RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000431095.5

H19-208, H19, imprinted maternally expressed transcript, human

TSL 5

Gene H19, Length 1,481 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
H19-208	ENST00000431095	NALCN	Q8IZF0	1738 aa		32.21	■■■□□ 2.75
H19-208	ENST00000431095	NBPF8	Q3BBV2	869 aa		32.2	■■■□□ 2.75
H19-208	ENST00000431095	PRAM1	Q96QH2	718 aa		32.2	■■■□□ 2.75
H19-208	ENST00000431095	POGK	Q9P215	609 aa		32.16	■■■□□ 2.74
H19-208	ENST00000431095	TRPM1	Q7Z4N2	1603 aa		32.16	■■■□□ 2.74
H19-208	ENST00000431095	MST1R	Q04912	1400 aa		32.12	■■■□□ 2.73
H19-208	ENST00000431095	ROCK2	O75116	1388 aa	Known RBP	32.12	■■■□□ 2.73
H19-208	ENST00000431095	CDC42BPG	Q6DT37	1551 aa		32.1	■■■□□ 2.73
H19-208	ENST00000431095	SAFB2	Q14151	953 aa	Known RBP eCLIP	32.1	■■■□□ 2.73
H19-208	ENST00000431095	GPRASP1	Q5JY77	1395 aa		32.09	■■■□□ 2.73
H19-208	ENST00000431095	ARHGEF28	Q8N1W1	1705 aa	Known RBP	32.08	■■■□□ 2.73
H19-208	ENST00000431095	ROBO1	Q9Y6N7	1651 aa		32.07	■■■□□ 2.72
H19-208	ENST00000431095	HSPA1L	P34931	641 aa		32.05	■■■□□ 2.72
H19-208	ENST00000431095	C1orf167	Q5SNV9	1468 aa		32.05	■■■□□ 2.72
H19-208	ENST00000431095	RALGAPB	Q86X10	1494 aa		32.05	■■■□□ 2.72
H19-208	ENST00000431095	BRINP3	Q76B58	766 aa		32.03	■■■□□ 2.72
H19-208	ENST00000431095	ADGRB2	O60241	1585 aa		32.01	■■■□□ 2.71
H19-208	ENST00000431095	MINK1	Q8N4C8	1332 aa	Predicted RBP	32	■■■□□ 2.71
H19-208	ENST00000431095	CARD11	Q9BXL7	1154 aa		31.99	■■■□□ 2.71
H19-208	ENST00000431095	HIRIP3	Q9BW71	556 aa	Predicted RBP	31.97	■■■□□ 2.71
H19-208	ENST00000431095	CENPJ	Q9HC77	1338 aa	Predicted RBP	31.97	■■■□□ 2.71
H19-208	ENST00000431095	FMN2	Q9NZ56	1722 aa		31.95	■■■□□ 2.71
H19-208	ENST00000431095	EIF3A	Q14152	1382 aa	Known RBP	31.95	■■■□□ 2.71
H19-208	ENST00000431095	WASL	O00401	505 aa	Predicted RBP	31.95	■■■□□ 2.7
H19-208	ENST00000431095	ORAI2	Q96SN7	254 aa		31.95	■■■□□ 2.7
H19-208	ENST00000431095	NUTM2F	A1L443	756 aa		31.93	■■■□□ 2.7
H19-208	ENST00000431095	ESCO1	Q5FWF5	840 aa		31.91	■■■□□ 2.7
H19-208	ENST00000431095	AHDC1	Q5TGY3	1603 aa	Predicted RBP	31.9	■■■□□ 2.7
H19-208	ENST00000431095	ANKAR	Q7Z5J8	1434 aa		31.9	■■■□□ 2.7
H19-208	ENST00000431095	PHLPP1	O60346	1717 aa		31.86	■■■□□ 2.69
H19-208	ENST00000431095	CDK19	Q9BWU1	502 aa		31.85	■■■□□ 2.69
H19-208	ENST00000431095	TULP4	Q9NRJ4	1543 aa		31.84	■■■□□ 2.69
