RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491139.5

NELFE-210, Transcript of negative elongation factor complex member E, humanhuman

TSL 3

Gene NELFE, Length 582 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NELFE-210ENST00000491139 ESCO1Q5FWF5 840 aa31.47■■■□□ 2.63
NELFE-210ENST00000491139 ATRNO75882 1429 aa31.46■■■□□ 2.63
NELFE-210ENST00000491139 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP31.46■■■□□ 2.63
NELFE-210ENST00000491139 FOXD1Q16676 465 aa31.45■■■□□ 2.63
NELFE-210ENST00000491139 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP31.43■■■□□ 2.62
NELFE-210ENST00000491139 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP31.43■■■□□ 2.62
NELFE-210ENST00000491139 MYOM2P54296 1465 aa31.41■■■□□ 2.62
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NELFE-210ENST00000491139 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa31.39■■■□□ 2.62
NELFE-210ENST00000491139 FOXO3O43524 673 aa31.39■■■□□ 2.62
NELFE-210ENST00000491139 ZRANB1Q9UGI0 708 aa31.39■■■□□ 2.62
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NELFE-210ENST00000491139 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP31.37■■■□□ 2.61
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NELFE-210ENST00000491139 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP31.33■■■□□ 2.61
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NELFE-210ENST00000491139 WAPLQ7Z5K2 1190 aa31.31■■■□□ 2.6
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NELFE-210ENST00000491139 RGL3Q3MIN7 710 aa31.26■■■□□ 2.59
NELFE-210ENST00000491139 UNC5CLQ8IV45 518 aa31.25■■■□□ 2.59
NELFE-210ENST00000491139 ABCC11Q96J66 1382 aa31.24■■■□□ 2.59
NELFE-210ENST00000491139 CCDC144AA2RUR9 1427 aa31.24■■■□□ 2.59
NELFE-210ENST00000491139 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa31.23■■■□□ 2.59
NELFE-210ENST00000491139 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa31.23■■■□□ 2.59
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NELFE-210ENST00000491139 SLIT2O94813 1529 aa31.19■■■□□ 2.58
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NELFE-210ENST00000491139 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa31.18■■■□□ 2.58
NELFE-210ENST00000491139 KRT28Q7Z3Y7 464 aa31.18■■■□□ 2.58
NELFE-210ENST00000491139 KNDC1Q76NI1 1749 aa31.16■■■□□ 2.58
NELFE-210ENST00000491139 KIF1AQ12756 1690 aa31.16■■■□□ 2.58
NELFE-210ENST00000491139 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP31.15■■■□□ 2.58
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NELFE-210ENST00000491139 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP31.14■■■□□ 2.58
NELFE-210ENST00000491139 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP31.14■■■□□ 2.58
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NELFE-210ENST00000491139 PIK3C2GO75747 1445 aa31.13■■■□□ 2.57
NELFE-210ENST00000491139 PSME1Q06323 249 aa31.11■■■□□ 2.57
NELFE-210ENST00000491139 USP32Q8NFA0 1604 aa31.11■■■□□ 2.57
NELFE-210ENST00000491139 SIRT1Q96EB6 747 aa31.11■■■□□ 2.57
NELFE-210ENST00000491139 MPHOSPH9Q99550 1183 aa31.1■■■□□ 2.57
NELFE-210ENST00000491139 PHF8Q9UPP1 1060 aa31.1■■■□□ 2.57
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NELFE-210ENST00000491139 TNS3Q68CZ2 1445 aa31.07■■■□□ 2.57
NELFE-210ENST00000491139 VPS72Q15906 364 aa31.07■■■□□ 2.56
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NELFE-210ENST00000491139 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP31.02■■■□□ 2.56
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NELFE-210ENST00000491139 KRT27Q7Z3Y8 459 aa30.99■■■□□ 2.55
NELFE-210ENST00000491139 NRXN1Q9ULB1 1477 aa30.99■■■□□ 2.55
NELFE-210ENST00000491139 NWD2Q9ULI1 1742 aa30.98■■■□□ 2.55
NELFE-210ENST00000491139 CFAP70Q5T0N1 1121 aa30.98■■■□□ 2.55
NELFE-210ENST00000491139 PLCH1Q4KWH8 1693 aa30.97■■■□□ 2.55
NELFE-210ENST00000491139 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP30.97■■■□□ 2.55
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NELFE-210ENST00000491139 A0A0G2JS52 829 aa30.93■■■□□ 2.54
NELFE-210ENST00000491139 MYT1Q01538 1121 aa30.93■■■□□ 2.54
NELFE-210ENST00000491139 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa30.93■■■□□ 2.54
NELFE-210ENST00000491139 POGKQ9P215 609 aa30.92■■■□□ 2.54
NELFE-210ENST00000491139 ABCA3Q99758 1704 aa30.92■■■□□ 2.54
NELFE-210ENST00000491139 ANKARQ7Z5J8 1434 aa30.9■■■□□ 2.54
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NELFE-210ENST00000491139 DLC1Q96QB1 1528 aa30.85■■■□□ 2.53
NELFE-210ENST00000491139 GPRASP1Q5JY77 1395 aa30.83■■■□□ 2.53
NELFE-210ENST00000491139 LRP5O75197 1615 aa30.83■■■□□ 2.53
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NELFE-210ENST00000491139 ADGRB2O60241 1585 aa30.8■■■□□ 2.52
NELFE-210ENST00000491139 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP30.8■■■□□ 2.52
NELFE-210ENST00000491139 NRAPQ86VF7 1730 aa30.8■■■□□ 2.52
NELFE-210ENST00000491139 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP30.79■■■□□ 2.52
NELFE-210ENST00000491139 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP30.78■■■□□ 2.52
NELFE-210ENST00000491139 TRAK1Q9UPV9 953 aa30.78■■■□□ 2.52
NELFE-210ENST00000491139 COL14A1Q05707 1796 aaKnown RBP30.77■■■□□ 2.52
NELFE-210ENST00000491139 HRCP23327 699 aa30.77■■■□□ 2.52
NELFE-210ENST00000491139 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP30.76■■■□□ 2.52
NELFE-210ENST00000491139 ALS2Q96Q42 1657 aa30.75■■■□□ 2.51
NELFE-210ENST00000491139 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP30.75■■■□□ 2.51
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