RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000477413.1

CNIH4-208, Transcript of cornichon family AMPA receptor auxiliary protein 4, human

TSL 5

Gene CNIH4, Length 820 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CNIH4-208	ENST00000477413	RGS17	Q9UGC6	210 aa	Predicted RBP	33.24	■■■□□ 2.91
CNIH4-208	ENST00000477413	FMN2	Q9NZ56	1722 aa		33.22	■■■□□ 2.91
CNIH4-208	ENST00000477413	TMEM132E	Q6IEE7	984 aa		33.21	■■■□□ 2.91
CNIH4-208	ENST00000477413	DHX57	Q6P158	1386 aa	Known RBP	33.19	■■■□□ 2.9
CNIH4-208	ENST00000477413	PLEKHH1	Q9ULM0	1364 aa		33.19	■■■□□ 2.9
CNIH4-208	ENST00000477413	CFAP70	Q5T0N1	1121 aa		33.18	■■■□□ 2.9
CNIH4-208	ENST00000477413	STK26	Q9P289	416 aa		33.16	■■■□□ 2.9
CNIH4-208	ENST00000477413	ADGRB2	O60241	1585 aa		33.15	■■■□□ 2.9
CNIH4-208	ENST00000477413	WAPL	Q7Z5K2	1190 aa		33.14	■■■□□ 2.9
CNIH4-208	ENST00000477413	SOS2	Q07890	1332 aa	Predicted RBP	33.13	■■■□□ 2.89
CNIH4-208	ENST00000477413	LRRC59	Q96AG4	307 aa	Known RBP	33.13	■■■□□ 2.89
CNIH4-208	ENST00000477413	PNPLA6	Q8IY17	1366 aa		33.12	■■■□□ 2.89
CNIH4-208	ENST00000477413	ORAI2	Q96SN7	254 aa		33.11	■■■□□ 2.89
CNIH4-208	ENST00000477413	KIF1A	Q12756	1690 aa		33.1	■■■□□ 2.89
CNIH4-208	ENST00000477413	KIAA1210	Q9ULL0	1709 aa		33.09	■■■□□ 2.89
CNIH4-208	ENST00000477413	COL22A1	Q8NFW1	1626 aa	Predicted RBP	33.09	■■■□□ 2.89
CNIH4-208	ENST00000477413	DCAF11	Q8TEB1	546 aa		33.08	■■■□□ 2.89
CNIH4-208	ENST00000477413	PXDN	Q92626	1479 aa		33.07	■■■□□ 2.88
CNIH4-208	ENST00000477413	DDX17	Q92841	729 aa	Known RBP	33.06	■■■□□ 2.88
CNIH4-208	ENST00000477413	NPHP3	Q7Z494	1330 aa		33.02	■■■□□ 2.88
CNIH4-208	ENST00000477413	POTEA	Q6S8J7	498 aa		33.02	■■■□□ 2.88
CNIH4-208	ENST00000477413	ARHGEF28	Q8N1W1	1705 aa	Known RBP	33.02	■■■□□ 2.88
CNIH4-208	ENST00000477413	PRAM1	Q96QH2	718 aa		32.99	■■■□□ 2.87
CNIH4-208	ENST00000477413	ESCO1	Q5FWF5	840 aa		32.98	■■■□□ 2.87
CNIH4-208	ENST00000477413	ANKAR	Q7Z5J8	1434 aa		32.98	■■■□□ 2.87
CNIH4-208	ENST00000477413	KDM2A	Q9Y2K7	1162 aa		32.98	■■■□□ 2.87
CNIH4-208	ENST00000477413	RGPD8	O14715	1765 aa	Predicted RBP	32.98	■■■□□ 2.87
CNIH4-208	ENST00000477413	USP32	Q8NFA0	1604 aa		32.98	■■■□□ 2.87
CNIH4-208	ENST00000477413	MEX3C	Q5U5Q3	659 aa	Known RBP	32.94	■■■□□ 2.86
CNIH4-208	ENST00000477413	ZNF772	Q68DY9	489 aa	Predicted RBP	32.92	■■■□□ 2.86
CNIH4-208	ENST00000477413	TULP4	Q9NRJ4	1543 aa		32.89	■■■□□ 2.86
