RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000490677.1

HOXB3-211, Transcript of homeobox B3, human

TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXB3, Length 1,109 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
HOXB3-211	ENST00000490677	PLEKHH1	Q9ULM0	1364 aa		41.12	■■■■■ 4.17
HOXB3-211	ENST00000490677	C14orf93	Q9H972	538 aa	Known RBP	41.11	■■■■■ 4.17
HOXB3-211	ENST00000490677	STK26	Q9P289	416 aa		41.11	■■■■■ 4.17
HOXB3-211	ENST00000490677	WAPL	Q7Z5K2	1190 aa		41.1	■■■■■ 4.17
HOXB3-211	ENST00000490677	PNPLA6	Q8IY17	1366 aa		41.1	■■■■■ 4.17
HOXB3-211	ENST00000490677	FMN2	Q9NZ56	1722 aa		41.1	■■■■■ 4.17
HOXB3-211	ENST00000490677	LRRC59	Q96AG4	307 aa	Known RBP	41.09	■■■■■ 4.17
HOXB3-211	ENST00000490677	SOS2	Q07890	1332 aa	Predicted RBP	41.06	■■■■■ 4.16
HOXB3-211	ENST00000490677	CFAP70	Q5T0N1	1121 aa		41.04	■■■■■ 4.16
HOXB3-211	ENST00000490677	RGPD8	O14715	1765 aa	Predicted RBP	41.02	■■■■■ 4.16
HOXB3-211	ENST00000490677	ADGRB1	O14514	1584 aa		41	■■■■■ 4.15
HOXB3-211	ENST00000490677	NUTM2B	A6NNL0	878 aa	Predicted RBP	40.99	■■■■■ 4.15
HOXB3-211	ENST00000490677	NUTM2E	B1AL46	878 aa	Predicted RBP	40.99	■■■■■ 4.15
HOXB3-211	ENST00000490677	MEX3C	Q5U5Q3	659 aa	Known RBP	40.99	■■■■■ 4.15
HOXB3-211	ENST00000490677	NUTM2A	Q8IVF1	878 aa	Predicted RBP	40.99	■■■■■ 4.15
HOXB3-211	ENST00000490677	SIRT1	Q96EB6	747 aa		40.99	■■■■■ 4.15
HOXB3-211	ENST00000490677	COL22A1	Q8NFW1	1626 aa	Predicted RBP	40.99	■■■■■ 4.15
HOXB3-211	ENST00000490677	PXDN	Q92626	1479 aa		40.96	■■■■■ 4.15
HOXB3-211	ENST00000490677	DLC1	Q96QB1	1528 aa		40.94	■■■■■ 4.14
HOXB3-211	ENST00000490677	DHX57	Q6P158	1386 aa	Known RBP	40.93	■■■■■ 4.14
HOXB3-211	ENST00000490677	ZNF772	Q68DY9	489 aa	Predicted RBP	40.91	■■■■■ 4.14
HOXB3-211	ENST00000490677	ESCO1	Q5FWF5	840 aa		40.9	■■■■■ 4.14
HOXB3-211	ENST00000490677	KIF1A	Q12756	1690 aa		40.9	■■■■■ 4.14
HOXB3-211	ENST00000490677	NUTM2F	A1L443	756 aa		40.86	■■■■■ 4.13
HOXB3-211	ENST00000490677	AFF2	P51816	1311 aa		40.85	■■■■■ 4.13
HOXB3-211	ENST00000490677	NPHP3	Q7Z494	1330 aa		40.85	■■■■■ 4.13
HOXB3-211	ENST00000490677	ADGRB2	O60241	1585 aa		40.84	■■■■■ 4.13
HOXB3-211	ENST00000490677	MARF1	Q9Y4F3	1742 aa	Known RBP	40.84	■■■■■ 4.13
HOXB3-211	ENST00000490677	USP32	Q8NFA0	1604 aa		40.83	■■■■■ 4.13
HOXB3-211	ENST00000490677	DCAF11	Q8TEB1	546 aa		40.82	■■■■■ 4.13
HOXB3-211	ENST00000490677	FOXO3	O43524	673 aa		40.8	■■■■■ 4.12
