RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000497977.1

PTPRN-218, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type N, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRN, Length 701 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRN-218ENST00000497977 PPLO60437 1756 aa14.78□□□□□ -0.04
PTPRN-218ENST00000497977 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa14.78□□□□□ -0.04
PTPRN-218ENST00000497977 ORAI2Q96SN7 254 aa14.78□□□□□ -0.04
PTPRN-218ENST00000497977 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa14.77□□□□□ -0.04
PTPRN-218ENST00000497977 NUTM2FA1L443 756 aa14.76□□□□□ -0.05
PTPRN-218ENST00000497977 WASLO00401 505 aaPredicted RBP14.76□□□□□ -0.05
PTPRN-218ENST00000497977 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
PTPRN-218ENST00000497977 C1orf167Q5SNV9 1468 aa14.76□□□□□ -0.05
PTPRN-218ENST00000497977 MST1RQ04912 1400 aa14.75□□□□□ -0.05
PTPRN-218ENST00000497977 FOXO3O43524 673 aa14.75□□□□□ -0.05
PTPRN-218ENST00000497977 NBPF1Q3BBV0 1214 aa14.74□□□□□ -0.05
PTPRN-218ENST00000497977 PHF8Q9UPP1 1060 aa14.74□□□□□ -0.05
PTPRN-218ENST00000497977 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP14.73□□□□□ -0.05
PTPRN-218ENST00000497977 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
PTPRN-218ENST00000497977 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
PTPRN-218ENST00000497977 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
PTPRN-218ENST00000497977 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa14.72□□□□□ -0.05
PTPRN-218ENST00000497977 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.05
PTPRN-218ENST00000497977 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.05
PTPRN-218ENST00000497977 LAMC1P11047 1609 aa14.71□□□□□ -0.05
PTPRN-218ENST00000497977 KRT28Q7Z3Y7 464 aa14.71□□□□□ -0.05
PTPRN-218ENST00000497977 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
PTPRN-218ENST00000497977 CDK19Q9BWU1 502 aa14.71□□□□□ -0.05
PTPRN-218ENST00000497977 CARD11Q9BXL7 1154 aa14.71□□□□□ -0.05
PTPRN-218ENST00000497977 DLC1Q96QB1 1528 aa14.71□□□□□ -0.06
PTPRN-218ENST00000497977 CCDC61Q9Y6R9 512 aa14.7□□□□□ -0.06
PTPRN-218ENST00000497977 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
PTPRN-218ENST00000497977 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
PTPRN-218ENST00000497977 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
PTPRN-218ENST00000497977 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
PTPRN-218ENST00000497977 ZNF772Q68DY9 489 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
PTPRN-218ENST00000497977 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
PTPRN-218ENST00000497977 GPRASP1Q5JY77 1395 aa14.69□□□□□ -0.06
PTPRN-218ENST00000497977 EVC2Q86UK5 1308 aa14.68□□□□□ -0.06
PTPRN-218ENST00000497977 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
PTPRN-218ENST00000497977 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
PTPRN-218ENST00000497977 ANKARQ7Z5J8 1434 aa14.66□□□□□ -0.06
PTPRN-218ENST00000497977 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa14.66□□□□□ -0.06
PTPRN-218ENST00000497977 LMOD2Q6P5Q4 547 aa14.66□□□□□ -0.06
PTPRN-218ENST00000497977 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa14.66□□□□□ -0.06
PTPRN-218ENST00000497977 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
PTPRN-218ENST00000497977 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa14.66□□□□□ -0.06
PTPRN-218ENST00000497977 ADGRB1O14514 1584 aa14.65□□□□□ -0.06
PTPRN-218ENST00000497977 NGLY1Q96IV0 654 aa14.65□□□□□ -0.06
PTPRN-218ENST00000497977 NBPF8Q3BBV2 869 aa14.64□□□□□ -0.07
PTPRN-218ENST00000497977 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa14.64□□□□□ -0.07
PTPRN-218ENST00000497977 PLEKHG3A1L390 1219 aa14.63□□□□□ -0.07
PTPRN-218ENST00000497977 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
