RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000440016.6

HOXD-AS2-202, HOXD cluster antisense RNA 2, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene HOXD-AS2, Length 999 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD-AS2-202ENST00000440016 TRAK1Q9UPV9 953 aa39.05■■■■□ 3.84
HOXD-AS2-202ENST00000440016 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa39.03■■■■□ 3.84
HOXD-AS2-202ENST00000440016 PRAM1Q96QH2 718 aa39.03■■■■□ 3.84
HOXD-AS2-202ENST00000440016 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP39.03■■■■□ 3.84
HOXD-AS2-202ENST00000440016 NBPF1Q3BBV0 1214 aa39.01■■■■□ 3.84
HOXD-AS2-202ENST00000440016 POGKQ9P215 609 aa38.98■■■■□ 3.83
HOXD-AS2-202ENST00000440016 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP38.96■■■■□ 3.83
HOXD-AS2-202ENST00000440016 CLSPNQ9HAW4 1339 aa38.95■■■■□ 3.83
HOXD-AS2-202ENST00000440016 C1orf167Q5SNV9 1468 aa38.95■■■■□ 3.83
HOXD-AS2-202ENST00000440016 PHLPP1O60346 1717 aa38.94■■■■□ 3.82
HOXD-AS2-202ENST00000440016 BRINP3Q76B58 766 aa38.94■■■■□ 3.82
HOXD-AS2-202ENST00000440016 FMN2Q9NZ56 1722 aa38.94■■■■□ 3.82
HOXD-AS2-202ENST00000440016 NBPF8Q3BBV2 869 aa38.92■■■■□ 3.82
HOXD-AS2-202ENST00000440016 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP38.9■■■■□ 3.82
HOXD-AS2-202ENST00000440016 ADGRB2O60241 1585 aa38.9■■■■□ 3.82
HOXD-AS2-202ENST00000440016 NHSL1Q5SYE7 1610 aa38.87■■■■□ 3.81
HOXD-AS2-202ENST00000440016 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP38.85■■■■□ 3.81
HOXD-AS2-202ENST00000440016 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP38.85■■■■□ 3.81
HOXD-AS2-202ENST00000440016 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP38.84■■■■□ 3.81
HOXD-AS2-202ENST00000440016 ORAI2Q96SN7 254 aa38.82■■■■□ 3.8
HOXD-AS2-202ENST00000440016 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP38.82■■■■□ 3.8
HOXD-AS2-202ENST00000440016 NUTM2FA1L443 756 aa38.81■■■■□ 3.8
HOXD-AS2-202ENST00000440016 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP38.8■■■■□ 3.8
HOXD-AS2-202ENST00000440016 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP38.8■■■■□ 3.8
HOXD-AS2-202ENST00000440016 RALGAPBQ86X10 1494 aa38.78■■■■□ 3.8
HOXD-AS2-202ENST00000440016 GPRASP1Q5JY77 1395 aa38.77■■■■□ 3.8
HOXD-AS2-202ENST00000440016 ESCO1Q5FWF5 840 aa38.75■■■■□ 3.79
HOXD-AS2-202ENST00000440016 USP32Q8NFA0 1604 aa38.74■■■■□ 3.79
HOXD-AS2-202ENST00000440016 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP38.73■■■■□ 3.79
HOXD-AS2-202ENST00000440016 QRICH2Q9H0J4 1663 aa38.73■■■■□ 3.79
HOXD-AS2-202ENST00000440016 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP38.71■■■■□ 3.79
HOXD-AS2-202ENST00000440016 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa38.71■■■■□ 3.79
HOXD-AS2-202ENST00000440016 WASLO00401 505 aaPredicted RBP38.7■■■■□ 3.79
HOXD-AS2-202ENST00000440016 KIF1AQ12756 1690 aa38.7■■■■□ 3.79
HOXD-AS2-202ENST00000440016 ANKARQ7Z5J8 1434 aa38.69■■■■□ 3.78
HOXD-AS2-202ENST00000440016 TULP4Q9NRJ4 1543 aa38.68■■■■□ 3.78
HOXD-AS2-202ENST00000440016 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP38.67■■■■□ 3.78
HOXD-AS2-202ENST00000440016 JCADQ9P266 1359 aa38.66■■■■□ 3.78
HOXD-AS2-202ENST00000440016 CARD11Q9BXL7 1154 aa38.65■■■■□ 3.78
HOXD-AS2-202ENST00000440016 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP38.64■■■■□ 3.78
HOXD-AS2-202ENST00000440016 SHPRHQ149N8 1683 aa38.64■■■■□ 3.78
HOXD-AS2-202ENST00000440016 DISP3Q9P2K9 1392 aa38.63■■■■□ 3.77
HOXD-AS2-202ENST00000440016 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP38.61■■■■□ 3.77
HOXD-AS2-202ENST00000440016 PRR36Q9H6K5 1346 aa38.61■■■■□ 3.77
HOXD-AS2-202ENST00000440016 NPHP3Q7Z494 1330 aa38.6■■■■□ 3.77
HOXD-AS2-202ENST00000440016 FOXO3O43524 673 aa38.59■■■■□ 3.77
HOXD-AS2-202ENST00000440016 PHF8Q9UPP1 1060 aa38.59■■■■□ 3.77
HOXD-AS2-202ENST00000440016 CDK19Q9BWU1 502 aa38.58■■■■□ 3.77
HOXD-AS2-202ENST00000440016 ITSN1Q15811 1721 aa38.58■■■■□ 3.77
HOXD-AS2-202ENST00000440016 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP38.57■■■■□ 3.76
