RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000467594.1

NISCH-205, Transcript of nischarin, humanhuman

TSL 2

Gene NISCH, Length 1,014 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-205ENST00000467594 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa22.63■■□□□ 1.21
NISCH-205ENST00000467594 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP22.63■■□□□ 1.21
NISCH-205ENST00000467594 WAPLQ7Z5K2 1190 aa22.62■■□□□ 1.21
NISCH-205ENST00000467594 CFAP70Q5T0N1 1121 aa22.61■■□□□ 1.21
NISCH-205ENST00000467594 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP22.6■■□□□ 1.21
NISCH-205ENST00000467594 ORAI2Q96SN7 254 aa22.6■■□□□ 1.21
NISCH-205ENST00000467594 DCAF11Q8TEB1 546 aa22.58■■□□□ 1.21
NISCH-205ENST00000467594 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP22.58■■□□□ 1.21
NISCH-205ENST00000467594 LRP6O75581 1613 aa22.57■■□□□ 1.2
NISCH-205ENST00000467594 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa22.56■■□□□ 1.2
NISCH-205ENST00000467594 POTEAQ6S8J7 498 aa22.56■■□□□ 1.2
NISCH-205ENST00000467594 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP22.56■■□□□ 1.2
NISCH-205ENST00000467594 ESCO1Q5FWF5 840 aa22.55■■□□□ 1.2
NISCH-205ENST00000467594 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa22.55■■□□□ 1.2
NISCH-205ENST00000467594 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP22.54■■□□□ 1.2
NISCH-205ENST00000467594 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP22.54■■□□□ 1.2
NISCH-205ENST00000467594 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP22.54■■□□□ 1.2
NISCH-205ENST00000467594 PNPLA6Q8IY17 1366 aa22.53■■□□□ 1.2
NISCH-205ENST00000467594 ZNF772Q68DY9 489 aaPredicted RBP22.53■■□□□ 1.2
NISCH-205ENST00000467594 NPHP3Q7Z494 1330 aa22.53■■□□□ 1.2
NISCH-205ENST00000467594 DLC1Q96QB1 1528 aa22.51■■□□□ 1.19
NISCH-205ENST00000467594 PRAM1Q96QH2 718 aa22.5■■□□□ 1.19
NISCH-205ENST00000467594 POGKQ9P215 609 aa22.49■■□□□ 1.19
NISCH-205ENST00000467594 ADGRB1O14514 1584 aa22.49■■□□□ 1.19
NISCH-205ENST00000467594 FMN2Q9NZ56 1722 aa22.48■■□□□ 1.19
NISCH-205ENST00000467594 NUTM2FA1L443 756 aa22.48■■□□□ 1.19
NISCH-205ENST00000467594 FOXO3O43524 673 aa22.47■■□□□ 1.19
NISCH-205ENST00000467594 TRAK1Q9UPV9 953 aa22.45■■□□□ 1.18
NISCH-205ENST00000467594 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP22.44■■□□□ 1.18
NISCH-205ENST00000467594 PXDNQ92626 1479 aa22.43■■□□□ 1.18
NISCH-205ENST00000467594 KIF1AQ12756 1690 aa22.42■■□□□ 1.18
NISCH-205ENST00000467594 AFF2P51816 1311 aa22.42■■□□□ 1.18
NISCH-205ENST00000467594 C8orf37Q96NL8 207 aa22.41■■□□□ 1.18
NISCH-205ENST00000467594 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP22.4■■□□□ 1.18
NISCH-205ENST00000467594 PHF8Q9UPP1 1060 aa22.4■■□□□ 1.18
NISCH-205ENST00000467594 ADGRB2O60241 1585 aa22.39■■□□□ 1.18
NISCH-205ENST00000467594 ADAMTS2O95450 1211 aa22.39■■□□□ 1.17
NISCH-205ENST00000467594 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP22.39■■□□□ 1.17
NISCH-205ENST00000467594 ANKARQ7Z5J8 1434 aa22.39■■□□□ 1.17
NISCH-205ENST00000467594 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP22.38■■□□□ 1.17
NISCH-205ENST00000467594 RXRBP28702 533 aa22.38■■□□□ 1.17
NISCH-205ENST00000467594 NGLY1Q96IV0 654 aa22.38■■□□□ 1.17
NISCH-205ENST00000467594 PSME1Q06323 249 aa22.36■■□□□ 1.17
NISCH-205ENST00000467594 KRT28Q7Z3Y7 464 aa22.36■■□□□ 1.17
NISCH-205ENST00000467594 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP22.35■■□□□ 1.17
NISCH-205ENST00000467594 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa22.35■■□□□ 1.17
NISCH-205ENST00000467594 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa22.34■■□□□ 1.17
NISCH-205ENST00000467594 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP22.34■■□□□ 1.17
NISCH-205ENST00000467594 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP22.34■■□□□ 1.17
