RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511185.5

SH3BP2-218, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP2, Length 1,071 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-218ENST00000511185 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa27.35■■□□□ 1.97
SH3BP2-218ENST00000511185 C1orf167Q5SNV9 1468 aa27.35■■□□□ 1.97
SH3BP2-218ENST00000511185 DLC1Q96QB1 1528 aa27.35■■□□□ 1.97
SH3BP2-218ENST00000511185 WAPLQ7Z5K2 1190 aa27.32■■□□□ 1.96
SH3BP2-218ENST00000511185 ADGRB2O60241 1585 aa27.3■■□□□ 1.96
SH3BP2-218ENST00000511185 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP27.28■■□□□ 1.96
SH3BP2-218ENST00000511185 USP32Q8NFA0 1604 aa27.27■■□□□ 1.96
SH3BP2-218ENST00000511185 ILDR2Q71H61 639 aa27.25■■□□□ 1.95
SH3BP2-218ENST00000511185 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP27.25■■□□□ 1.95
SH3BP2-218ENST00000511185 LRP6O75581 1613 aa27.25■■□□□ 1.95
SH3BP2-218ENST00000511185 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa27.24■■□□□ 1.95
SH3BP2-218ENST00000511185 KIF1AQ12756 1690 aa27.24■■□□□ 1.95
SH3BP2-218ENST00000511185 JCADQ9P266 1359 aa27.23■■□□□ 1.95
SH3BP2-218ENST00000511185 SIN3AQ96ST3 1273 aa27.23■■□□□ 1.95
SH3BP2-218ENST00000511185 ORAI2Q96SN7 254 aa27.2■■□□□ 1.94
SH3BP2-218ENST00000511185 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP27.19■■□□□ 1.94
SH3BP2-218ENST00000511185 PRAM1Q96QH2 718 aa27.19■■□□□ 1.94
SH3BP2-218ENST00000511185 NUTM2FA1L443 756 aa27.17■■□□□ 1.94
SH3BP2-218ENST00000511185 TRAK1Q9UPV9 953 aa27.17■■□□□ 1.94
SH3BP2-218ENST00000511185 PXDNQ92626 1479 aa27.15■■□□□ 1.94
SH3BP2-218ENST00000511185 SIRT1Q96EB6 747 aa27.15■■□□□ 1.94
SH3BP2-218ENST00000511185 STAC3Q96MF2 364 aa27.15■■□□□ 1.94
SH3BP2-218ENST00000511185 QRICH2Q9H0J4 1663 aa27.14■■□□□ 1.94
SH3BP2-218ENST00000511185 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP27.13■■□□□ 1.93
SH3BP2-218ENST00000511185 NEUROD1Q13562 356 aa27.12■■□□□ 1.93
SH3BP2-218ENST00000511185 L3MBTL2Q969R5 705 aa27.12■■□□□ 1.93
SH3BP2-218ENST00000511185 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP27.12■■□□□ 1.93
SH3BP2-218ENST00000511185 ITSN1Q15811 1721 aa27.12■■□□□ 1.93
SH3BP2-218ENST00000511185 PNPLA6Q8IY17 1366 aa27.1■■□□□ 1.93
SH3BP2-218ENST00000511185 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa27.1■■□□□ 1.93
SH3BP2-218ENST00000511185 POGKQ9P215 609 aa27.09■■□□□ 1.93
SH3BP2-218ENST00000511185 TULP4Q9NRJ4 1543 aa27.09■■□□□ 1.93
SH3BP2-218ENST00000511185 NBPF1Q3BBV0 1214 aa27.08■■□□□ 1.93
SH3BP2-218ENST00000511185 ESCO1Q5FWF5 840 aa27.08■■□□□ 1.93
SH3BP2-218ENST00000511185 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP27.08■■□□□ 1.93
SH3BP2-218ENST00000511185 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP27.07■■□□□ 1.92
SH3BP2-218ENST00000511185 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP27.07■■□□□ 1.92
SH3BP2-218ENST00000511185 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP27.07■■□□□ 1.92
SH3BP2-218ENST00000511185 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP27.07■■□□□ 1.92
SH3BP2-218ENST00000511185 ABCA3Q99758 1704 aa27.06■■□□□ 1.92
SH3BP2-218ENST00000511185 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa27.06■■□□□ 1.92
SH3BP2-218ENST00000511185 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP27.05■■□□□ 1.92
SH3BP2-218ENST00000511185 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP27.03■■□□□ 1.92
SH3BP2-218ENST00000511185 ANKARQ7Z5J8 1434 aa27.03■■□□□ 1.92
SH3BP2-218ENST00000511185 ATP7BP35670 1465 aa27.02■■□□□ 1.92
SH3BP2-218ENST00000511185 NPHP3Q7Z494 1330 aa27■■□□□ 1.91
SH3BP2-218ENST00000511185 PRR36Q9H6K5 1346 aa27■■□□□ 1.91
SH3BP2-218ENST00000511185 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP27■■□□□ 1.91
SH3BP2-218ENST00000511185 FOXO3O43524 673 aa26.99■■□□□ 1.91