HOXB3-211	ENST00000490677	PRAM1	Q96QH2	718 aa		40.8	■■■■■ 4.12
HOXB3-211	ENST00000490677	KDM2A	Q9Y2K7	1162 aa		40.78	■■■■■ 4.12
HOXB3-211	ENST00000490677	C8orf37	Q96NL8	207 aa		40.77	■■■■■ 4.12
HOXB3-211	ENST00000490677	ARHGEF28	Q8N1W1	1705 aa	Known RBP	40.76	■■■■■ 4.12
HOXB3-211	ENST00000490677	STAC3	Q96MF2	364 aa		40.76	■■■■■ 4.12
HOXB3-211	ENST00000490677	XPC	Q01831	940 aa	Predicted RBP	40.75	■■■■■ 4.11
HOXB3-211	ENST00000490677	CDK12	Q9NYV4	1490 aa	Predicted RBP	40.73	■■■■■ 4.11
HOXB3-211	ENST00000490677	ADAMTS2	O95450	1211 aa		40.72	■■■■■ 4.11
HOXB3-211	ENST00000490677	SAFB2	Q14151	953 aa	Known RBP eCLIP	40.72	■■■■■ 4.11
HOXB3-211	ENST00000490677	KIAA1210	Q9ULL0	1709 aa		40.7	■■■■■ 4.11
HOXB3-211	ENST00000490677	RXRB	P28702	533 aa		40.68	■■■■■ 4.1
HOXB3-211	ENST00000490677	TRAK1	Q9UPV9	953 aa		40.68	■■■■■ 4.1
HOXB3-211	ENST00000490677	POGK	Q9P215	609 aa		40.65	■■■■■ 4.1
HOXB3-211	ENST00000490677	ANKAR	Q7Z5J8	1434 aa		40.65	■■■■■ 4.1
HOXB3-211	ENST00000490677	SPATA31A3	Q5VYP0	1347 aa		40.64	■■■■■ 4.1
HOXB3-211	ENST00000490677	NGLY1	Q96IV0	654 aa		40.63	■■■■■ 4.09
HOXB3-211	ENST00000490677	PHF8	Q9UPP1	1060 aa		40.63	■■■■■ 4.09
HOXB3-211	ENST00000490677	QTRT2	Q9H974	415 aa	Known RBP	40.61	■■■■■ 4.09
HOXB3-211	ENST00000490677	ABCA3	Q99758	1704 aa		40.6	■■■■■ 4.09
HOXB3-211	ENST00000490677	FNBP4	Q8N3X1	1017 aa	Predicted RBP	40.6	■■■■■ 4.09
HOXB3-211	ENST00000490677	TRPM3	Q9HCF6	1732 aa	Predicted RBP	40.59	■■■■■ 4.09
HOXB3-211	ENST00000490677	RGS12	O14924	1447 aa		40.59	■■■■■ 4.09
HOXB3-211	ENST00000490677	KRT28	Q7Z3Y7	464 aa		40.58	■■■■■ 4.09
HOXB3-211	ENST00000490677	TULP4	Q9NRJ4	1543 aa		40.57	■■■■■ 4.09
HOXB3-211	ENST00000490677	HIRIP3	Q9BW71	556 aa	Predicted RBP	40.56	■■■■■ 4.08
HOXB3-211	ENST00000490677	RBM6	P78332	1123 aa	Known RBP	40.55	■■■■■ 4.08
HOXB3-211	ENST00000490677	MINK1	Q8N4C8	1332 aa	Predicted RBP	40.55	■■■■■ 4.08
HOXB3-211	ENST00000490677	TNS3	Q68CZ2	1445 aa		40.55	■■■■■ 4.08
HOXB3-211	ENST00000490677	TNKS1BP1	Q9C0C2	1729 aa	Known RBP	40.55	■■■■■ 4.08
HOXB3-211	ENST00000490677	BCL9L	Q86UU0	1499 aa		40.54	■■■■■ 4.08
HOXB3-211	ENST00000490677	PRR36	Q9H6K5	1346 aa		40.54	■■■■■ 4.08
HOXB3-211	ENST00000490677	ATRN	O75882	1429 aa		40.52	■■■■■ 4.08
HOXB3-211	ENST00000490677	USP21	Q9UK80	565 aa		40.52	■■■■■ 4.08
HOXB3-211	ENST00000490677	SBNO1	A3KN83	1393 aa		40.51	■■■■■ 4.08
HOXB3-211	ENST00000490677	ALS2	Q96Q42	1657 aa		40.5	■■■■■ 4.07
