RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000466964.1

LAMC1-202, Transcript of laminin subunit gamma 1, humanhuman

TSL 4

Gene LAMC1, Length 820 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMC1-202ENST00000466964 ORAI2Q96SN7 254 aa16.12■□□□□ 0.17
LAMC1-202ENST00000466964 SLIT2O94813 1529 aa16.11■□□□□ 0.17
LAMC1-202ENST00000466964 ROBO2Q9HCK4 1378 aa16.11■□□□□ 0.17
LAMC1-202ENST00000466964 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP16.1■□□□□ 0.17
LAMC1-202ENST00000466964 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa16.09■□□□□ 0.17
LAMC1-202ENST00000466964 CLTCL1P53675 1640 aa16.09■□□□□ 0.17
LAMC1-202ENST00000466964 RALGAPBQ86X10 1494 aa16.09■□□□□ 0.17
LAMC1-202ENST00000466964 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa16.08■□□□□ 0.16
LAMC1-202ENST00000466964 NUP155O75694 1391 aa16.06■□□□□ 0.16
LAMC1-202ENST00000466964 HFM1A2PYH4 1435 aa16.05■□□□□ 0.16
LAMC1-202ENST00000466964 DEFB132Q7Z7B7 95 aa16.03■□□□□ 0.16
LAMC1-202ENST00000466964 USP32Q8NFA0 1604 aa16.02■□□□□ 0.16
LAMC1-202ENST00000466964 NPHP3Q7Z494 1330 aa16.02■□□□□ 0.16
LAMC1-202ENST00000466964 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP16.02■□□□□ 0.16
LAMC1-202ENST00000466964 KIF1BO60333 1816 aa16.01■□□□□ 0.15
LAMC1-202ENST00000466964 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP16.01■□□□□ 0.15
LAMC1-202ENST00000466964 UNC5CLQ8IV45 518 aa16.01■□□□□ 0.15
LAMC1-202ENST00000466964 NWD2Q9ULI1 1742 aa16■□□□□ 0.15
LAMC1-202ENST00000466964 APLP2Q06481 763 aa15.99■□□□□ 0.15
LAMC1-202ENST00000466964 TECPR2O15040 1411 aa15.98■□□□□ 0.15
LAMC1-202ENST00000466964 PPLO60437 1756 aa15.98■□□□□ 0.15
LAMC1-202ENST00000466964 HRCP23327 699 aa15.97■□□□□ 0.15
LAMC1-202ENST00000466964 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP15.97■□□□□ 0.15
LAMC1-202ENST00000466964 PLCH1Q4KWH8 1693 aa15.97■□□□□ 0.15
LAMC1-202ENST00000466964 ABCA3Q99758 1704 aa15.97■□□□□ 0.15
LAMC1-202ENST00000466964 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa15.95■□□□□ 0.14
LAMC1-202ENST00000466964 KIF1AQ12756 1690 aa15.95■□□□□ 0.14
LAMC1-202ENST00000466964 FMN2Q9NZ56 1722 aa15.94■□□□□ 0.14
LAMC1-202ENST00000466964 FOXO3O43524 673 aa15.94■□□□□ 0.14
LAMC1-202ENST00000466964 VPS72Q15906 364 aa15.94■□□□□ 0.14
LAMC1-202ENST00000466964 SEPT12Q8IYM1 358 aa15.94■□□□□ 0.14
LAMC1-202ENST00000466964 DISP2A7MBM2 1401 aa15.94■□□□□ 0.14
LAMC1-202ENST00000466964 NAIPQ13075 1403 aa15.94■□□□□ 0.14
LAMC1-202ENST00000466964 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
LAMC1-202ENST00000466964 ESCO1Q5FWF5 840 aa15.93■□□□□ 0.14
LAMC1-202ENST00000466964 KNDC1Q76NI1 1749 aa15.93■□□□□ 0.14
LAMC1-202ENST00000466964 NRAPQ86VF7 1730 aa15.93■□□□□ 0.14
LAMC1-202ENST00000466964 VGFO15240 615 aaPredicted RBP15.92■□□□□ 0.14
LAMC1-202ENST00000466964 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP15.91■□□□□ 0.14
LAMC1-202ENST00000466964 CCDC144AA2RUR9 1427 aa15.91■□□□□ 0.14
LAMC1-202ENST00000466964 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa15.91■□□□□ 0.14
LAMC1-202ENST00000466964 RGPD1P0DJD0 1748 aa15.91■□□□□ 0.14
LAMC1-202ENST00000466964 TNS1Q9HBL0 1735 aaKnown RBP15.91■□□□□ 0.14
LAMC1-202ENST00000466964 KRT27Q7Z3Y8 459 aa15.89■□□□□ 0.13
LAMC1-202ENST00000466964 TNS3Q68CZ2 1445 aa15.88■□□□□ 0.13
LAMC1-202ENST00000466964 PSDA5PKW4 1024 aaPredicted RBP15.88■□□□□ 0.13
LAMC1-202ENST00000466964 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP15.88■□□□□ 0.13
LAMC1-202ENST00000466964 THSD7AQ9UPZ6 1657 aa15.87■□□□□ 0.13
LAMC1-202ENST00000466964 ABCC11Q96J66 1382 aa15.86■□□□□ 0.13
LAMC1-202ENST00000466964 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP15.85■□□□□ 0.13
