RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000482110.5

PBX1-208, Transcript of PBX homeobox 1, human

TSL 5

Gene PBX1, Length 572 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PBX1-208	ENST00000482110	SIN3A	Q96ST3	1273 aa		32.53	■■■□□ 2.8
PBX1-208	ENST00000482110	DISP3	Q9P2K9	1392 aa		32.53	■■■□□ 2.8
PBX1-208	ENST00000482110	MED1	Q15648	1581 aa	Predicted RBP	32.53	■■■□□ 2.8
PBX1-208	ENST00000482110	NHSL1	Q5SYE7	1610 aa		32.5	■■■□□ 2.79
PBX1-208	ENST00000482110	NEUROD1	Q13562	356 aa		32.48	■■■□□ 2.79
PBX1-208	ENST00000482110	L3MBTL2	Q969R5	705 aa		32.48	■■■□□ 2.79
PBX1-208	ENST00000482110	PRAM1	Q96QH2	718 aa		32.48	■■■□□ 2.79
PBX1-208	ENST00000482110	POGK	Q9P215	609 aa		32.46	■■■□□ 2.79
PBX1-208	ENST00000482110	JCAD	Q9P266	1359 aa		32.45	■■■□□ 2.79
PBX1-208	ENST00000482110	TRAK1	Q9UPV9	953 aa		32.45	■■■□□ 2.79
PBX1-208	ENST00000482110	FMN2	Q9NZ56	1722 aa		32.45	■■■□□ 2.78
PBX1-208	ENST00000482110	ADGRB2	O60241	1585 aa		32.41	■■■□□ 2.78
PBX1-208	ENST00000482110	ARHGEF28	Q8N1W1	1705 aa	Known RBP	32.41	■■■□□ 2.78
PBX1-208	ENST00000482110	SHPRH	Q149N8	1683 aa		32.38	■■■□□ 2.77
PBX1-208	ENST00000482110	SAFB2	Q14151	953 aa	Known RBP eCLIP	32.38	■■■□□ 2.77
PBX1-208	ENST00000482110	ORAI2	Q96SN7	254 aa		32.38	■■■□□ 2.77
PBX1-208	ENST00000482110	ESCO1	Q5FWF5	840 aa		32.35	■■■□□ 2.77
PBX1-208	ENST00000482110	LRRC59	Q96AG4	307 aa	Known RBP	32.33	■■■□□ 2.77
PBX1-208	ENST00000482110	SPATA31A6	Q5VVP1	1343 aa		32.32	■■■□□ 2.76
PBX1-208	ENST00000482110	KIF1A	Q12756	1690 aa		32.32	■■■□□ 2.76
PBX1-208	ENST00000482110	NBPF1	Q3BBV0	1214 aa		32.32	■■■□□ 2.76
PBX1-208	ENST00000482110	TRPM1	Q7Z4N2	1603 aa		32.32	■■■□□ 2.76
PBX1-208	ENST00000482110	TONSL	Q96HA7	1378 aa		32.32	■■■□□ 2.76
PBX1-208	ENST00000482110	EIF3A	Q14152	1382 aa	Known RBP	32.31	■■■□□ 2.76
PBX1-208	ENST00000482110	NUTM2F	A1L443	756 aa		32.3	■■■□□ 2.76
PBX1-208	ENST00000482110	PHF23	Q9BUL5	403 aa	Predicted RBP	32.3	■■■□□ 2.76
PBX1-208	ENST00000482110	PCGF6	Q9BYE7	350 aa		32.3	■■■□□ 2.76
PBX1-208	ENST00000482110	NPHP3	Q7Z494	1330 aa		32.29	■■■□□ 2.76
PBX1-208	ENST00000482110	ANKAR	Q7Z5J8	1434 aa		32.29	■■■□□ 2.76
PBX1-208	ENST00000482110	DDX17	Q92841	729 aa	Known RBP	32.29	■■■□□ 2.76
PBX1-208	ENST00000482110	SOS2	Q07890	1332 aa	Predicted RBP	32.28	■■■□□ 2.76
PBX1-208	ENST00000482110	MINK1	Q8N4C8	1332 aa	Predicted RBP	32.28	■■■□□ 2.76