H19-208	ENST00000431095	QRICH2	Q9H0J4	1663 aa		31.84	■■■□□ 2.69
H19-208	ENST00000431095	NHSL1	Q5SYE7	1610 aa		31.84	■■■□□ 2.69
H19-208	ENST00000431095	PRR36	Q9H6K5	1346 aa		31.82	■■■□□ 2.68
H19-208	ENST00000431095	SBNO2	Q9Y2G9	1366 aa		31.81	■■■□□ 2.68
H19-208	ENST00000431095	DDX17	Q92841	729 aa	Known RBP	31.81	■■■□□ 2.68
H19-208	ENST00000431095	COL16A1	Q07092	1604 aa	Predicted RBP	31.81	■■■□□ 2.68
H19-208	ENST00000431095	USP32	Q8NFA0	1604 aa		31.81	■■■□□ 2.68
H19-208	ENST00000431095	NPHP3	Q7Z494	1330 aa		31.8	■■■□□ 2.68
H19-208	ENST00000431095	PHF8	Q9UPP1	1060 aa		31.79	■■■□□ 2.68
H19-208	ENST00000431095	SOS2	Q07890	1332 aa	Predicted RBP	31.79	■■■□□ 2.68
H19-208	ENST00000431095	RGPD8	O14715	1765 aa	Predicted RBP	31.79	■■■□□ 2.68
H19-208	ENST00000431095	FOXO3	O43524	673 aa		31.78	■■■□□ 2.68
H19-208	ENST00000431095	NUDT16	Q96DE0	195 aa	Known RBP	31.78	■■■□□ 2.68
H19-208	ENST00000431095	KIF1A	Q12756	1690 aa		31.77	■■■□□ 2.68
H19-208	ENST00000431095	EVC2	Q86UK5	1308 aa		31.77	■■■□□ 2.68
H19-208	ENST00000431095	LRRC59	Q96AG4	307 aa	Known RBP	31.76	■■■□□ 2.67
H19-208	ENST00000431095	ATP7B	P35670	1465 aa		31.76	■■■□□ 2.67
H19-208	ENST00000431095	SRPK2	P78362	688 aa	Known RBP	31.74	■■■□□ 2.67
H19-208	ENST00000431095	JCAD	Q9P266	1359 aa		31.74	■■■□□ 2.67
H19-208	ENST00000431095	CCDC61	Q9Y6R9	512 aa		31.74	■■■□□ 2.67
H19-208	ENST00000431095	ST20-MTHFS	A0A0A6YYL1	179 aa		31.73	■■■□□ 2.67
H19-208	ENST00000431095	USP47	Q96K76	1375 aa		31.73	■■■□□ 2.67
H19-208	ENST00000431095	SLC24A1	O60721	1099 aa		31.72	■■■□□ 2.67
H19-208	ENST00000431095	CABP2	Q9NPB3	220 aa		31.72	■■■□□ 2.67
H19-208	ENST00000431095	PMFBP1	Q8TBY8	1022 aa		31.71	■■■□□ 2.67
H19-208	ENST00000431095	PXDN	Q92626	1479 aa		31.7	■■■□□ 2.66
H19-208	ENST00000431095	TESK2	Q96S53	571 aa		31.69	■■■□□ 2.66
H19-208	ENST00000431095	ITSN1	Q15811	1721 aa		31.66	■■■□□ 2.66
H19-208	ENST00000431095	PLEKHG3	A1L390	1219 aa		31.66	■■■□□ 2.66
H19-208	ENST00000431095	KRT28	Q7Z3Y7	464 aa		31.66	■■■□□ 2.66
H19-208	ENST00000431095	XPC	Q01831	940 aa	Predicted RBP	31.65	■■■□□ 2.66
H19-208	ENST00000431095	PSME1	Q06323	249 aa		31.65	■■■□□ 2.66
H19-208	ENST00000431095	TOPAZ1	Q8N9V7	1692 aa		31.64	■■■□□ 2.65
H19-208	ENST00000431095	SPATA31A6	Q5VVP1	1343 aa		31.63	■■■□□ 2.65
H19-208	ENST00000431095	NGDN	Q8NEJ9	315 aa	Known RBP	31.63	■■■□□ 2.65
