RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000436287.1

ACTBP11-201, Transcript of actin, beta pseudogene 11, humanhuman

BASIC

Gene ACTBP11, Length 1,126 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTBP11-201ENST00000436287 ESCO1Q5FWF5 840 aa22.5■■□□□ 1.19
ACTBP11-201ENST00000436287 NPHP3Q7Z494 1330 aa22.5■■□□□ 1.19
ACTBP11-201ENST00000436287 ATRNO75882 1429 aa22.48■■□□□ 1.19
ACTBP11-201ENST00000436287 FOXO3O43524 673 aa22.46■■□□□ 1.19
ACTBP11-201ENST00000436287 MYOM2P54296 1465 aa22.46■■□□□ 1.19
ACTBP11-201ENST00000436287 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa22.45■■□□□ 1.18
ACTBP11-201ENST00000436287 BCL9LQ86UU0 1499 aa22.43■■□□□ 1.18
ACTBP11-201ENST00000436287 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP22.43■■□□□ 1.18
ACTBP11-201ENST00000436287 FOXD1Q16676 465 aa22.43■■□□□ 1.18
ACTBP11-201ENST00000436287 WAPLQ7Z5K2 1190 aa22.43■■□□□ 1.18
ACTBP11-201ENST00000436287 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP22.42■■□□□ 1.18
ACTBP11-201ENST00000436287 PXDNQ92626 1479 aa22.42■■□□□ 1.18
ACTBP11-201ENST00000436287 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP22.42■■□□□ 1.18
ACTBP11-201ENST00000436287 STK26Q9P289 416 aa22.42■■□□□ 1.18
ACTBP11-201ENST00000436287 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa22.42■■□□□ 1.18
ACTBP11-201ENST00000436287 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa22.42■■□□□ 1.18
ACTBP11-201ENST00000436287 TECPR2O15040 1411 aa22.4■■□□□ 1.18
ACTBP11-201ENST00000436287 ABCC11Q96J66 1382 aa22.4■■□□□ 1.18
ACTBP11-201ENST00000436287 RGL3Q3MIN7 710 aa22.4■■□□□ 1.18
ACTBP11-201ENST00000436287 CCDC125Q86Z20 511 aa22.4■■□□□ 1.18
ACTBP11-201ENST00000436287 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP22.4■■□□□ 1.18
ACTBP11-201ENST00000436287 NUTM2FA1L443 756 aa22.39■■□□□ 1.17
ACTBP11-201ENST00000436287 PPLO60437 1756 aa22.38■■□□□ 1.17
ACTBP11-201ENST00000436287 ZRANB1Q9UGI0 708 aa22.38■■□□□ 1.17
ACTBP11-201ENST00000436287 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa22.38■■□□□ 1.17
ACTBP11-201ENST00000436287 TMEM132EQ6IEE7 984 aa22.37■■□□□ 1.17
ACTBP11-201ENST00000436287 CCDC144AA2RUR9 1427 aa22.37■■□□□ 1.17
ACTBP11-201ENST00000436287 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa22.36■■□□□ 1.17
ACTBP11-201ENST00000436287 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa22.36■■□□□ 1.17
ACTBP11-201ENST00000436287 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa22.35■■□□□ 1.17
ACTBP11-201ENST00000436287 UNC5CLQ8IV45 518 aa22.34■■□□□ 1.17
ACTBP11-201ENST00000436287 SIRT1Q96EB6 747 aa22.32■■□□□ 1.16
ACTBP11-201ENST00000436287 MPHOSPH9Q99550 1183 aa22.32■■□□□ 1.16
ACTBP11-201ENST00000436287 KRT28Q7Z3Y7 464 aa22.31■■□□□ 1.16
ACTBP11-201ENST00000436287 SLIT2O94813 1529 aa22.3■■□□□ 1.16
ACTBP11-201ENST00000436287 PIK3C2GO75747 1445 aa22.3■■□□□ 1.16
ACTBP11-201ENST00000436287 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP22.29■■□□□ 1.16
ACTBP11-201ENST00000436287 RALGAPBQ86X10 1494 aa22.28■■□□□ 1.16
ACTBP11-201ENST00000436287 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP22.27■■□□□ 1.16
ACTBP11-201ENST00000436287 EP400Q96L91 3159 aa22.27■■□□□ 1.16
ACTBP11-201ENST00000436287 PHF8Q9UPP1 1060 aa22.26■■□□□ 1.15
ACTBP11-201ENST00000436287 PSME1Q06323 249 aa22.25■■□□□ 1.15
ACTBP11-201ENST00000436287 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP22.23■■□□□ 1.15
ACTBP11-201ENST00000436287 VPS72Q15906 364 aa22.23■■□□□ 1.15
ACTBP11-201ENST00000436287 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP22.23■■□□□ 1.15
ACTBP11-201ENST00000436287 GLI3P10071 1580 aa22.22■■□□□ 1.15
ACTBP11-201ENST00000436287 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP22.22■■□□□ 1.15
ACTBP11-201ENST00000436287 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP22.22■■□□□ 1.15
