RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491163.1

C7orf50-208, Transcript of chromosome 7 open reading frame 50, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 3

Gene C7orf50, Length 621 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C7orf50-208ENST00000491163 C1orf167Q5SNV9 1468 aa28.96■■■□□ 2.23
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C7orf50-208ENST00000491163 DLC1Q96QB1 1528 aa28.94■■■□□ 2.22
C7orf50-208ENST00000491163 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP28.94■■■□□ 2.22
C7orf50-208ENST00000491163 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP28.93■■■□□ 2.22
C7orf50-208ENST00000491163 DISP3Q9P2K9 1392 aa28.92■■■□□ 2.22
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C7orf50-208ENST00000491163 SIRT1Q96EB6 747 aa28.89■■■□□ 2.22
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C7orf50-208ENST00000491163 USP32Q8NFA0 1604 aa28.76■■■□□ 2.19
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C7orf50-208ENST00000491163 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP28.63■■■□□ 2.17
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C7orf50-208ENST00000491163 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa28.54■■■□□ 2.16
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C7orf50-208ENST00000491163 AFF2P51816 1311 aa28.4■■■□□ 2.14
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C7orf50-208ENST00000491163 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP28.36■■■□□ 2.13
C7orf50-208ENST00000491163 ARHGEF10O15013 1369 aa28.36■■■□□ 2.13
C7orf50-208ENST00000491163 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa28.35■■■□□ 2.13
C7orf50-208ENST00000491163 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa28.35■■■□□ 2.13
C7orf50-208ENST00000491163 NGLY1Q96IV0 654 aa28.33■■■□□ 2.13
C7orf50-208ENST00000491163 CABP1Q9NZU7 370 aa28.33■■■□□ 2.13
C7orf50-208ENST00000491163 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa28.31■■■□□ 2.12
C7orf50-208ENST00000491163 ZNF772Q68DY9 489 aaPredicted RBP28.31■■■□□ 2.12
C7orf50-208ENST00000491163 USP47Q96K76 1375 aa28.3■■■□□ 2.12
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