RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000482429.1

LTB-212, Transcript of lymphotoxin beta, humanhuman

TSL 2

Gene LTB, Length 1,388 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTB-212ENST00000482429 ATRNO75882 1429 aa31.16■■■□□ 2.58
LTB-212ENST00000482429 PPLO60437 1756 aa31.15■■■□□ 2.58
LTB-212ENST00000482429 EP400Q96L91 3159 aa31.14■■■□□ 2.58
LTB-212ENST00000482429 MYOM2P54296 1465 aa31.13■■■□□ 2.57
LTB-212ENST00000482429 NPHP3Q7Z494 1330 aa31.12■■■□□ 2.57
LTB-212ENST00000482429 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa31.12■■■□□ 2.57
LTB-212ENST00000482429 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP31.1■■■□□ 2.57
LTB-212ENST00000482429 FOXD1Q16676 465 aa31.1■■■□□ 2.57
LTB-212ENST00000482429 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP31.1■■■□□ 2.57
LTB-212ENST00000482429 PXDNQ92626 1479 aa31.08■■■□□ 2.57
LTB-212ENST00000482429 ESCO1Q5FWF5 840 aa31.07■■■□□ 2.56
LTB-212ENST00000482429 BCL9LQ86UU0 1499 aa31.07■■■□□ 2.56
LTB-212ENST00000482429 CCDC125Q86Z20 511 aa31.05■■■□□ 2.56
LTB-212ENST00000482429 ZRANB1Q9UGI0 708 aa31.04■■■□□ 2.56
LTB-212ENST00000482429 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP31.02■■■□□ 2.56
LTB-212ENST00000482429 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP31.01■■■□□ 2.56
LTB-212ENST00000482429 FOXO3O43524 673 aa31■■■□□ 2.55
LTB-212ENST00000482429 TECPR2O15040 1411 aa31■■■□□ 2.55
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LTB-212ENST00000482429 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP30.98■■■□□ 2.55
LTB-212ENST00000482429 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP30.95■■■□□ 2.55
LTB-212ENST00000482429 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa30.94■■■□□ 2.54
LTB-212ENST00000482429 KNDC1Q76NI1 1749 aa30.92■■■□□ 2.54
LTB-212ENST00000482429 ABCC11Q96J66 1382 aa30.92■■■□□ 2.54
LTB-212ENST00000482429 WAPLQ7Z5K2 1190 aa30.91■■■□□ 2.54
LTB-212ENST00000482429 SLIT2O94813 1529 aa30.9■■■□□ 2.54
LTB-212ENST00000482429 UNC5CLQ8IV45 518 aa30.9■■■□□ 2.54
LTB-212ENST00000482429 FMN2Q9NZ56 1722 aa30.9■■■□□ 2.54
LTB-212ENST00000482429 STK26Q9P289 416 aa30.9■■■□□ 2.54
LTB-212ENST00000482429 IFT172Q9UG01 1749 aa30.9■■■□□ 2.54
LTB-212ENST00000482429 KIF1AQ12756 1690 aa30.89■■■□□ 2.54
LTB-212ENST00000482429 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa30.89■■■□□ 2.54
LTB-212ENST00000482429 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa30.88■■■□□ 2.53
LTB-212ENST00000482429 CCDC144AA2RUR9 1427 aa30.88■■■□□ 2.53
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LTB-212ENST00000482429 RALGAPBQ86X10 1494 aa30.88■■■□□ 2.53
LTB-212ENST00000482429 GLI3P10071 1580 aa30.87■■■□□ 2.53
LTB-212ENST00000482429 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa30.87■■■□□ 2.53
LTB-212ENST00000482429 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP30.85■■■□□ 2.53
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LTB-212ENST00000482429 USP32Q8NFA0 1604 aa30.84■■■□□ 2.53
LTB-212ENST00000482429 RGL3Q3MIN7 710 aa30.82■■■□□ 2.52
LTB-212ENST00000482429 PIK3C2GO75747 1445 aa30.82■■■□□ 2.52
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LTB-212ENST00000482429 BRWD3Q6RI45 1802 aa30.81■■■□□ 2.52
LTB-212ENST00000482429 KRT28Q7Z3Y7 464 aa30.8■■■□□ 2.52
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LTB-212ENST00000482429 TNS3Q68CZ2 1445 aa30.76■■■□□ 2.51
LTB-212ENST00000482429 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP30.75■■■□□ 2.51
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LTB-212ENST00000482429 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP30.72■■■□□ 2.51
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LTB-212ENST00000482429 NRXN1Q9ULB1 1477 aa30.68■■■□□ 2.5
LTB-212ENST00000482429 ARHGEF10O15013 1369 aa30.67■■■□□ 2.5
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LTB-212ENST00000482429 PCGF6Q9BYE7 350 aa30.64■■■□□ 2.5
LTB-212ENST00000482429 LRP5O75197 1615 aa30.62■■■□□ 2.49
LTB-212ENST00000482429 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP30.62■■■□□ 2.49
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LTB-212ENST00000482429 FAM83GA6ND36 823 aa30.58■■■□□ 2.49
LTB-212ENST00000482429 CFAP70Q5T0N1 1121 aa30.58■■■□□ 2.49
LTB-212ENST00000482429 PRAM1Q96QH2 718 aa30.58■■■□□ 2.49
LTB-212ENST00000482429 DLC1Q96QB1 1528 aa30.57■■■□□ 2.48
LTB-212ENST00000482429 NRAPQ86VF7 1730 aa30.56■■■□□ 2.48
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LTB-212ENST00000482429 ALS2Q96Q42 1657 aa30.51■■■□□ 2.47
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LTB-212ENST00000482429 MYT1Q01538 1121 aa30.49■■■□□ 2.47
LTB-212ENST00000482429 BTG4Q9NY30 223 aa30.49■■■□□ 2.47
LTB-212ENST00000482429 FAM98CQ17RN3 349 aaKnown RBP30.48■■■□□ 2.47
LTB-212ENST00000482429 GPRASP1Q5JY77 1395 aa30.46■■■□□ 2.47
LTB-212ENST00000482429 RGPD1P0DJD0 1748 aa30.46■■■□□ 2.47
LTB-212ENST00000482429 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP30.46■■■□□ 2.47
LTB-212ENST00000482429 ADGRB1O14514 1584 aa30.45■■■□□ 2.46
LTB-212ENST00000482429 HRCP23327 699 aa30.43■■■□□ 2.46
LTB-212ENST00000482429 PSDA5PKW4 1024 aaPredicted RBP30.42■■■□□ 2.46
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