RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000513573.1

CDH18-AS1-201, CDH18 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene CDH18-AS1, Length 424 nt, Biotype lincRNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH18-AS1-201ENST00000513573 HFM1A2PYH4 1435 aa30.72■■■□□ 2.51
CDH18-AS1-201ENST00000513573 CCDC125Q86Z20 511 aa30.7■■■□□ 2.51
CDH18-AS1-201ENST00000513573 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa30.69■■■□□ 2.5
CDH18-AS1-201ENST00000513573 PXDNQ92626 1479 aa30.67■■■□□ 2.5
CDH18-AS1-201ENST00000513573 ZRANB1Q9UGI0 708 aa30.66■■■□□ 2.5
CDH18-AS1-201ENST00000513573 FOXD1Q16676 465 aa30.65■■■□□ 2.5
CDH18-AS1-201ENST00000513573 NPHP3Q7Z494 1330 aa30.65■■■□□ 2.5
CDH18-AS1-201ENST00000513573 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa30.63■■■□□ 2.49
CDH18-AS1-201ENST00000513573 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP30.62■■■□□ 2.49
CDH18-AS1-201ENST00000513573 NAIPQ13075 1403 aa30.62■■■□□ 2.49
CDH18-AS1-201ENST00000513573 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP30.61■■■□□ 2.49
CDH18-AS1-201ENST00000513573 ESCO1Q5FWF5 840 aa30.58■■■□□ 2.49
CDH18-AS1-201ENST00000513573 PPLO60437 1756 aa30.58■■■□□ 2.49
CDH18-AS1-201ENST00000513573 TNKS1BP1Q9C0C2 1729 aaKnown RBP30.56■■■□□ 2.48
CDH18-AS1-201ENST00000513573 FOXO3O43524 673 aa30.55■■■□□ 2.48
CDH18-AS1-201ENST00000513573 TECPR2O15040 1411 aa30.54■■■□□ 2.48
CDH18-AS1-201ENST00000513573 SLIT2O94813 1529 aa30.53■■■□□ 2.48
CDH18-AS1-201ENST00000513573 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP30.52■■■□□ 2.48
CDH18-AS1-201ENST00000513573 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP30.51■■■□□ 2.47
CDH18-AS1-201ENST00000513573 GLI3P10071 1580 aa30.49■■■□□ 2.47
CDH18-AS1-201ENST00000513573 UNC5CLQ8IV45 518 aa30.49■■■□□ 2.47
CDH18-AS1-201ENST00000513573 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP30.47■■■□□ 2.47
CDH18-AS1-201ENST00000513573 RALGAPBQ86X10 1494 aa30.47■■■□□ 2.47
CDH18-AS1-201ENST00000513573 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP30.47■■■□□ 2.47
CDH18-AS1-201ENST00000513573 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa30.47■■■□□ 2.47
CDH18-AS1-201ENST00000513573 ABCC11Q96J66 1382 aa30.46■■■□□ 2.47
CDH18-AS1-201ENST00000513573 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa30.45■■■□□ 2.46
CDH18-AS1-201ENST00000513573 WAPLQ7Z5K2 1190 aa30.44■■■□□ 2.46
CDH18-AS1-201ENST00000513573 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP30.44■■■□□ 2.46
CDH18-AS1-201ENST00000513573 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP30.42■■■□□ 2.46
CDH18-AS1-201ENST00000513573 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP30.41■■■□□ 2.46
CDH18-AS1-201ENST00000513573 FMN2Q9NZ56 1722 aa30.39■■■□□ 2.45
CDH18-AS1-201ENST00000513573 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa30.39■■■□□ 2.45
CDH18-AS1-201ENST00000513573 USP32Q8NFA0 1604 aa30.38■■■□□ 2.45
CDH18-AS1-201ENST00000513573 KNDC1Q76NI1 1749 aa30.38■■■□□ 2.45
CDH18-AS1-201ENST00000513573 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa30.38■■■□□ 2.45
CDH18-AS1-201ENST00000513573 BRWD3Q6RI45 1802 aa30.38■■■□□ 2.45
CDH18-AS1-201ENST00000513573 CCDC144AA2RUR9 1427 aa30.38■■■□□ 2.45
CDH18-AS1-201ENST00000513573 SIRT1Q96EB6 747 aa30.37■■■□□ 2.45
CDH18-AS1-201ENST00000513573 KIF1AQ12756 1690 aa30.36■■■□□ 2.45
CDH18-AS1-201ENST00000513573 NUTM2FA1L443 756 aa30.36■■■□□ 2.45
CDH18-AS1-201ENST00000513573 VPS72Q15906 364 aa30.35■■■□□ 2.45
CDH18-AS1-201ENST00000513573 STK26Q9P289 416 aa30.35■■■□□ 2.45
CDH18-AS1-201ENST00000513573 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa30.35■■■□□ 2.45
CDH18-AS1-201ENST00000513573 IFT172Q9UG01 1749 aa30.34■■■□□ 2.45
CDH18-AS1-201ENST00000513573 KRT28Q7Z3Y7 464 aa30.34■■■□□ 2.45
CDH18-AS1-201ENST00000513573 DEFB132Q7Z7B7 95 aa30.34■■■□□ 2.45
CDH18-AS1-201ENST00000513573 SEPT12Q8IYM1 358 aa30.33■■■□□ 2.45