PBX1-208	ENST00000482110	RGPD8	O14715	1765 aa	Predicted RBP	32.25	■■■□□ 2.75
PBX1-208	ENST00000482110	HIRIP3	Q9BW71	556 aa	Predicted RBP	32.25	■■■□□ 2.75
PBX1-208	ENST00000482110	TULP4	Q9NRJ4	1543 aa		32.23	■■■□□ 2.75
PBX1-208	ENST00000482110	USP32	Q8NFA0	1604 aa		32.22	■■■□□ 2.75
PBX1-208	ENST00000482110	ROCK2	O75116	1388 aa	Known RBP	32.22	■■■□□ 2.75
PBX1-208	ENST00000482110	WASL	O00401	505 aa	Predicted RBP	32.22	■■■□□ 2.75
PBX1-208	ENST00000482110	PXDN	Q92626	1479 aa		32.22	■■■□□ 2.75
PBX1-208	ENST00000482110	PNPLA6	Q8IY17	1366 aa		32.21	■■■□□ 2.75
PBX1-208	ENST00000482110	FOXO3	O43524	673 aa		32.2	■■■□□ 2.75
PBX1-208	ENST00000482110	PHF8	Q9UPP1	1060 aa		32.19	■■■□□ 2.74
PBX1-208	ENST00000482110	CLSPN	Q9HAW4	1339 aa		32.18	■■■□□ 2.74
PBX1-208	ENST00000482110	CENPJ	Q9HC77	1338 aa	Predicted RBP	32.18	■■■□□ 2.74
PBX1-208	ENST00000482110	LRP6	O75581	1613 aa		32.18	■■■□□ 2.74
PBX1-208	ENST00000482110	NBPF8	Q3BBV2	869 aa		32.16	■■■□□ 2.74
PBX1-208	ENST00000482110	GPRASP1	Q5JY77	1395 aa		32.16	■■■□□ 2.74
PBX1-208	ENST00000482110	ITSN1	Q15811	1721 aa		32.14	■■■□□ 2.74
PBX1-208	ENST00000482110	QRICH2	Q9H0J4	1663 aa		32.14	■■■□□ 2.74
PBX1-208	ENST00000482110	COL22A1	Q8NFW1	1626 aa	Predicted RBP	32.13	■■■□□ 2.73
PBX1-208	ENST00000482110	RALGAPB	Q86X10	1494 aa		32.12	■■■□□ 2.73
PBX1-208	ENST00000482110	MEX3C	Q5U5Q3	659 aa	Known RBP	32.12	■■■□□ 2.73
PBX1-208	ENST00000482110	ILDR2	Q71H61	639 aa		32.12	■■■□□ 2.73
PBX1-208	ENST00000482110	PRR36	Q9H6K5	1346 aa		32.11	■■■□□ 2.73
PBX1-208	ENST00000482110	ATP7B	P35670	1465 aa		32.1	■■■□□ 2.73
PBX1-208	ENST00000482110	XPC	Q01831	940 aa	Predicted RBP	32.1	■■■□□ 2.73
PBX1-208	ENST00000482110	NUTM2B	A6NNL0	878 aa	Predicted RBP	32.09	■■■□□ 2.73
PBX1-208	ENST00000482110	NUTM2E	B1AL46	878 aa	Predicted RBP	32.09	■■■□□ 2.73
PBX1-208	ENST00000482110	PSME1	Q06323	249 aa		32.09	■■■□□ 2.73
PBX1-208	ENST00000482110	NUTM2A	Q8IVF1	878 aa	Predicted RBP	32.09	■■■□□ 2.73
PBX1-208	ENST00000482110	CDK19	Q9BWU1	502 aa		32.09	■■■□□ 2.73
PBX1-208	ENST00000482110	KRT28	Q7Z3Y7	464 aa		32.08	■■■□□ 2.73
PBX1-208	ENST00000482110	PMFBP1	Q8TBY8	1022 aa		32.06	■■■□□ 2.72
PBX1-208	ENST00000482110	NUDT16	Q96DE0	195 aa	Known RBP	32.06	■■■□□ 2.72
PBX1-208	ENST00000482110	RGS17	Q9UGC6	210 aa	Predicted RBP	32.06	■■■□□ 2.72
PBX1-208	ENST00000482110	SBNO1	A3KN83	1393 aa		32.05	■■■□□ 2.72
