RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000472729.1

COMMD1-208, Transcript of copper metabolism domain containing 1, human

TSL 3

Gene COMMD1, Length 629 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
COMMD1-208	ENST00000472729	AHDC1	Q5TGY3	1603 aa	Predicted RBP	28.18	■■■□□ 2.1
COMMD1-208	ENST00000472729	DDX17	Q92841	729 aa	Known RBP	28.17	■■■□□ 2.1
COMMD1-208	ENST00000472729	IFT172	Q9UG01	1749 aa		28.16	■■■□□ 2.1
COMMD1-208	ENST00000472729	NUTM2F	A1L443	756 aa		28.16	■■■□□ 2.1
COMMD1-208	ENST00000472729	NUTM2B	A6NNL0	878 aa	Predicted RBP	28.16	■■■□□ 2.1
COMMD1-208	ENST00000472729	NUTM2E	B1AL46	878 aa	Predicted RBP	28.16	■■■□□ 2.1
COMMD1-208	ENST00000472729	NUTM2A	Q8IVF1	878 aa	Predicted RBP	28.16	■■■□□ 2.1
COMMD1-208	ENST00000472729	PRAM1	Q96QH2	718 aa		28.16	■■■□□ 2.1
COMMD1-208	ENST00000472729	SAFB2	Q14151	953 aa	Known RBP eCLIP	28.15	■■■□□ 2.1
COMMD1-208	ENST00000472729	NALCN	Q8IZF0	1738 aa		28.15	■■■□□ 2.1
COMMD1-208	ENST00000472729	PLEKHH1	Q9ULM0	1364 aa		28.13	■■■□□ 2.09
COMMD1-208	ENST00000472729	TRAK1	Q9UPV9	953 aa		28.13	■■■□□ 2.09
COMMD1-208	ENST00000472729	COL16A1	Q07092	1604 aa	Predicted RBP	28.13	■■■□□ 2.09
COMMD1-208	ENST00000472729	NPHP3	Q7Z494	1330 aa		28.11	■■■□□ 2.09
COMMD1-208	ENST00000472729	LAMC1	P11047	1609 aa		28.1	■■■□□ 2.09
COMMD1-208	ENST00000472729	RGS17	Q9UGC6	210 aa	Predicted RBP	28.08	■■■□□ 2.09
COMMD1-208	ENST00000472729	CDC42BPG	Q6DT37	1551 aa		28.07	■■■□□ 2.08
COMMD1-208	ENST00000472729	FOXO3	O43524	673 aa		28.06	■■■□□ 2.08
COMMD1-208	ENST00000472729	TRIM26	Q12899	539 aa	Predicted RBP	28.05	■■■□□ 2.08
COMMD1-208	ENST00000472729	ZNF772	Q68DY9	489 aa	Predicted RBP	28.05	■■■□□ 2.08
COMMD1-208	ENST00000472729	SOS2	Q07890	1332 aa	Predicted RBP	28.04	■■■□□ 2.08
COMMD1-208	ENST00000472729	NEUROD1	Q13562	356 aa		28.03	■■■□□ 2.08
COMMD1-208	ENST00000472729	XPC	Q01831	940 aa	Predicted RBP	28	■■■□□ 2.07
COMMD1-208	ENST00000472729	POTEA	Q6S8J7	498 aa		28	■■■□□ 2.07
COMMD1-208	ENST00000472729	KNDC1	Q76NI1	1749 aa		28	■■■□□ 2.07
COMMD1-208	ENST00000472729	PNPLA6	Q8IY17	1366 aa		27.99	■■■□□ 2.07
COMMD1-208	ENST00000472729	HIRIP3	Q9BW71	556 aa	Predicted RBP	27.99	■■■□□ 2.07
COMMD1-208	ENST00000472729	MINK1	Q8N4C8	1332 aa	Predicted RBP	27.98	■■■□□ 2.07
COMMD1-208	ENST00000472729	PHF8	Q9UPP1	1060 aa		27.98	■■■□□ 2.07
COMMD1-208	ENST00000472729	DLC1	Q96QB1	1528 aa		27.97	■■■□□ 2.07
COMMD1-208	ENST00000472729	NHSL1	Q5SYE7	1610 aa		27.97	■■■□□ 2.07