CNIH4-208	ENST00000477413	EIF3A	Q14152	1382 aa	Known RBP	32.89	■■■□□ 2.86
CNIH4-208	ENST00000477413	POGK	Q9P215	609 aa		32.89	■■■□□ 2.86
CNIH4-208	ENST00000477413	TRAK1	Q9UPV9	953 aa		32.89	■■■□□ 2.86
CNIH4-208	ENST00000477413	NUTM2B	A6NNL0	878 aa	Predicted RBP	32.88	■■■□□ 2.85
CNIH4-208	ENST00000477413	NUTM2E	B1AL46	878 aa	Predicted RBP	32.88	■■■□□ 2.85
CNIH4-208	ENST00000477413	FOXO3	O43524	673 aa		32.88	■■■□□ 2.85
CNIH4-208	ENST00000477413	NUTM2A	Q8IVF1	878 aa	Predicted RBP	32.88	■■■□□ 2.85
CNIH4-208	ENST00000477413	MARF1	Q9Y4F3	1742 aa	Known RBP	32.87	■■■□□ 2.85
CNIH4-208	ENST00000477413	NUTM2F	A1L443	756 aa		32.86	■■■□□ 2.85
CNIH4-208	ENST00000477413	SAFB2	Q14151	953 aa	Known RBP eCLIP	32.84	■■■□□ 2.85
CNIH4-208	ENST00000477413	CDK12	Q9NYV4	1490 aa	Predicted RBP	32.84	■■■□□ 2.85
CNIH4-208	ENST00000477413	AFF2	P51816	1311 aa		32.82	■■■□□ 2.84
CNIH4-208	ENST00000477413	PHF8	Q9UPP1	1060 aa		32.81	■■■□□ 2.84
CNIH4-208	ENST00000477413	ITSN1	Q15811	1721 aa		32.8	■■■□□ 2.84
CNIH4-208	ENST00000477413	SPATA31A3	Q5VYP0	1347 aa		32.79	■■■□□ 2.84
CNIH4-208	ENST00000477413	TNS3	Q68CZ2	1445 aa		32.79	■■■□□ 2.84
CNIH4-208	ENST00000477413	TRPM3	Q9HCF6	1732 aa	Predicted RBP	32.78	■■■□□ 2.84
CNIH4-208	ENST00000477413	SBNO1	A3KN83	1393 aa		32.78	■■■□□ 2.84
CNIH4-208	ENST00000477413	ATP7B	P35670	1465 aa		32.77	■■■□□ 2.84
CNIH4-208	ENST00000477413	TRPM1	Q7Z4N2	1603 aa		32.77	■■■□□ 2.84
CNIH4-208	ENST00000477413	WASL	O00401	505 aa	Predicted RBP	32.76	■■■□□ 2.83
CNIH4-208	ENST00000477413	XPC	Q01831	940 aa	Predicted RBP	32.76	■■■□□ 2.83
CNIH4-208	ENST00000477413	MINK1	Q8N4C8	1332 aa	Predicted RBP	32.76	■■■□□ 2.83
CNIH4-208	ENST00000477413	ABCA3	Q99758	1704 aa		32.75	■■■□□ 2.83
CNIH4-208	ENST00000477413	C8orf37	Q96NL8	207 aa		32.75	■■■□□ 2.83
CNIH4-208	ENST00000477413	TOPAZ1	Q8N9V7	1692 aa		32.75	■■■□□ 2.83
CNIH4-208	ENST00000477413	PRR36	Q9H6K5	1346 aa		32.75	■■■□□ 2.83
CNIH4-208	ENST00000477413	KRT28	Q7Z3Y7	464 aa		32.73	■■■□□ 2.83
CNIH4-208	ENST00000477413	HIRIP3	Q9BW71	556 aa	Predicted RBP	32.73	■■■□□ 2.83
CNIH4-208	ENST00000477413	L3MBTL2	Q969R5	705 aa		32.72	■■■□□ 2.83
CNIH4-208	ENST00000477413	ALS2	Q96Q42	1657 aa		32.72	■■■□□ 2.83
CNIH4-208	ENST00000477413	TNKS1BP1	Q9C0C2	1729 aa	Known RBP	32.71	■■■□□ 2.83
CNIH4-208	ENST00000477413	FNBP4	Q8N3X1	1017 aa	Predicted RBP	32.71	■■■□□ 2.83
CNIH4-208	ENST00000477413	ADAMTS2	O95450	1211 aa		32.7	■■■□□ 2.83
CNIH4-208	ENST00000477413	NBPF1	Q3BBV0	1214 aa		32.7	■■■□□ 2.83
