPM2O94759 1503 aa9.04□□□□□ -0.96
RRN3P1-201ENST00000514813 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP9.04□□□□□ -0.96
RRN3P1-201ENST00000514813 PTPRUQ92729 1446 aa9.04□□□□□ -0.96
RRN3P1-201ENST00000514813 DEPDC5O75140 1603 aa9.04□□□□□ -0.96
RRN3P1-201ENST00000514813 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP9.04□□□□□ -0.96
RRN3P1-201ENST00000514813 LRRC7Q96NW7 1537 aa9.03□□□□□ -0.96
RRN3P1-201ENST00000514813 ARHGAP23Q9P227 1491 aa9.03□□□□□ -0.96
RRN3P1-201ENST00000514813 CCDC61Q9Y6R9 512 aa9.03□□□□□ -0.96
RRN3P1-201ENST00000514813 CHRNA2Q15822 529 aa9.03□□□□□ -0.96
RRN3P1-201ENST00000514813 PRDM11Q9NQV5 511 aa9.03□□□□□ -0.96
RRN3P1-201ENST00000514813 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP9.03□□□□□ -0.96
RRN3P1-201ENST00000514813 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa9.03□□□□□ -0.96
RRN3P1-201ENST00000514813 STRCQ7RTU9 1775 aa9.02□□□□□ -0.96
RRN3P1-201ENST00000514813 UBR1Q8IWV7 1749 aa9.02□□□□□ -0.96
RRN3P1-201ENST00000514813 SLIT1O75093 1534 aa9.02□□□□□ -0.97
RRN3P1-201ENST00000514813 TMF1P82094 1093 aa9.02□□□□□ -0.97
RRN3P1-201ENST00000514813 NEUROD2Q15784 382 aa9.02□□□□□ -0.97
RRN3P1-201ENST00000514813 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa9.02□□□□□ -0.97
RRN3P1-201ENST00000514813 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP9.02□□□□□ -0.97
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RRN3P1-201ENST00000514813 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa9.01□□□□□ -0.97
RRN3P1-201ENST00000514813 PIK3R4Q99570 1358 aa9.01□□□□□ -0.97
RRN3P1-201ENST00000514813 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa9□□□□□ -0.97
RRN3P1-201ENST00000514813 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP9□□□□□ -0.97
RRN3P1-201ENST00000514813 MED14O60244 1454 aa9□□□□□ -0.97
RRN3P1-201ENST00000514813 KIF1BO60333 1816 aa9□□□□□ -0.97
RRN3P1-201ENST00000514813 ABCC11Q96J66 1382 aa9□□□□□ -0.97
RRN3P1-201ENST00000514813 PLCD3Q8N3E9 789 aa9□□□□□ -0.97
RRN3P1-201ENST00000514813 ACEP12821 1306 aa9□□□□□ -0.97
RRN3P1-201ENST00000514813 MYO5BQ9ULV0 1848 aa9□□□□□ -0.97
RRN3P1-201ENST00000514813 CPS1P31327 1500 aa8.99□□□□□ -0.97
RRN3P1-201ENST00000514813 NEURL4Q96JN8 1562 aa8.99□□□□□ -0.97
RRN3P1-201ENST00000514813 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP8.99□□□□□ -0.97
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