COMMD1-208	ENST00000472729	PSME1	Q06323	249 aa		27.97	■■■□□ 2.07
COMMD1-208	ENST00000472729	C8orf37	Q96NL8	207 aa		27.97	■■■□□ 2.07
COMMD1-208	ENST00000472729	LRP6	O75581	1613 aa		27.96	■■■□□ 2.07
COMMD1-208	ENST00000472729	ADAMTS2	O95450	1211 aa		27.96	■■■□□ 2.07
COMMD1-208	ENST00000472729	SIN3A	Q96ST3	1273 aa		27.96	■■■□□ 2.07
COMMD1-208	ENST00000472729	SHPRH	Q149N8	1683 aa		27.96	■■■□□ 2.07
COMMD1-208	ENST00000472729	EIF3A	Q14152	1382 aa	Known RBP	27.96	■■■□□ 2.07
COMMD1-208	ENST00000472729	ADGRB1	O14514	1584 aa		27.95	■■■□□ 2.07
COMMD1-208	ENST00000472729	L3MBTL2	Q969R5	705 aa		27.94	■■■□□ 2.06
COMMD1-208	ENST00000472729	NGLY1	Q96IV0	654 aa		27.94	■■■□□ 2.06
COMMD1-208	ENST00000472729	KRT28	Q7Z3Y7	464 aa		27.93	■■■□□ 2.06
COMMD1-208	ENST00000472729	WASL	O00401	505 aa	Predicted RBP	27.91	■■■□□ 2.06
COMMD1-208	ENST00000472729	AFF2	P51816	1311 aa		27.91	■■■□□ 2.06
COMMD1-208	ENST00000472729	HAP1	P54257	671 aa	Predicted RBP	27.89	■■■□□ 2.06
COMMD1-208	ENST00000472729	LMOD2	Q6P5Q4	547 aa		27.89	■■■□□ 2.06
COMMD1-208	ENST00000472729	PMFBP1	Q8TBY8	1022 aa		27.89	■■■□□ 2.06
COMMD1-208	ENST00000472729	ANKAR	Q7Z5J8	1434 aa		27.87	■■■□□ 2.05
COMMD1-208	ENST00000472729	RXRB	P28702	533 aa		27.87	■■■□□ 2.05
COMMD1-208	ENST00000472729	NBPF1	Q3BBV0	1214 aa		27.87	■■■□□ 2.05
COMMD1-208	ENST00000472729	PXDN	Q92626	1479 aa		27.84	■■■□□ 2.05
COMMD1-208	ENST00000472729	NGDN	Q8NEJ9	315 aa	Known RBP	27.84	■■■□□ 2.05
COMMD1-208	ENST00000472729	SPATA31A3	Q5VYP0	1347 aa		27.84	■■■□□ 2.05
COMMD1-208	ENST00000472729	GPRASP1	Q5JY77	1395 aa		27.84	■■■□□ 2.05
COMMD1-208	ENST00000472729	FMN2	Q9NZ56	1722 aa		27.84	■■■□□ 2.05
COMMD1-208	ENST00000472729	QTRT2	Q9H974	415 aa	Known RBP	27.82	■■■□□ 2.04
COMMD1-208	ENST00000472729	PLEKHG5	O94827	1062 aa		27.8	■■■□□ 2.04
COMMD1-208	ENST00000472729	CDK19	Q9BWU1	502 aa		27.8	■■■□□ 2.04
COMMD1-208	ENST00000472729	USP21	Q9UK80	565 aa		27.8	■■■□□ 2.04
COMMD1-208	ENST00000472729	KIF1A	Q12756	1690 aa		27.79	■■■□□ 2.04
COMMD1-208	ENST00000472729	NUDT16	Q96DE0	195 aa	Known RBP	27.79	■■■□□ 2.04
COMMD1-208	ENST00000472729	CENPJ	Q9HC77	1338 aa	Predicted RBP	27.78	■■■□□ 2.04
COMMD1-208	ENST00000472729	ADGRB2	O60241	1585 aa		27.77	■■■□□ 2.04
COMMD1-208	ENST00000472729	TONSL	Q96HA7	1378 aa		27.76	■■■□□ 2.03
COMMD1-208	ENST00000472729	PAK3	O75914	559 aa	Predicted RBP	27.76	■■■□□ 2.03
COMMD1-208	ENST00000472729	SRPK2	P78362	688 aa	Known RBP	27.76	■■■□□ 2.03
