RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000440001.2

TRAF3IP2-AS1-203, TRAF3IP2 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene TRAF3IP2-AS1, Length 915 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF3IP2-AS1-203ENST00000440001 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP40.63■■■■■ 4.09
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TRAF3IP2-AS1-203ENST00000440001 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP40.59■■■■■ 4.09
TRAF3IP2-AS1-203ENST00000440001 WAPLQ7Z5K2 1190 aa40.59■■■■■ 4.09
TRAF3IP2-AS1-203ENST00000440001 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP40.59■■■■■ 4.09
TRAF3IP2-AS1-203ENST00000440001 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP40.58■■■■■ 4.09
TRAF3IP2-AS1-203ENST00000440001 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa40.58■■■■■ 4.09
TRAF3IP2-AS1-203ENST00000440001 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP40.55■■■■■ 4.08
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TRAF3IP2-AS1-203ENST00000440001 CFAP70Q5T0N1 1121 aa40.51■■■■■ 4.08
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TRAF3IP2-AS1-203ENST00000440001 SIRT1Q96EB6 747 aa40.47■■■■■ 4.07
TRAF3IP2-AS1-203ENST00000440001 ESCO1Q5FWF5 840 aa40.46■■■■■ 4.07
TRAF3IP2-AS1-203ENST00000440001 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP40.44■■■■■ 4.06
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TRAF3IP2-AS1-203ENST00000440001 AFF2P51816 1311 aa40.41■■■■■ 4.06
TRAF3IP2-AS1-203ENST00000440001 NPHP3Q7Z494 1330 aa40.41■■■■■ 4.06
TRAF3IP2-AS1-203ENST00000440001 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP40.4■■■■■ 4.06
TRAF3IP2-AS1-203ENST00000440001 NUTM2FA1L443 756 aa40.39■■■■■ 4.06
TRAF3IP2-AS1-203ENST00000440001 ADGRB1O14514 1584 aa40.38■■■■■ 4.05
TRAF3IP2-AS1-203ENST00000440001 DLC1Q96QB1 1528 aa40.36■■■■■ 4.05
TRAF3IP2-AS1-203ENST00000440001 C8orf37Q96NL8 207 aa40.35■■■■■ 4.05
TRAF3IP2-AS1-203ENST00000440001 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP40.34■■■■■ 4.05
TRAF3IP2-AS1-203ENST00000440001 FOXO3O43524 673 aa40.34■■■■■ 4.05
TRAF3IP2-AS1-203ENST00000440001 KIF1AQ12756 1690 aa40.33■■■■■ 4.05
TRAF3IP2-AS1-203ENST00000440001 DCAF11Q8TEB1 546 aa40.31■■■■■ 4.04
TRAF3IP2-AS1-203ENST00000440001 ADAMTS2O95450 1211 aa40.3■■■■■ 4.04
TRAF3IP2-AS1-203ENST00000440001 PRAM1Q96QH2 718 aa40.3■■■■■ 4.04
TRAF3IP2-AS1-203ENST00000440001 RXRBP28702 533 aa40.29■■■■■ 4.04
TRAF3IP2-AS1-203ENST00000440001 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP40.29■■■■■ 4.04
TRAF3IP2-AS1-203ENST00000440001 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa40.29■■■■■ 4.04
TRAF3IP2-AS1-203ENST00000440001 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP40.26■■■■■ 4.03
TRAF3IP2-AS1-203ENST00000440001 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP40.25■■■■■ 4.03
TRAF3IP2-AS1-203ENST00000440001 STAC3Q96MF2 364 aa40.25■■■■■ 4.03
TRAF3IP2-AS1-203ENST00000440001 ADGRB2O60241 1585 aa40.23■■■■■ 4.03
TRAF3IP2-AS1-203ENST00000440001 NGLY1Q96IV0 654 aa40.22■■■■■ 4.03
TRAF3IP2-AS1-203ENST00000440001 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP40.2■■■■■ 4.03
TRAF3IP2-AS1-203ENST00000440001 POGKQ9P215 609 aa40.2■■■■■ 4.03
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TRAF3IP2-AS1-203ENST00000440001 TRAK1Q9UPV9 953 aa40.19■■■■■ 4.02
TRAF3IP2-AS1-203ENST00000440001 USP32Q8NFA0 1604 aa40.19■■■■■ 4.02
TRAF3IP2-AS1-203ENST00000440001 PHF8Q9UPP1 1060 aa40.15■■■■■ 4.02
TRAF3IP2-AS1-203ENST00000440001 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa40.15■■■■■ 4.02
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TRAF3IP2-AS1-203ENST00000440001 ANKARQ7Z5J8 1434 aa40.13■■■■■ 4.01
TRAF3IP2-AS1-203ENST00000440001 KRT28Q7Z3Y7 464 aa40.12■■■■■ 4.01
TRAF3IP2-AS1-203ENST00000440001 RGS12O14924 1447 aa40.11■■■■■ 4.01
TRAF3IP2-AS1-203ENST00000440001 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP40.11■■■■■ 4.01
TRAF3IP2-AS1-203ENST00000440001 USP21Q9UK80 565 aa40.1■■■■■ 4.01
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TRAF3IP2-AS1-203ENST00000440001 ITSN1Q15811 1721 aa39.88■■■■□ 3.97
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TRAF3IP2-AS1-203ENST00000440001 LMOD2Q6P5Q4 547 aa39.85■■■■□ 3.97
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TRAF3IP2-AS1-203ENST00000440001 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP39.81■■■■□ 3.96
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TRAF3IP2-AS1-203ENST00000440001 RALGAPBQ86X10 1494 aa39.75■■■■□ 3.95
TRAF3IP2-AS1-203ENST00000440001 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa39.75■■■■□ 3.95
TRAF3IP2-AS1-203ENST00000440001 L3MBTL2Q969R5 705 aa39.75■■■■□ 3.95
TRAF3IP2-AS1-203ENST00000440001 ATAD2Q6PL18 1390 aa39.74■■■■□ 3.95
TRAF3IP2-AS1-203ENST00000440001 SIN3AQ96ST3 1273 aa39.73■■■■□ 3.95
TRAF3IP2-AS1-203ENST00000440001 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa39.67■■■■□ 3.94
TRAF3IP2-AS1-203ENST00000440001 FAM83GA6ND36 823 aa39.67■■■■□ 3.94
TRAF3IP2-AS1-203ENST00000440001 NRAPQ86VF7 1730 aa39.66■■■■□ 3.94
TRAF3IP2-AS1-203ENST00000440001 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP39.66■■■■□ 3.94
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