HOXB3-211	ENST00000490677	ITSN1	Q15811	1721 aa		40.49	■■■■■ 4.07
HOXB3-211	ENST00000490677	WASL	O00401	505 aa	Predicted RBP	40.47	■■■■■ 4.07
HOXB3-211	ENST00000490677	UPF1	Q92900	1129 aa	Known RBP eCLIP	40.47	■■■■■ 4.07
HOXB3-211	ENST00000490677	PMFBP1	Q8TBY8	1022 aa		40.46	■■■■■ 4.07
HOXB3-211	ENST00000490677	EIF3A	Q14152	1382 aa	Known RBP	40.45	■■■■■ 4.07
HOXB3-211	ENST00000490677	SLIT2	O94813	1529 aa		40.44	■■■■■ 4.06
HOXB3-211	ENST00000490677	TRPC5	Q9UL62	973 aa	Predicted RBP	40.44	■■■■■ 4.06
HOXB3-211	ENST00000490677	ATP7B	P35670	1465 aa		40.44	■■■■■ 4.06
HOXB3-211	ENST00000490677	PSME1	Q06323	249 aa		40.43	■■■■■ 4.06
HOXB3-211	ENST00000490677	TOPAZ1	Q8N9V7	1692 aa		40.42	■■■■■ 4.06
HOXB3-211	ENST00000490677	NBPF1	Q3BBV0	1214 aa		40.41	■■■■■ 4.06
HOXB3-211	ENST00000490677	CRYBG1	Q9Y4K1	1723 aa		40.41	■■■■■ 4.06
HOXB3-211	ENST00000490677	PLCH1	Q4KWH8	1693 aa		40.4	■■■■■ 4.06
HOXB3-211	ENST00000490677	ARHGEF10	O15013	1369 aa		40.37	■■■■■ 4.05
HOXB3-211	ENST00000490677	NWD2	Q9ULI1	1742 aa		40.37	■■■■■ 4.05
HOXB3-211	ENST00000490677	CABLES1	Q8TDN4	633 aa		40.36	■■■■■ 4.05
HOXB3-211	ENST00000490677	GLI3	P10071	1580 aa		40.34	■■■■■ 4.05
HOXB3-211	ENST00000490677	TRPM1	Q7Z4N2	1603 aa		40.32	■■■■■ 4.05
HOXB3-211	ENST00000490677	L3MBTL2	Q969R5	705 aa		40.31	■■■■■ 4.04
HOXB3-211	ENST00000490677	SIN3A	Q96ST3	1273 aa		40.3	■■■■■ 4.04
HOXB3-211	ENST00000490677	QRICH2	Q9H0J4	1663 aa		40.29	■■■■■ 4.04
HOXB3-211	ENST00000490677	EP400	Q96L91	3159 aa		40.28	■■■■■ 4.04
HOXB3-211	ENST00000490677	NUDT16	Q96DE0	195 aa	Known RBP	40.28	■■■■■ 4.04
HOXB3-211	ENST00000490677	GPRASP1	Q5JY77	1395 aa		40.27	■■■■■ 4.04
HOXB3-211	ENST00000490677	UNC5CL	Q8IV45	518 aa		40.27	■■■■■ 4.04
HOXB3-211	ENST00000490677	NRAP	Q86VF7	1730 aa		40.27	■■■■■ 4.04
HOXB3-211	ENST00000490677	LMOD2	Q6P5Q4	547 aa		40.25	■■■■■ 4.03
HOXB3-211	ENST00000490677	GJD4	Q96KN9	370 aa	Predicted RBP	40.25	■■■■■ 4.03
HOXB3-211	ENST00000490677	CDK19	Q9BWU1	502 aa		40.25	■■■■■ 4.03
HOXB3-211	ENST00000490677	RALGAPB	Q86X10	1494 aa		40.25	■■■■■ 4.03
HOXB3-211	ENST00000490677	BRWD3	Q6RI45	1802 aa		40.23	■■■■■ 4.03
HOXB3-211	ENST00000490677	PLEKHG5	O94827	1062 aa		40.2	■■■■■ 4.03
HOXB3-211	ENST00000490677	NGDN	Q8NEJ9	315 aa	Known RBP	40.2	■■■■■ 4.03
HOXB3-211	ENST00000490677	POLR3A	O14802	1390 aa	Predicted RBP	40.19	■■■■■ 4.02

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 78.8 ms