RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000481622.1

UBE2E1-208, Transcript of ubiquitin conjugating enzyme E2 E1, human

TSL 5

Gene UBE2E1, Length 432 nt, Biotype processed transcript.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
UBE2E1-208	ENST00000481622	ATAD2	Q6PL18	1390 aa		28.17	■■■□□ 2.1
UBE2E1-208	ENST00000481622	USP21	Q9UK80	565 aa		28.17	■■■□□ 2.1
UBE2E1-208	ENST00000481622	MYOM2	P54296	1465 aa		28.16	■■■□□ 2.1
UBE2E1-208	ENST00000481622	MARF1	Q9Y4F3	1742 aa	Known RBP	28.16	■■■□□ 2.1
UBE2E1-208	ENST00000481622	NPHP3	Q7Z494	1330 aa		28.16	■■■□□ 2.1
UBE2E1-208	ENST00000481622	EP400	Q96L91	3159 aa		28.15	■■■□□ 2.1
UBE2E1-208	ENST00000481622	TRPC5	Q9UL62	973 aa	Predicted RBP	28.15	■■■□□ 2.1
UBE2E1-208	ENST00000481622	ATRN	O75882	1429 aa		28.15	■■■□□ 2.1
UBE2E1-208	ENST00000481622	PXDN	Q92626	1479 aa		28.15	■■■□□ 2.1
UBE2E1-208	ENST00000481622	FNBP4	Q8N3X1	1017 aa	Predicted RBP	28.14	■■■□□ 2.1
UBE2E1-208	ENST00000481622	IFT172	Q9UG01	1749 aa		28.12	■■■□□ 2.09
UBE2E1-208	ENST00000481622	KNDC1	Q76NI1	1749 aa		28.12	■■■□□ 2.09
UBE2E1-208	ENST00000481622	TECPR2	O15040	1411 aa		28.11	■■■□□ 2.09
UBE2E1-208	ENST00000481622	ESCO1	Q5FWF5	840 aa		28.11	■■■□□ 2.09
UBE2E1-208	ENST00000481622	CCDC144A	A2RUR9	1427 aa		28.09	■■■□□ 2.09
UBE2E1-208	ENST00000481622	ADGRF5	Q8IZF2	1346 aa		28.07	■■■□□ 2.08
UBE2E1-208	ENST00000481622	LRPPRC	P42704	1394 aa	Known RBP	28.06	■■■□□ 2.08
UBE2E1-208	ENST00000481622	SPATA31E1	Q6ZUB1	1445 aa		28.05	■■■□□ 2.08
UBE2E1-208	ENST00000481622	FMN2	Q9NZ56	1722 aa		28.05	■■■□□ 2.08
UBE2E1-208	ENST00000481622	TNKS1BP1	Q9C0C2	1729 aa	Known RBP	28.04	■■■□□ 2.08
UBE2E1-208	ENST00000481622	KIF1A	Q12756	1690 aa		28.04	■■■□□ 2.08
UBE2E1-208	ENST00000481622	BCL9L	Q86UU0	1499 aa		28.04	■■■□□ 2.08
UBE2E1-208	ENST00000481622	ANKRD30B	Q9BXX2	1392 aa		28.04	■■■□□ 2.08
UBE2E1-208	ENST00000481622	FOXO3	O43524	673 aa		28.03	■■■□□ 2.08
UBE2E1-208	ENST00000481622	FOXD1	Q16676	465 aa		28.03	■■■□□ 2.08
UBE2E1-208	ENST00000481622	STK26	Q9P289	416 aa		28.02	■■■□□ 2.08
UBE2E1-208	ENST00000481622	ABCC11	Q96J66	1382 aa		28.01	■■■□□ 2.07
UBE2E1-208	ENST00000481622	XPC	Q01831	940 aa	Predicted RBP	28.01	■■■□□ 2.07
UBE2E1-208	ENST00000481622	PIK3C2G	O75747	1445 aa		28.01	■■■□□ 2.07
UBE2E1-208	ENST00000481622	WAPL	Q7Z5K2	1190 aa		28	■■■□□ 2.07
UBE2E1-208	ENST00000481622	RGL3	Q3MIN7	710 aa		27.98	■■■□□ 2.07