COMMD1-208	ENST00000472729	SBNO1	A3KN83	1393 aa		27.75	■■■□□ 2.03
COMMD1-208	ENST00000472729	ARHGEF10	O15013	1369 aa		27.75	■■■□□ 2.03
COMMD1-208	ENST00000472729	ROCK2	O75116	1388 aa	Known RBP	27.75	■■■□□ 2.03
COMMD1-208	ENST00000472729	PRR36	Q9H6K5	1346 aa		27.75	■■■□□ 2.03
COMMD1-208	ENST00000472729	RBM6	P78332	1123 aa	Known RBP	27.75	■■■□□ 2.03
COMMD1-208	ENST00000472729	TULP4	Q9NRJ4	1543 aa		27.75	■■■□□ 2.03
COMMD1-208	ENST00000472729	TNS3	Q68CZ2	1445 aa		27.74	■■■□□ 2.03
COMMD1-208	ENST00000472729	TRPC5	Q9UL62	973 aa	Predicted RBP	27.73	■■■□□ 2.03
COMMD1-208	ENST00000472729	CCDC61	Q9Y6R9	512 aa		27.73	■■■□□ 2.03
COMMD1-208	ENST00000472729	FNBP4	Q8N3X1	1017 aa	Predicted RBP	27.72	■■■□□ 2.03
COMMD1-208	ENST00000472729	KIAA1210	Q9ULL0	1709 aa		27.72	■■■□□ 2.03
COMMD1-208	ENST00000472729	CABLES1	Q8TDN4	633 aa		27.69	■■■□□ 2.02
COMMD1-208	ENST00000472729	COL22A1	Q8NFW1	1626 aa	Predicted RBP	27.67	■■■□□ 2.02
COMMD1-208	ENST00000472729	ARHGEF28	Q8N1W1	1705 aa	Known RBP	27.65	■■■□□ 2.02
COMMD1-208	ENST00000472729	CABP2	Q9NPB3	220 aa		27.65	■■■□□ 2.02
COMMD1-208	ENST00000472729	CARD11	Q9BXL7	1154 aa		27.64	■■■□□ 2.02
COMMD1-208	ENST00000472729	EVC2	Q86UK5	1308 aa		27.64	■■■□□ 2.01
COMMD1-208	ENST00000472729	USP32	Q8NFA0	1604 aa		27.62	■■■□□ 2.01
COMMD1-208	ENST00000472729	ACE	P12821	1306 aa		27.62	■■■□□ 2.01
COMMD1-208	ENST00000472729	PLEKHG3	A1L390	1219 aa		27.61	■■■□□ 2.01
COMMD1-208	ENST00000472729	NBPF8	Q3BBV2	869 aa		27.61	■■■□□ 2.01
COMMD1-208	ENST00000472729	UNC5CL	Q8IV45	518 aa		27.61	■■■□□ 2.01
COMMD1-208	ENST00000472729	ATP7B	P35670	1465 aa		27.61	■■■□□ 2.01
COMMD1-208	ENST00000472729	CDK12	Q9NYV4	1490 aa	Predicted RBP	27.6	■■■□□ 2.01
COMMD1-208	ENST00000472729	RGPD8	O14715	1765 aa	Predicted RBP	27.59	■■■□□ 2.01
COMMD1-208	ENST00000472729	CCDC9	Q9Y3X0	531 aa	Known RBP	27.58	■■■□□ 2.01
COMMD1-208	ENST00000472729	PCGF6	Q9BYE7	350 aa		27.57	■■■□□ 2
COMMD1-208	ENST00000472729	GJD4	Q96KN9	370 aa	Predicted RBP	27.56	■■■□□ 2
COMMD1-208	ENST00000472729	PPIP5K1	Q6PFW1	1433 aa		27.55	■■■□□ 2
COMMD1-208	ENST00000472729	POLR3A	O14802	1390 aa	Predicted RBP	27.54	■■■□□ 2
COMMD1-208	ENST00000472729	BCL9L	Q86UU0	1499 aa		27.54	■■■□□ 2
COMMD1-208	ENST00000472729	ABTB2	Q8N961	1025 aa		27.54	■■■□□ 2
COMMD1-208	ENST00000472729	CABP1	Q9NZU7	370 aa		27.54	■■■□□ 2
COMMD1-208	ENST00000472729	ATRN	O75882	1429 aa		27.53	■■■□□ 2

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