H19-208	ENST00000431095	SHPRH	Q149N8	1683 aa		31.62	■■■□□ 2.65
H19-208	ENST00000431095	PUS7	Q96PZ0	661 aa	Known RBP	31.62	■■■□□ 2.65
H19-208	ENST00000431095	POLR3A	O14802	1390 aa	Predicted RBP	31.61	■■■□□ 2.65
H19-208	ENST00000431095	ATAD2	Q6PL18	1390 aa		31.6	■■■□□ 2.65
H19-208	ENST00000431095	PNPLA6	Q8IY17	1366 aa		31.6	■■■□□ 2.65
H19-208	ENST00000431095	PPIP5K1	Q6PFW1	1433 aa		31.6	■■■□□ 2.65
H19-208	ENST00000431095	SBNO1	A3KN83	1393 aa		31.59	■■■□□ 2.65
H19-208	ENST00000431095	ACE	P12821	1306 aa		31.58	■■■□□ 2.65
H19-208	ENST00000431095	SPATA31A3	Q5VYP0	1347 aa		31.58	■■■□□ 2.65
H19-208	ENST00000431095	CABP1	Q9NZU7	370 aa		31.58	■■■□□ 2.65
H19-208	ENST00000431095	EIF4G2	P78344	907 aa	Known RBP eCLIP	31.55	■■■□□ 2.64
H19-208	ENST00000431095	TMF1	P82094	1093 aa		31.53	■■■□□ 2.64
H19-208	ENST00000431095	MED1	Q15648	1581 aa	Predicted RBP	31.53	■■■□□ 2.64
H19-208	ENST00000431095	TNS3	Q68CZ2	1445 aa		31.52	■■■□□ 2.64
H19-208	ENST00000431095	COL22A1	Q8NFW1	1626 aa	Predicted RBP	31.49	■■■□□ 2.63
H19-208	ENST00000431095	TRPM3	Q9HCF6	1732 aa	Predicted RBP	31.49	■■■□□ 2.63
H19-208	ENST00000431095	ARHGEF10	O15013	1369 aa		31.48	■■■□□ 2.63
H19-208	ENST00000431095	DISP3	Q9P2K9	1392 aa		31.48	■■■□□ 2.63
H19-208	ENST00000431095	HSPA5	P11021	654 aa	Known RBP	31.47	■■■□□ 2.63
H19-208	ENST00000431095	ZNF692	Q9BU19	519 aa	Predicted RBP	31.47	■■■□□ 2.63
H19-208	ENST00000431095	BRD4	O60885	1362 aa	Predicted RBP	31.47	■■■□□ 2.63
H19-208	ENST00000431095	CDCA8	Q53HL2	280 aa		31.46	■■■□□ 2.63
H19-208	ENST00000431095	LRP6	O75581	1613 aa		31.46	■■■□□ 2.63
H19-208	ENST00000431095	NUTM2B	A6NNL0	878 aa	Predicted RBP	31.45	■■■□□ 2.62
H19-208	ENST00000431095	NUTM2E	B1AL46	878 aa	Predicted RBP	31.45	■■■□□ 2.62
H19-208	ENST00000431095	NUTM2A	Q8IVF1	878 aa	Predicted RBP	31.45	■■■□□ 2.62
H19-208	ENST00000431095	PAK3	O75914	559 aa	Predicted RBP	31.44	■■■□□ 2.62
H19-208	ENST00000431095	CPSF1	Q10570	1443 aa	Known RBP	31.43	■■■□□ 2.62
H19-208	ENST00000431095	LMOD2	Q6P5Q4	547 aa		31.43	■■■□□ 2.62
H19-208	ENST00000431095	USP6	P35125	1406 aa		31.42	■■■□□ 2.62
H19-208	ENST00000431095	SLC12A5	Q9H2X9	1139 aa		31.42	■■■□□ 2.62
H19-208	ENST00000431095	NINL	Q9Y2I6	1382 aa		31.42	■■■□□ 2.62
H19-208	ENST00000431095	TMC1	Q8TDI8	760 aa		31.41	■■■□□ 2.62

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