RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428892.1

APOBEC3C-202, Transcript of apolipoprotein B mRNA editing enzyme catalytic subunit 3C, humanhuman

TSL 3

Gene APOBEC3C, Length 1,056 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3C-202ENST00000428892 C1orf167Q5SNV9 1468 aa16.26■□□□□ 0.19
APOBEC3C-202ENST00000428892 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP16.25■□□□□ 0.19
APOBEC3C-202ENST00000428892 MAPK8IP2Q13387 824 aaPredicted RBP16.25■□□□□ 0.19
APOBEC3C-202ENST00000428892 PTCH1Q13635 1447 aa16.25■□□□□ 0.19
APOBEC3C-202ENST00000428892 ATAD2Q6PL18 1390 aa16.25■□□□□ 0.19
APOBEC3C-202ENST00000428892 PPLO60437 1756 aa16.24■□□□□ 0.19
APOBEC3C-202ENST00000428892 USP21Q9UK80 565 aa16.22■□□□□ 0.19
APOBEC3C-202ENST00000428892 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP16.22■□□□□ 0.19
APOBEC3C-202ENST00000428892 TRPC5Q9UL62 973 aaPredicted RBP16.21■□□□□ 0.19
APOBEC3C-202ENST00000428892 VGFO15240 615 aaPredicted RBP16.2■□□□□ 0.18
APOBEC3C-202ENST00000428892 ORAI2Q96SN7 254 aa16.19■□□□□ 0.18
APOBEC3C-202ENST00000428892 ROBO2Q9HCK4 1378 aa16.18■□□□□ 0.18
APOBEC3C-202ENST00000428892 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP16.18■□□□□ 0.18
APOBEC3C-202ENST00000428892 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa16.17■□□□□ 0.18
APOBEC3C-202ENST00000428892 ESCO1Q5FWF5 840 aa16.15■□□□□ 0.18
APOBEC3C-202ENST00000428892 TNKS1BP1Q9C0C2 1729 aaKnown RBP16.15■□□□□ 0.18
APOBEC3C-202ENST00000428892 NPHP3Q7Z494 1330 aa16.15■□□□□ 0.18
APOBEC3C-202ENST00000428892 ZRANB1Q9UGI0 708 aa16.14■□□□□ 0.17
APOBEC3C-202ENST00000428892 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa16.14■□□□□ 0.17
APOBEC3C-202ENST00000428892 ATRNO75882 1429 aa16.13■□□□□ 0.17
APOBEC3C-202ENST00000428892 PRAG1Q86YV5 1406 aa16.13■□□□□ 0.17
APOBEC3C-202ENST00000428892 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP16.12■□□□□ 0.17
APOBEC3C-202ENST00000428892 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP16.12■□□□□ 0.17
APOBEC3C-202ENST00000428892 KIF1AQ12756 1690 aa16.11■□□□□ 0.17
APOBEC3C-202ENST00000428892 KNDC1Q76NI1 1749 aa16.11■□□□□ 0.17
APOBEC3C-202ENST00000428892 MYOM2P54296 1465 aa16.11■□□□□ 0.17
APOBEC3C-202ENST00000428892 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa16.11■□□□□ 0.17
APOBEC3C-202ENST00000428892 PXDNQ92626 1479 aa16.1■□□□□ 0.17
APOBEC3C-202ENST00000428892 IFT172Q9UG01 1749 aa16.1■□□□□ 0.17
APOBEC3C-202ENST00000428892 FMN2Q9NZ56 1722 aa16.09■□□□□ 0.17
APOBEC3C-202ENST00000428892 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP16.09■□□□□ 0.17
APOBEC3C-202ENST00000428892 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP16.09■□□□□ 0.17
APOBEC3C-202ENST00000428892 BRWD3Q6RI45 1802 aa16.08■□□□□ 0.17
APOBEC3C-202ENST00000428892 NUTM2FA1L443 756 aa16.08■□□□□ 0.16
APOBEC3C-202ENST00000428892 CCDC125Q86Z20 511 aa16.08■□□□□ 0.16
APOBEC3C-202ENST00000428892 FOXO3O43524 673 aa16.07■□□□□ 0.16
APOBEC3C-202ENST00000428892 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP16.07■□□□□ 0.16
APOBEC3C-202ENST00000428892 USP32Q8NFA0 1604 aa16.07■□□□□ 0.16
APOBEC3C-202ENST00000428892 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP16.07■□□□□ 0.16
APOBEC3C-202ENST00000428892 BCL9LQ86UU0 1499 aa16.06■□□□□ 0.16
APOBEC3C-202ENST00000428892 CCDC144AA2RUR9 1427 aa16.06■□□□□ 0.16
APOBEC3C-202ENST00000428892 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP16.06■□□□□ 0.16
APOBEC3C-202ENST00000428892 MPHOSPH9Q99550 1183 aa16.06■□□□□ 0.16
APOBEC3C-202ENST00000428892 STK26Q9P289 416 aa16.06■□□□□ 0.16
APOBEC3C-202ENST00000428892 PLCH1Q4KWH8 1693 aa16.05■□□□□ 0.16
APOBEC3C-202ENST00000428892 EP400Q96L91 3159 aa16.05■□□□□ 0.16
APOBEC3C-202ENST00000428892 HRCP23327 699 aa16.05■□□□□ 0.16
APOBEC3C-202ENST00000428892 GLI3P10071 1580 aa16.04■□□□□ 0.16