PTPRN-218ENST00000497977 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
PTPRN-218ENST00000497977 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
PTPRN-218ENST00000497977 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
PTPRN-218ENST00000497977 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
PTPRN-218ENST00000497977 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
PTPRN-218ENST00000497977 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa14.62□□□□□ -0.07
PTPRN-218ENST00000497977 ADAMTS2O95450 1211 aa14.61□□□□□ -0.07
PTPRN-218ENST00000497977 SBNO1A3KN83 1393 aa14.6□□□□□ -0.07
PTPRN-218ENST00000497977 ARHGEF10O15013 1369 aa14.6□□□□□ -0.07
PTPRN-218ENST00000497977 CDCA8Q53HL2 280 aa14.6□□□□□ -0.07
PTPRN-218ENST00000497977 C8orf37Q96NL8 207 aa14.6□□□□□ -0.07
PTPRN-218ENST00000497977 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
PTPRN-218ENST00000497977 PNPLA6Q8IY17 1366 aa14.6□□□□□ -0.07
PTPRN-218ENST00000497977 CABP2Q9NPB3 220 aa14.59□□□□□ -0.07
PTPRN-218ENST00000497977 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa14.59□□□□□ -0.07
PTPRN-218ENST00000497977 RXRBP28702 533 aa14.58□□□□□ -0.08
PTPRN-218ENST00000497977 CABP1Q9NZU7 370 aa14.58□□□□□ -0.08
PTPRN-218ENST00000497977 PHLPP1O60346 1717 aa14.58□□□□□ -0.08
PTPRN-218ENST00000497977 ILDR2Q71H61 639 aa14.57□□□□□ -0.08
PTPRN-218ENST00000497977 ACEP12821 1306 aa14.57□□□□□ -0.08
PTPRN-218ENST00000497977 KNDC1Q76NI1 1749 aa14.57□□□□□ -0.08
PTPRN-218ENST00000497977 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP14.57□□□□□ -0.08
PTPRN-218ENST00000497977 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa14.56□□□□□ -0.08
PTPRN-218ENST00000497977 QTRT2Q9H974 415 aaKnown RBP14.56□□□□□ -0.08
PTPRN-218ENST00000497977 USP21Q9UK80 565 aa14.56□□□□□ -0.08
PTPRN-218ENST00000497977 SOCS7O14512 581 aa14.55□□□□□ -0.08
PTPRN-218ENST00000497977 TMF1P82094 1093 aa14.55□□□□□ -0.08
PTPRN-218ENST00000497977 NLRP13Q86W25 1043 aa14.55□□□□□ -0.08
PTPRN-218ENST00000497977 ABTB2Q8N961 1025 aa14.55□□□□□ -0.08
PTPRN-218ENST00000497977 TRPC5Q9UL62 973 aaPredicted RBP14.55□□□□□ -0.08
PTPRN-218ENST00000497977 PRR36Q9H6K5 1346 aa14.55□□□□□ -0.08
PTPRN-218ENST00000497977 ATAD2Q6PL18 1390 aa14.55□□□□□ -0.08
PTPRN-218ENST00000497977 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP14.55□□□□□ -0.08
PTPRN-218ENST00000497977 NALCNQ8IZF0 1738 aa14.55□□□□□ -0.08
PTPRN-218ENST00000497977 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP14.54□□□□□ -0.08
PTPRN-218ENST00000497977 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP14.54□□□□□ -0.08
PTPRN-218ENST00000497977 TERF2IPQ9NYB0 399 aa14.54□□□□□ -0.08
PTPRN-218ENST00000497977 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP14.54□□□□□ -0.08
PTPRN-218ENST00000497977 AFF2P51816 1311 aa14.54□□□□□ -0.08
PTPRN-218ENST00000497977 TULP4Q9NRJ4 1543 aa14.54□□□□□ -0.08
PTPRN-218ENST00000497977 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa14.53□□□□□ -0.08
PTPRN-218ENST00000497977 TMC1Q8TDI8 760 aa14.53□□□□□ -0.08
PTPRN-218ENST00000497977 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP14.52□□□□□ -0.08
PTPRN-218ENST00000497977 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa14.52□□□□□ -0.08
PTPRN-218ENST00000497977 RBM6P78332 1123 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.09
PTPRN-218ENST00000497977 TNS3Q68CZ2 1445 aa14.51□□□□□ -0.09
PTPRN-218ENST00000497977 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP14.51□□□□□ -0.09
PTPRN-218ENST00000497977 POTEAQ6S8J7 498 aa14.51□□□□□ -0.09
PTPRN-218ENST00000497977 ADGRB2O60241 1585 aa14.51□□□□□ -0.09
PTPRN-218ENST00000497977 PXDNQ92626 1479 aa14.5□□□□□ -0.09
PTPRN-218ENST00000497977 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa14.5□□□□□ -0.09
PTPRN-218ENST00000497977 PLEKHG5O94827 1062 aa14.5□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 11 ms