RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000446285.5

ODC1-204, Transcript of ornithine decarboxylase 1, humanhuman

TSL 5

Gene ODC1, Length 665 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODC1-204ENST00000446285 SIRT1Q96EB6 747 aa39.17■■■■□ 3.86
ODC1-204ENST00000446285 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP39.15■■■■□ 3.86
ODC1-204ENST00000446285 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP39.14■■■■□ 3.86
ODC1-204ENST00000446285 POTEAQ6S8J7 498 aa39.13■■■■□ 3.85
ODC1-204ENST00000446285 WAPLQ7Z5K2 1190 aa39.12■■■■□ 3.85
ODC1-204ENST00000446285 STAC3Q96MF2 364 aa39.12■■■■□ 3.85
ODC1-204ENST00000446285 ORAI2Q96SN7 254 aa39.12■■■■□ 3.85
ODC1-204ENST00000446285 CFAP70Q5T0N1 1121 aa39.1■■■■□ 3.85
ODC1-204ENST00000446285 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP39.09■■■■□ 3.85
ODC1-204ENST00000446285 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP39.09■■■■□ 3.85
ODC1-204ENST00000446285 PNPLA6Q8IY17 1366 aa39.08■■■■□ 3.85
ODC1-204ENST00000446285 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa39.08■■■■□ 3.85
ODC1-204ENST00000446285 ZNF772Q68DY9 489 aaPredicted RBP39.06■■■■□ 3.84
ODC1-204ENST00000446285 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP39.03■■■■□ 3.84
ODC1-204ENST00000446285 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP39.03■■■■□ 3.84
ODC1-204ENST00000446285 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP39.03■■■■□ 3.84
ODC1-204ENST00000446285 DLC1Q96QB1 1528 aa39.03■■■■□ 3.84
ODC1-204ENST00000446285 FMN2Q9NZ56 1722 aa39.03■■■■□ 3.84
ODC1-204ENST00000446285 ESCO1Q5FWF5 840 aa39.02■■■■□ 3.84
ODC1-204ENST00000446285 NPHP3Q7Z494 1330 aa39.02■■■■□ 3.84
ODC1-204ENST00000446285 DCAF11Q8TEB1 546 aa38.99■■■■□ 3.83
ODC1-204ENST00000446285 ADGRB1O14514 1584 aa38.99■■■■□ 3.83
ODC1-204ENST00000446285 KIF1AQ12756 1690 aa38.94■■■■□ 3.82
ODC1-204ENST00000446285 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa38.94■■■■□ 3.82
ODC1-204ENST00000446285 PRAM1Q96QH2 718 aa38.92■■■■□ 3.82
ODC1-204ENST00000446285 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP38.92■■■■□ 3.82
ODC1-204ENST00000446285 PXDNQ92626 1479 aa38.92■■■■□ 3.82
ODC1-204ENST00000446285 NUTM2FA1L443 756 aa38.89■■■■□ 3.82
ODC1-204ENST00000446285 POGKQ9P215 609 aa38.89■■■■□ 3.82
ODC1-204ENST00000446285 FOXO3O43524 673 aa38.87■■■■□ 3.81
ODC1-204ENST00000446285 AFF2P51816 1311 aa38.87■■■■□ 3.81
ODC1-204ENST00000446285 ADGRB2O60241 1585 aa38.87■■■■□ 3.81
ODC1-204ENST00000446285 C8orf37Q96NL8 207 aa38.83■■■■□ 3.81
ODC1-204ENST00000446285 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP38.81■■■■□ 3.8
ODC1-204ENST00000446285 TRAK1Q9UPV9 953 aa38.81■■■■□ 3.8
ODC1-204ENST00000446285 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP38.8■■■■□ 3.8
ODC1-204ENST00000446285 ANKARQ7Z5J8 1434 aa38.8■■■■□ 3.8
ODC1-204ENST00000446285 RXRBP28702 533 aa38.78■■■■□ 3.8
ODC1-204ENST00000446285 ADAMTS2O95450 1211 aa38.77■■■■□ 3.8
ODC1-204ENST00000446285 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP38.77■■■■□ 3.8
ODC1-204ENST00000446285 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa38.77■■■■□ 3.8
ODC1-204ENST00000446285 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP38.76■■■■□ 3.8
ODC1-204ENST00000446285 PHF8Q9UPP1 1060 aa38.76■■■■□ 3.8
ODC1-204ENST00000446285 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP38.75■■■■□ 3.79
ODC1-204ENST00000446285 NGLY1Q96IV0 654 aa38.75■■■■□ 3.79
ODC1-204ENST00000446285 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP38.72■■■■□ 3.79
ODC1-204ENST00000446285 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa38.7■■■■□ 3.79
ODC1-204ENST00000446285 PSME1Q06323 249 aa38.7■■■■□ 3.79
ODC1-204ENST00000446285 KRT28Q7Z3Y7 464 aa38.7■■■■□ 3.79
