RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000440289.6

PTPRJ-202, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type J, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRJ, Length 3,158 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJ-202ENST00000440289 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa23.24■■□□□ 1.31
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PTPRJ-202ENST00000440289 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP23.24■■□□□ 1.31
PTPRJ-202ENST00000440289 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa23.23■■□□□ 1.31
PTPRJ-202ENST00000440289 TBC1D2Q9BYX2 928 aa23.23■■□□□ 1.31
PTPRJ-202ENST00000440289 ADGRL1O94910 1474 aa23.23■■□□□ 1.31
PTPRJ-202ENST00000440289 IQGAP3Q86VI3 1631 aa23.23■■□□□ 1.31
PTPRJ-202ENST00000440289 RWDD1Q9H446 243 aaPredicted RBP23.23■■□□□ 1.31
PTPRJ-202ENST00000440289 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP23.22■■□□□ 1.31
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PTPRJ-202ENST00000440289 MYH16Q9H6N6 1097 aa23.15■■□□□ 1.3
PTPRJ-202ENST00000440289 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP23.15■■□□□ 1.3
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PTPRJ-202ENST00000440289 SSH1Q8WYL5 1049 aa23.12■■□□□ 1.29
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PTPRJ-202ENST00000440289 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa23.11■■□□□ 1.29
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PTPRJ-202ENST00000440289 RIPK4P57078 832 aa23.09■■□□□ 1.29
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PTPRJ-202ENST00000440289 NAP1L5Q96NT1 182 aaPredicted RBP23.09■■□□□ 1.29
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PTPRJ-202ENST00000440289 CYB5RLQ6IPT4 315 aa23.08■■□□□ 1.29
PTPRJ-202ENST00000440289 TMEM57Q8N5G2 664 aa23.08■■□□□ 1.29
PTPRJ-202ENST00000440289 HSCBQ8IWL3 235 aa23.07■■□□□ 1.28
PTPRJ-202ENST00000440289 GOLGA6L3A6NEY3 463 aa23.07■■□□□ 1.28
PTPRJ-202ENST00000440289 CD109Q6YHK3 1445 aa23.07■■□□□ 1.28
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PTPRJ-202ENST00000440289 WDR63Q8IWG1 891 aa23.02■■□□□ 1.28
PTPRJ-202ENST00000440289 STAG3Q9UJ98 1225 aa23.02■■□□□ 1.28
PTPRJ-202ENST00000440289 ABCA9Q8IUA7 1624 aa23.02■■□□□ 1.28
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PTPRJ-202ENST00000440289 DDX19BQ9UMR2 479 aa22.96■■□□□ 1.27
PTPRJ-202ENST00000440289 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa22.96■■□□□ 1.27
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PTPRJ-202ENST00000440289 CHMP5Q9NZZ3 219 aa22.95■■□□□ 1.26
PTPRJ-202ENST00000440289 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa22.95■■□□□ 1.26
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PTPRJ-202ENST00000440289 FOXD4L5Q5VV16 416 aaPredicted RBP22.91■■□□□ 1.26
PTPRJ-202ENST00000440289 FOXD4L4Q8WXT5 416 aaPredicted RBP22.91■■□□□ 1.26
PTPRJ-202ENST00000440289 NPATQ14207 1427 aa22.9■■□□□ 1.26
PTPRJ-202ENST00000440289 IQGAP1P46940 1657 aa22.9■■□□□ 1.26
PTPRJ-202ENST00000440289 DCTN1Q14203 1278 aa22.9■■□□□ 1.26
PTPRJ-202ENST00000440289 PLPPR3Q6T4P5 718 aa22.9■■□□□ 1.26
PTPRJ-202ENST00000440289 ZBTB7CA1YPR0 619 aa22.89■■□□□ 1.26
PTPRJ-202ENST00000440289 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP22.89■■□□□ 1.26
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