RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000483873.6

GTF3C4-202, Transcript of general transcription factor IIIC subunit 4, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene GTF3C4, Length 1,417 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C4-202ENST00000483873 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa38.17■■■■□ 3.7
GTF3C4-202ENST00000483873 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa38.17■■■■□ 3.7
GTF3C4-202ENST00000483873 SIRT1Q96EB6 747 aa38.16■■■■□ 3.7
GTF3C4-202ENST00000483873 TONSLQ96HA7 1378 aa38.16■■■■□ 3.7
GTF3C4-202ENST00000483873 NBPF1Q3BBV0 1214 aa38.15■■■■□ 3.7
GTF3C4-202ENST00000483873 PRAM1Q96QH2 718 aa38.14■■■■□ 3.7
GTF3C4-202ENST00000483873 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP38.12■■■■□ 3.69
GTF3C4-202ENST00000483873 PHLPP1O60346 1717 aa38.09■■■■□ 3.69
GTF3C4-202ENST00000483873 C1orf167Q5SNV9 1468 aa38.08■■■■□ 3.69
GTF3C4-202ENST00000483873 FMN2Q9NZ56 1722 aa38.07■■■■□ 3.69
GTF3C4-202ENST00000483873 POGKQ9P215 609 aa38.07■■■■□ 3.69
GTF3C4-202ENST00000483873 BRINP3Q76B58 766 aa38.06■■■■□ 3.68
GTF3C4-202ENST00000483873 NBPF8Q3BBV2 869 aa38.05■■■■□ 3.68
GTF3C4-202ENST00000483873 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP38.02■■■■□ 3.68
GTF3C4-202ENST00000483873 ADGRB2O60241 1585 aa38.01■■■■□ 3.68
GTF3C4-202ENST00000483873 NHSL1Q5SYE7 1610 aa38.01■■■■□ 3.67
GTF3C4-202ENST00000483873 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP38■■■■□ 3.67
GTF3C4-202ENST00000483873 CLSPNQ9HAW4 1339 aa37.99■■■■□ 3.67
GTF3C4-202ENST00000483873 NUTM2FA1L443 756 aa37.98■■■■□ 3.67
GTF3C4-202ENST00000483873 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP37.98■■■■□ 3.67
GTF3C4-202ENST00000483873 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP37.95■■■■□ 3.67
GTF3C4-202ENST00000483873 ORAI2Q96SN7 254 aa37.95■■■■□ 3.67
GTF3C4-202ENST00000483873 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP37.95■■■■□ 3.67
GTF3C4-202ENST00000483873 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP37.95■■■■□ 3.67
GTF3C4-202ENST00000483873 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP37.95■■■■□ 3.67
GTF3C4-202ENST00000483873 ILDR2Q71H61 639 aa37.93■■■■□ 3.66
GTF3C4-202ENST00000483873 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP37.91■■■■□ 3.66
GTF3C4-202ENST00000483873 RALGAPBQ86X10 1494 aa37.9■■■■□ 3.66
GTF3C4-202ENST00000483873 USP32Q8NFA0 1604 aa37.9■■■■□ 3.66
GTF3C4-202ENST00000483873 QRICH2Q9H0J4 1663 aa37.89■■■■□ 3.66
GTF3C4-202ENST00000483873 ESCO1Q5FWF5 840 aa37.87■■■■□ 3.65
GTF3C4-202ENST00000483873 GPRASP1Q5JY77 1395 aa37.86■■■■□ 3.65
GTF3C4-202ENST00000483873 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP37.85■■■■□ 3.65
GTF3C4-202ENST00000483873 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP37.81■■■■□ 3.64
GTF3C4-202ENST00000483873 KIF1AQ12756 1690 aa37.81■■■■□ 3.64
GTF3C4-202ENST00000483873 WASLO00401 505 aaPredicted RBP37.8■■■■□ 3.64
GTF3C4-202ENST00000483873 TULP4Q9NRJ4 1543 aa37.8■■■■□ 3.64
GTF3C4-202ENST00000483873 ANKARQ7Z5J8 1434 aa37.78■■■■□ 3.64
GTF3C4-202ENST00000483873 SHPRHQ149N8 1683 aa37.77■■■■□ 3.64
GTF3C4-202ENST00000483873 JCADQ9P266 1359 aa37.76■■■■□ 3.63
GTF3C4-202ENST00000483873 CARD11Q9BXL7 1154 aa37.76■■■■□ 3.63
GTF3C4-202ENST00000483873 PRR36Q9H6K5 1346 aa37.75■■■■□ 3.63
GTF3C4-202ENST00000483873 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa37.73■■■■□ 3.63
GTF3C4-202ENST00000483873 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP37.72■■■■□ 3.63
GTF3C4-202ENST00000483873 FOXO3O43524 673 aa37.72■■■■□ 3.63
GTF3C4-202ENST00000483873 PXDNQ92626 1479 aa37.71■■■■□ 3.63
GTF3C4-202ENST00000483873 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP37.71■■■■□ 3.63
GTF3C4-202ENST00000483873 ATP7BP35670 1465 aa37.7■■■■□ 3.63
GTF3C4-202ENST00000483873 ITSN1Q15811 1721 aa37.7■■■■□ 3.63
GTF3C4-202ENST00000483873 CDK19Q9BWU1 502 aa37.7■■■■□ 3.62
GTF3C4-202ENST00000483873 PHF8Q9UPP1 1060 aa37.7■■■■□ 3.62
