RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000478653.6

NBPF3-210, Transcript of NBPF member 3, humanhuman

TSL 3

Gene NBPF3, Length 1,417 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBPF3-210ENST00000478653 NPHP3Q7Z494 1330 aa29.25■■■□□ 2.27
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NBPF3-210ENST00000478653 TECPR2O15040 1411 aa29.24■■■□□ 2.27
NBPF3-210ENST00000478653 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa29.22■■■□□ 2.27
NBPF3-210ENST00000478653 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP29.2■■■□□ 2.27
NBPF3-210ENST00000478653 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP29.2■■■□□ 2.26
NBPF3-210ENST00000478653 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa29.2■■■□□ 2.26
NBPF3-210ENST00000478653 FOXD1Q16676 465 aa29.2■■■□□ 2.26
NBPF3-210ENST00000478653 ESCO1Q5FWF5 840 aa29.2■■■□□ 2.26
NBPF3-210ENST00000478653 USP21Q9UK80 565 aa29.19■■■□□ 2.26
NBPF3-210ENST00000478653 TRPC5Q9UL62 973 aaPredicted RBP29.19■■■□□ 2.26
NBPF3-210ENST00000478653 IFT172Q9UG01 1749 aa29.18■■■□□ 2.26
NBPF3-210ENST00000478653 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP29.18■■■□□ 2.26
NBPF3-210ENST00000478653 ABCC11Q96J66 1382 aa29.17■■■□□ 2.26
NBPF3-210ENST00000478653 MPHOSPH9Q99550 1183 aa29.17■■■□□ 2.26
NBPF3-210ENST00000478653 KNDC1Q76NI1 1749 aa29.16■■■□□ 2.26
NBPF3-210ENST00000478653 RGL3Q3MIN7 710 aa29.16■■■□□ 2.26
NBPF3-210ENST00000478653 MYOM2P54296 1465 aa29.16■■■□□ 2.26
NBPF3-210ENST00000478653 PXDNQ92626 1479 aa29.16■■■□□ 2.26
NBPF3-210ENST00000478653 PIK3C2GO75747 1445 aa29.14■■■□□ 2.26
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NBPF3-210ENST00000478653 STK26Q9P289 416 aa29.12■■■□□ 2.25
NBPF3-210ENST00000478653 ATRNO75882 1429 aa29.12■■■□□ 2.25
NBPF3-210ENST00000478653 FOXO3O43524 673 aa29.1■■■□□ 2.25
NBPF3-210ENST00000478653 WAPLQ7Z5K2 1190 aa29.1■■■□□ 2.25
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NBPF3-210ENST00000478653 FMN2Q9NZ56 1722 aa29.07■■■□□ 2.24
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NBPF3-210ENST00000478653 KRT28Q7Z3Y7 464 aa28.94■■■□□ 2.22
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NBPF3-210ENST00000478653 ANKARQ7Z5J8 1434 aa28.87■■■□□ 2.21
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NBPF3-210ENST00000478653 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP28.8■■■□□ 2.2
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NBPF3-210ENST00000478653 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP28.7■■■□□ 2.19
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NBPF3-210ENST00000478653 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP28.7■■■□□ 2.18
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NBPF3-210ENST00000478653 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP28.66■■■□□ 2.18
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NBPF3-210ENST00000478653 PLEKHG5O94827 1062 aa28.66■■■□□ 2.18
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NBPF3-210ENST00000478653 KRT27Q7Z3Y8 459 aa28.64■■■□□ 2.18
NBPF3-210ENST00000478653 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa28.64■■■□□ 2.18
NBPF3-210ENST00000478653 COL14A1Q05707 1796 aaKnown RBP28.63■■■□□ 2.17
NBPF3-210ENST00000478653 NRAPQ86VF7 1730 aa28.63■■■□□ 2.17
NBPF3-210ENST00000478653 PRR36Q9H6K5 1346 aa28.63■■■□□ 2.17
NBPF3-210ENST00000478653 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP28.6■■■□□ 2.17
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