NISCH-205ENST00000467594 WASLO00401 505 aaPredicted RBP22.33■■□□□ 1.17
NISCH-205ENST00000467594 QTRT2Q9H974 415 aaKnown RBP22.32■■□□□ 1.16
NISCH-205ENST00000467594 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP22.32■■□□□ 1.16
NISCH-205ENST00000467594 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP22.31■■□□□ 1.16
NISCH-205ENST00000467594 SBNO1A3KN83 1393 aa22.3■■□□□ 1.16
NISCH-205ENST00000467594 RBM6P78332 1123 aaKnown RBP22.3■■□□□ 1.16
NISCH-205ENST00000467594 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP22.3■■□□□ 1.16
NISCH-205ENST00000467594 USP32Q8NFA0 1604 aa22.3■■□□□ 1.16
NISCH-205ENST00000467594 TULP4Q9NRJ4 1543 aa22.3■■□□□ 1.16
NISCH-205ENST00000467594 USP21Q9UK80 565 aa22.29■■□□□ 1.16
NISCH-205ENST00000467594 TNS3Q68CZ2 1445 aa22.29■■□□□ 1.16
NISCH-205ENST00000467594 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa22.28■■□□□ 1.16
NISCH-205ENST00000467594 L3MBTL2Q969R5 705 aa22.27■■□□□ 1.16
NISCH-205ENST00000467594 ARHGEF10O15013 1369 aa22.26■■□□□ 1.15
NISCH-205ENST00000467594 NBPF1Q3BBV0 1214 aa22.26■■□□□ 1.15
NISCH-205ENST00000467594 TRPC5Q9UL62 973 aaPredicted RBP22.26■■□□□ 1.15
NISCH-205ENST00000467594 PRR36Q9H6K5 1346 aa22.26■■□□□ 1.15
NISCH-205ENST00000467594 GPRASP1Q5JY77 1395 aa22.25■■□□□ 1.15
NISCH-205ENST00000467594 SIN3AQ96ST3 1273 aa22.25■■□□□ 1.15
NISCH-205ENST00000467594 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP22.25■■□□□ 1.15
NISCH-205ENST00000467594 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP22.23■■□□□ 1.15
NISCH-205ENST00000467594 NEUROD1Q13562 356 aa22.23■■□□□ 1.15
NISCH-205ENST00000467594 LMOD2Q6P5Q4 547 aa22.22■■□□□ 1.15
NISCH-205ENST00000467594 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP22.22■■□□□ 1.15
NISCH-205ENST00000467594 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP22.22■■□□□ 1.15
NISCH-205ENST00000467594 CDK19Q9BWU1 502 aa22.21■■□□□ 1.15
NISCH-205ENST00000467594 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP22.2■■□□□ 1.14
NISCH-205ENST00000467594 ATRNO75882 1429 aa22.2■■□□□ 1.14
NISCH-205ENST00000467594 ATP7BP35670 1465 aa22.19■■□□□ 1.14
NISCH-205ENST00000467594 BCL9LQ86UU0 1499 aa22.19■■□□□ 1.14
NISCH-205ENST00000467594 ITSN1Q15811 1721 aa22.19■■□□□ 1.14
NISCH-205ENST00000467594 RGS12O14924 1447 aa22.18■■□□□ 1.14
NISCH-205ENST00000467594 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP22.18■■□□□ 1.14
NISCH-205ENST00000467594 CABLES1Q8TDN4 633 aa22.17■■□□□ 1.14
NISCH-205ENST00000467594 CCDC61Q9Y6R9 512 aa22.17■■□□□ 1.14
NISCH-205ENST00000467594 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP22.17■■□□□ 1.14
NISCH-205ENST00000467594 UNC5CLQ8IV45 518 aa22.16■■□□□ 1.14
NISCH-205ENST00000467594 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP22.15■■□□□ 1.14
NISCH-205ENST00000467594 SLIT2O94813 1529 aa22.15■■□□□ 1.14
NISCH-205ENST00000467594 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa22.13■■□□□ 1.13
NISCH-205ENST00000467594 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
NISCH-205ENST00000467594 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
NISCH-205ENST00000467594 TNKS1BP1Q9C0C2 1729 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
NISCH-205ENST00000467594 ALS2Q96Q42 1657 aa22.13■■□□□ 1.13
NISCH-205ENST00000467594 PLEKHG3A1L390 1219 aa22.12■■□□□ 1.13
NISCH-205ENST00000467594 PLEKHG5O94827 1062 aa22.12■■□□□ 1.13
NISCH-205ENST00000467594 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
NISCH-205ENST00000467594 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
NISCH-205ENST00000467594 ABCA3Q99758 1704 aa22.11■■□□□ 1.13
NISCH-205ENST00000467594 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
NISCH-205ENST00000467594 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa22.11■■□□□ 1.13
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