RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429299.2

LTB-210, Transcript of lymphotoxin beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LTB, Length 897 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTB-210ENST00000429299 EP400Q96L91 3159 aa29.42■■■□□ 2.3
LTB-210ENST00000429299 HFM1A2PYH4 1435 aa29.42■■■□□ 2.3
LTB-210ENST00000429299 NPHP3Q7Z494 1330 aa29.41■■■□□ 2.3
LTB-210ENST00000429299 ESCO1Q5FWF5 840 aa29.39■■■□□ 2.3
LTB-210ENST00000429299 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP29.38■■■□□ 2.29
LTB-210ENST00000429299 MYOM2P54296 1465 aa29.36■■■□□ 2.29
LTB-210ENST00000429299 BCL9LQ86UU0 1499 aa29.36■■■□□ 2.29
LTB-210ENST00000429299 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP29.35■■■□□ 2.29
LTB-210ENST00000429299 FOXO3O43524 673 aa29.33■■■□□ 2.29
LTB-210ENST00000429299 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP29.33■■■□□ 2.29
LTB-210ENST00000429299 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP29.31■■■□□ 2.28
LTB-210ENST00000429299 PXDNQ92626 1479 aa29.29■■■□□ 2.28
LTB-210ENST00000429299 NAIPQ13075 1403 aa29.29■■■□□ 2.28
LTB-210ENST00000429299 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP29.27■■■□□ 2.28
LTB-210ENST00000429299 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa29.26■■■□□ 2.28
LTB-210ENST00000429299 UNC5CLQ8IV45 518 aa29.25■■■□□ 2.27
LTB-210ENST00000429299 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP29.25■■■□□ 2.27
LTB-210ENST00000429299 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP29.22■■■□□ 2.27
LTB-210ENST00000429299 WAPLQ7Z5K2 1190 aa29.21■■■□□ 2.27
LTB-210ENST00000429299 PPLO60437 1756 aa29.21■■■□□ 2.27
LTB-210ENST00000429299 NUTM2FA1L443 756 aa29.2■■■□□ 2.26
LTB-210ENST00000429299 STK26Q9P289 416 aa29.2■■■□□ 2.26
LTB-210ENST00000429299 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP29.19■■■□□ 2.26
LTB-210ENST00000429299 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa29.19■■■□□ 2.26
LTB-210ENST00000429299 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP29.18■■■□□ 2.26
LTB-210ENST00000429299 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa29.18■■■□□ 2.26
LTB-210ENST00000429299 TECPR2O15040 1411 aa29.17■■■□□ 2.26
LTB-210ENST00000429299 ABCC11Q96J66 1382 aa29.16■■■□□ 2.26
LTB-210ENST00000429299 SLIT2O94813 1529 aa29.16■■■□□ 2.26
LTB-210ENST00000429299 RALGAPBQ86X10 1494 aa29.16■■■□□ 2.26
LTB-210ENST00000429299 TNKS1BP1Q9C0C2 1729 aaKnown RBP29.14■■■□□ 2.26
LTB-210ENST00000429299 KRT28Q7Z3Y7 464 aa29.13■■■□□ 2.25
LTB-210ENST00000429299 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP29.12■■■□□ 2.25
LTB-210ENST00000429299 RGL3Q3MIN7 710 aa29.11■■■□□ 2.25
LTB-210ENST00000429299 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa29.11■■■□□ 2.25
LTB-210ENST00000429299 CCDC144AA2RUR9 1427 aa29.11■■■□□ 2.25
LTB-210ENST00000429299 GLI3P10071 1580 aa29.1■■■□□ 2.25
LTB-210ENST00000429299 TMEM132EQ6IEE7 984 aa29.1■■■□□ 2.25
LTB-210ENST00000429299 SEPT12Q8IYM1 358 aa29.1■■■□□ 2.25
LTB-210ENST00000429299 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP29.09■■■□□ 2.25
LTB-210ENST00000429299 VPS72Q15906 364 aa29.09■■■□□ 2.25
LTB-210ENST00000429299 DEFB132Q7Z7B7 95 aa29.09■■■□□ 2.25
LTB-210ENST00000429299 PSME1Q06323 249 aa29.08■■■□□ 2.25
LTB-210ENST00000429299 SIRT1Q96EB6 747 aa29.08■■■□□ 2.25
LTB-210ENST00000429299 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa29.08■■■□□ 2.25
LTB-210ENST00000429299 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP29.07■■■□□ 2.24
LTB-210ENST00000429299 PHF8Q9UPP1 1060 aa29.04■■■□□ 2.24
