RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000476204.5

HOXB-AS3-208, HOXB cluster antisense RNA 3, humanhuman

TSL 4

Gene HOXB-AS3, Length 539 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB-AS3-208ENST00000476204 DCCP43146 1447 aa27.44■■□□□ 1.98
HOXB-AS3-208ENST00000476204 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa27.44■■□□□ 1.98
HOXB-AS3-208ENST00000476204 SLC24A1O60721 1099 aa27.43■■□□□ 1.98
HOXB-AS3-208ENST00000476204 RALGAPBQ86X10 1494 aa27.43■■□□□ 1.98
HOXB-AS3-208ENST00000476204 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP27.41■■□□□ 1.98
HOXB-AS3-208ENST00000476204 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa27.41■■□□□ 1.98
HOXB-AS3-208ENST00000476204 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP27.41■■□□□ 1.98
HOXB-AS3-208ENST00000476204 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP27.41■■□□□ 1.98
HOXB-AS3-208ENST00000476204 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP27.36■■□□□ 1.97
HOXB-AS3-208ENST00000476204 PIP4K2BP78356 416 aa27.36■■□□□ 1.97
HOXB-AS3-208ENST00000476204 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP27.35■■□□□ 1.97
HOXB-AS3-208ENST00000476204 WASLO00401 505 aaPredicted RBP27.34■■□□□ 1.97
HOXB-AS3-208ENST00000476204 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP27.33■■□□□ 1.97
HOXB-AS3-208ENST00000476204 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP27.3■■□□□ 1.96
HOXB-AS3-208ENST00000476204 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP27.29■■□□□ 1.96
HOXB-AS3-208ENST00000476204 CDK19Q9BWU1 502 aa27.28■■□□□ 1.96
HOXB-AS3-208ENST00000476204 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP27.27■■□□□ 1.96
HOXB-AS3-208ENST00000476204 NALCNQ8IZF0 1738 aa27.27■■□□□ 1.96
HOXB-AS3-208ENST00000476204 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa27.26■■□□□ 1.96
HOXB-AS3-208ENST00000476204 MST1RQ04912 1400 aa27.26■■□□□ 1.95
HOXB-AS3-208ENST00000476204 EVC2Q86UK5 1308 aa27.26■■□□□ 1.95
HOXB-AS3-208ENST00000476204 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa27.26■■□□□ 1.95
HOXB-AS3-208ENST00000476204 ESCO1Q5FWF5 840 aa27.25■■□□□ 1.95
HOXB-AS3-208ENST00000476204 C1orf167Q5SNV9 1468 aa27.25■■□□□ 1.95
HOXB-AS3-208ENST00000476204 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa27.24■■□□□ 1.95
HOXB-AS3-208ENST00000476204 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP27.24■■□□□ 1.95
HOXB-AS3-208ENST00000476204 BRINP3Q76B58 766 aa27.23■■□□□ 1.95
HOXB-AS3-208ENST00000476204 NUTM2FA1L443 756 aa27.22■■□□□ 1.95
HOXB-AS3-208ENST00000476204 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP27.22■■□□□ 1.95
HOXB-AS3-208ENST00000476204 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP27.22■■□□□ 1.95
HOXB-AS3-208ENST00000476204 USP47Q96K76 1375 aa27.22■■□□□ 1.95
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HOXB-AS3-208ENST00000476204 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP27.21■■□□□ 1.95
HOXB-AS3-208ENST00000476204 ORAI2Q96SN7 254 aa27.21■■□□□ 1.95
HOXB-AS3-208ENST00000476204 CCDC61Q9Y6R9 512 aa27.21■■□□□ 1.95
HOXB-AS3-208ENST00000476204 ADGRB2O60241 1585 aa27.21■■□□□ 1.95
HOXB-AS3-208ENST00000476204 ANKARQ7Z5J8 1434 aa27.2■■□□□ 1.94
HOXB-AS3-208ENST00000476204 PHF8Q9UPP1 1060 aa27.17■■□□□ 1.94
HOXB-AS3-208ENST00000476204 CDCA8Q53HL2 280 aa27.16■■□□□ 1.94
HOXB-AS3-208ENST00000476204 TESK2Q96S53 571 aa27.16■■□□□ 1.94
HOXB-AS3-208ENST00000476204 TMF1P82094 1093 aa27.15■■□□□ 1.94
HOXB-AS3-208ENST00000476204 FMN2Q9NZ56 1722 aa27.14■■□□□ 1.94
HOXB-AS3-208ENST00000476204 CABP2Q9NPB3 220 aa27.14■■□□□ 1.94
HOXB-AS3-208ENST00000476204 HSPA1LP34931 641 aa27.13■■□□□ 1.93
HOXB-AS3-208ENST00000476204 QRICH2Q9H0J4 1663 aa27.13■■□□□ 1.93
HOXB-AS3-208ENST00000476204 NPHP3Q7Z494 1330 aa27.13■■□□□ 1.93
HOXB-AS3-208ENST00000476204 TULP4Q9NRJ4 1543 aa27.12■■□□□ 1.93
HOXB-AS3-208ENST00000476204 PLEKHG3A1L390 1219 aa27.12■■□□□ 1.93