SH3BP2-218ENST00000511185 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP26.98■■□□□ 1.91
SH3BP2-218ENST00000511185 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP26.98■■□□□ 1.91
SH3BP2-218ENST00000511185 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP26.98■■□□□ 1.91
SH3BP2-218ENST00000511185 ALS2Q96Q42 1657 aa26.97■■□□□ 1.91
SH3BP2-218ENST00000511185 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa26.94■■□□□ 1.9
SH3BP2-218ENST00000511185 NBPF8Q3BBV2 869 aa26.94■■□□□ 1.9
SH3BP2-218ENST00000511185 WASLO00401 505 aaPredicted RBP26.93■■□□□ 1.9
SH3BP2-218ENST00000511185 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP26.93■■□□□ 1.9
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SH3BP2-218ENST00000511185 PHF8Q9UPP1 1060 aa26.93■■□□□ 1.9
SH3BP2-218ENST00000511185 TONSLQ96HA7 1378 aa26.93■■□□□ 1.9
SH3BP2-218ENST00000511185 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP26.92■■□□□ 1.9
SH3BP2-218ENST00000511185 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP26.92■■□□□ 1.9
SH3BP2-218ENST00000511185 RALGAPBQ86X10 1494 aa26.92■■□□□ 1.9
SH3BP2-218ENST00000511185 TNS3Q68CZ2 1445 aa26.91■■□□□ 1.9
SH3BP2-218ENST00000511185 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa26.89■■□□□ 1.9
SH3BP2-218ENST00000511185 PCGF6Q9BYE7 350 aa26.88■■□□□ 1.89
SH3BP2-218ENST00000511185 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP26.88■■□□□ 1.89
SH3BP2-218ENST00000511185 GPRASP1Q5JY77 1395 aa26.87■■□□□ 1.89
SH3BP2-218ENST00000511185 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa26.86■■□□□ 1.89
SH3BP2-218ENST00000511185 PLCH1Q4KWH8 1693 aa26.85■■□□□ 1.89
SH3BP2-218ENST00000511185 SOCS7O14512 581 aa26.84■■□□□ 1.89
SH3BP2-218ENST00000511185 KRT28Q7Z3Y7 464 aa26.84■■□□□ 1.89
SH3BP2-218ENST00000511185 ADAMTS2O95450 1211 aa26.83■■□□□ 1.89
SH3BP2-218ENST00000511185 C8orf37Q96NL8 207 aa26.83■■□□□ 1.89
SH3BP2-218ENST00000511185 AFF2P51816 1311 aa26.83■■□□□ 1.89
SH3BP2-218ENST00000511185 PHRF1Q9P1Y6 1649 aaKnown RBP26.83■■□□□ 1.88
SH3BP2-218ENST00000511185 CDK19Q9BWU1 502 aa26.82■■□□□ 1.88
SH3BP2-218ENST00000511185 SBNO1A3KN83 1393 aa26.82■■□□□ 1.88
SH3BP2-218ENST00000511185 TNKS1BP1Q9C0C2 1729 aaKnown RBP26.82■■□□□ 1.88
SH3BP2-218ENST00000511185 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP26.8■■□□□ 1.88
SH3BP2-218ENST00000511185 AKAP12Q02952 1782 aa26.79■■□□□ 1.88
SH3BP2-218ENST00000511185 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa26.75■■□□□ 1.87
SH3BP2-218ENST00000511185 PSME1Q06323 249 aa26.75■■□□□ 1.87
SH3BP2-218ENST00000511185 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP26.74■■□□□ 1.87
SH3BP2-218ENST00000511185 NRAPQ86VF7 1730 aa26.74■■□□□ 1.87
SH3BP2-218ENST00000511185 PLEKHG5O94827 1062 aa26.74■■□□□ 1.87
SH3BP2-218ENST00000511185 ZNF772Q68DY9 489 aaPredicted RBP26.74■■□□□ 1.87
SH3BP2-218ENST00000511185 CABP2Q9NPB3 220 aa26.74■■□□□ 1.87
SH3BP2-218ENST00000511185 NWD2Q9ULI1 1742 aa26.73■■□□□ 1.87
SH3BP2-218ENST00000511185 ARHGEF10O15013 1369 aa26.73■■□□□ 1.87
SH3BP2-218ENST00000511185 NRKQ7Z2Y5 1582 aa26.73■■□□□ 1.87
SH3BP2-218ENST00000511185 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP26.72■■□□□ 1.87
SH3BP2-218ENST00000511185 CABLES1Q8TDN4 633 aa26.72■■□□□ 1.87
SH3BP2-218ENST00000511185 LMOD2Q6P5Q4 547 aa26.71■■□□□ 1.87
SH3BP2-218ENST00000511185 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP26.71■■□□□ 1.87
SH3BP2-218ENST00000511185 CARD11Q9BXL7 1154 aa26.7■■□□□ 1.86
SH3BP2-218ENST00000511185 MON2Q7Z3U7 1717 aa26.7■■□□□ 1.86
SH3BP2-218ENST00000511185 NGLY1Q96IV0 654 aa26.69■■□□□ 1.86
SH3BP2-218ENST00000511185 BCL9LQ86UU0 1499 aa26.68■■□□□ 1.86
SH3BP2-218ENST00000511185 ACEP12821 1306 aa26.68■■□□□ 1.86
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