ACTBP11-201ENST00000436287 SEPT12Q8IYM1 358 aa22.22■■□□□ 1.15
ACTBP11-201ENST00000436287 CABLES1Q8TDN4 633 aa22.22■■□□□ 1.15
ACTBP11-201ENST00000436287 CFAP70Q5T0N1 1121 aa22.21■■□□□ 1.15
ACTBP11-201ENST00000436287 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP22.21■■□□□ 1.15
ACTBP11-201ENST00000436287 TNS3Q68CZ2 1445 aa22.21■■□□□ 1.15
ACTBP11-201ENST00000436287 KNDC1Q76NI1 1749 aa22.2■■□□□ 1.14
ACTBP11-201ENST00000436287 TNKS1BP1Q9C0C2 1729 aaKnown RBP22.2■■□□□ 1.14
ACTBP11-201ENST00000436287 FMN2Q9NZ56 1722 aa22.2■■□□□ 1.14
ACTBP11-201ENST00000436287 SBNO1A3KN83 1393 aa22.2■■□□□ 1.14
ACTBP11-201ENST00000436287 KIF1AQ12756 1690 aa22.2■■□□□ 1.14
ACTBP11-201ENST00000436287 DEFB132Q7Z7B7 95 aa22.19■■□□□ 1.14
ACTBP11-201ENST00000436287 IFT172Q9UG01 1749 aa22.18■■□□□ 1.14
ACTBP11-201ENST00000436287 PRAM1Q96QH2 718 aa22.18■■□□□ 1.14
ACTBP11-201ENST00000436287 USP32Q8NFA0 1604 aa22.17■■□□□ 1.14
ACTBP11-201ENST00000436287 LMOD2Q6P5Q4 547 aa22.17■■□□□ 1.14
ACTBP11-201ENST00000436287 NRXN1Q9ULB1 1477 aa22.16■■□□□ 1.14
ACTBP11-201ENST00000436287 ARHGEF10O15013 1369 aa22.16■■□□□ 1.14
ACTBP11-201ENST00000436287 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
ACTBP11-201ENST00000436287 PLEKHG5O94827 1062 aa22.16■■□□□ 1.14
ACTBP11-201ENST00000436287 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
ACTBP11-201ENST00000436287 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP22.16■■□□□ 1.14
ACTBP11-201ENST00000436287 FAM83GA6ND36 823 aa22.15■■□□□ 1.14
ACTBP11-201ENST00000436287 KRT27Q7Z3Y8 459 aa22.15■■□□□ 1.14
ACTBP11-201ENST00000436287 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
ACTBP11-201ENST00000436287 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa22.13■■□□□ 1.13
ACTBP11-201ENST00000436287 POGKQ9P215 609 aa22.13■■□□□ 1.13
ACTBP11-201ENST00000436287 ANKARQ7Z5J8 1434 aa22.11■■□□□ 1.13
ACTBP11-201ENST00000436287 DLC1Q96QB1 1528 aa22.08■■□□□ 1.13
ACTBP11-201ENST00000436287 BTG4Q9NY30 223 aa22.07■■□□□ 1.12
ACTBP11-201ENST00000436287 FAM98CQ17RN3 349 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
ACTBP11-201ENST00000436287 BRWD3Q6RI45 1802 aa22.06■■□□□ 1.12
ACTBP11-201ENST00000436287 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP22.05■■□□□ 1.12
ACTBP11-201ENST00000436287 GPRASP1Q5JY77 1395 aa22.05■■□□□ 1.12
ACTBP11-201ENST00000436287 A0A0G2JS52 829 aa22.05■■□□□ 1.12
ACTBP11-201ENST00000436287 MYT1Q01538 1121 aa22.05■■□□□ 1.12
ACTBP11-201ENST00000436287 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP22.05■■□□□ 1.12
ACTBP11-201ENST00000436287 TRAK1Q9UPV9 953 aa22.05■■□□□ 1.12
ACTBP11-201ENST00000436287 NWD2Q9ULI1 1742 aa22.05■■□□□ 1.12
ACTBP11-201ENST00000436287 BAG6P46379 1132 aa22.04■■□□□ 1.12
ACTBP11-201ENST00000436287 PRR36Q9H6K5 1346 aa22.04■■□□□ 1.12
ACTBP11-201ENST00000436287 PLCH1Q4KWH8 1693 aa22.02■■□□□ 1.12
ACTBP11-201ENST00000436287 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP22.02■■□□□ 1.12
ACTBP11-201ENST00000436287 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP22.01■■□□□ 1.11
ACTBP11-201ENST00000436287 ADGRB1O14514 1584 aa22.01■■□□□ 1.11
ACTBP11-201ENST00000436287 WASLO00401 505 aaPredicted RBP22.01■■□□□ 1.11
ACTBP11-201ENST00000436287 ADGRB2O60241 1585 aa22■■□□□ 1.11
ACTBP11-201ENST00000436287 ABCA3Q99758 1704 aa21.99■■□□□ 1.11
ACTBP11-201ENST00000436287 SPATA31A5Q5VU36 1347 aa21.99■■□□□ 1.11
ACTBP11-201ENST00000436287 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa21.99■■□□□ 1.11
ACTBP11-201ENST00000436287 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP21.98■■□□□ 1.11
ACTBP11-201ENST00000436287 PSDA5PKW4 1024 aaPredicted RBP21.97■■□□□ 1.11
ACTBP11-201ENST00000436287 HRCP23327 699 aa21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 446 ms