CNIH4-208	ENST00000477413	PSME1	Q06323	249 aa		32.69	■■■□□ 2.82
CNIH4-208	ENST00000477413	ARHGEF10	O15013	1369 aa		32.69	■■■□□ 2.82
CNIH4-208	ENST00000477413	RXRB	P28702	533 aa		32.67	■■■□□ 2.82
CNIH4-208	ENST00000477413	SIN3A	Q96ST3	1273 aa		32.67	■■■□□ 2.82
CNIH4-208	ENST00000477413	NGLY1	Q96IV0	654 aa		32.66	■■■□□ 2.82
CNIH4-208	ENST00000477413	QRICH2	Q9H0J4	1663 aa		32.66	■■■□□ 2.82
CNIH4-208	ENST00000477413	TRIM26	Q12899	539 aa	Predicted RBP	32.65	■■■□□ 2.82
CNIH4-208	ENST00000477413	ATRN	O75882	1429 aa		32.64	■■■□□ 2.82
CNIH4-208	ENST00000477413	CRYBG1	Q9Y4K1	1723 aa		32.63	■■■□□ 2.81
CNIH4-208	ENST00000477413	BCL9L	Q86UU0	1499 aa		32.62	■■■□□ 2.81
CNIH4-208	ENST00000477413	SLIT2	O94813	1529 aa		32.61	■■■□□ 2.81
CNIH4-208	ENST00000477413	RBM6	P78332	1123 aa	Known RBP	32.61	■■■□□ 2.81
CNIH4-208	ENST00000477413	PMFBP1	Q8TBY8	1022 aa		32.61	■■■□□ 2.81
CNIH4-208	ENST00000477413	RGS12	O14924	1447 aa		32.6	■■■□□ 2.81
CNIH4-208	ENST00000477413	GPRASP1	Q5JY77	1395 aa		32.6	■■■□□ 2.81
CNIH4-208	ENST00000477413	QTRT2	Q9H974	415 aa	Known RBP	32.6	■■■□□ 2.81
CNIH4-208	ENST00000477413	USP21	Q9UK80	565 aa		32.59	■■■□□ 2.81
CNIH4-208	ENST00000477413	NWD2	Q9ULI1	1742 aa		32.59	■■■□□ 2.81
CNIH4-208	ENST00000477413	POLR3A	O14802	1390 aa	Predicted RBP	32.58	■■■□□ 2.81
CNIH4-208	ENST00000477413	CENPJ	Q9HC77	1338 aa	Predicted RBP	32.58	■■■□□ 2.81
CNIH4-208	ENST00000477413	NUDT16	Q96DE0	195 aa	Known RBP	32.57	■■■□□ 2.8
CNIH4-208	ENST00000477413	TRPC5	Q9UL62	973 aa	Predicted RBP	32.56	■■■□□ 2.8
CNIH4-208	ENST00000477413	PLCH1	Q4KWH8	1693 aa		32.56	■■■□□ 2.8
CNIH4-208	ENST00000477413	CDK19	Q9BWU1	502 aa		32.55	■■■□□ 2.8
CNIH4-208	ENST00000477413	NEUROD1	Q13562	356 aa		32.53	■■■□□ 2.8
CNIH4-208	ENST00000477413	ROCK2	O75116	1388 aa	Known RBP	32.51	■■■□□ 2.79
CNIH4-208	ENST00000477413	CCDC61	Q9Y6R9	512 aa		32.51	■■■□□ 2.79
CNIH4-208	ENST00000477413	PLEKHG3	A1L390	1219 aa		32.49	■■■□□ 2.79
CNIH4-208	ENST00000477413	NGDN	Q8NEJ9	315 aa	Known RBP	32.49	■■■□□ 2.79
CNIH4-208	ENST00000477413	RALGAPB	Q86X10	1494 aa		32.48	■■■□□ 2.79
CNIH4-208	ENST00000477413	NRAP	Q86VF7	1730 aa		32.46	■■■□□ 2.79
CNIH4-208	ENST00000477413	GLI3	P10071	1580 aa		32.45	■■■□□ 2.79
CNIH4-208	ENST00000477413	PHRF1	Q9P1Y6	1649 aa	Known RBP	32.45	■■■□□ 2.79
CNIH4-208	ENST00000477413	COL14A1	Q05707	1796 aa	Known RBP	32.45	■■■□□ 2.78

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