APOBEC3C-202ENST00000428892 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP16.03■□□□□ 0.16
APOBEC3C-202ENST00000428892 NWD2Q9ULI1 1742 aa16.02■□□□□ 0.16
APOBEC3C-202ENST00000428892 RALGAPBQ86X10 1494 aa16.02■□□□□ 0.15
APOBEC3C-202ENST00000428892 ABCA3Q99758 1704 aa16.02■□□□□ 0.15
APOBEC3C-202ENST00000428892 TECPR2O15040 1411 aa16.02■□□□□ 0.15
APOBEC3C-202ENST00000428892 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP16.02■□□□□ 0.15
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APOBEC3C-202ENST00000428892 WAPLQ7Z5K2 1190 aa16.01■□□□□ 0.15
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APOBEC3C-202ENST00000428892 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa16■□□□□ 0.15
APOBEC3C-202ENST00000428892 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa16■□□□□ 0.15
APOBEC3C-202ENST00000428892 PLEKHG5O94827 1062 aa16■□□□□ 0.15
APOBEC3C-202ENST00000428892 HOXD11P31277 338 aaPredicted RBP16■□□□□ 0.15
APOBEC3C-202ENST00000428892 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP16■□□□□ 0.15
APOBEC3C-202ENST00000428892 SLIT2O94813 1529 aa15.99■□□□□ 0.15
APOBEC3C-202ENST00000428892 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa15.98■□□□□ 0.15
APOBEC3C-202ENST00000428892 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa15.98■□□□□ 0.15
APOBEC3C-202ENST00000428892 TNS3Q68CZ2 1445 aa15.97■□□□□ 0.15
APOBEC3C-202ENST00000428892 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP15.97■□□□□ 0.15
APOBEC3C-202ENST00000428892 A0A0G2JS52 829 aa15.97■□□□□ 0.15
APOBEC3C-202ENST00000428892 MYT1Q01538 1121 aa15.97■□□□□ 0.15
APOBEC3C-202ENST00000428892 PSME1Q06323 249 aa15.97■□□□□ 0.15
APOBEC3C-202ENST00000428892 TMEM132EQ6IEE7 984 aa15.97■□□□□ 0.15
APOBEC3C-202ENST00000428892 LMOD2Q6P5Q4 547 aa15.97■□□□□ 0.15
APOBEC3C-202ENST00000428892 KRT28Q7Z3Y7 464 aa15.97■□□□□ 0.15
APOBEC3C-202ENST00000428892 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa15.97■□□□□ 0.15
APOBEC3C-202ENST00000428892 ABCC11Q96J66 1382 aa15.97■□□□□ 0.15
APOBEC3C-202ENST00000428892 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa15.97■□□□□ 0.15
APOBEC3C-202ENST00000428892 PIK3C2GO75747 1445 aa15.96■□□□□ 0.15
APOBEC3C-202ENST00000428892 LRP5O75197 1615 aa15.94■□□□□ 0.14
APOBEC3C-202ENST00000428892 DEFB132Q7Z7B7 95 aa15.93■□□□□ 0.14
APOBEC3C-202ENST00000428892 SEPT12Q8IYM1 358 aa15.93■□□□□ 0.14
APOBEC3C-202ENST00000428892 PHF8Q9UPP1 1060 aa15.93■□□□□ 0.14
APOBEC3C-202ENST00000428892 RGPD1P0DJD0 1748 aa15.93■□□□□ 0.14
APOBEC3C-202ENST00000428892 ARHGEF10O15013 1369 aa15.92■□□□□ 0.14
APOBEC3C-202ENST00000428892 VPS72Q15906 364 aa15.92■□□□□ 0.14
APOBEC3C-202ENST00000428892 NRAPQ86VF7 1730 aa15.91■□□□□ 0.14
APOBEC3C-202ENST00000428892 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP15.91■□□□□ 0.14
APOBEC3C-202ENST00000428892 KRT27Q7Z3Y8 459 aa15.91■□□□□ 0.14
APOBEC3C-202ENST00000428892 CABLES1Q8TDN4 633 aa15.91■□□□□ 0.14
APOBEC3C-202ENST00000428892 NRXN1Q9ULB1 1477 aa15.91■□□□□ 0.14
APOBEC3C-202ENST00000428892 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP15.9■□□□□ 0.14
APOBEC3C-202ENST00000428892 COL14A1Q05707 1796 aaKnown RBP15.9■□□□□ 0.14
APOBEC3C-202ENST00000428892 SBNO1A3KN83 1393 aa15.89■□□□□ 0.13
APOBEC3C-202ENST00000428892 BAG6P46379 1132 aa15.89■□□□□ 0.13
APOBEC3C-202ENST00000428892 POGKQ9P215 609 aa15.88■□□□□ 0.13
APOBEC3C-202ENST00000428892 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP15.87■□□□□ 0.13
APOBEC3C-202ENST00000428892 ADGRB2O60241 1585 aa15.87■□□□□ 0.13
APOBEC3C-202ENST00000428892 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa15.86■□□□□ 0.13
APOBEC3C-202ENST00000428892 SIRT1Q96EB6 747 aa15.86■□□□□ 0.13
APOBEC3C-202ENST00000428892 PRAM1Q96QH2 718 aa15.86■□□□□ 0.13
APOBEC3C-202ENST00000428892 ALS2Q96Q42 1657 aa15.86■□□□□ 0.13
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