GTF3C4-202ENST00000483873 NPHP3Q7Z494 1330 aa37.69■■■■□ 3.62
GTF3C4-202ENST00000483873 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP37.68■■■■□ 3.62
GTF3C4-202ENST00000483873 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa37.66■■■■□ 3.62
GTF3C4-202ENST00000483873 SOCS7O14512 581 aa37.66■■■■□ 3.62
GTF3C4-202ENST00000483873 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa37.65■■■■□ 3.62
GTF3C4-202ENST00000483873 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP37.65■■■■□ 3.62
GTF3C4-202ENST00000483873 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP37.62■■■■□ 3.61
GTF3C4-202ENST00000483873 PNPLA6Q8IY17 1366 aa37.61■■■■□ 3.61
GTF3C4-202ENST00000483873 LRP6O75581 1613 aa37.59■■■■□ 3.61
GTF3C4-202ENST00000483873 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP37.59■■■■□ 3.61
GTF3C4-202ENST00000483873 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP37.57■■■■□ 3.6
GTF3C4-202ENST00000483873 CABP2Q9NPB3 220 aa37.57■■■■□ 3.6
GTF3C4-202ENST00000483873 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa37.56■■■■□ 3.6
GTF3C4-202ENST00000483873 KRT28Q7Z3Y7 464 aa37.56■■■■□ 3.6
GTF3C4-202ENST00000483873 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP37.53■■■■□ 3.6
GTF3C4-202ENST00000483873 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP37.53■■■■□ 3.6
GTF3C4-202ENST00000483873 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa37.53■■■■□ 3.6
GTF3C4-202ENST00000483873 EVC2Q86UK5 1308 aa37.52■■■■□ 3.6
GTF3C4-202ENST00000483873 PSME1Q06323 249 aa37.5■■■■□ 3.59
GTF3C4-202ENST00000483873 CCDC61Q9Y6R9 512 aa37.5■■■■□ 3.59
GTF3C4-202ENST00000483873 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP37.49■■■■□ 3.59
GTF3C4-202ENST00000483873 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP37.49■■■■□ 3.59
GTF3C4-202ENST00000483873 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP37.49■■■■□ 3.59
GTF3C4-202ENST00000483873 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP37.48■■■■□ 3.59
GTF3C4-202ENST00000483873 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa37.48■■■■□ 3.59
GTF3C4-202ENST00000483873 USP47Q96K76 1375 aa37.47■■■■□ 3.59
GTF3C4-202ENST00000483873 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa37.47■■■■□ 3.59
GTF3C4-202ENST00000483873 TNS3Q68CZ2 1445 aa37.46■■■■□ 3.59
GTF3C4-202ENST00000483873 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa37.45■■■■□ 3.59
GTF3C4-202ENST00000483873 SBNO1A3KN83 1393 aa37.43■■■■□ 3.58
GTF3C4-202ENST00000483873 ALS2Q96Q42 1657 aa37.42■■■■□ 3.58
GTF3C4-202ENST00000483873 PLEKHG3A1L390 1219 aa37.42■■■■□ 3.58
GTF3C4-202ENST00000483873 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP37.42■■■■□ 3.58
GTF3C4-202ENST00000483873 ACEP12821 1306 aa37.42■■■■□ 3.58
GTF3C4-202ENST00000483873 TESK2Q96S53 571 aa37.4■■■■□ 3.58
GTF3C4-202ENST00000483873 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP37.38■■■■□ 3.57
GTF3C4-202ENST00000483873 CABP1Q9NZU7 370 aa37.36■■■■□ 3.57
GTF3C4-202ENST00000483873 ABCA3Q99758 1704 aa37.36■■■■□ 3.57
GTF3C4-202ENST00000483873 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP37.36■■■■□ 3.57
GTF3C4-202ENST00000483873 LMOD2Q6P5Q4 547 aa37.35■■■■□ 3.57
GTF3C4-202ENST00000483873 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP37.34■■■■□ 3.57
GTF3C4-202ENST00000483873 ATAD2Q6PL18 1390 aa37.33■■■■□ 3.57
GTF3C4-202ENST00000483873 AKAP12Q02952 1782 aa37.32■■■■□ 3.56
GTF3C4-202ENST00000483873 ADAMTS2O95450 1211 aa37.31■■■■□ 3.56
GTF3C4-202ENST00000483873 ARHGEF10O15013 1369 aa37.31■■■■□ 3.56
GTF3C4-202ENST00000483873 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP37.3■■■■□ 3.56
GTF3C4-202ENST00000483873 PLEKHG5O94827 1062 aa37.29■■■■□ 3.56
GTF3C4-202ENST00000483873 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa37.27■■■■□ 3.56
GTF3C4-202ENST00000483873 CABLES1Q8TDN4 633 aa37.27■■■■□ 3.56
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 50.7 ms