PBX1-208	ENST00000482110	SPATA31A3	Q5VYP0	1347 aa		32.04	■■■□□ 2.72
PBX1-208	ENST00000482110	TOPAZ1	Q8N9V7	1692 aa		32.04	■■■□□ 2.72
PBX1-208	ENST00000482110	TNS3	Q68CZ2	1445 aa		32.03	■■■□□ 2.72
PBX1-208	ENST00000482110	CARD11	Q9BXL7	1154 aa		32.03	■■■□□ 2.72
PBX1-208	ENST00000482110	TIMELESS	Q9UNS1	1208 aa		32.03	■■■□□ 2.72
PBX1-208	ENST00000482110	NGDN	Q8NEJ9	315 aa	Known RBP	31.99	■■■□□ 2.71
PBX1-208	ENST00000482110	CCDC61	Q9Y6R9	512 aa		31.99	■■■□□ 2.71
PBX1-208	ENST00000482110	SRPK2	P78362	688 aa	Known RBP	31.98	■■■□□ 2.71
PBX1-208	ENST00000482110	TRPM3	Q9HCF6	1732 aa	Predicted RBP	31.97	■■■□□ 2.71
PBX1-208	ENST00000482110	ARHGEF10	O15013	1369 aa		31.97	■■■□□ 2.71
PBX1-208	ENST00000482110	ZNF772	Q68DY9	489 aa	Predicted RBP	31.97	■■■□□ 2.71
PBX1-208	ENST00000482110	EVC2	Q86UK5	1308 aa		31.97	■■■□□ 2.71
PBX1-208	ENST00000482110	SBNO2	Q9Y2G9	1366 aa		31.95	■■■□□ 2.71
PBX1-208	ENST00000482110	CCER1	Q8TC90	406 aa	Predicted RBP	31.94	■■■□□ 2.7
PBX1-208	ENST00000482110	PLEKHG3	A1L390	1219 aa		31.93	■■■□□ 2.7
PBX1-208	ENST00000482110	POLR3A	O14802	1390 aa	Predicted RBP	31.93	■■■□□ 2.7
PBX1-208	ENST00000482110	ADAMTS2	O95450	1211 aa		31.92	■■■□□ 2.7
PBX1-208	ENST00000482110	POTEA	Q6S8J7	498 aa		31.92	■■■□□ 2.7
PBX1-208	ENST00000482110	C8orf37	Q96NL8	207 aa		31.92	■■■□□ 2.7
PBX1-208	ENST00000482110	MARF1	Q9Y4F3	1742 aa	Known RBP	31.92	■■■□□ 2.7
PBX1-208	ENST00000482110	CABP2	Q9NPB3	220 aa		31.91	■■■□□ 2.7
PBX1-208	ENST00000482110	ALS2	Q96Q42	1657 aa		31.91	■■■□□ 2.7
PBX1-208	ENST00000482110	AFF2	P51816	1311 aa		31.9	■■■□□ 2.7
PBX1-208	ENST00000482110	PPIP5K1	Q6PFW1	1433 aa		31.9	■■■□□ 2.7
PBX1-208	ENST00000482110	LMOD2	Q6P5Q4	547 aa		31.88	■■■□□ 2.69
PBX1-208	ENST00000482110	ACE	P12821	1306 aa		31.87	■■■□□ 2.69
PBX1-208	ENST00000482110	NGLY1	Q96IV0	654 aa		31.87	■■■□□ 2.69
PBX1-208	ENST00000482110	SOCS7	O14512	581 aa		31.86	■■■□□ 2.69
PBX1-208	ENST00000482110	ABCA3	Q99758	1704 aa		31.85	■■■□□ 2.69
PBX1-208	ENST00000482110	ATAD2	Q6PL18	1390 aa		31.82	■■■□□ 2.69
PBX1-208	ENST00000482110	PAK3	O75914	559 aa	Predicted RBP	31.82	■■■□□ 2.68
PBX1-208	ENST00000482110	HAP1	P54257	671 aa	Predicted RBP	31.82	■■■□□ 2.68
PBX1-208	ENST00000482110	BRD4	O60885	1362 aa	Predicted RBP	31.81	■■■□□ 2.68
PBX1-208	ENST00000482110	FNBP4	Q8N3X1	1017 aa	Predicted RBP	31.8	■■■□□ 2.68

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