RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000420058.1

NFE4-201, Transcript of nuclear factor, erythroid 4, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene NFE4, Length 1,072 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFE4-201ENST00000420058 ATRNO75882 1429 aa21.56■■□□□ 1.04
NFE4-201ENST00000420058 ESCO1Q5FWF5 840 aa21.55■■□□□ 1.04
NFE4-201ENST00000420058 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP21.55■■□□□ 1.04
NFE4-201ENST00000420058 MYOM2P54296 1465 aa21.55■■□□□ 1.04
NFE4-201ENST00000420058 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa21.55■■□□□ 1.04
NFE4-201ENST00000420058 BCL9LQ86UU0 1499 aa21.54■■□□□ 1.04
NFE4-201ENST00000420058 ATAD2Q6PL18 1390 aa21.53■■□□□ 1.04
NFE4-201ENST00000420058 FOXO3O43524 673 aa21.53■■□□□ 1.04
NFE4-201ENST00000420058 FOXD1Q16676 465 aa21.53■■□□□ 1.04
NFE4-201ENST00000420058 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP21.53■■□□□ 1.04
NFE4-201ENST00000420058 PXDNQ92626 1479 aa21.52■■□□□ 1.04
NFE4-201ENST00000420058 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP21.52■■□□□ 1.04
NFE4-201ENST00000420058 WAPLQ7Z5K2 1190 aa21.52■■□□□ 1.04
NFE4-201ENST00000420058 NPHP3Q7Z494 1330 aa21.52■■□□□ 1.03
NFE4-201ENST00000420058 PPLO60437 1756 aa21.51■■□□□ 1.03
NFE4-201ENST00000420058 STK26Q9P289 416 aa21.48■■□□□ 1.03
NFE4-201ENST00000420058 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa21.48■■□□□ 1.03
NFE4-201ENST00000420058 NUTM2FA1L443 756 aa21.47■■□□□ 1.03
NFE4-201ENST00000420058 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa21.47■■□□□ 1.03
NFE4-201ENST00000420058 TECPR2O15040 1411 aa21.46■■□□□ 1.03
NFE4-201ENST00000420058 RGL3Q3MIN7 710 aa21.46■■□□□ 1.03
NFE4-201ENST00000420058 TMEM132EQ6IEE7 984 aa21.46■■□□□ 1.03
NFE4-201ENST00000420058 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP21.46■■□□□ 1.03
NFE4-201ENST00000420058 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP21.46■■□□□ 1.03
NFE4-201ENST00000420058 ABCC11Q96J66 1382 aa21.46■■□□□ 1.03
NFE4-201ENST00000420058 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa21.46■■□□□ 1.03
NFE4-201ENST00000420058 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa21.42■■□□□ 1.02
NFE4-201ENST00000420058 CCDC125Q86Z20 511 aa21.41■■□□□ 1.02
NFE4-201ENST00000420058 UNC5CLQ8IV45 518 aa21.4■■□□□ 1.02
NFE4-201ENST00000420058 ZRANB1Q9UGI0 708 aa21.4■■□□□ 1.02
NFE4-201ENST00000420058 SLIT2O94813 1529 aa21.39■■□□□ 1.02
NFE4-201ENST00000420058 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa21.39■■□□□ 1.02
NFE4-201ENST00000420058 MPHOSPH9Q99550 1183 aa21.39■■□□□ 1.01
NFE4-201ENST00000420058 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP21.38■■□□□ 1.01
NFE4-201ENST00000420058 KRT28Q7Z3Y7 464 aa21.38■■□□□ 1.01
NFE4-201ENST00000420058 SIRT1Q96EB6 747 aa21.38■■□□□ 1.01
NFE4-201ENST00000420058 CCDC144AA2RUR9 1427 aa21.38■■□□□ 1.01
NFE4-201ENST00000420058 PIK3C2GO75747 1445 aa21.37■■□□□ 1.01
NFE4-201ENST00000420058 RALGAPBQ86X10 1494 aa21.36■■□□□ 1.01
NFE4-201ENST00000420058 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP21.36■■□□□ 1.01
NFE4-201ENST00000420058 GLI3P10071 1580 aa21.36■■□□□ 1.01
NFE4-201ENST00000420058 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP21.35■■□□□ 1.01
NFE4-201ENST00000420058 IFT172Q9UG01 1749 aa21.33■■□□□ 1.01
NFE4-201ENST00000420058 CABLES1Q8TDN4 633 aa21.33■■□□□ 1.01
NFE4-201ENST00000420058 FMN2Q9NZ56 1722 aa21.32■■□□□ 1
NFE4-201ENST00000420058 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP21.32■■□□□ 1
NFE4-201ENST00000420058 PHF8Q9UPP1 1060 aa21.31■■□□□ 1
