RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000476336.5

PRAME-211, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

TSL 2

Gene PRAME, Length 589 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-211ENST00000476336 DLC1Q96QB1 1528 aa19.28■□□□□ 0.68
PRAME-211ENST00000476336 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP19.28■□□□□ 0.68
PRAME-211ENST00000476336 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa19.27■□□□□ 0.68
PRAME-211ENST00000476336 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa19.27■□□□□ 0.68
PRAME-211ENST00000476336 ADGRB1O14514 1584 aa19.26■□□□□ 0.67
PRAME-211ENST00000476336 BRINP3Q76B58 766 aa19.25■□□□□ 0.67
PRAME-211ENST00000476336 SHPRHQ149N8 1683 aa19.23■□□□□ 0.67
PRAME-211ENST00000476336 WAPLQ7Z5K2 1190 aa19.22■□□□□ 0.67
PRAME-211ENST00000476336 C1orf167Q5SNV9 1468 aa19.22■□□□□ 0.67
PRAME-211ENST00000476336 POGKQ9P215 609 aa19.21■□□□□ 0.67
PRAME-211ENST00000476336 NHSL1Q5SYE7 1610 aa19.19■□□□□ 0.66
PRAME-211ENST00000476336 NEUROD1Q13562 356 aa19.19■□□□□ 0.66
PRAME-211ENST00000476336 L3MBTL2Q969R5 705 aa19.19■□□□□ 0.66
PRAME-211ENST00000476336 PRAM1Q96QH2 718 aa19.19■□□□□ 0.66
PRAME-211ENST00000476336 SIN3AQ96ST3 1273 aa19.19■□□□□ 0.66
PRAME-211ENST00000476336 LRP6O75581 1613 aa19.18■□□□□ 0.66
PRAME-211ENST00000476336 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP19.18■□□□□ 0.66
PRAME-211ENST00000476336 ZNF772Q68DY9 489 aaPredicted RBP19.18■□□□□ 0.66
PRAME-211ENST00000476336 TRAK1Q9UPV9 953 aa19.17■□□□□ 0.66
PRAME-211ENST00000476336 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa19.17■□□□□ 0.66
PRAME-211ENST00000476336 FMN2Q9NZ56 1722 aa19.17■□□□□ 0.66
PRAME-211ENST00000476336 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP19.16■□□□□ 0.66
PRAME-211ENST00000476336 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP19.16■□□□□ 0.66
PRAME-211ENST00000476336 ADGRB2O60241 1585 aa19.15■□□□□ 0.66
PRAME-211ENST00000476336 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP19.14■□□□□ 0.66
PRAME-211ENST00000476336 ESCO1Q5FWF5 840 aa19.13■□□□□ 0.65
PRAME-211ENST00000476336 NPHP3Q7Z494 1330 aa19.13■□□□□ 0.65
PRAME-211ENST00000476336 TONSLQ96HA7 1378 aa19.13■□□□□ 0.65
PRAME-211ENST00000476336 KIF1AQ12756 1690 aa19.12■□□□□ 0.65
PRAME-211ENST00000476336 CLSPNQ9HAW4 1339 aa19.12■□□□□ 0.65
PRAME-211ENST00000476336 ANKARQ7Z5J8 1434 aa19.11■□□□□ 0.65
PRAME-211ENST00000476336 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP19.11■□□□□ 0.65
PRAME-211ENST00000476336 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP19.11■□□□□ 0.65
PRAME-211ENST00000476336 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP19.11■□□□□ 0.65
PRAME-211ENST00000476336 ORAI2Q96SN7 254 aa19.11■□□□□ 0.65
PRAME-211ENST00000476336 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP19.1■□□□□ 0.65
PRAME-211ENST00000476336 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa19.1■□□□□ 0.65
PRAME-211ENST00000476336 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP19.09■□□□□ 0.65
PRAME-211ENST00000476336 PCGF6Q9BYE7 350 aa19.09■□□□□ 0.65
PRAME-211ENST00000476336 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP19.08■□□□□ 0.64
PRAME-211ENST00000476336 RXRBP28702 533 aa19.07■□□□□ 0.64
PRAME-211ENST00000476336 NBPF1Q3BBV0 1214 aa19.07■□□□□ 0.64
PRAME-211ENST00000476336 WASLO00401 505 aaPredicted RBP19.06■□□□□ 0.64
PRAME-211ENST00000476336 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP19.06■□□□□ 0.64
PRAME-211ENST00000476336 PNPLA6Q8IY17 1366 aa19.06■□□□□ 0.64
PRAME-211ENST00000476336 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP19.05■□□□□ 0.64
PRAME-211ENST00000476336 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa19.05■□□□□ 0.64
PRAME-211ENST00000476336 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP19.05■□□□□ 0.64
PRAME-211ENST00000476336 TULP4Q9NRJ4 1543 aa19.05■□□□□ 0.64