ODC1-204ENST00000446285 USP32Q8NFA0 1604 aa38.7■■■■□ 3.79
ODC1-204ENST00000446285 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP38.69■■■■□ 3.78
ODC1-204ENST00000446285 QTRT2Q9H974 415 aaKnown RBP38.67■■■■□ 3.78
ODC1-204ENST00000446285 TULP4Q9NRJ4 1543 aa38.66■■■■□ 3.78
ODC1-204ENST00000446285 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP38.65■■■■□ 3.78
ODC1-204ENST00000446285 RBM6P78332 1123 aaKnown RBP38.65■■■■□ 3.78
ODC1-204ENST00000446285 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP38.65■■■■□ 3.78
ODC1-204ENST00000446285 TNS3Q68CZ2 1445 aa38.64■■■■□ 3.78
ODC1-204ENST00000446285 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP38.64■■■■□ 3.78
ODC1-204ENST00000446285 SBNO1A3KN83 1393 aa38.64■■■■□ 3.78
ODC1-204ENST00000446285 WASLO00401 505 aaPredicted RBP38.63■■■■□ 3.77
ODC1-204ENST00000446285 USP21Q9UK80 565 aa38.62■■■■□ 3.77
ODC1-204ENST00000446285 TRPC5Q9UL62 973 aaPredicted RBP38.58■■■■□ 3.77
ODC1-204ENST00000446285 ARHGEF10O15013 1369 aa38.57■■■■□ 3.77
ODC1-204ENST00000446285 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa38.55■■■■□ 3.76
ODC1-204ENST00000446285 ITSN1Q15811 1721 aa38.55■■■■□ 3.76
ODC1-204ENST00000446285 PRR36Q9H6K5 1346 aa38.54■■■■□ 3.76
ODC1-204ENST00000446285 ATRNO75882 1429 aa38.53■■■■□ 3.76
ODC1-204ENST00000446285 GPRASP1Q5JY77 1395 aa38.52■■■■□ 3.76
ODC1-204ENST00000446285 RGS12O14924 1447 aa38.52■■■■□ 3.76
ODC1-204ENST00000446285 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP38.49■■■■□ 3.75
ODC1-204ENST00000446285 TNKS1BP1Q9C0C2 1729 aaKnown RBP38.49■■■■□ 3.75
ODC1-204ENST00000446285 BCL9LQ86UU0 1499 aa38.48■■■■□ 3.75
ODC1-204ENST00000446285 ATP7BP35670 1465 aa38.47■■■■□ 3.75
ODC1-204ENST00000446285 NBPF1Q3BBV0 1214 aa38.47■■■■□ 3.75
ODC1-204ENST00000446285 L3MBTL2Q969R5 705 aa38.47■■■■□ 3.75
ODC1-204ENST00000446285 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP38.46■■■■□ 3.75
ODC1-204ENST00000446285 ABCA3Q99758 1704 aa38.45■■■■□ 3.75
ODC1-204ENST00000446285 LMOD2Q6P5Q4 547 aa38.44■■■■□ 3.74
ODC1-204ENST00000446285 SLIT2O94813 1529 aa38.43■■■■□ 3.74
ODC1-204ENST00000446285 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP38.43■■■■□ 3.74
ODC1-204ENST00000446285 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP38.43■■■■□ 3.74
ODC1-204ENST00000446285 ALS2Q96Q42 1657 aa38.43■■■■□ 3.74
ODC1-204ENST00000446285 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP38.42■■■■□ 3.74
ODC1-204ENST00000446285 SIN3AQ96ST3 1273 aa38.42■■■■□ 3.74
ODC1-204ENST00000446285 CDK19Q9BWU1 502 aa38.41■■■■□ 3.74
ODC1-204ENST00000446285 UNC5CLQ8IV45 518 aa38.38■■■■□ 3.73
ODC1-204ENST00000446285 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa38.38■■■■□ 3.73
ODC1-204ENST00000446285 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP38.38■■■■□ 3.73
ODC1-204ENST00000446285 CABLES1Q8TDN4 633 aa38.37■■■■□ 3.73
ODC1-204ENST00000446285 NWD2Q9ULI1 1742 aa38.36■■■■□ 3.73
ODC1-204ENST00000446285 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa38.36■■■■□ 3.73
ODC1-204ENST00000446285 NEUROD1Q13562 356 aa38.35■■■■□ 3.73
ODC1-204ENST00000446285 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP38.34■■■■□ 3.73
ODC1-204ENST00000446285 CCDC61Q9Y6R9 512 aa38.34■■■■□ 3.73
ODC1-204ENST00000446285 PLCH1Q4KWH8 1693 aa38.32■■■■□ 3.72
ODC1-204ENST00000446285 QRICH2Q9H0J4 1663 aa38.32■■■■□ 3.72
ODC1-204ENST00000446285 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP38.31■■■■□ 3.72
ODC1-204ENST00000446285 ATAD2Q6PL18 1390 aa38.29■■■■□ 3.72
ODC1-204ENST00000446285 PLEKHG3A1L390 1219 aa38.28■■■■□ 3.72
ODC1-204ENST00000446285 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP38.27■■■■□ 3.72
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