NFE4-201ENST00000420058 KNDC1Q76NI1 1749 aa21.31■■□□□ 1
NFE4-201ENST00000420058 TNKS1BP1Q9C0C2 1729 aaKnown RBP21.31■■□□□ 1
NFE4-201ENST00000420058 CFAP70Q5T0N1 1121 aa21.3■■□□□ 1
NFE4-201ENST00000420058 VPS72Q15906 364 aa21.29■■□□□ 1
NFE4-201ENST00000420058 DEFB132Q7Z7B7 95 aa21.29■■□□□ 1
NFE4-201ENST00000420058 SEPT12Q8IYM1 358 aa21.29■■□□□ 1
NFE4-201ENST00000420058 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP21.29■■□□□ 1
NFE4-201ENST00000420058 NRXN1Q9ULB1 1477 aa21.27■■□□□ 1
NFE4-201ENST00000420058 USP32Q8NFA0 1604 aa21.27■■□□□ 1
NFE4-201ENST00000420058 TNS3Q68CZ2 1445 aa21.27■■□□□ 1
NFE4-201ENST00000420058 KIF1AQ12756 1690 aa21.26■□□□□ 0.99
NFE4-201ENST00000420058 FAM83GA6ND36 823 aa21.26■□□□□ 0.99
NFE4-201ENST00000420058 PSME1Q06323 249 aa21.26■□□□□ 0.99
NFE4-201ENST00000420058 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP21.25■□□□□ 0.99
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NFE4-201ENST00000420058 BRWD3Q6RI45 1802 aa21.25■□□□□ 0.99
NFE4-201ENST00000420058 PRAM1Q96QH2 718 aa21.25■□□□□ 0.99
NFE4-201ENST00000420058 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP21.24■□□□□ 0.991e-6■■■□□ 15.1
NFE4-201ENST00000420058 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP21.23■□□□□ 0.99
NFE4-201ENST00000420058 PLEKHG5O94827 1062 aa21.23■□□□□ 0.99
NFE4-201ENST00000420058 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa21.21■□□□□ 0.99
NFE4-201ENST00000420058 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP21.2■□□□□ 0.98
NFE4-201ENST00000420058 KRT27Q7Z3Y8 459 aa21.2■□□□□ 0.98
NFE4-201ENST00000420058 LMOD2Q6P5Q4 547 aa21.19■□□□□ 0.98
NFE4-201ENST00000420058 ARHGEF10O15013 1369 aa21.18■□□□□ 0.98
NFE4-201ENST00000420058 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP21.17■□□□□ 0.98
NFE4-201ENST00000420058 NWD2Q9ULI1 1742 aa21.16■□□□□ 0.98
NFE4-201ENST00000420058 ANKARQ7Z5J8 1434 aa21.16■□□□□ 0.98
NFE4-201ENST00000420058 PRR36Q9H6K5 1346 aa21.16■□□□□ 0.98
NFE4-201ENST00000420058 PLCH1Q4KWH8 1693 aa21.15■□□□□ 0.98
NFE4-201ENST00000420058 DLC1Q96QB1 1528 aa21.15■□□□□ 0.98
NFE4-201ENST00000420058 POGKQ9P215 609 aa21.15■□□□□ 0.98
NFE4-201ENST00000420058 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP21.14■□□□□ 0.97
NFE4-201ENST00000420058 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP21.14■□□□□ 0.97
NFE4-201ENST00000420058 BTG4Q9NY30 223 aa21.14■□□□□ 0.97
NFE4-201ENST00000420058 ABCA3Q99758 1704 aa21.14■□□□□ 0.97
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NFE4-201ENST00000420058 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP21.11■□□□□ 0.97
NFE4-201ENST00000420058 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP21.1■□□□□ 0.97
NFE4-201ENST00000420058 ADGRB2O60241 1585 aa21.1■□□□□ 0.97
NFE4-201ENST00000420058 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP21.09■□□□□ 0.97
NFE4-201ENST00000420058 FAM182BQ5T319 152 aa21.09■□□□□ 0.97
NFE4-201ENST00000420058 SPATA31A5Q5VU36 1347 aa21.08■□□□□ 0.97
NFE4-201ENST00000420058 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa21.08■□□□□ 0.97
NFE4-201ENST00000420058 PSDA5PKW4 1024 aaPredicted RBP21.08■□□□□ 0.97
NFE4-201ENST00000420058 WASLO00401 505 aaPredicted RBP21.08■□□□□ 0.97
NFE4-201ENST00000420058 NRAPQ86VF7 1730 aa21.08■□□□□ 0.97
NFE4-201ENST00000420058 HRCP23327 699 aa21.07■□□□□ 0.96
NFE4-201ENST00000420058 ALS2Q96Q42 1657 aa21.07■□□□□ 0.96
NFE4-201ENST00000420058 BAG6P46379 1132 aa21.06■□□□□ 0.96
NFE4-201ENST00000420058 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP21.06■□□□□ 0.96
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