PRAME-211ENST00000476336 AFF2P51816 1311 aa19.04■□□□□ 0.64
PRAME-211ENST00000476336 NUTM2FA1L443 756 aa19.04■□□□□ 0.64
PRAME-211ENST00000476336 FOXO3O43524 673 aa19.04■□□□□ 0.64
PRAME-211ENST00000476336 PHF8Q9UPP1 1060 aa19.04■□□□□ 0.64
PRAME-211ENST00000476336 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP19.03■□□□□ 0.64
PRAME-211ENST00000476336 ITSN1Q15811 1721 aa19.03■□□□□ 0.64
PRAME-211ENST00000476336 PSME1Q06323 249 aa19.03■□□□□ 0.64
PRAME-211ENST00000476336 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP19.02■□□□□ 0.64
PRAME-211ENST00000476336 PXDNQ92626 1479 aa19.02■□□□□ 0.63
PRAME-211ENST00000476336 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP19.02■□□□□ 0.63
PRAME-211ENST00000476336 GPRASP1Q5JY77 1395 aa19.01■□□□□ 0.63
PRAME-211ENST00000476336 USP32Q8NFA0 1604 aa19■□□□□ 0.63
PRAME-211ENST00000476336 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP19■□□□□ 0.63
PRAME-211ENST00000476336 C8orf37Q96NL8 207 aa19■□□□□ 0.63
PRAME-211ENST00000476336 QTRT2Q9H974 415 aaKnown RBP18.99■□□□□ 0.63
PRAME-211ENST00000476336 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP18.99■□□□□ 0.63
PRAME-211ENST00000476336 QRICH2Q9H0J4 1663 aa18.98■□□□□ 0.63
PRAME-211ENST00000476336 RALGAPBQ86X10 1494 aa18.97■□□□□ 0.63
PRAME-211ENST00000476336 RBM6P78332 1123 aaKnown RBP18.97■□□□□ 0.63
PRAME-211ENST00000476336 NBPF8Q3BBV2 869 aa18.97■□□□□ 0.63
PRAME-211ENST00000476336 KRT28Q7Z3Y7 464 aa18.97■□□□□ 0.63
PRAME-211ENST00000476336 NGLY1Q96IV0 654 aa18.97■□□□□ 0.63
PRAME-211ENST00000476336 CDK19Q9BWU1 502 aa18.97■□□□□ 0.63
PRAME-211ENST00000476336 SBNO1A3KN83 1393 aa18.96■□□□□ 0.63
PRAME-211ENST00000476336 CARD11Q9BXL7 1154 aa18.96■□□□□ 0.63
PRAME-211ENST00000476336 SLC24A1O60721 1099 aa18.95■□□□□ 0.62
PRAME-211ENST00000476336 ADAMTS2O95450 1211 aa18.95■□□□□ 0.62
PRAME-211ENST00000476336 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP18.95■□□□□ 0.62
PRAME-211ENST00000476336 CCDC61Q9Y6R9 512 aa18.95■□□□□ 0.62
PRAME-211ENST00000476336 ATP7BP35670 1465 aa18.95■□□□□ 0.62
PRAME-211ENST00000476336 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa18.95■□□□□ 0.62
PRAME-211ENST00000476336 EVC2Q86UK5 1308 aa18.94■□□□□ 0.62
PRAME-211ENST00000476336 ARHGEF10O15013 1369 aa18.93■□□□□ 0.62
PRAME-211ENST00000476336 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP18.93■□□□□ 0.62
PRAME-211ENST00000476336 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa18.93■□□□□ 0.62
PRAME-211ENST00000476336 PRR36Q9H6K5 1346 aa18.93■□□□□ 0.62
PRAME-211ENST00000476336 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa18.93■□□□□ 0.62
PRAME-211ENST00000476336 TNS3Q68CZ2 1445 aa18.92■□□□□ 0.62
PRAME-211ENST00000476336 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP18.92■□□□□ 0.62
PRAME-211ENST00000476336 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP18.92■□□□□ 0.62
PRAME-211ENST00000476336 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa18.92■□□□□ 0.62
PRAME-211ENST00000476336 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP18.91■□□□□ 0.62
PRAME-211ENST00000476336 PLEKHG3A1L390 1219 aa18.9■□□□□ 0.62
PRAME-211ENST00000476336 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP18.9■□□□□ 0.62
PRAME-211ENST00000476336 USP21Q9UK80 565 aa18.9■□□□□ 0.62
PRAME-211ENST00000476336 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP18.89■□□□□ 0.61
PRAME-211ENST00000476336 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP18.88■□□□□ 0.61
PRAME-211ENST00000476336 TRPC5Q9UL62 973 aaPredicted RBP18.88■□□□□ 0.61
PRAME-211ENST00000476336 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP18.88■□□□□ 0.61
PRAME-211ENST00000476336 RGS12O14924 1447 aa18.88■□□□□ 0.61
PRAME-211ENST00000476336 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP18.88■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 63 ms