LTB-210ENST00000429299 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa29.03■■■□□ 2.24
LTB-210ENST00000429299 KIF1AQ12756 1690 aa29.03■■■□□ 2.24
LTB-210ENST00000429299 USP32Q8NFA0 1604 aa29.03■■■□□ 2.24
LTB-210ENST00000429299 FMN2Q9NZ56 1722 aa29.02■■■□□ 2.24
LTB-210ENST00000429299 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP29.02■■■□□ 2.24
LTB-210ENST00000429299 BRWD3Q6RI45 1802 aa29.01■■■□□ 2.24
LTB-210ENST00000429299 KRT27Q7Z3Y8 459 aa29.01■■■□□ 2.23
LTB-210ENST00000429299 CABLES1Q8TDN4 633 aa29.01■■■□□ 2.23
LTB-210ENST00000429299 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP29.01■■■□□ 2.23
LTB-210ENST00000429299 TNS3Q68CZ2 1445 aa29■■■□□ 2.23
LTB-210ENST00000429299 KNDC1Q76NI1 1749 aa29■■■□□ 2.23
LTB-210ENST00000429299 PIK3C2GO75747 1445 aa28.99■■■□□ 2.23
LTB-210ENST00000429299 SBNO1A3KN83 1393 aa28.98■■■□□ 2.23
LTB-210ENST00000429299 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP28.96■■■□□ 2.23
LTB-210ENST00000429299 LMOD2Q6P5Q4 547 aa28.95■■■□□ 2.22
LTB-210ENST00000429299 ARHGEF10O15013 1369 aa28.95■■■□□ 2.22
LTB-210ENST00000429299 FAM83GA6ND36 823 aa28.94■■■□□ 2.22
LTB-210ENST00000429299 MPHOSPH9Q99550 1183 aa28.94■■■□□ 2.22
LTB-210ENST00000429299 PLEKHG5O94827 1062 aa28.93■■■□□ 2.22
LTB-210ENST00000429299 BAG6P46379 1132 aa28.93■■■□□ 2.22
LTB-210ENST00000429299 NWD2Q9ULI1 1742 aa28.93■■■□□ 2.22
LTB-210ENST00000429299 IFT172Q9UG01 1749 aa28.92■■■□□ 2.22
LTB-210ENST00000429299 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP28.91■■■□□ 2.22
LTB-210ENST00000429299 NRXN1Q9ULB1 1477 aa28.91■■■□□ 2.22
LTB-210ENST00000429299 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP28.89■■■□□ 2.22
LTB-210ENST00000429299 LRP5O75197 1615 aa28.88■■■□□ 2.21
LTB-210ENST00000429299 A0A0G2JS52 829 aa28.88■■■□□ 2.21
LTB-210ENST00000429299 MYT1Q01538 1121 aa28.88■■■□□ 2.21
LTB-210ENST00000429299 PLCH1Q4KWH8 1693 aa28.88■■■□□ 2.21
LTB-210ENST00000429299 PRAM1Q96QH2 718 aa28.87■■■□□ 2.21
LTB-210ENST00000429299 HRCP23327 699 aa28.86■■■□□ 2.21
LTB-210ENST00000429299 FAM98CQ17RN3 349 aaKnown RBP28.86■■■□□ 2.21
LTB-210ENST00000429299 CFAP70Q5T0N1 1121 aa28.86■■■□□ 2.21
LTB-210ENST00000429299 PSDA5PKW4 1024 aaPredicted RBP28.85■■■□□ 2.21
LTB-210ENST00000429299 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa28.85■■■□□ 2.21
LTB-210ENST00000429299 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP28.84■■■□□ 2.21
LTB-210ENST00000429299 BTG4Q9NY30 223 aa28.84■■■□□ 2.21
LTB-210ENST00000429299 POGKQ9P215 609 aa28.82■■■□□ 2.2
LTB-210ENST00000429299 ANKARQ7Z5J8 1434 aa28.82■■■□□ 2.2
LTB-210ENST00000429299 ABCA3Q99758 1704 aa28.8■■■□□ 2.2
LTB-210ENST00000429299 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP28.79■■■□□ 2.2
LTB-210ENST00000429299 GPRASP1Q5JY77 1395 aa28.77■■■□□ 2.2
LTB-210ENST00000429299 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP28.76■■■□□ 2.19
LTB-210ENST00000429299 SPATA31A5Q5VU36 1347 aa28.75■■■□□ 2.19
LTB-210ENST00000429299 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa28.75■■■□□ 2.19
LTB-210ENST00000429299 DLC1Q96QB1 1528 aa28.74■■■□□ 2.19
LTB-210ENST00000429299 NRAPQ86VF7 1730 aa28.72■■■□□ 2.19
LTB-210ENST00000429299 FAM182BQ5T319 152 aa28.72■■■□□ 2.19
LTB-210ENST00000429299 COL14A1Q05707 1796 aaKnown RBP28.71■■■□□ 2.19
LTB-210ENST00000429299 R3HDM1Q15032 1099 aaKnown RBP28.71■■■□□ 2.19
LTB-210ENST00000429299 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP28.7■■■□□ 2.18
LTB-210ENST00000429299 DISP2A7MBM2 1401 aa28.69■■■□□ 2.18
LTB-210ENST00000429299 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP28.69■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 60.3 ms