UBE2E1-208	ENST00000481622	PLEKHH1	Q9ULM0	1364 aa		27.98	■■■□□ 2.07
UBE2E1-208	ENST00000481622	NUTM2F	A1L443	756 aa		27.97	■■■□□ 2.07
UBE2E1-208	ENST00000481622	YTHDC2	Q9H6S0	1430 aa	Known RBP	27.95	■■■□□ 2.07
UBE2E1-208	ENST00000481622	USP32	Q8NFA0	1604 aa		27.95	■■■□□ 2.06
UBE2E1-208	ENST00000481622	GJD4	Q96KN9	370 aa	Predicted RBP	27.94	■■■□□ 2.06
UBE2E1-208	ENST00000481622	SLIT2	O94813	1529 aa		27.93	■■■□□ 2.06
UBE2E1-208	ENST00000481622	TMEM132E	Q6IEE7	984 aa		27.93	■■■□□ 2.06
UBE2E1-208	ENST00000481622	SPATA31A3	Q5VYP0	1347 aa		27.92	■■■□□ 2.06
UBE2E1-208	ENST00000481622	GLI3	P10071	1580 aa		27.92	■■■□□ 2.06
UBE2E1-208	ENST00000481622	CCDC125	Q86Z20	511 aa		27.92	■■■□□ 2.06
UBE2E1-208	ENST00000481622	MPHOSPH9	Q99550	1183 aa		27.91	■■■□□ 2.06
UBE2E1-208	ENST00000481622	ZRANB1	Q9UGI0	708 aa		27.91	■■■□□ 2.06
UBE2E1-208	ENST00000481622	RGPD8	O14715	1765 aa	Predicted RBP	27.91	■■■□□ 2.06
UBE2E1-208	ENST00000481622	RALGAPB	Q86X10	1494 aa		27.9	■■■□□ 2.06
UBE2E1-208	ENST00000481622	UNC5CL	Q8IV45	518 aa		27.89	■■■□□ 2.06
UBE2E1-208	ENST00000481622	TNS3	Q68CZ2	1445 aa		27.87	■■■□□ 2.05
UBE2E1-208	ENST00000481622	SIRT1	Q96EB6	747 aa		27.86	■■■□□ 2.05
UBE2E1-208	ENST00000481622	ABCA3	Q99758	1704 aa		27.86	■■■□□ 2.05
UBE2E1-208	ENST00000481622	BRWD3	Q6RI45	1802 aa		27.85	■■■□□ 2.05
UBE2E1-208	ENST00000481622	PLCH1	Q4KWH8	1693 aa		27.85	■■■□□ 2.05
UBE2E1-208	ENST00000481622	NRXN1	Q9ULB1	1477 aa		27.85	■■■□□ 2.05
UBE2E1-208	ENST00000481622	KRT28	Q7Z3Y7	464 aa		27.85	■■■□□ 2.05
UBE2E1-208	ENST00000481622	NWD2	Q9ULI1	1742 aa		27.84	■■■□□ 2.05
UBE2E1-208	ENST00000481622	C14orf93	Q9H972	538 aa	Known RBP	27.82	■■■□□ 2.04
UBE2E1-208	ENST00000481622	PHF8	Q9UPP1	1060 aa		27.82	■■■□□ 2.04
UBE2E1-208	ENST00000481622	BLM	P54132	1417 aa	Predicted RBP	27.82	■■■□□ 2.04
UBE2E1-208	ENST00000481622	HAP1	P54257	671 aa	Predicted RBP	27.8	■■■□□ 2.04
UBE2E1-208	ENST00000481622	PSME1	Q06323	249 aa		27.8	■■■□□ 2.04
UBE2E1-208	ENST00000481622	DHX57	Q6P158	1386 aa	Known RBP	27.8	■■■□□ 2.04
UBE2E1-208	ENST00000481622	SBNO1	A3KN83	1393 aa		27.79	■■■□□ 2.04
UBE2E1-208	ENST00000481622	ARHGEF10	O15013	1369 aa		27.77	■■■□□ 2.04
UBE2E1-208	ENST00000481622	ADGRB2	O60241	1585 aa		27.77	■■■□□ 2.04
UBE2E1-208	ENST00000481622	DLC1	Q96QB1	1528 aa		27.77	■■■□□ 2.04
UBE2E1-208	ENST00000481622	ACIN1	Q9UKV3	1341 aa	Known RBP	27.76	■■■□□ 2.03
UBE2E1-208	ENST00000481622	ANKAR	Q7Z5J8	1434 aa		27.75	■■■□□ 2.03