HOXB-AS3-208ENST00000476204 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa27.11■■□□□ 1.93
HOXB-AS3-208ENST00000476204 PSME1Q06323 249 aa27.11■■□□□ 1.93
HOXB-AS3-208ENST00000476204 PRR36Q9H6K5 1346 aa27.11■■□□□ 1.93
HOXB-AS3-208ENST00000476204 FOXO3O43524 673 aa27.1■■□□□ 1.93
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HOXB-AS3-208ENST00000476204 ATAD2Q6PL18 1390 aa27.08■■□□□ 1.93
HOXB-AS3-208ENST00000476204 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa27.07■■□□□ 1.92
HOXB-AS3-208ENST00000476204 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP27.06■■□□□ 1.92
HOXB-AS3-208ENST00000476204 KRT28Q7Z3Y7 464 aa27.05■■□□□ 1.92
HOXB-AS3-208ENST00000476204 CABP1Q9NZU7 370 aa27.05■■□□□ 1.92
HOXB-AS3-208ENST00000476204 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP27.05■■□□□ 1.92
HOXB-AS3-208ENST00000476204 ATP7BP35670 1465 aa27.01■■□□□ 1.91
HOXB-AS3-208ENST00000476204 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP27.01■■□□□ 1.91
HOXB-AS3-208ENST00000476204 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP27.01■■□□□ 1.91
HOXB-AS3-208ENST00000476204 ACEP12821 1306 aa27■■□□□ 1.91
HOXB-AS3-208ENST00000476204 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP27■■□□□ 1.91
HOXB-AS3-208ENST00000476204 KIF1AQ12756 1690 aa27■■□□□ 1.91
HOXB-AS3-208ENST00000476204 USP32Q8NFA0 1604 aa27■■□□□ 1.91
HOXB-AS3-208ENST00000476204 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa26.99■■□□□ 1.91
HOXB-AS3-208ENST00000476204 TMC1Q8TDI8 760 aa26.98■■□□□ 1.91
HOXB-AS3-208ENST00000476204 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP26.97■■□□□ 1.91
HOXB-AS3-208ENST00000476204 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP26.97■■□□□ 1.91
HOXB-AS3-208ENST00000476204 PHLPP1O60346 1717 aa26.96■■□□□ 1.91
HOXB-AS3-208ENST00000476204 ITSN1Q15811 1721 aa26.96■■□□□ 1.91
HOXB-AS3-208ENST00000476204 JCADQ9P266 1359 aa26.96■■□□□ 1.91
HOXB-AS3-208ENST00000476204 NINLQ9Y2I6 1382 aa26.96■■□□□ 1.91
HOXB-AS3-208ENST00000476204 TERF2IPQ9NYB0 399 aa26.95■■□□□ 1.9
HOXB-AS3-208ENST00000476204 NHSL1Q5SYE7 1610 aa26.94■■□□□ 1.9
HOXB-AS3-208ENST00000476204 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa26.94■■□□□ 1.9
HOXB-AS3-208ENST00000476204 SBNO1A3KN83 1393 aa26.94■■□□□ 1.9
HOXB-AS3-208ENST00000476204 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP26.93■■□□□ 1.9
HOXB-AS3-208ENST00000476204 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa26.92■■□□□ 1.9
HOXB-AS3-208ENST00000476204 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP26.92■■□□□ 1.9
HOXB-AS3-208ENST00000476204 DISP3Q9P2K9 1392 aa26.92■■□□□ 1.9
HOXB-AS3-208ENST00000476204 PXDNQ92626 1479 aa26.89■■□□□ 1.9
HOXB-AS3-208ENST00000476204 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP26.89■■□□□ 1.9
HOXB-AS3-208ENST00000476204 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa26.89■■□□□ 1.89
HOXB-AS3-208ENST00000476204 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP26.87■■□□□ 1.89
HOXB-AS3-208ENST00000476204 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa26.86■■□□□ 1.89
HOXB-AS3-208ENST00000476204 ARHGEF10O15013 1369 aa26.85■■□□□ 1.89
HOXB-AS3-208ENST00000476204 LMOD2Q6P5Q4 547 aa26.85■■□□□ 1.89
HOXB-AS3-208ENST00000476204 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP26.84■■□□□ 1.89
HOXB-AS3-208ENST00000476204 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP26.84■■□□□ 1.89
HOXB-AS3-208ENST00000476204 POLR3GLQ9BT43 218 aa26.83■■□□□ 1.89
HOXB-AS3-208ENST00000476204 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP26.81■■□□□ 1.88
HOXB-AS3-208ENST00000476204 ABTB2Q8N961 1025 aa26.81■■□□□ 1.88
HOXB-AS3-208ENST00000476204 TTC21AQ8NDW8 1320 aa26.81■■□□□ 1.88
HOXB-AS3-208ENST00000476204 PNPLA6Q8IY17 1366 aa26.81■■□□□ 1.88
HOXB-AS3-208ENST00000476204 USP6P35125 1406 aa26.81■■□□□ 1.88
HOXB-AS3-208ENST00000476204 TNS3Q68CZ2 1445 aa26.81■■□□□ 1.88
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