LAMC1-202ENST00000466964 BAG6P46379 1132 aa15.85■□□□□ 0.13
LAMC1-202ENST00000466964 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa15.85■□□□□ 0.13
LAMC1-202ENST00000466964 IFT172Q9UG01 1749 aa15.85■□□□□ 0.13
LAMC1-202ENST00000466964 SBNO1A3KN83 1393 aa15.84■□□□□ 0.13
LAMC1-202ENST00000466964 NRXN1Q9ULB1 1477 aa15.84■□□□□ 0.13
LAMC1-202ENST00000466964 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP15.82■□□□□ 0.12
LAMC1-202ENST00000466964 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa15.82■□□□□ 0.12
LAMC1-202ENST00000466964 KRT28Q7Z3Y7 464 aa15.81■□□□□ 0.12
LAMC1-202ENST00000466964 WAPLQ7Z5K2 1190 aa15.81■□□□□ 0.12
LAMC1-202ENST00000466964 RREB1Q92766 1687 aa15.81■□□□□ 0.12
LAMC1-202ENST00000466964 FAM83GA6ND36 823 aa15.8■□□□□ 0.12
LAMC1-202ENST00000466964 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP15.8■□□□□ 0.12
LAMC1-202ENST00000466964 PIAS4Q8N2W9 510 aaPredicted RBP15.8■□□□□ 0.12
LAMC1-202ENST00000466964 COL14A1Q05707 1796 aaKnown RBP15.8■□□□□ 0.12
LAMC1-202ENST00000466964 ALS2Q96Q42 1657 aa15.79■□□□□ 0.12
LAMC1-202ENST00000466964 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP15.79■□□□□ 0.12
LAMC1-202ENST00000466964 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa15.79■□□□□ 0.12
LAMC1-202ENST00000466964 CABLES1Q8TDN4 633 aa15.79■□□□□ 0.12
LAMC1-202ENST00000466964 PIK3C2GO75747 1445 aa15.78■□□□□ 0.12
LAMC1-202ENST00000466964 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa15.78■□□□□ 0.12
LAMC1-202ENST00000466964 ARHGEF10O15013 1369 aa15.78■□□□□ 0.12
LAMC1-202ENST00000466964 R3HDM1Q15032 1099 aaKnown RBP15.78■□□□□ 0.12
LAMC1-202ENST00000466964 SIRT1Q96EB6 747 aa15.78■□□□□ 0.12
LAMC1-202ENST00000466964 NUTM2FA1L443 756 aa15.77■□□□□ 0.12
LAMC1-202ENST00000466964 CAMKK2Q96RR4 588 aa15.77■□□□□ 0.12
LAMC1-202ENST00000466964 ADGRB2O60241 1585 aa15.77■□□□□ 0.11
LAMC1-202ENST00000466964 NUP188Q5SRE5 1749 aa15.77■□□□□ 0.11
LAMC1-202ENST00000466964 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP15.76■□□□□ 0.11
LAMC1-202ENST00000466964 PARD3Q8TEW0 1356 aa15.75■□□□□ 0.11
LAMC1-202ENST00000466964 SPATA31A5Q5VU36 1347 aa15.75■□□□□ 0.11
LAMC1-202ENST00000466964 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa15.75■□□□□ 0.11
LAMC1-202ENST00000466964 FAM98CQ17RN3 349 aaKnown RBP15.75■□□□□ 0.11
LAMC1-202ENST00000466964 PHF8Q9UPP1 1060 aa15.75■□□□□ 0.11
LAMC1-202ENST00000466964 YY1P25490 414 aa15.73■□□□□ 0.11
LAMC1-202ENST00000466964 PSME1Q06323 249 aa15.73■□□□□ 0.11
LAMC1-202ENST00000466964 EZH2Q15910 746 aaKnown RBP15.73■□□□□ 0.11
LAMC1-202ENST00000466964 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa15.73■□□□□ 0.11
LAMC1-202ENST00000466964 ANKARQ7Z5J8 1434 aa15.72■□□□□ 0.11
LAMC1-202ENST00000466964 FAM182BQ5T319 152 aa15.71■□□□□ 0.11
LAMC1-202ENST00000466964 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP15.71■□□□□ 0.11
LAMC1-202ENST00000466964 ITGAEP38570 1179 aa15.7■□□□□ 0.1
LAMC1-202ENST00000466964 TMEM132EQ6IEE7 984 aa15.7■□□□□ 0.1
LAMC1-202ENST00000466964 BTG4Q9NY30 223 aa15.7■□□□□ 0.1
LAMC1-202ENST00000466964 STK26Q9P289 416 aa15.7■□□□□ 0.1
LAMC1-202ENST00000466964 DLC1Q96QB1 1528 aa15.68■□□□□ 0.1
LAMC1-202ENST00000466964 NINLQ9Y2I6 1382 aa15.67■□□□□ 0.1
LAMC1-202ENST00000466964 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP15.67■□□□□ 0.1
LAMC1-202ENST00000466964 UTRNP46939 3433 aa15.66■□□□□ 0.1
LAMC1-202ENST00000466964 SPATA31A1Q5TZJ5 1347 aa15.66■□□□□ 0.1
LAMC1-202ENST00000466964 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP15.65■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 11.8 ms