UBE2E1-208	ENST00000481622	VPS72	Q15906	364 aa		27.75	■■■□□ 2.03
UBE2E1-208	ENST00000481622	CFAP70	Q5T0N1	1121 aa		27.75	■■■□□ 2.03
UBE2E1-208	ENST00000481622	CABLES1	Q8TDN4	633 aa		27.74	■■■□□ 2.03
UBE2E1-208	ENST00000481622	PRAM1	Q96QH2	718 aa		27.74	■■■□□ 2.03
UBE2E1-208	ENST00000481622	SEPT12	Q8IYM1	358 aa		27.72	■■■□□ 2.03
UBE2E1-208	ENST00000481622	SAFB2	Q14151	953 aa	Known RBP eCLIP	27.71	■■■□□ 2.03
UBE2E1-208	ENST00000481622	TRPM3	Q9HCF6	1732 aa	Predicted RBP	27.71	■■■□□ 2.03
UBE2E1-208	ENST00000481622	NRAP	Q86VF7	1730 aa		27.7	■■■□□ 2.03
UBE2E1-208	ENST00000481622	LMOD2	Q6P5Q4	547 aa		27.7	■■■□□ 2.02
UBE2E1-208	ENST00000481622	CCDC9	Q9Y3X0	531 aa	Known RBP	27.69	■■■□□ 2.02
UBE2E1-208	ENST00000481622	PLEKHG5	O94827	1062 aa		27.68	■■■□□ 2.02
UBE2E1-208	ENST00000481622	SF3B2	Q13435	895 aa	Known RBP	27.68	■■■□□ 2.02
UBE2E1-208	ENST00000481622	POGK	Q9P215	609 aa		27.68	■■■□□ 2.02
UBE2E1-208	ENST00000481622	ADGRB1	O14514	1584 aa		27.68	■■■□□ 2.02
UBE2E1-208	ENST00000481622	ALS2	Q96Q42	1657 aa		27.67	■■■□□ 2.02
UBE2E1-208	ENST00000481622	ONECUT3	O60422	494 aa	Predicted RBP	27.66	■■■□□ 2.02
UBE2E1-208	ENST00000481622	DEFB132	Q7Z7B7	95 aa		27.66	■■■□□ 2.02
UBE2E1-208	ENST00000481622	EIF3A	Q14152	1382 aa	Known RBP	27.64	■■■□□ 2.02
UBE2E1-208	ENST00000481622	COL14A1	Q05707	1796 aa	Known RBP	27.64	■■■□□ 2.02
UBE2E1-208	ENST00000481622	KRT27	Q7Z3Y8	459 aa		27.64	■■■□□ 2.02
UBE2E1-208	ENST00000481622	PMFBP1	Q8TBY8	1022 aa		27.64	■■■□□ 2.02
UBE2E1-208	ENST00000481622	TULP4	Q9NRJ4	1543 aa		27.62	■■■□□ 2.01
UBE2E1-208	ENST00000481622	LRP5	O75197	1615 aa		27.61	■■■□□ 2.01
UBE2E1-208	ENST00000481622	FAM83G	A6ND36	823 aa		27.61	■■■□□ 2.01
UBE2E1-208	ENST00000481622	GPRASP1	Q5JY77	1395 aa		27.6	■■■□□ 2.01
UBE2E1-208	ENST00000481622	CRYBG1	Q9Y4K1	1723 aa		27.6	■■■□□ 2.01
UBE2E1-208	ENST00000481622		A0A0G2JS52	829 aa		27.58	■■■□□ 2.01
UBE2E1-208	ENST00000481622	MYT1	Q01538	1121 aa		27.58	■■■□□ 2.01
UBE2E1-208	ENST00000481622	HIRIP3	Q9BW71	556 aa	Predicted RBP	27.57	■■■□□ 2
UBE2E1-208	ENST00000481622	TRAK1	Q9UPV9	953 aa		27.56	■■■□□ 2
UBE2E1-208	ENST00000481622	PRR36	Q9H6K5	1346 aa		27.56	■■■□□ 2
UBE2E1-208	ENST00000481622	RAB3GAP2	Q9H2M9	1393 aa		27.56	■■■□□ 2
UBE2E1-208	ENST00000481622	RGPD1	P0DJD0	1748 aa		27.55	■■■□□ 2
UBE2E1-208	ENST00000481622	ITSN1	Q15811	1721 aa		27.55	■■■□□ 2

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