CDH18-AS1-201ENST00000513573 PIK3C2GO75747 1445 aa30.32■■■□□ 2.44
CDH18-AS1-201ENST00000513573 TMEM132EQ6IEE7 984 aa30.31■■■□□ 2.44
CDH18-AS1-201ENST00000513573 NWD2Q9ULI1 1742 aa30.29■■■□□ 2.44
CDH18-AS1-201ENST00000513573 TNS3Q68CZ2 1445 aa30.29■■■□□ 2.44
CDH18-AS1-201ENST00000513573 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP30.29■■■□□ 2.44
CDH18-AS1-201ENST00000513573 LRP5O75197 1615 aa30.29■■■□□ 2.44
CDH18-AS1-201ENST00000513573 SBNO1A3KN83 1393 aa30.27■■■□□ 2.44
CDH18-AS1-201ENST00000513573 RGL3Q3MIN7 710 aa30.25■■■□□ 2.43
CDH18-AS1-201ENST00000513573 PHF8Q9UPP1 1060 aa30.25■■■□□ 2.43
CDH18-AS1-201ENST00000513573 PSME1Q06323 249 aa30.24■■■□□ 2.43
CDH18-AS1-201ENST00000513573 PLCH1Q4KWH8 1693 aa30.23■■■□□ 2.43
CDH18-AS1-201ENST00000513573 KRT27Q7Z3Y8 459 aa30.23■■■□□ 2.43
CDH18-AS1-201ENST00000513573 CABLES1Q8TDN4 633 aa30.23■■■□□ 2.43
CDH18-AS1-201ENST00000513573 NRXN1Q9ULB1 1477 aa30.23■■■□□ 2.43
CDH18-AS1-201ENST00000513573 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP30.23■■■□□ 2.43
CDH18-AS1-201ENST00000513573 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP30.22■■■□□ 2.43
CDH18-AS1-201ENST00000513573 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP30.21■■■□□ 2.43
CDH18-AS1-201ENST00000513573 ABCA3Q99758 1704 aa30.21■■■□□ 2.43
CDH18-AS1-201ENST00000513573 FAM83GA6ND36 823 aa30.19■■■□□ 2.42
CDH18-AS1-201ENST00000513573 ARHGEF10O15013 1369 aa30.18■■■□□ 2.42
CDH18-AS1-201ENST00000513573 MPHOSPH9Q99550 1183 aa30.15■■■□□ 2.42
CDH18-AS1-201ENST00000513573 HRCP23327 699 aa30.13■■■□□ 2.41
CDH18-AS1-201ENST00000513573 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP30.13■■■□□ 2.41
CDH18-AS1-201ENST00000513573 NRAPQ86VF7 1730 aa30.13■■■□□ 2.41
CDH18-AS1-201ENST00000513573 BAG6P46379 1132 aa30.11■■■□□ 2.41
CDH18-AS1-201ENST00000513573 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP30.11■■■□□ 2.41
CDH18-AS1-201ENST00000513573 ANKARQ7Z5J8 1434 aa30.11■■■□□ 2.41
CDH18-AS1-201ENST00000513573 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP30.1■■■□□ 2.41
CDH18-AS1-201ENST00000513573 CFAP70Q5T0N1 1121 aa30.08■■■□□ 2.41
CDH18-AS1-201ENST00000513573 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP30.08■■■□□ 2.41
CDH18-AS1-201ENST00000513573 DLC1Q96QB1 1528 aa30.07■■■□□ 2.4
CDH18-AS1-201ENST00000513573 PRAM1Q96QH2 718 aa30.06■■■□□ 2.4
CDH18-AS1-201ENST00000513573 DISP2A7MBM2 1401 aa30.05■■■□□ 2.4
CDH18-AS1-201ENST00000513573 PSDA5PKW4 1024 aaPredicted RBP30.05■■■□□ 2.4
CDH18-AS1-201ENST00000513573 FAM98CQ17RN3 349 aaKnown RBP30.05■■■□□ 2.4
CDH18-AS1-201ENST00000513573 ADGRB2O60241 1585 aa30.05■■■□□ 2.4
CDH18-AS1-201ENST00000513573 BTG4Q9NY30 223 aa30.04■■■□□ 2.4
CDH18-AS1-201ENST00000513573 ALS2Q96Q42 1657 aa30.04■■■□□ 2.4
CDH18-AS1-201ENST00000513573 LMOD2Q6P5Q4 547 aa30.03■■■□□ 2.4
CDH18-AS1-201ENST00000513573 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa30.03■■■□□ 2.4
CDH18-AS1-201ENST00000513573 COL14A1Q05707 1796 aaKnown RBP30.03■■■□□ 2.4
CDH18-AS1-201ENST00000513573 SPATA31A5Q5VU36 1347 aa30.01■■■□□ 2.4
CDH18-AS1-201ENST00000513573 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa30.01■■■□□ 2.4
CDH18-AS1-201ENST00000513573 RGPD1P0DJD0 1748 aa30■■■□□ 2.39
CDH18-AS1-201ENST00000513573 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP30■■■□□ 2.39
CDH18-AS1-201ENST00000513573 THSD7AQ9UPZ6 1657 aa29.99■■■□□ 2.39
CDH18-AS1-201ENST00000513573 PLEKHG5O94827 1062 aa29.99■■■□□ 2.39
CDH18-AS1-201ENST00000513573 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP29.98■■■□□ 2.39
CDH18-AS1-201ENST00000513573 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa29.97■■■□□ 2.39
CDH18-AS1-201ENST00000513573 ADGRB1O14514 1584 aa29.97■■■□□ 2.39
CDH18-AS1-201ENST00000513573 PRR36Q9H6K5 1346 aa29.96■■■□□ 2.39
CDH18-AS1-201ENST00000513573 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP29.96■■■□□ 2.39
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