HOXD-AS2-202ENST00000440016 ATP7BP35670 1465 aa38.57■■■■□ 3.76
HOXD-AS2-202ENST00000440016 PXDNQ92626 1479 aa38.57■■■■□ 3.76
HOXD-AS2-202ENST00000440016 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa38.52■■■■□ 3.76
HOXD-AS2-202ENST00000440016 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP38.51■■■■□ 3.76
HOXD-AS2-202ENST00000440016 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP38.51■■■■□ 3.76
HOXD-AS2-202ENST00000440016 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa38.5■■■■□ 3.75
HOXD-AS2-202ENST00000440016 PNPLA6Q8IY17 1366 aa38.48■■■■□ 3.75
HOXD-AS2-202ENST00000440016 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa38.47■■■■□ 3.75
HOXD-AS2-202ENST00000440016 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP38.45■■■■□ 3.75
HOXD-AS2-202ENST00000440016 KRT28Q7Z3Y7 464 aa38.44■■■■□ 3.74
HOXD-AS2-202ENST00000440016 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa38.44■■■■□ 3.74
HOXD-AS2-202ENST00000440016 EVC2Q86UK5 1308 aa38.43■■■■□ 3.74
HOXD-AS2-202ENST00000440016 CABP2Q9NPB3 220 aa38.43■■■■□ 3.74
HOXD-AS2-202ENST00000440016 LRP6O75581 1613 aa38.42■■■■□ 3.74
HOXD-AS2-202ENST00000440016 ILDR2Q71H61 639 aa38.42■■■■□ 3.74
HOXD-AS2-202ENST00000440016 CCDC61Q9Y6R9 512 aa38.41■■■■□ 3.74
HOXD-AS2-202ENST00000440016 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP38.4■■■■□ 3.74
HOXD-AS2-202ENST00000440016 PSME1Q06323 249 aa38.39■■■■□ 3.74
HOXD-AS2-202ENST00000440016 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP38.37■■■■□ 3.73
HOXD-AS2-202ENST00000440016 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP38.37■■■■□ 3.73
HOXD-AS2-202ENST00000440016 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa38.36■■■■□ 3.73
HOXD-AS2-202ENST00000440016 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP38.34■■■■□ 3.73
HOXD-AS2-202ENST00000440016 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP38.34■■■■□ 3.73
HOXD-AS2-202ENST00000440016 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP38.34■■■■□ 3.73
HOXD-AS2-202ENST00000440016 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa38.34■■■■□ 3.73
HOXD-AS2-202ENST00000440016 SBNO1A3KN83 1393 aa38.33■■■■□ 3.73
HOXD-AS2-202ENST00000440016 USP47Q96K76 1375 aa38.33■■■■□ 3.73
HOXD-AS2-202ENST00000440016 TNS3Q68CZ2 1445 aa38.33■■■■□ 3.73
HOXD-AS2-202ENST00000440016 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP38.33■■■■□ 3.73
HOXD-AS2-202ENST00000440016 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa38.32■■■■□ 3.72
HOXD-AS2-202ENST00000440016 PLEKHG3A1L390 1219 aa38.32■■■■□ 3.72
HOXD-AS2-202ENST00000440016 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP38.31■■■■□ 3.72
HOXD-AS2-202ENST00000440016 ACEP12821 1306 aa38.29■■■■□ 3.72
HOXD-AS2-202ENST00000440016 TESK2Q96S53 571 aa38.27■■■■□ 3.72
HOXD-AS2-202ENST00000440016 ALS2Q96Q42 1657 aa38.27■■■■□ 3.72
HOXD-AS2-202ENST00000440016 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP38.26■■■■□ 3.72
HOXD-AS2-202ENST00000440016 CABP1Q9NZU7 370 aa38.24■■■■□ 3.71
HOXD-AS2-202ENST00000440016 ATAD2Q6PL18 1390 aa38.23■■■■□ 3.71
HOXD-AS2-202ENST00000440016 ARHGEF10O15013 1369 aa38.21■■■■□ 3.71
HOXD-AS2-202ENST00000440016 LMOD2Q6P5Q4 547 aa38.2■■■■□ 3.71
HOXD-AS2-202ENST00000440016 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP38.19■■■■□ 3.7
HOXD-AS2-202ENST00000440016 ABCA3Q99758 1704 aa38.18■■■■□ 3.7
HOXD-AS2-202ENST00000440016 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP38.18■■■■□ 3.7
HOXD-AS2-202ENST00000440016 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP38.17■■■■□ 3.7
HOXD-AS2-202ENST00000440016 SLC24A1O60721 1099 aa38.16■■■■□ 3.7
HOXD-AS2-202ENST00000440016 ADAMTS2O95450 1211 aa38.16■■■■□ 3.7
HOXD-AS2-202ENST00000440016 AKAP12Q02952 1782 aa38.16■■■■□ 3.7
HOXD-AS2-202ENST00000440016 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP38.12■■■■□ 3.69
HOXD-AS2-202ENST00000440016 USP6P35125 1406 aa38.11■■■■□ 3.69
HOXD-AS2-202ENST00000440016 CABLES1Q8TDN4 633 aa38.1■■■■□ 3.69
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