RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429299.2

LTB-210, Transcript of lymphotoxin beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LTB, Length 897 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTB-210ENST00000429299 EP400Q96L91 3159 aa29.42■■■□□ 2.3
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LTB-210ENST00000429299 NPHP3Q7Z494 1330 aa29.41■■■□□ 2.3
LTB-210ENST00000429299 ESCO1Q5FWF5 840 aa29.39■■■□□ 2.3
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LTB-210ENST00000429299 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP29.35■■■□□ 2.29
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LTB-210ENST00000429299 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa29.03■■■□□ 2.24
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LTB-210ENST00000429299 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa28.75■■■□□ 2.19
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LTB-210ENST00000429299 FAM182BQ5T319 152 aa28.72■■■□□ 2.19
LTB-210ENST00000429299 COL14A1Q05707 1796 aaKnown RBP28.71■■■□□ 2.19
LTB-210ENST00000429299 R3HDM1Q15032 1099 aaKnown RBP28.71■■■□□ 2.19
LTB-210ENST00000429299 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP28.7■■■□□ 2.18
LTB-210ENST00000429299 DISP2A7MBM2 1401 aa28.69■■■□□ 2.18
LTB-210ENST00000429299 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP28.69■■■□□ 2.18
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